PanCoreGen - Profiling, detecting, annotating protein-coding genes in microbial genomes.

Paul, Sandip; Bhardwaj, Archana; Bag, Sumit K; Sokurenko, Evgeni V; Chattopadhyay, Sujay

Paul, Sandip; Bhardwaj, Archana; Bag, Sumit K; Sokurenko, Evgeni V; Chattopadhyay, Sujay.

Afiliação

Paul S; Department of Microbiology, University of Washington, Seattle, WA 98195 USA. Electronic address: sandipp@u.washington.edu.
Bhardwaj A; CSIR - National Botanical Research Institute, Rana Pratap Marg, Lucknow 226001, India. Electronic address: archana2287@gmail.com.
Bag SK; CSIR - National Botanical Research Institute, Rana Pratap Marg, Lucknow 226001, India. Electronic address: sumit.bag@nbri.res.in.
Sokurenko EV; Department of Microbiology, University of Washington, Seattle, WA 98195 USA. Electronic address: evs@u.washington.edu.
Chattopadhyay S; Department of Microbiology, University of Washington, Seattle, WA 98195 USA. Electronic address: sujayc@u.washington.edu.

Genomics ; 106(6): 367-72, 2015 Dec.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26456591

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Genoma Microbiano/genética; Anotação de Sequência Molecular/métodos; Fases de Leitura Aberta/genética; Proteínas de Bactérias/genética; Transferência Genética Horizontal/genética; Genoma Bacteriano/genética; Filogenia; Reprodutibilidade dos Testes; Salmonella enterica/classificação; Salmonella enterica/genética; Especificidade da Espécie

Palavras-chave

Core-genome; Draft-genome annotation; Pan-genome; Protein-coding genes

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fases de Leitura Aberta / Biologia Computacional / Perfilação da Expressão Gênica / Anotação de Sequência Molecular / Genoma Microbiano Idioma: En Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article

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