PSEA-Quant: a protein set enrichment analysis on label-free and label-based protein quantification data.

Lavallée-Adam, Mathieu; Rauniyar, Navin; McClatchy, Daniel B; Yates, John R

Lavallée-Adam, Mathieu; Rauniyar, Navin; McClatchy, Daniel B; Yates, John R.

Afiliação

Lavallée-Adam M; Department of Chemical Physiology, The Scripps Research Institute , 10550 N. Torrey Pines Rd., La Jolla, California 92037, United States.

J Proteome Res ; 13(12): 5496-509, 2014 Dec 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25177766

Assuntos

Algoritmos; Biologia Computacional/métodos; Proteínas/análise; Proteoma/análise; Proteômica/métodos; Animais; Encéfalo/metabolismo; Linhagem Celular; Cromatografia Líquida; Regulador de Condutância Transmembrana em Fibrose Cística/genética; Regulador de Condutância Transmembrana em Fibrose Cística/metabolismo; Bases de Dados de Proteínas; Humanos; Camundongos; Mutação; Proteínas/metabolismo; Proteoma/metabolismo; Ratos; Espectrometria de Massas em Tandem

Palavras-chave

bioinformatics; computational biology; cystic fibrosis; gene ontology; gene set enrichment analysis; isobaric tandem mass tagging; mass spectrometry; protein quantification; spectral counting; statistics

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Proteínas / Biologia Computacional / Proteoma / Proteômica Idioma: En Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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