SLR-superscaffolder: a de novo scaffolding tool for synthetic long reads using a top-to-bottom scheme.

Guo, Lidong; Xu, Mengyang; Wang, Wenchao; Gu, Shengqiang; Zhao, Xia; Chen, Fang; Wang, Ou; Xu, Xun; Seim, Inge; Fan, Guangyi; Deng, Li; Liu, Xin

Guo, Lidong; Xu, Mengyang; Wang, Wenchao; Gu, Shengqiang; Zhao, Xia; Chen, Fang; Wang, Ou; Xu, Xun; Seim, Inge; Fan, Guangyi; Deng, Li; Liu, Xin.

Afiliación

Guo L; BGI Education Center, University of Chinese Academy of Sciences, Shenzhen, 518083, China.
Xu M; BGI-Qingdao, BGI-Shenzhen, Qingdao, 266555, China.
Wang W; State Key Laboratory of Agricultural Genomics, BGI-Shenzhen, Shenzhen, 518083, China.
Gu S; BGI-Qingdao, BGI-Shenzhen, Qingdao, 266555, China.
Zhao X; State Key Laboratory of Agricultural Genomics, BGI-Shenzhen, Shenzhen, 518083, China.
Chen F; BGI-Shenzhen, Shenzhen, 518083, China.
Wang O; China National GeneBank, BGI-Shenzhen, Shenzhen, 518120, China.
Xu X; BGI-Qingdao, BGI-Shenzhen, Qingdao, 266555, China.
Seim I; BGI Education Center, University of Chinese Academy of Sciences, Shenzhen, 518083, China.
Fan G; MGI, BGI-Shenzhen, Shenzhen, 518083, China.
Deng L; MGI, BGI-Shenzhen, Shenzhen, 518083, China.
Liu X; BGI-Shenzhen, Shenzhen, 518083, China.

BMC Bioinformatics ; 22(1): 158, 2021 Mar 25.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33765921

Asunto(s)

Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Programas Informáticos; Algoritmos; Genómica; Humanos; Análisis de Secuencia de ADN

Palabras clave

Genome assembly; Next-generation sequencing; Scaffolding; Synthetic long reads

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Límite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: China

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