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1.
Biochemistry ; 51(16): 3321-33, 2012 Apr 24.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-22471593

RESUMO

Precursor-mRNA splicing is catalyzed by an extraordinarily large and highly dynamic macromolecular assemblage termed the spliceosome. Detailed biochemical and structural study of the spliceosome presents a formidable challenge, but there has recently been significant progress made on this front highlighted by the crystal structure of a 10-subunit human U1 snRNP. This review provides an overview of our current understanding of the architecture of the spliceosome and the RNA-protein complexes integral to its function, the U snRNPs.


Assuntos
Spliceossomos/genética , Animais , Humanos , Modelos Moleculares , Conformação Proteica , Precursores de RNA/química , Precursores de RNA/genética , Precursores de RNA/metabolismo , Splicing de RNA , RNA Mensageiro/química , RNA Mensageiro/genética , RNA Mensageiro/metabolismo , Ribonucleoproteína Nuclear Pequena U1/química , Ribonucleoproteína Nuclear Pequena U1/genética , Ribonucleoproteína Nuclear Pequena U1/metabolismo , Spliceossomos/química , Spliceossomos/metabolismo
2.
Structure ; 22(4): 628-35, 2014 Apr 08.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-24560806

RESUMO

There is significant demand for experimental approaches to aid protein localization in electron microscopy micrographs and ultimately in three-dimensional reconstructions of macromolecular assemblies. We report preparation and use of a reagent consisting of tris-nitrilotriacetic acid (tris-NTA) conjugated with a monofunctional gold nanoparticle ((AuNP)tris-NTA) for site-specific, non-covalent labeling of protein termini fused to a histidine-tag (His-tag). Multivalent binding of tris-NTA to a His-tag via complexed Ni(II) ions results in subnanomolar affinity and a defined 1:1 stoichiometry. Precise localization of (AuNP)tris-NTA labeled proteins by electron microscopy is further ensured by the reagent's short conformationally restricted linker. We used (AuNP)tris-NTA to localize His-tagged proteins in an oligomeric ATPase and in the bacterial 50S ribosomal subunit. (AuNP)tris-NTA can specifically bind to the target proteins in these assemblies and is clearly discernible. Our labeling reagent should find broad application in noncovalent, site-specific labeling of protein termini to pinpoint their location in macromolecular assemblies.


Assuntos
Adenosina Trifosfatases/química , Proteínas de Bactérias/química , Ouro/química , Histidina/química , Nanopartículas Metálicas/química , Subunidades Ribossômicas Maiores de Bactérias/química , Escherichia coli/química , Indicadores e Reagentes/química , Microscopia Eletrônica , Ácido Nitrilotriacético/química , Proteínas Recombinantes de Fusão/química , Coloração e Rotulagem/métodos , Thermus thermophilus/química , Trometamina/química
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