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4.
Med. clín (Ed. impr.) ; 152(8): 317-323, abr. 2019. ilus, tab
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-183611

RESUMO

Mycobacterium chimaera (M. chimaera) es una micobacteria no tuberculosa del complejo Mycobacterium avium complex. Desde 2013 hasta abril de 2018 se han identificado más de 140 casos de infección grave por M. chimaera, todos ellos en pacientes sometidos a cirugía cardiotorácica con circulación extracorpórea. Las investigaciones epidemiológicas han mostrado que la mayoría de las infecciones tienen una fuente común: módulos de normo-hipotermia contaminados. Estos aparatos poseen en su interior un circuito de agua y ventiladores de enfriamiento que producen un aerosol, que puede contener M. chimaera, contaminar el aire del quirófano y transmitirse al paciente. La sintomatología clínica puede tardar meses, incluso años, en aparecer tras la cirugía extracorpórea, con una media de 1,5 años, y en general se presenta en forma de síntomas constitucionales. La sarcoidosis es la entidad descrita con mayor frecuencia como error diagnóstico en estos pacientes, por lo que es necesario mantener una elevada sospecha diagnóstica en todos aquellos pacientes con antecedente de cirugía cardíaca con circulación extracorpórea


Mycobacterium chimaera (M. chimaera) is a non-tuberculous mycobacterium of the Mycobacterium avium complex. Between 2013 and April 2018, more than 140 cases of severe infection have been identified, all of them in patients who had undergone cardiothoracic surgery with extracorporeal circulation. The epidemiological investigations have shown that the majority of infections have a common source: contaminated normo-hypothermia modules. These devices have a water circuit inside and cooling fans that produce an aerosol, which can be contaminated with M. chimaera, and disperse it into the air in the operating room. The clinical symptoms can take months, even years to appear after the extracorporeal surgery, with an average of 1.5 years. Sarcoidosis is the most frequently described entity as a misdiagnosis in these patients, so it is necessary to maintain a high diagnostic suspicion in all patients with a history of cardiac surgery with extracorporeal circulation


Assuntos
Humanos , Circulação Extracorpórea/efeitos adversos , Procedimentos Cirúrgicos Cardíacos/efeitos adversos , Infecção Hospitalar/microbiologia , Contaminação de Equipamentos , Mycobacterium/classificação , Mycobacterium/isolamento & purificação , Infecções por Mycobacterium/microbiologia , Infecções por Mycobacterium/diagnóstico
6.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 36(10): 640-643, dic. 2018. tab, graf
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-176929

RESUMO

INTRODUCCIÓN: La linfadenitis cervical es la infección más frecuente por micobacterias no tuberculosas (MNT) en niños inmunocompetentes, principalmente menores de 5 años. Durante años se ha considerado a Mycobacterium lentiflavum (M. lentiflavum) una inusual MNT causante de esta patología. MÉTODOS: Se realizó un estudio retrospectivo, observacional desde 2009 a 2016, que incluyó a pacientes pediátricos del Hospital Infantil Universitario Niño Jesús de Madrid, diagnosticados clínicamente y microbiológicamente de linfadenitis cervical por MNT. RESULTADOS: En el periodo estudiado se registraron 28 casos de linfadenitis cervical. En 23 (82,14%) pacientes se aisló M. lentiflavum y en 5 (17,85%), Mycobacterium avium. De los 23 pacientes con infección por M. lentiflavum, la localización más frecuente fue la submandibular (43,47%), 15 (65,21%) fueron niños, la media de edad global fue de 30,8 meses y todos los casos evolucionaron satisfactoriamente. CONCLUSIÓN: M. lentiflavum debe ser considerado como un importante patógeno emergente causante de linfadenitis cervical en población pediátrica


