An in silico model for identification of small RNAs in whole bacterial genomes: characterization of antisense RNAs in pathogenic Escherichia coli and Streptococcus agalactiae strains.

Pichon, Christophe; du Merle, Laurence; Caliot, Marie Elise; Trieu-Cuot, Patrick; Le Bouguénec, Chantal

Pichon, Christophe; du Merle, Laurence; Caliot, Marie Elise; Trieu-Cuot, Patrick; Le Bouguénec, Chantal.

Afiliação

Pichon C; Institut Pasteur, Unité de Biologie des Bactéries Pathogènes à Gram Positif, 25-28 Rue du Docteur Roux, F-75724 Paris, France.

Nucleic Acids Res ; 40(7): 2846-61, 2012 Apr.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-22139924

Assuntos

Simulação por Computador; Escherichia coli/genética; Genoma Bacteriano; RNA Antissenso/metabolismo; Streptococcus agalactiae/genética; Antígenos de Bactérias/genética; Pareamento de Bases; Biofilmes; Escherichia coli/patogenicidade; Escherichia coli/fisiologia; Proteínas de Escherichia coli/genética; Proteínas de Escherichia coli/fisiologia; Proteínas de Fímbrias/genética; Proteínas de Fímbrias/metabolismo; Regulação Bacteriana da Expressão Gênica; Ilhas Genômicas; Fator Proteico 1 do Hospedeiro/fisiologia; RNA Antissenso/química; RNA Antissenso/genética; RNA Mensageiro/metabolismo; Regulon; Streptococcus agalactiae/patogenicidade

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Streptococcus agalactiae / Simulação por Computador / RNA Antissenso / Genoma Bacteriano / Escherichia coli Idioma: En Ano de publicação: 2012 Tipo de documento: Article País de afiliação: França

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