Detalhe da pesquisa
1.
What is allosteric regulation? Exploring the exceptions that prove the rule!
J Biol Chem
; 300(3): 105672, 2024 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38272229
2.
Motif V regulates energy transduction between the flavivirus NS3 ATPase and RNA-binding cleft.
J Biol Chem
; 295(6): 1551-1564, 2020 02 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31914411
3.
NMR and MD simulations reveal the impact of the V23D mutation on the function of yeast oligosaccharyltransferase subunit Ost4.
Glycobiology
; 31(7): 838-850, 2021 08 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33442744
4.
A Hyperactive Kunjin Virus NS3 Helicase Mutant Demonstrates Increased Dissemination and Mortality in Mosquitoes.
J Virol
; 94(19)2020 09 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32699093
5.
Allostery in the dengue virus NS3 helicase: Insights into the NTPase cycle from molecular simulations.
PLoS Comput Biol
; 14(4): e1006103, 2018 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29659571
6.
Self-Assembly of Perylenediimide-Single-Strand-DNA Conjugates: Employing Hydrophobic Interactions and DNA Base-Pairing To Create a Diverse Structural Space.
Chemistry
; 23(43): 10328-10337, 2017 Aug 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28543996
7.
Unraveling the mystery of ATP hydrolysis in actin filaments.
J Am Chem Soc
; 136(37): 13053-8, 2014 Sep 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25181471
8.
Thymine photodimer formation in DNA hairpins. Unusual conformations favor (6 - 4) vs. (2 + 2) adducts.
Photochem Photobiol Sci
; 13(2): 266-71, 2014 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24212351
9.
Quantifying Unbiased Conformational Ensembles from Biased Simulations Using ShapeGMM.
J Chem Theory Comput
; 20(9): 3492-3502, 2024 May 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38662196
10.
Role of ATP Hydrolysis and Product Release in the Translocation Mechanism of SARS-CoV-2 NSP13.
J Phys Chem B
; 128(2): 492-503, 2024 Jan 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38175211
11.
Reaction Coordinates for Conformational Transitions Using Linear Discriminant Analysis on Positions.
J Chem Theory Comput
; 19(14): 4427-4435, 2023 Jul 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37130367
12.
The Role of ATP Hydrolysis and Product Release in the Translocation Mechanism of SARS-CoV-2 NSP13.
bioRxiv
; 2023 Sep 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37808802
13.
Motif-VI Loop Acts as a Nucleotide Valve in the West Nile Virus NS3 Helicase.
bioRxiv
; 2023 Nov 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38077049
14.
Size-and-Shape Space Gaussian Mixture Models for Structural Clustering of Molecular Dynamics Trajectories.
J Chem Theory Comput
; 18(5): 3218-3230, 2022 May 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35483073
15.
Conserved motifs in the flavivirus NS3 RNA helicase enzyme.
Wiley Interdiscip Rev RNA
; 13(2): e1688, 2022 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34472205
16.
Modeling Catalysis in Allosteric Enzymes: Capturing Conformational Consequences.
Top Catal
; 65(1-4): 165-186, 2022 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36304771
17.
DNA-based optomechanical molecular motor.
J Am Chem Soc
; 133(10): 3452-9, 2011 Mar 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21341796
18.
Electron donor-acceptor interactions with flanking purines influence the efficiency of thymine photodimerization.
J Am Chem Soc
; 133(51): 20793-8, 2011 Dec 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22032333
19.
Role of ATP in the RNA Translocation Mechanism of SARS-CoV-2 NSP13 Helicase.
J Phys Chem B
; 125(31): 8787-8796, 2021 08 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34328740
20.
Implicit Solvation Using the Superposition Approximation (IS-SPA): Extension to Peptides in a Polar Solvent.
J Chem Theory Comput
; 17(2): 703-713, 2021 Feb 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33428425