INTRODUCTION: Cervical lymphadenitis is the most common nontuberculous mycobacteria (NTM) infection in immunocompetent children, mainly in those under 5years. For many years Mycobacterium lentiflavum (M. lentiflavum) has been considered a rare NTM causing lymphadenitis. METHODS: A restrospective study was performed in pediatric patients with microbiologically confirmed NTM cervical lympahdenitis at the Niño Jesús Hospital in Madrid during 2009-2016. RESULTS: During the period studied, 28 cases of cervical lymphadenitis were recorded. In 23 (82.14%) and in 5 (17,85%) cases, M. lentiflavum and Mycobacterium avium were isolated, respectively. In those patients infected with M. lentiflavum, the most frequent location was sub-maxilar (43.47%); 15 (65.21%) were boys, global median age was 30,8 months and all cases showed a satisfactory evolution. CONCLUSION: We propose that M. lentiflavum should be considered an important emergent pathogen cause of cervical lymphadenitis in the pediatric population


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Lactente , Pré-Escolar , Tuberculose dos Linfonodos/microbiologia , Tuberculose dos Linfonodos/diagnóstico , Mycobacterium/classificação , Mycobacterium/isolamento & purificação , Estudos Retrospectivos , Biópsia por Agulha Fina , Estudo Observacional
10.
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-176518

RESUMO

La aplicación de técnicas de genotipificación ha permitido discriminar entre los aislados de Mycobacterium tuberculosis obtenidos en el laboratorio. Esta singularización a nivel de cepa abrió las puertas a estudios de epidemiología molecular que han permitido progresar en nuestro conocimiento de la transmisión de este patógeno en entornos socio-epidemiológicos cada vez más complejos. La estabilidad genética de este microorganismo ha llevado al desarrollo de metodologías específicas, que son revisadas en detalle en este capítulo. Además de las aplicaciones epidemiológicas, repasamos cómo dan respuesta asimismo a diversos interrogantes diagnósticos y clínicos. Por último, nos ocupamos de describir la nueva revolución genómica en el estudio de la tuberculosis, los métodos en los que descansa y las posibilidades inéditas que ofrece, incluyendo nuevas vías de integración de los lenguajes moleculares y genómicos en propuestas innovadoras de trabajo posgenómico, más adaptadas a la realidad de nuestro entorno


The application of genotyping tools allowed us to discriminate between the Mycobacterium tuberculosis isolates obtained in the laboratory. The differentiation between single strains opened the door to molecular epidemiology studies, which had helped us to progress in our knowledge of how this pathogen is transmitted in the progressively more complex socio-epidemiological scenario. The genetic stability of this microorganism led to develop specific methodologies, which are thoroughly revised in this chapter. In addition to their application in epidemiology, we review, how they can offer a response to different diagnostic and clinical challenges. Finally, we focus on describing the novel genomic revolution we are experiencing in the analysis of tuberculosis, the methodology in which it is based and the novel possibilities it offers, including new routes of integrating both the molecular and genomic languages in innovative post-genomic proposals, better suited to our real-life context


Assuntos
Humanos , Mycobacterium/genética , Tuberculose/epidemiologia , Tuberculose/microbiologia , Técnicas de Tipagem Bacteriana , Genoma Bacteriano , Epidemiologia Molecular , Filogenia , Polimorfismo Genético
11.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 36(2): 104-111, feb. 2018. tab
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-170699

RESUMO

El cultivo de micobacterias es la prueba de referencia, y la más sensible, en el diagnóstico microbiológico de la tuberculosis y de las infecciones por micobacterias no tuberculosas. Sin embargo, requiere al menos 2-3 semanas para ser positivo. La tinción, rápida, aunque poco sensible, actúa como un complemento. Las pruebas de amplificación genética tienen una sensibilidad intermedia y obtienen resultados en 1-2 días. Estas últimas están indicadas cuando el grado de sospecha es moderado o alto. En pacientes infectados por el VIH con inmunodepresión severa (<200 CD4) puede ser útil la detección de antígeno lipoarabinomanano en orina. La identificación de los aislamientos de los cultivos positivos es imprescindible para evaluar la significación clínica y la orientación terapéutica. Actualmente se dispone de un abanico de técnicas de identificación que facilitan resultados en periodos de solo 1-4 días. El futuro del diagnóstico pasa por un mayor desarrollo de las técnicas de amplificación genética y por potenciar la búsqueda de biomarcadores que permitan un nuevo enfoque del diagnóstico de estas infecciones (AU)


