Twenty-one genome sequences from Pseudomonas species and 19 genome sequences from diverse bacteria isolated from the rhizosphere and endosphere of Populus deltoides.

Brown, Steven D; Utturkar, Sagar M; Klingeman, Dawn M; Johnson, Courtney M; Martin, Stanton L; Land, Miriam L; Lu, Tse-Yuan S; Schadt, Christopher W; Doktycz, Mitchel J; Pelletier, Dale A

Brown, Steven D; Utturkar, Sagar M; Klingeman, Dawn M; Johnson, Courtney M; Martin, Stanton L; Land, Miriam L; Lu, Tse-Yuan S; Schadt, Christopher W; Doktycz, Mitchel J; Pelletier, Dale A.

Afiliação

Brown SD; Biosciences Division, Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, Tennessee, USA. brownsd@ornl.gov

J Bacteriol ; 194(21): 5991-3, 2012 Nov.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-23045501

ABSTRACT

ABSTRACT

To aid in the investigation of the Populus deltoides microbiome, we generated draft genome sequences for 21 Pseudomonas strains and 19 other diverse bacteria isolated from Populus deltoides roots. Genome sequences for isolates similar to Acidovorax, Bradyrhizobium, Brevibacillus, Caulobacter, Chryseobacterium, Flavobacterium, Herbaspirillum, Novosphingobium, Pantoea, Phyllobacterium, Polaromonas, Rhizobium, Sphingobium, and Variovorax were generated.

Assuntos

Bactérias/genética; DNA Bacteriano/química; DNA Bacteriano/genética; Genoma Bacteriano; Análise de Sequência de DNA; Bactérias/isolamento & purificação; Endófitos/genética; Endófitos/isolamento & purificação; Metagenoma; Dados de Sequência Molecular; Raízes de Plantas/microbiologia; Populus/microbiologia; Rizosfera; Microbiologia do Solo

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / DNA Bacteriano / Genoma Bacteriano / Análise de Sequência de DNA Idioma: En Revista: J Bacteriol Ano de publicação: 2012 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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