Estimating the relative proportions of SARS-CoV-2 haplotypes from wastewater samples.

Pipes, Lenore; Chen, Zihao; Afanaseva, Svetlana; Nielsen, Rasmus

Pipes, Lenore; Chen, Zihao; Afanaseva, Svetlana; Nielsen, Rasmus.

Afiliação

Pipes L; Department of Integrative Biology, University of California-Berkeley, 4098 Valley Life Sciences Building, Berkeley, CA 94720, USA.
Chen Z; School of Mathematical Sciences, Peking University, Beijing 100871, China.
Afanaseva S; Department of Integrative Biology, University of California-Berkeley, 4098 Valley Life Sciences Building, Berkeley, CA 94720, USA.
Nielsen R; Department of Integrative Biology, University of California-Berkeley, 4098 Valley Life Sciences Building, Berkeley, CA 94720, USA.

Cell Rep Methods ; 2(10): 100313, 2022 10 24.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-36159190

Assuntos

COVID-19; SARS-CoV-2; Humanos; SARS-CoV-2/genética; COVID-19/epidemiologia; Haplótipos; Filogenia; RNA Viral/genética; Águas Residuárias; Vigilância Epidemiológica Baseada em Águas Residuárias; Funções Verossimilhança

Palavras-chave

COVID-19; SARS-CoV-2; expectation maximization; imputation; wastewater surveillance; wastewater-based epidemiology

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: SARS-CoV-2 / COVID-19 Limite: Humans Idioma: En Revista: Cell Rep Methods Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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