Detalhe da pesquisa
1.
A distance-based model for convergent evolution.
J Math Biol
; 88(2): 17, 2024 01 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38238584
2.
The Space of Equidistant Phylogenetic Cactuses.
Ann Comb
; 28(1): 1-32, 2024.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38433929
3.
Evolutionary genomics of the cold-adapted diatom Fragilariopsis cylindrus.
Nature
; 541(7638): 536-540, 2017 01 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28092920
4.
NATpare: a pipeline for high-throughput prediction and functional analysis of nat-siRNAs.
Nucleic Acids Res
; 48(12): 6481-6490, 2020 07 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32463462
5.
PAREameters: a tool for computational inference of plant miRNA-mRNA targeting rules using small RNA and degradome sequencing data.
Nucleic Acids Res
; 48(5): 2258-2270, 2020 03 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31943065
6.
The rigid hybrid number for two phylogenetic trees.
J Math Biol
; 82(5): 40, 2021 03 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33770290
7.
A novel stratification framework for predicting outcome in patients with prostate cancer.
Br J Cancer
; 122(10): 1467-1476, 2020 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32203215
8.
Exploring and Visualizing Spaces of Tree Reconciliations.
Syst Biol
; 68(4): 607-618, 2019 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30418649
9.
OSF-Builder: A New Tool for Constructing and Representing Evolutionary Histories Involving Introgression.
Syst Biol
; 68(5): 717-729, 2019 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30668824
10.
PAREsnip2: a tool for high-throughput prediction of small RNA targets from degradome sequencing data using configurable targeting rules.
Nucleic Acids Res
; 46(17): 8730-8739, 2018 09 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30007348
11.
INDISIM-Denitrification, an individual-based model for study the denitrification process.
J Ind Microbiol Biotechnol
; 47(1): 1-20, 2020 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31691030
12.
Comprehensive processing of high-throughput small RNA sequencing data including quality checking, normalization, and differential expression analysis using the UEA sRNA Workbench.
RNA
; 23(6): 823-835, 2017 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28289155
13.
SPECTRE: a suite of phylogenetic tools for reticulate evolution.
Bioinformatics
; 34(6): 1056-1057, 2018 03 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29186450
14.
The UEA sRNA Workbench (version 4.4): a comprehensive suite of tools for analyzing miRNAs and sRNAs.
Bioinformatics
; 34(19): 3382-3384, 2018 10 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29722807
15.
Phylogenetic Flexibility via Hall-Type Inequalities and Submodularity.
Bull Math Biol
; 81(2): 598-617, 2019 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29589255
16.
Reconstructing Tree-Child Networks from Reticulate-Edge-Deleted Subnetworks.
Bull Math Biol
; 81(10): 3823-3863, 2019 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31297691
17.
Reconciling event-labeled gene trees with MUL-trees and species networks.
J Math Biol
; 79(5): 1885-1925, 2019 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31410552
18.
miRCat2: accurate prediction of plant and animal microRNAs from next-generation sequencing datasets.
Bioinformatics
; 33(16): 2446-2454, 2017 Aug 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28407097
19.
Identifiability of tree-child phylogenetic networks under a probabilistic recombination-mutation model of evolution.
J Theor Biol
; 446: 160-167, 2018 06 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29548737
20.
Quarnet Inference Rules for Level-1 Networks.
Bull Math Biol
; 80(8): 2137-2153, 2018 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29869043