A Markov-chain model description of binding funnels to enhance the ranking of docked solutions.

Torchala, Mieczyslaw; Moal, Iain H; Chaleil, Raphael A G; Agius, Rudi; Bates, Paul A

Torchala, Mieczyslaw; Moal, Iain H; Chaleil, Raphael A G; Agius, Rudi; Bates, Paul A.

Afiliação

Torchala M; Biomolecular Modelling Laboratory, Cancer Research UK London Research Institute, London, WC2A 3LY, United Kingdom.

Proteins ; 81(12): 2143-9, 2013 Dec.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-23900714

Assuntos

Modelos Moleculares; Simulação de Acoplamento Molecular; Conformação Proteica; Proteínas/química; Sítios de Ligação; Simulação por Computador; Cadeias de Markov; Ligação Proteica; Software; Soluções/química; Termodinâmica

Palavras-chave

Markovian dynamics; SwarmDock; node occupancies; protein conformational states; protein-protein docking funnels; scoring protein complexes

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Conformação Proteica / Proteínas / Modelos Moleculares / Simulação de Acoplamento Molecular Idioma: En Ano de publicação: 2013 Tipo de documento: Article País de afiliação: Reino Unido

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