Aprimoramento da anotação N-terminal de proteínas através da predição de peptídeo sinal em proteínas ortólogase desenvolvimento de uma ferramenta automática para a identificação de grupos ortólogos contendo erros deanotação / Improved annotation of N-terminal protein through the prediction of signal peptide in orthologous proteins and developing a tool for automatic Identification of orthologs groups containing errors annotation
Belo Horizonte; s.n; 2012. 107 p. ilus.
Thesis
em Pt
| LILACS
| ID: lil-671207
Biblioteca responsável:
BR1719.1
Localização: BR1719.1; 616.936 2, M541a, 2012
RESUMO
O peptídeo sinal é um motivo encontrado, geralmente, na extremidade N-terminal deproteínas e a sua presença determina a entrada na via clássica de transporte intracelular,após a translocação da proteína para o lúmen do retículo endoplasmático. Portanto, apresença ou ausência do peptídeo sinal influencia a função biológica de uma proteína ao serum fator determinante da sua localização subcelular. Como a conservação de função entreproteínas ortólogas é esperada, foi hipotetizado que a localização subcelular e,consequentemente, a presença do peptídeo sinal deveriam, também, se apresentarconservadas. Partindo desta premissa, as predições de peptídeo sinal em proteínasortólogas de cinco espécies de Plasmodium foram analisadas.Predições de peptídeo sinal (SignalP) e informações de ortologia (OrthoMCL-DB)para proteínas de cinco espécies do gênero Plasmodium (Plasmodium falciparum,Plasmodium vivax, Plasmodium knowlesi, Plasmodium berguei e Plasmodium yoelii) foramcombinadas em uma estratégia inovadora, visando a identificação de grupos de proteínasortólogas que apresentam predições de peptídeo sinal divergentes (grupos Mistos).
Texto completo:
1
Coleções:
01-internacional
Base de dados:
LILACS
Assunto principal:
Peptídeos
/
Plasmodium
/
Malária
Tipo de estudo:
Diagnostic_studies
/
Prognostic_studies
/
Risk_factors_studies
Limite:
Female
/
Humans
/
Male
Idioma:
Pt
Ano de publicação:
2012
Tipo de documento:
Thesis