Detalhe da pesquisa
1.
Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges.
Nat Methods
; 19(4): 429-440, 2022 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35396482
2.
SVJedi-graph: improving the genotyping of close and overlapping structural variants with long reads using a variation graph.
Bioinformatics
; 39(39 Suppl 1): i270-i278, 2023 06 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37387169
3.
MTG-Link: leveraging barcode information from linked-reads to assemble specific loci.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 284, 2023 Jul 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37452278
4.
SVJedi: genotyping structural variations with long reads.
Bioinformatics
; 36(17): 4568-4575, 2020 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32437523
5.
SimkaMin: fast and resource frugal de novo comparative metagenomics.
Bioinformatics
; 36(4): 1275-1276, 2020 02 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31504187
6.
Genomic architecture of endogenous ichnoviruses reveals distinct evolutionary pathways leading to virus domestication in parasitic wasps.
BMC Biol
; 18(1): 89, 2020 07 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32703219
7.
Towards a better understanding of the low recall of insertion variants with short-read based variant callers.
BMC Genomics
; 21(1): 762, 2020 Nov 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33148192
8.
Critical Assessment of Metagenome Interpretation-a benchmark of metagenomics software.
Nat Methods
; 14(11): 1063-1071, 2017 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28967888
9.
Contrasting genomic and phenotypic outcomes of hybridization between pairs of mimetic butterfly taxa across a suture zone.
Mol Ecol
; 29(7): 1328-1343, 2020 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32145112
10.
Identifying genomic hotspots of differentiation and candidate genes involved in the adaptive divergence of pea aphid host races.
Mol Ecol
; 2018 Jul 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30010213
11.
Reference-free detection of isolated SNPs.
Nucleic Acids Res
; 43(2): e11, 2015 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25404127
12.
Reference-free compression of high throughput sequencing data with a probabilistic de Bruijn graph.
BMC Bioinformatics
; 16: 288, 2015 Sep 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26370285
13.
MindTheGap: integrated detection and assembly of short and long insertions.
Bioinformatics
; 30(24): 3451-7, 2014 Dec 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25123898
14.
GATB: Genome Assembly & Analysis Tool Box.
Bioinformatics
; 30(20): 2959-61, 2014 Oct 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24990603
15.
Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) host-plant variants: two host strains or two distinct species?
Genetica
; 143(3): 305-16, 2015 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25694156
16.
Chromosome-Level Assembly and Annotation of the Pearly Heath Coenonympha arcania Butterfly Genome.
Genome Biol Evol
; 16(3)2024 Mar 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38491969
17.
First chromosome scale genomes of ithomiine butterflies (Nymphalidae: Ithomiini): Comparative models for mimicry genetic studies.
Mol Ecol Resour
; 23(4): 872-885, 2023 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36533297
18.
Compareads: comparing huge metagenomic experiments.
BMC Bioinformatics
; 13 Suppl 19: S10, 2012.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23282463
19.
Genomic evidence for global ocean plankton biogeography shaped by large-scale current systems.
Elife
; 112022 08 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35920817
20.
A novel substitution matrix fitted to the compositional bias in Mollicutes improves the prediction of homologous relationships.
BMC Bioinformatics
; 12: 457, 2011 Nov 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22115330