Allele-specific SHAPE-MaP assessment of the effects of somatic variation and protein binding on mRNA structure.

Lackey, Lela; Coria, Aaztli; Woods, Chanin; McArthur, Evonne; Laederach, Alain

Lackey, Lela; Coria, Aaztli; Woods, Chanin; McArthur, Evonne; Laederach, Alain.

Afiliação

Lackey L; Department of Biology, University of North Carolina, Chapel Hill, North Carolina 27599, USA.
Coria A; Department of Biology, University of North Carolina, Chapel Hill, North Carolina 27599, USA.
Woods C; Department of Biology, University of North Carolina, Chapel Hill, North Carolina 27599, USA.
McArthur E; School of Medicine, Vanderbilt University, Nashville, Tennessee 37232, USA.
Laederach A; Department of Biology, University of North Carolina, Chapel Hill, North Carolina 27599, USA.

RNA ; 24(4): 513-528, 2018 04.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29317542

Assuntos

Biomarcadores Tumorais/genética; Proteínas dos Microfilamentos/genética; Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética; Dobramento de RNA/fisiologia; RNA Mensageiro/genética; Alelos; Sequência de Bases; Linhagem Celular; Bases de Dados Genéticas; Variação Genética/genética; Células HEK293; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Humanos; RNA Mensageiro/química; Proteínas de Ligação a RNA/genética; Termodinâmica; Proteína Tumoral 1 Controlada por Tradução

Palavras-chave

LCP1; RNA secondary structure; SHAPE-MaP; TPT1; riboSNitch; somatic mutation

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA Mensageiro / Biomarcadores Tumorais / Polimorfismo de Nucleotídeo Único / Dobramento de RNA / Proteínas dos Microfilamentos Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: RNA Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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