Simple oligonucleotide-based multiplexing of single-cell chromatin accessibility.

Wang, Kaile; Xiao, Zhenna; Yan, Yun; Ye, Rui; Hu, Min; Bai, Shanshan; Sei, Emi; Qiao, Yawei; Chen, Hui; Lim, Bora; Lin, Steven H; Navin, Nicholas E

Wang, Kaile; Xiao, Zhenna; Yan, Yun; Ye, Rui; Hu, Min; Bai, Shanshan; Sei, Emi; Qiao, Yawei; Chen, Hui; Lim, Bora; Lin, Steven H; Navin, Nicholas E.

Afiliação

Wang K; Department of Genetics, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA.
Xiao Z; Department of Genetics, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA.
Yan Y; Department of Genetics, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA; Graduate School of Biological Sciences, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA.
Ye R; Graduate School of Biological Sciences, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA; Department of Radiation Oncology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA.
Hu M; Department of Genetics, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA.
Bai S; Department of Genetics, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA.
Sei E; Department of Genetics, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA.
Qiao Y; Department of Radiation Oncology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA.
Chen H; Department of Pathology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA.
Lim B; Department of Breast Medical Oncology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA.
Lin SH; Graduate School of Biological Sciences, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA; Department of Radiation Oncology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA.
Navin NE; Department of Genetics, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA; Graduate School of Biological Sciences, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA; Department of Bioinformatics and Computational Biology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA. Electronic address

Mol Cell ; 81(20): 4319-4332.e10, 2021 10 21.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34686316

Assuntos

Montagem e Desmontagem da Cromatina; Cromatina/metabolismo; Epigênese Genética; Regulação Neoplásica da Expressão Gênica; Heterogeneidade Genética; Neoplasias Pulmonares/metabolismo; Análise de Célula Única; Fatores de Transcrição/metabolismo; Animais; Antineoplásicos/farmacologia; Quimiorradioterapia; Cromatina/genética; Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação; Feminino; Humanos; Células K562; Cinética; Neoplasias Pulmonares/genética; Neoplasias Pulmonares/patologia; Neoplasias Pulmonares/terapia; Masculino; Camundongos da Linhagem 129; RNA-Seq; Dosagem Radioterapêutica; Fatores de Transcrição/genética

Palavras-chave

SNuBar; cell-type-specific transcription factors; multiplexing therapy combinations; single-cell ATAC sequencing; single-cell multiomics multiplexing; single-cell multiomics sequencing; single-cell multiplexing; spatial epigenetic heterogeneity

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fatores de Transcrição / Cromatina / Regulação Neoplásica da Expressão Gênica / Heterogeneidade Genética / Montagem e Desmontagem da Cromatina / Epigênese Genética / Análise de Célula Única / Neoplasias Pulmonares Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals / Female / Humans / Male Idioma: En Revista: Mol Cell Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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