Piphillin predicts metagenomic composition and dynamics from DADA2-corrected 16S rDNA sequences.

Narayan, Nicole R; Weinmaier, Thomas; Laserna-Mendieta, Emilio J; Claesson, Marcus J; Shanahan, Fergus; Dabbagh, Karim; Iwai, Shoko; DeSantis, Todd Z

Narayan, Nicole R; Weinmaier, Thomas; Laserna-Mendieta, Emilio J; Claesson, Marcus J; Shanahan, Fergus; Dabbagh, Karim; Iwai, Shoko; DeSantis, Todd Z.

Afiliación

Narayan NR; Informatics Department, Second Genome Inc., South San Francisco, California, USA.
Weinmaier T; Informatics Department, Second Genome Inc., South San Francisco, California, USA.
Laserna-Mendieta EJ; APC Microbiome Ireland, University College Cork, Co., Cork, Ireland.
Claesson MJ; School of Microbiology, University College Cork, Co., Cork, Ireland.
Shanahan F; APC Microbiome Ireland, University College Cork, Co., Cork, Ireland.
Dabbagh K; School of Microbiology, University College Cork, Co., Cork, Ireland.
Iwai S; APC Microbiome Ireland, University College Cork, Co., Cork, Ireland.
DeSantis TZ; Department of Medicine, University College Cork, Co., Cork, Ireland.

BMC Genomics ; 21(1): 56, 2020 Jan 17.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31952477

Asunto(s)

Metagenómica/métodos; ARN Ribosómico 16S/genética; Análisis de Secuencia de ADN/métodos; Programas Informáticos; Bases de Datos de Ácidos Nucleicos

Palabras clave

Genomic databases; Metagenomics; Phylogenetic analysis; Sequence alignment; Shotgun sequencing

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / ARN Ribosómico 16S / Análisis de Secuencia de ADN / Metagenómica Tipo de estudio: Evaluation_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: BMC Genomics Asunto de la revista: GENETICA Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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