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Prediction of G-protein-coupled receptor classes in low homology using Chou's pseudo amino acid composition with approximate entropy and hydrophobicity patterns.
Gu, Q; Ding, Y S; Zhang, T L.
Afiliação
  • Gu Q; College of Information Sciences and Technology, Donghua University, Shanghai 201620, China.
Protein Pept Lett ; 17(5): 559-67, 2010 May.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-19594431
We use approximate entropy and hydrophobicity patterns to predict G-protein-coupled receptors. Adaboost classifier is adopted as the prediction engine. A low homology dataset is used to validate the proposed method. Compared with the results reported, the successful rate is encouraging. The source code is written by Matlab.
Assuntos
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Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Receptores Acoplados a Proteínas G / Aminoácidos Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Animals Idioma: En Revista: Protein Pept Lett Assunto da revista: BIOQUIMICA Ano de publicação: 2010 Tipo de documento: Article País de afiliação: China
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