De novo motif identification improves the accuracy of predicting transcription factor binding sites in ChIP-Seq data analysis.

Boeva, Valentina; Surdez, Didier; Guillon, Noëlle; Tirode, Franck; Fejes, Anthony P; Delattre, Olivier; Barillot, Emmanuel

Boeva, Valentina; Surdez, Didier; Guillon, Noëlle; Tirode, Franck; Fejes, Anthony P; Delattre, Olivier; Barillot, Emmanuel.

Afiliação

Boeva V; Institut Curie, 26 rue d'Ulm, Paris, France.

Nucleic Acids Res ; 38(11): e126, 2010 Jun.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-20375099

Assuntos

Algoritmos; Imunoprecipitação da Cromatina/métodos; Elementos Reguladores de Transcrição; Análise de Sequência de DNA; Fatores de Transcrição/metabolismo; Sequência de Bases; Sítios de Ligação; Linhagem Celular Tumoral; Sequência Consenso; Humanos; Proteínas de Fusão Oncogênica/metabolismo; Proteína Proto-Oncogênica c-fli-1/metabolismo; Proteína EWS de Ligação a RNA

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fatores de Transcrição / Algoritmos / Análise de Sequência de DNA / Imunoprecipitação da Cromatina / Elementos Reguladores de Transcrição Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Evaluation_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Nucleic Acids Res Ano de publicação: 2010 Tipo de documento: Article País de afiliação: França

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