Mycobacterial culture has a high sensitivity and is the test of choice for the microbiological diagnosis of tuberculosis and nontuberculous mycobacterial infections. However, the results of this culture require at least 2-3 weeks to obtain positivity. Staining is rapid and can be used as a complementary study, although its sensitivity is low. Gene amplification tests have an intermediate sensitivity and obtain results in 1-2 days. These last tests are indicated in cases with moderate or high clinical suspicion. In HIV patients with severe immunodeficiency (<200 CD4), lipoarabinomannan antigen detection in urine may be useful. The identification of isolates from positive cultures is essential to evaluate the clinical significance of the culture results and consider the therapeutic options available. At present, there is a wide range of identification techniques available, which provide results within just 1-4 days. The future of diagnostic techniques in tuberculosis and nontuberculous mycobacterial infections lies in greater development of gene amplification techniques and promoting the search for biomarkers which enable a new approach to the diagnosis of these infections (AU)


Assuntos
Humanos , Infecções por Mycobacterium não Tuberculosas/diagnóstico , Infecções por Mycobacterium não Tuberculosas/microbiologia , Mycobacterium/isolamento & purificação , Tuberculose/microbiologia , Mycobacterium , Tuberculose/diagnóstico , Mycobacterium tuberculosis/isolamento & purificação , Algoritmos , Coloração e Rotulagem , Diagnóstico Diferencial , Cromatografia de Afinidade/métodos , Cromatografia Gasosa-Espectrometria de Massas , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos
12.
Arch. bronconeumol. (Ed. impr.) ; 53(10): 554-560, oct. 2017. graf, tab
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-167422

RESUMO

Introducción y objetivo: Los aislamientos de micobacterias no tuberculosas (MNT) son cada vez más frecuentes. El objetivo principal de nuestro estudio fue conocer el número y la variedad de especies de MNT en nuestra región, su distribución según el origen de la muestra, y la edad y sexo de los pacientes; asimismo, analizar pormenorizadamente los aislamientos clínicamente significativos. Metodología: Estudio prospectivo que incluye todas las MNT aisladas en Asturias durante el período 2005-2012. Las muestras se procesaron siguiendo directrices internacionalmente aceptadas. Para el tratamiento estadístico de los datos se utilizaron tablas de contingencia 2 × 2 aplicando el test exacto de Fisher. Resultados: Se aislaron 3.284 micobacterias: 1.499 Mycobacterium tuberculosis complex (MTB) y 1.785 MNT. A lo largo del estudio se incrementaron los aislamientos de MNT y se redujeron los de MTB. Los aislamientos de MNT fueron más numerosos en hombres que en mujeres (p <0,001). M. gordonae, la especie más frecuentemente aislada, no originó enfermedad en ningún caso. El aislamiento fue clínicamente significativo en 212 pacientes (17,1%), siendo M. kansasii y M. avium las especies que más frecuentemente causaron enfermedad. La diferencia de aislamientos de M. kansasii entre mujeres y hombres fue estadísticamente significativa (p < 0,01). Conclusiones: En nuestro estudio, los aislamientos de MNT se incrementaron un 35%, frente a un descenso del 21% de los casos de MTB. Tanto los aislamientos de MNT como los casos clínicamente significativos fueron más frecuentes en hombres. Solo un 17,1% de las MNT aisladas, principalmente M. avium complex (MAC) y M. kansasii, ocasionaron enfermedad


Introduction and objective: Non-tuberculous mycobacteria (NTM) isolates are becoming more common. The main objective of our study was to establish the number and diversity of NTM species in our region and their distribution according to the source sample, age and gender of the patients, and to analyse clinically significant isolates. Methodology: Prospective study of all NTM isolated in Asturias from 2005 to 2012. Samples were processed following internationally accepted guidelines. Statistical analysis was based on Fisher's exact test for 2 × 2 contingency tables. Results: A total of 3,284 mycobacteria were isolated: 1,499 Mycobacterium tuberculosis complex (MTB) and 1,785 NTM. During the study, NTM isolation rates increased while MTB isolation decreased. NTM were more frequent in men (P < .001). M. gordonae was the most frequently isolated species but did not cause disease in any case. NTM isolates from 212 patients were associated with clinically significant disease (17.1%). M. kansasii and M. avium were most commonly associated with disease. The number of M. kansasii isolates from men was statistically significant (P < .01). Conclusions: In our study, NTM isolates increased by 35%, compared with a 21% decline in cases of MTB. Both isolation of NTM and clinically significant cases were more common in men. Only 17.1% of NTM isolates were associated with disease, most commonly M. avium complex and M. kansasii


