ConBind: motif-aware cross-species alignment for the identification of functional transcription factor binding sites.

Lelieveld, Stefan H; Schütte, Judith; Dijkstra, Maurits J J; Bawono, Punto; Kinston, Sarah J; Göttgens, Berthold; Heringa, Jaap; Bonzanni, Nicola

Lelieveld, Stefan H; Schütte, Judith; Dijkstra, Maurits J J; Bawono, Punto; Kinston, Sarah J; Göttgens, Berthold; Heringa, Jaap; Bonzanni, Nicola.

Afiliação

Lelieveld SH; Centre for Integrative Bioinformatics VU, VU University Amsterdam, Amsterdam 1081 HV, The Netherlands Department of Human Genetics, Radboud Institute for Molecular Life Sciences, Radboud University Medical Center, Nijmegen 6525 GA, The Netherlands.
Schütte J; Department of Haematology, Wellcome Trust-MRC Cambridge Stem Cell Institute & Cambridge Institute for Medical Research, Cambridge University, Cambridge CB2 0XY, UK Klinik für Hämatologie, Universitätsklinik Essen 45147, Germany.
Dijkstra MJ; Centre for Integrative Bioinformatics VU, VU University Amsterdam, Amsterdam 1081 HV, The Netherlands.
Bawono P; Centre for Integrative Bioinformatics VU, VU University Amsterdam, Amsterdam 1081 HV, The Netherlands.
Kinston SJ; Department of Haematology, Wellcome Trust-MRC Cambridge Stem Cell Institute & Cambridge Institute for Medical Research, Cambridge University, Cambridge CB2 0XY, UK.
Göttgens B; Department of Haematology, Wellcome Trust-MRC Cambridge Stem Cell Institute & Cambridge Institute for Medical Research, Cambridge University, Cambridge CB2 0XY, UK bg200@cam.ac.uk.
Heringa J; Centre for Integrative Bioinformatics VU, VU University Amsterdam, Amsterdam 1081 HV, The Netherlands j.heringa@vu.nl.
Bonzanni N; Centre for Integrative Bioinformatics VU, VU University Amsterdam, Amsterdam 1081 HV, The Netherlands Computational Cancer Biology Group, Division of Molecular Carcinogenesis, The Netherlands Cancer Institute, Amsterdam 1066 CX, The Netherlands ENPICOM, Eindhoven 5632 CW, The Netherlands n.bonzanni@

Nucleic Acids Res ; 44(8): e72, 2016 05 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26721389

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Proteínas de Ligação a DNA/metabolismo; Elementos Facilitadores Genéticos/genética; Regiões Promotoras Genéticas/genética; Alinhamento de Sequência/métodos; Fatores de Transcrição/metabolismo; Animais; Sequência de Bases; Sítios de Ligação/genética; Regulação da Expressão Gênica/genética; Humanos; Análise de Sequência de DNA

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fatores de Transcrição / Alinhamento de Sequência / Elementos Facilitadores Genéticos / Regiões Promotoras Genéticas / Biologia Computacional / Proteínas de Ligação a DNA Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Nucleic Acids Res Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article País de afiliação: Holanda

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