Identification of functional clusters of transcription factor binding motifs in genome sequences: the MSCAN algorithm.

Johansson, O; Alkema, W; Wasserman, W W; Lagergren, J

Johansson, O; Alkema, W; Wasserman, W W; Lagergren, J.

Afiliação

Johansson O; Department of Computer Science and Engineering, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093-0114, USA.

Bioinformatics ; 19 Suppl 1: i169-76, 2003.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-12855453

Assuntos

Algoritmos; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Proteoma/genética; Proteoma/metabolismo; Sequências Reguladoras de Ácido Nucleico/genética; Análise de Sequência de DNA/métodos; Fatores de Transcrição/genética; Motivos de Aminoácidos/genética; Animais; Células Cultivadas; Análise por Conglomerados; Técnicas de Cultura; Regulação da Expressão Gênica/fisiologia; Humanos; Fígado/metabolismo; Músculo Esquelético/metabolismo; Ligação Proteica; Alinhamento de Sequência/métodos; Homologia de Sequência; Takifugu/genética; Fatores de Transcrição/classificação; Fatores de Transcrição/metabolismo

Buscar no Google

Imprimir

XML

PubMed Links

Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fatores de Transcrição / Algoritmos / Sequências Reguladoras de Ácido Nucleico / Análise de Sequência de DNA / Proteoma / Perfilação da Expressão Gênica Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Evaluation_studies / Prognostic_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2003 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

Buscar no Google

Imprimir

XML

PubMed Links