Deep-learning augmented RNA-seq analysis of transcript splicing.

Zhang, Zijun; Pan, Zhicheng; Ying, Yi; Xie, Zhijie; Adhikari, Samir; Phillips, John; Carstens, Russ P; Black, Douglas L; Wu, Yingnian; Xing, Yi

Zhang, Zijun; Pan, Zhicheng; Ying, Yi; Xie, Zhijie; Adhikari, Samir; Phillips, John; Carstens, Russ P; Black, Douglas L; Wu, Yingnian; Xing, Yi.

Afiliação

Zhang Z; Bioinformatics Interdepartmental Graduate Program, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, USA.
Pan Z; Bioinformatics Interdepartmental Graduate Program, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, USA.
Ying Y; Department of Microbiology, Immunology & Molecular Genetics, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, USA.
Xie Z; Department of Microbiology, Immunology & Molecular Genetics, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, USA.
Adhikari S; Department of Microbiology, Immunology & Molecular Genetics, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, USA.
Phillips J; Center for Computational and Genomic Medicine, The Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, USA.
Carstens RP; Department of Molecular and Medical Pharmacology, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, USA.
Black DL; Department of Medicine, University of Pennsylvania, Philadelphia, PA, USA.
Wu Y; Department of Microbiology, Immunology & Molecular Genetics, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, USA.
Xing Y; Department of Statistics, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, USA.

Nat Methods ; 16(4): 307-310, 2019 04.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30923373

Assuntos

Aprendizado Profundo; Splicing de RNA; RNA/análise; Análise de Sequência de RNA; Algoritmos; Processamento Alternativo; Teorema de Bayes; Epigenômica; Éxons; Perfilação da Expressão Gênica; Regulação da Expressão Gênica; Células Hep G2; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Humanos; Células K562; Modelos Estatísticos; RNA/genética; Reprodutibilidade dos Testes; Processamento de Sinais Assistido por Computador

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA / Splicing de RNA / Análise de Sequência de RNA / Aprendizado Profundo Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Nat Methods Assunto da revista: TECNICAS E PROCEDIMENTOS DE LABORATORIO Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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