TraSig: inferring cell-cell interactions from pseudotime ordering of scRNA-Seq data.

Li, Dongshunyi; Velazquez, Jeremy J; Ding, Jun; Hislop, Joshua; Ebrahimkhani, Mo R; Bar-Joseph, Ziv

Li, Dongshunyi; Velazquez, Jeremy J; Ding, Jun; Hislop, Joshua; Ebrahimkhani, Mo R; Bar-Joseph, Ziv.

Afiliação

Li D; Computational Biology Department, School of Computer Science, Carnegie Mellon Universit, Pittsburgh, 15213, PA, USA.
Velazquez JJ; Department of Pathology, School of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, 15213, PA, USA.
Ding J; Pittsburgh Liver Research Center, University of Pittsburgh, Pittsburgh, 15261, PA, USA.
Hislop J; Meakins-Christie Laboratories, Department of Medicine, McGill University Health Centre, Montreal, H4A 3J1, Quebec, Canada.
Ebrahimkhani MR; Department of Pathology, School of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, 15213, PA, USA.
Bar-Joseph Z; Pittsburgh Liver Research Center, University of Pittsburgh, Pittsburgh, 15261, PA, USA.

Genome Biol ; 23(1): 73, 2022 03 07.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-35255944

Assuntos

Perfilação da Expressão Gênica; Análise de Célula Única; Comunicação Celular; Análise de Sequência de RNA; Software

Palavras-chave

Cell-cell interactions; Development; Gene expression

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Perfilação da Expressão Gênica / Análise de Célula Única Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Genome Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google