Detalhe da pesquisa
1.
A modular master regulator landscape controls cancer transcriptional identity.
Cell
; 184(2): 334-351.e20, 2021 01 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33434495
2.
Phosphoproteome Integration Reveals Patient-Specific Networks in Prostate Cancer.
Cell
; 166(4): 1041-1054, 2016 Aug 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27499020
3.
The Immune Landscape of Cancer.
Immunity
; 48(4): 812-830.e14, 2018 04 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29628290
4.
The Immune Landscape of Cancer.
Immunity
; 51(2): 411-412, 2019 Aug 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31433971
5.
SJARACNe: a scalable software tool for gene network reverse engineering from big data.
Bioinformatics
; 35(12): 2165-2166, 2019 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30388204
6.
The number of titrated microRNA species dictates ceRNA regulation.
Nucleic Acids Res
; 46(9): 4354-4369, 2018 05 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29684207
7.
Inferring causal molecular networks: empirical assessment through a community-based effort.
Nat Methods
; 13(4): 310-8, 2016 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26901648
8.
Pathway-Based Genomics Prediction using Generalized Elastic Net.
PLoS Comput Biol
; 12(3): e1004790, 2016 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26960204
9.
Discovering causal pathways linking genomic events to transcriptional states using Tied Diffusion Through Interacting Events (TieDIE).
Bioinformatics
; 29(21): 2757-64, 2013 Nov 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23986566
10.
Oncoprotein-specific molecular interaction maps (SigMaps) for cancer network analyses.
Nat Biotechnol
; 39(2): 215-224, 2021 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32929263
11.
The Master Regulator Protein BAZ2B Can Reprogram Human Hematopoietic Lineage-Committed Progenitors into a Multipotent State.
Cell Rep
; 33(10): 108474, 2020 12 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33296649
12.
Prophetic Granger Causality to infer gene regulatory networks.
PLoS One
; 12(12): e0170340, 2017.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29211761
13.
Revealing cancer subtypes with higher-order correlations applied to imaging and omics data.
BMC Med Genomics
; 10(1): 20, 2017 03 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28359308
14.
Common and cell-type specific responses to anti-cancer drugs revealed by high throughput transcript profiling.
Nat Commun
; 8(1): 1186, 2017 10 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29084964
15.
ONE-CLASS DETECTION OF CELL STATES IN TUMOR SUBTYPES.
Pac Symp Biocomput
; 21: 405-16, 2016.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26776204
16.
Molecular pathways: extracting medical knowledge from high-throughput genomic data.
Clin Cancer Res
; 19(12): 3114-20, 2013 Jun 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23430023