Detalhe da pesquisa
1.
Benchmarking enrichment analysis methods with the disease pathway network.
Brief Bioinform
; 25(2)2024 Jan 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38436561
2.
GRNbenchmark - a web server for benchmarking directed gene regulatory network inference methods.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W398-W404, 2022 07 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35609981
3.
The Quest for Orthologs orthology benchmark service in 2022.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W623-W632, 2022 07 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35552456
4.
InParanoid-DIAMOND: faster orthology analysis with the InParanoid algorithm.
Bioinformatics
; 38(10): 2918-2919, 2022 05 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35561192
5.
Fast and accurate gene regulatory network inference by normalized least squares regression.
Bioinformatics
; 38(8): 2263-2268, 2022 04 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35176145
6.
PathwAX II: network-based pathway analysis with interactive visualization of network crosstalk.
Bioinformatics
; 38(9): 2659-2660, 2022 04 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35266519
7.
Pfam: The protein families database in 2021.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D412-D419, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33125078
8.
Ten Years of Collaborative Progress in the Quest for Orthologs.
Mol Biol Evol
; 38(8): 3033-3045, 2021 07 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33822172
9.
Genome-wide functional association networks: background, data & state-of-the-art resources.
Brief Bioinform
; 21(4): 1224-1237, 2020 07 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31281921
10.
Inferring the experimental design for accurate gene regulatory network inference.
Bioinformatics
; 37(20): 3553-3559, 2021 Oct 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33978748
11.
The Quest for Orthologs benchmark service and consensus calls in 2020.
Nucleic Acids Res
; 48(W1): W538-W545, 2020 07 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32374845
12.
The Pfam protein families database in 2019.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D427-D432, 2019 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30357350
13.
DNA Methylation Levels in Mononuclear Leukocytes from the Mother and Her Child Are Associated with IgE Sensitization to Allergens in Early Life.
Int J Mol Sci
; 22(2)2021 Jan 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33466918
14.
Advances and Applications in the Quest for Orthologs.
Mol Biol Evol
; 36(10): 2157-2164, 2019 10 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31241141
15.
A generalized framework for controlling FDR in gene regulatory network inference.
Bioinformatics
; 35(6): 1026-1032, 2019 03 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30169550
16.
FunCoup 4: new species, data, and visualization.
Nucleic Acids Res
; 46(D1): D601-D607, 2018 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29165593
17.
Domainoid: domain-oriented orthology inference.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 523, 2019 Oct 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31660857
18.
Standardized benchmarking in the quest for orthologs.
Nat Methods
; 13(5): 425-30, 2016 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27043882
19.
Gearing up to handle the mosaic nature of life in the quest for orthologs.
Bioinformatics
; 34(2): 323-329, 2018 Jan 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28968857
20.
HieranoiDB: a database of orthologs inferred by Hieranoid.
Nucleic Acids Res
; 45(D1): D687-D690, 2017 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27742821