LRcell: detecting the source of differential expression at the sub-cell-type level from bulk RNA-seq data.

Ma, Wenjing; Sharma, Sumeet; Jin, Peng; Gourley, Shannon L; Qin, Zhaohui S

Ma, Wenjing; Sharma, Sumeet; Jin, Peng; Gourley, Shannon L; Qin, Zhaohui S.

Afiliação

Ma W; Department of Computer Science, Emory University, 400 Dowman Drive, Atlanta, GA 30322, USA.
Sharma S; Graduate Program in Neuroscience, Emory University, 1462 Clifton Road NE, Atlanta, GA 30322, USA.
Jin P; Department of Human Genetics, Emory University, 1365 Clifton Road, Atlanta, GA 30322, USA.
Gourley SL; Department of Pediatrics, School of Medicine, Emory University, 100 Woodruff Circle, Atlanta, GA 30322, USA; Yerkes National Primate Research Center, Atlanta, GA 30322, USA.
Qin ZS; Department of Computer Science, Emory University, 400 Dowman Drive, Atlanta, GA 30322, USA.

Brief Bioinform ; 23(3)2022 05 13.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-35272348

Assuntos

Perfilação da Expressão Gênica; Análise de Célula Única; Simulação por Computador; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Humanos; RNA-Seq; Reprodutibilidade dos Testes; Análise de Sequência de RNA/métodos; Análise de Célula Única/métodos

Palavras-chave

cell marker genes; cell-type enrichment; differential gene expression

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Perfilação da Expressão Gênica / Análise de Célula Única Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Brief Bioinform Assunto da revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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