Detalhe da pesquisa
1.
SARS-CoV-2 lineage dynamics in England from September to November 2021: high diversity of Delta sub-lineages and increased transmissibility of AY.4.2.
BMC Infect Dis
; 22(1): 647, 2022 Jul 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35896970
2.
A Bayesian Supertree Model for Genome-Wide Species Tree Reconstruction.
Syst Biol
; 65(3): 397-416, 2016 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25281847
3.
SimPhy: Phylogenomic Simulation of Gene, Locus, and Species Trees.
Syst Biol
; 65(2): 334-44, 2016 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26526427
4.
Scalable neighbour search and alignment with uvaia.
PeerJ
; 12: e16890, 2024.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38464752
5.
Repurposing an integrated national influenza platform for genomic surveillance of SARS-CoV-2 in Ghana: a molecular epidemiological analysis.
Lancet Glob Health
; 11(7): e1075-e1085, 2023 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37349034
6.
Phylogenomic Analyses of 2,786 Genes in 158 Lineages Support a Root of the Eukaryotic Tree of Life between Opisthokonts and All Other Lineages.
Genome Biol Evol
; 14(8)2022 08 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35880421
7.
Tatajuba: exploring the distribution of homopolymer tracts.
NAR Genom Bioinform
; 4(1): lqac003, 2022 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35118377
8.
Datasets for benchmarking antimicrobial resistance genes in bacterial metagenomic and whole genome sequencing.
Sci Data
; 9(1): 341, 2022 06 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35705638
9.
Dynamics of competing SARS-CoV-2 variants during the Omicron epidemic in England.
Nat Commun
; 13(1): 4375, 2022 07 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35902613
10.
Replacement of the Alpha variant of SARS-CoV-2 by the Delta variant in Lebanon between April and June 2021.
Microb Genom
; 8(7)2022 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35876490
11.
SARS-CoV-2 variants of concern dominate in Lahore, Pakistan in April 2021.
Microb Genom
; 7(11)2021 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34846280
12.
Genomic epidemiology and the role of international and regional travel in the SARS-CoV-2 epidemic in Zimbabwe: a retrospective study of routinely collected surveillance data.
Lancet Glob Health
; 9(12): e1658-e1666, 2021 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34695371
13.
CoronaHiT: high-throughput sequencing of SARS-CoV-2 genomes.
Genome Med
; 13(1): 21, 2021 02 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33563320
14.
Large-scale sequencing of SARS-CoV-2 genomes from one region allows detailed epidemiology and enables local outbreak management.
Microb Genom
; 7(6)2021 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34184982
15.
Lineage-specific positive selection at the merozoite surface protein 1 (msp1) locus of Plasmodium vivax and related simian malaria parasites.
BMC Evol Biol
; 10: 52, 2010 Feb 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20167126
16.
Unsorted homology within locus and species trees.
Syst Biol
; 63(6): 988-92, 2014 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25077514
17.
Testing for universal common ancestry.
Syst Biol
; 63(5): 838-42, 2014 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24958930
18.
Taxonomic resolution of the ribosomal RNA operon in bacteria: implications for its use with long-read sequencing.
NAR Genom Bioinform
; 2(1): lqz016, 2020 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33575567
19.
Nanoneedle-Mediated Stimulation of Cell Mechanotransduction Machinery.
ACS Nano
; 13(3): 2913-2926, 2019 03 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30829469
20.
Species Tree Estimation from Genome-Wide Data with guenomu.
Methods Mol Biol
; 1525: 461-478, 2017.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27896732