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Int. microbiol ; 9(4): 259-266, dic. 2006. ilus, tab
Artigo em Inglês | IBECS | ID: ibc-055834

RESUMO

Communities of green sulfur bacteria were studied in selected marine and saline habitats on the basis of gene sequences of 16S rRNA and the Fenna- Matthews-Olson (FMO) protein. The availability of group-specific primers for both 16S rDNA and the fmoA gene, which is unique to green sulfur bacteria, has, for the first time, made it possible to analyze environmental communities of these bacteria by culture-independent methods using two independent genetic markers. Sequence results obtained with fmoA genes and with 16S rDNA were largely congruent to each other. All of the 16S rDNA and fmoA sequences from habitats of the Baltic Sea, the Mediterranean Sea, Sippewissett Salt Marsh (Massachusetts, USA), and Bad Water (Death Valley, California, USA) were found within salt-dependent phylogenetic lines of green sulfur bacteria established by pure culture studies. This strongly supports the existence of phylogenetic lineages of green sulfur bacteria specifically adapted to marine and saline environments and the exclusive occurrence of these bacteria in marine and saline habitats. The great majority of clone sequences belonged to different clusters of the Prosthecochloris genus and probably represent different species. Evidence for the occurrence of two new species of Prosthecochloris was also obtained. Different habitats were dominated by representatives from the Prosthecochloris group and different clusters or species of this genus were found either exclusively or as the clearly dominant green sulfur bacterium at different habitats (AU)


Se han estudiado las comunidades de bacterias verdes del azufre en hábitats marinos o salinos seleccionadas a partir de las secuencias de genes del rRNA 16S y de la proteína Fenna-Matthews-Olson (FMO). La disponibilidad de cebadores específicos de grupo para el rDNA 16S y para el gen fmoA, que es exclusivo de las bacterias verdes del azufre, ha permitido por primera vez analizar las comunidades naturales de estas bacterias por métodos que no requieren cultivo usando dos marcadores genéticos independientes. Los resultados de la secuencia obtenidos con los genes fmoA y con rDNA 16S concordaban entre sí. Todas las secuencias de rDNA 16S y fmoA procedentes de hábitats del mar Báltico, del Mediterráneo, de las salinas de Sippewissett (Massachusetts, EE UU) y de Bad Water (Death Valley, California, EE UU) se encuentran en las líneas filogenéticas dependientes de sal de las bacterias verdes del azufre establecidas mediante estudios de cultivo puro. Esta constatación respalda la existencia de linajes filogenéticos de bacterias verdes del azufre adaptadas específicamente a medios marinos o salinos y a su distribución exclusiva en tales ambientes. La gran mayoría de secuencias clónicas pertenece a agrupaciones genéticas (clusters) del género Prosthecochloris y probablemente representan especies diferentes. Se han conseguido pruebas de la presencia de dos nuevas especies de Prosthecochloris. En diversos hábitats dominaban representantes del grupo Prosthecochloris y varias agrupaciones genéticas o especies de ese género eran exclusivos de esos hábitats o bien eran las bacterias verdes del azufre claramente dominantes en ellos (AU)


Assuntos
Chlorobi/isolamento & purificação , RNA Ribossômico 16S/análise , Proteínas de Bactérias/genética , Ecossistema , Complexos de Proteínas Captadores de Luz/genética , Águas Salinas/análise , Água do Mar/análise , Variação Genética , Filogenia
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