Detalhe da pesquisa
1.
CAREx: context-aware read extension of paired-end sequencing data.
BMC Bioinformatics
; 25(1): 186, 2024 May 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38730374
2.
RabbitKSSD: accelerating genome distance estimation on modern multi-core architectures.
Bioinformatics
; 39(11)2023 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37971961
3.
RabbitQCPlus 2.0: More efficient and versatile quality control for sequencing data.
Methods
; 216: 39-50, 2023 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37330158
4.
RabbitV: fast detection of viruses and microorganisms in sequencing data on multi-core architectures.
Bioinformatics
; 38(10): 2932-2933, 2022 05 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35561184
5.
CARE 2.0: reducing false-positive sequencing error corrections using machine learning.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 227, 2022 Jun 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35698033
6.
Locality-sensitive hashing enables efficient and scalable signal classification in high-throughput mass spectrometry raw data.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 287, 2022 Jul 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35858828
7.
CARE: context-aware sequencing read error correction.
Bioinformatics
; 37(7): 889-895, 2021 05 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32818262
8.
RabbitMash: accelerating hash-based genome analysis on modern multi-core architectures.
Bioinformatics
; 37(6): 873-875, 2021 05 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32845281
9.
RabbitQC: high-speed scalable quality control for sequencing data.
Bioinformatics
; 37(4): 573-574, 2021 05 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32790850
10.
Fully automated detection of primary sclerosing cholangitis (PSC)-compatible bile duct changes based on 3D magnetic resonance cholangiopancreatography using machine learning.
Eur Radiol
; 31(4): 2482-2489, 2021 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32974688
11.
RainDrop: Rapid activation matrix computation for droplet-based single-cell RNA-seq reads.
BMC Bioinformatics
; 21(1): 274, 2020 Jul 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32611394
12.
A big data approach to metagenomics for all-food-sequencing.
BMC Bioinformatics
; 21(1): 102, 2020 Mar 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32164527
13.
BGSA: a bit-parallel global sequence alignment toolkit for multi-core and many-core architectures.
Bioinformatics
; 35(13): 2306-2308, 2019 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30445566
14.
kmcEx: memory-frugal and retrieval-efficient encoding of counted k-mers.
Bioinformatics
; 35(23): 4871-4878, 2019 12 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31038666
15.
Deep semantic lung segmentation for tracking potential pulmonary perfusion biomarkers in chronic obstructive pulmonary disease (COPD): The multi-ethnic study of atherosclerosis COPD study.
J Magn Reson Imaging
; 51(2): 571-579, 2020 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31276264
16.
Fast and efficient short read mapping based on a succinct hash index.
BMC Bioinformatics
; 19(1): 92, 2018 03 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29523083
17.
MetaCache: context-aware classification of metagenomic reads using minhashing.
Bioinformatics
; 33(23): 3740-3748, 2017 Dec 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28961782
18.
AFS: identification and quantification of species composition by metagenomic sequencing.
Bioinformatics
; 33(9): 1396-1398, 2017 05 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28453677
19.
A computational method for studying the relation between alternative splicing and DNA methylation.
Nucleic Acids Res
; 44(2): e19, 2016 Jan 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26365234
20.
Accelerating metagenomic read classification on CUDA-enabled GPUs.
BMC Bioinformatics
; 18(1): 11, 2017 Jan 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28049411