SARNAclust: Semi-automatic detection of RNA protein binding motifs from immunoprecipitation data.

Dotu, Ivan; Adamson, Scott I; Coleman, Benjamin; Fournier, Cyril; Ricart-Altimiras, Emma; Eyras, Eduardo; Chuang, Jeffrey H

Dotu, Ivan; Adamson, Scott I; Coleman, Benjamin; Fournier, Cyril; Ricart-Altimiras, Emma; Eyras, Eduardo; Chuang, Jeffrey H.

Afiliação

Dotu I; The Jackson Laboratory for Genomic Medicine, Farmington, CT, United States of America.
Adamson SI; Research Programme on Biomedical Informatics (GRIB), Hospital del Mar Medical Research Institute (IMIM)-Pompeu Fabra University (UPF), Barcelona, Spain.
Coleman B; The Jackson Laboratory for Genomic Medicine, Farmington, CT, United States of America.
Fournier C; UCONN Health, Department of Genetics and Genome Sciences, Farmington, CT, United States of America.
Ricart-Altimiras E; The Jackson Laboratory for Genomic Medicine, Farmington, CT, United States of America.
Eyras E; The Jackson Laboratory for Genomic Medicine, Farmington, CT, United States of America.
Chuang JH; The Jackson Laboratory for Genomic Medicine, Farmington, CT, United States of America.

PLoS Comput Biol ; 14(3): e1006078, 2018 03.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29596423

Assuntos

Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Análise de Sequência de RNA/métodos; Algoritmos; Sítios de Ligação; Análise por Conglomerados; Imunoprecipitação; Conformação de Ácido Nucleico; Motivos de Nucleotídeos; Ligação Proteica; RNA/genética; Proteínas com Motivo de Reconhecimento de RNA/genética; Proteínas com Motivo de Reconhecimento de RNA/fisiologia; Proteínas de Ligação a RNA/metabolismo

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Análise de Sequência de RNA / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Idioma: En Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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