Assuntos
Humanos , Mycobacterium/isolamento & purificação , Infecções por Mycobacterium não Tuberculosas/epidemiologia , Micobactérias não Tuberculosas/patogenicidade , Estudos Prospectivos , Infecções por Mycobacterium/epidemiologia , Doenças Transmissíveis Emergentes/epidemiologia , Mycobacterium kansasii/patogenicidade , Mycobacterium avium/patogenicidade , Mycobacterium tuberculosis/patogenicidade
14.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 35(8): 529-535, oct. 2017. tab
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-167842

RESUMO

Las micobacterias son un amplio grupo de microorganismos en el que múltiples especies son causa de una importante morbimortalidad, como la tuberculosis y la lepra. La aparición y diseminación de cepas del complejo Mycobacterium tuberculosis resistentes a diversos fármacos constituye en la actualidad uno de los problemas sanitarios de mayor gravedad a nivel mundial. Por otro lado, las micobacterias diferentes de M. tuberculosis y Mycobacterium leprae, denominadas micobacterias no tuberculosas (MNT), son aislamientos cada vez más frecuentes, requiriendo en muchos casos un tratamiento que precisa una orientación sobre la sensibilidad de estos microorganismos a los antimicrobianos. En el presente artículo se revisan los métodos para determinar la sensibilidad in vitro a los antimicobacterianos de los aislamientos del complejo M. tuberculosis y las MNT más relevantes. Además, también se realiza un análisis de las técnicas moleculares de detección rápida de la resistencia a partir de las muestras clínicas (AU)


Mycobacteria are a large group of microorganisms, multiple species of which are major causes of morbidity and mortality, such as tuberculosis and leprosy. At present, the emergence and spread of multidrug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis complex are one of the most serious health problems worldwide. Furthermore, in contrast to M. tuberculosis and Mycobacterium leprae, non-tuberculous mycobacteria (NTM) are more frequently isolated and, in many cases, treatment is based on drug susceptibility testing. This article is a review of the different methods to determine the in vitro drug susceptibility of M. tuberculosis complex and the most relevant NTM isolates. The molecular techniques currently used for rapid detection of resistance of clinical specimens are also analysed (AU)


Assuntos
Anti-Infecciosos/uso terapêutico , Mycobacterium/isolamento & purificação , Infecções por Mycobacterium/microbiologia , Resistência a Medicamentos , Resistência Microbiana a Medicamentos , Testes de Sensibilidade Microbiana/métodos , Testes de Sensibilidade Microbiana/tendências , Micobactérias não Tuberculosas , Infecções por Mycobacterium não Tuberculosas/tratamento farmacológico , Infecções por Mycobacterium não Tuberculosas/microbiologia
16.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 34(supl.2): 31-35, jun. 2016.
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-170764

RESUMO

Hasta la actualidad se han descrito más de 170 especies de micobacterias. Más de un tercio de ellas pueden ser patógenas para el ser humano, lo que supone una carga importante de trabajo en los laboratorios de microbiología. Su identificación se hace necesaria en la práctica clínica y ha supuesto durante años un importante problema debido a las carencias de los métodos fenotípicos o tradicionales y a la limitación y complejidad de las herramientas más modernas, basadas en su mayoría en técnicas de biología molecular. El objetivo de esta revisión es realizar una breve descripción de los diferentes aspectos relacionados con la utilización de la espectrometría de masas (EM) MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption ionization time-off light) en la identificación de las micobacterias. Son varias las dificultades encontradas en la aplicación del método en estos microorganismos, derivadas fundamentalmente del elevado carácter patógeno de algunos miembros, que hace necesaria su inactivación, y la peculiar estructura de su pared celular, que requiere protocolos especiales de extracción de las proteínas. Otros temas de relevancia -como son los medios de cultivo de los que se parte, los métodos de referencia utilizados (gold standard) en la identificación final de las distintas especies y los puntos de corte que deben asumirse para aceptar un resultado como válido- son también motivo de análisis, así como las bases de datos de los diferentes sistemas disponibles. La EM es una técnica que ha revolucionado el diagnóstico de la microbiología moderna; sin embargo, futuras y puntuales mejoras son necesarias para consolidar su uso en la identificación micobacteriológica


