Sierra: discovery of differential transcript usage from polyA-captured single-cell RNA-seq data.

Patrick, Ralph; Humphreys, David T; Janbandhu, Vaibhao; Oshlack, Alicia; Ho, Joshua W K; Harvey, Richard P; Lo, Kitty K

Patrick, Ralph; Humphreys, David T; Janbandhu, Vaibhao; Oshlack, Alicia; Ho, Joshua W K; Harvey, Richard P; Lo, Kitty K.

Afiliação

Patrick R; Victor Chang Cardiac Research Institute, 405 Liverpool St., Darlinghurst, 2010, Australia.
Humphreys DT; St. Vincent's Clinical School, UNSW Sydney, Kensington, 2052, Australia.
Janbandhu V; Victor Chang Cardiac Research Institute, 405 Liverpool St., Darlinghurst, 2010, Australia.
Oshlack A; St. Vincent's Clinical School, UNSW Sydney, Kensington, 2052, Australia.
Ho JWK; Victor Chang Cardiac Research Institute, 405 Liverpool St., Darlinghurst, 2010, Australia.
Harvey RP; St. Vincent's Clinical School, UNSW Sydney, Kensington, 2052, Australia.
Lo KK; Murdoch Children's Research Institute, Parkville, 3052, Victoria, Australia.

Genome Biol ; 21(1): 167, 2020 07 08.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32641141

Assuntos

Regiões 3' não Traduzidas; Regulação da Expressão Gênica; Análise de Sequência de RNA; Análise de Célula Única; Software; Animais; Humanos; Leucócitos Mononucleares/metabolismo; Camundongos; Miocárdio/metabolismo; Poli A

Palavras-chave

Alternative polyadenylation; Differential transcript use; mRNA isoforms; scRNA-seq

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Regulação da Expressão Gênica / Análise de Sequência de RNA / Regiões 3' não Traduzidas / Análise de Célula Única Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Genome Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Austrália

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google