Platform-independent and label-free quantitation of proteomic data using MS1 extracted ion chromatograms in skyline: application to protein acetylation and phosphorylation.

Schilling, Birgit; Rardin, Matthew J; MacLean, Brendan X; Zawadzka, Anna M; Frewen, Barbara E; Cusack, Michael P; Sorensen, Dylan J; Bereman, Michael S; Jing, Enxuan; Wu, Christine C; Verdin, Eric; Kahn, C Ronald; Maccoss, Michael J; Gibson, Bradford W

Schilling, Birgit; Rardin, Matthew J; MacLean, Brendan X; Zawadzka, Anna M; Frewen, Barbara E; Cusack, Michael P; Sorensen, Dylan J; Bereman, Michael S; Jing, Enxuan; Wu, Christine C; Verdin, Eric; Kahn, C Ronald; Maccoss, Michael J; Gibson, Bradford W.

Afiliación

Schilling B; Buck Institute for Research on Aging, Novato, California 94945, USA.

Mol Cell Proteomics ; 11(5): 202-14, 2012 May.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-22454539

Asunto(s)

Mapeo Peptídico/métodos; Procesamiento Proteico-Postraduccional; Proteoma/metabolismo; Programas Informáticos; Acetilación; Secuencia de Aminoácidos; Animales; Neoplasias de la Mama; Calibración/normas; Línea Celular Tumoral; Cromatografía Líquida de Alta Presión; Medios de Cultivo Condicionados/química; Femenino; Análisis de Fourier; Humanos; Ratones; Ratones Noqueados; Mitocondrias Hepáticas/enzimología; Mitocondrias Musculares/metabolismo; Datos de Secuencia Molecular; Fragmentos de Péptidos/química; Fosforilación; Proteoma/química; Proteoma/aislamiento & purificación; Proteómica; Complejo Piruvato Deshidrogenasa/química; Complejo Piruvato Deshidrogenasa/aislamiento & purificación; Complejo Piruvato Deshidrogenasa/metabolismo; Estándares de Referencia; Espectrometría de Masas en Tándem/normas

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Mapeo Peptídico / Programas Informáticos / Procesamiento Proteico-Postraduccional / Proteoma Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals / Female / Humans Idioma: En Revista: Mol Cell Proteomics Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / BIOQUIMICA Año: 2012 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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