Prediction of Structure and Molecular Interaction with DNA of BvrR, a Virulence-Associated Regulatory Protein of <i>Brucella</i>.

Ramírez-González, Edgar A; Moreno-Lafont, Martha C; Méndez-Tenorio, Alfonso; Cancino-Díaz, Mario E; Estrada-García, Iris; López-Santiago, Rubén

Prediction of Structure and Molecular Interaction with DNA of BvrR, a Virulence-Associated Regulatory Protein of Brucella.

Ramírez-González, Edgar A; Moreno-Lafont, Martha C; Méndez-Tenorio, Alfonso; Cancino-Díaz, Mario E; Estrada-García, Iris; López-Santiago, Rubén.

Affiliation

Ramírez-González EA; Departamento de Inmunología, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional, Ciudad de México 11340, Mexico.
Moreno-Lafont MC; Departamento de Inmunología, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional, Ciudad de México 11340, Mexico.
Méndez-Tenorio A; Laboratorio de Biotecnología y Bioinformática Genómica, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional, Ciudad de México 11340, Mexico.
Cancino-Díaz ME; Departamento de Inmunología, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional, Ciudad de México 11340, Mexico.
Estrada-García I; Departamento de Inmunología, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional, Ciudad de México 11340, Mexico.
López-Santiago R; Departamento de Inmunología, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional, Ciudad de México 11340, Mexico. rlopezsantiago@hotmail.com.

Molecules ; 24(17)2019 Aug 29.

Article in En | MEDLINE | ID: mdl-31470504

Subject(s)

Bacterial Proteins/chemistry; Brucella/chemistry; DNA/chemistry; Virulence Factors/chemistry; Amino Acid Motifs; Bacterial Proteins/metabolism; Binding Sites; Brucella/pathogenicity; DNA/metabolism; Molecular Docking Simulation; Molecular Dynamics Simulation; Nucleotide Motifs; Protein Binding; Protein Conformation, alpha-Helical; Protein Conformation, beta-Strand; Protein Interaction Domains and Motifs; Structural Homology, Protein; Thermodynamics; Virulence Factors/metabolism

Key words

BvrR; Gibbs sampling; MD simulation; protein structure prediction; protein-DNA docking

Fulltext

XML

PubMed Links

Search on Google

Full text: 1 Collection: 01-internacional Database: MEDLINE Main subject: Bacterial Proteins / Brucella / DNA / Virulence Factors Type of study: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Language: En Journal: Molecules Journal subject: BIOLOGIA Year: 2019 Type: Article Affiliation country: Mexico

Fulltext

XML

PubMed Links

Search on Google