To date, more than 170 species of mycobacteria have been described, of which more than one third may be pathogenic to humans, representing a significant workload for microbiology laboratories. These species must be identified in clinical practice, which has long been a major problem due to the shortcomings of conventional (phenotypic) methods and the limitations and complexity of modern methods largely based on molecular biology techniques. The aim of this review was to briefly describe different aspects related to the use of MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight) mass spectrometry (MS) for the identification of mycobacteria. Several difficulties are encountered with the use of this methodology in these microorganisms mainly due to the high pathogenicity of some mycobacteria and the peculiar structure of their cell wall, requiring inactivation and special protein extraction protocols. We also analysed other relevant aspects such as culture media, the reference methods employed (gold standard) in the final identification of the different species, the cut-off used to accept data as valid, and the databases of the different mass spectrometry systems available. MS has revolutionized diagnosis in modern microbiology; however, specific improvements are needed to consolidate the use of this technology in mycobacteriology


Assuntos
Humanos , Bactérias Gram-Positivas , Espectrometria de Massas por Ionização e Dessorção a Laser Assistida por Matriz/métodos , Bactérias/classificação , Mycobacterium , Meios de Cultura/análise , Infecções por Mycobacterium/diagnóstico , Infecções por Mycobacterium/microbiologia , Técnicas Microbiológicas/métodos
18.
Arch. bronconeumol. (Ed. impr.) ; 52(3): 145-150, mar. 2016. tab, graf
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-149913

RESUMO

Objetivo: Describir las diferencias clínicas, funcionales y radiográficas de la enfermedad respiratoria por micobacterias ambientales (MA) en pacientes con silicosis y sin silicosis. Método: Estudio observacional retrospectivo en pacientes a los que se les había aislado una micobacteria no tuberculosa en el laboratorio de Microbiología del hospital de O Meixoeiro (CHU de Vigo) desde enero 2007 hasta diciembre 2013. Se diferenció a los pacientes según presentaran o no silicosis y enfermedad pulmonar por MA utilizando los criterios de la American Thoracic Society. Resultados: Se identificaron 156 casos con aislamiento respiratorio de al menos una especie de MA. El 71% eran varones, de los cuales 40 (25,6%) tenían silicosis. En 60 pacientes (38,5%), el 62,5% del grupo de silicosis y el 30,2% del grupo sin silicosis, se cumplían los criterios microbiológicos recomendados por la American Thoracic Society siendo las especies más comunes Mycobacterium avium complex, Mycobacterium genavense y Mycobacterium chelonae. En 34 pacientes (22,7%), 14 del grupo de silicosis y 20 del grupo sin silicosis, se cumplían los criterios de la American Thoracic Society de enfermedad pulmonar por MA. Se realizó tratamiento en 24 casos, con mayores niveles de erradicación bacteriológica en el grupo sin silicosis. Conclusiones: En nuestros pacientes el antecedente de silicosis se relacionó con mayor incidencia de enfermedad por MA. La especie causante de la mayor parte de los casos de de enfermedad en nuestro medio por MA es Mycobacterium avium complex, seguido de Mycobacterium genavense. Los pacientes con silicosis presentaron menores niveles de curación tras el tratamiento


Objective: To describe the clinical, functional and radiographic differences of respiratory disease caused by environmental mycobacteria (EM) in patients with and without silicosis. Method: Retrospective, observational study in patients with nontuberculous mycobacteria isolated in the Hospital Meixoeiro (University Hospital of Vigo) microbiology laboratory between January 2007 and December 2013. Patients were grouped according to the presence or absence of silicosis and mycobacterial lung disease, using American Thoracic Society criteria. Results: In 156 cases, at least one species of EM had been isolated from the respiratory culture. A total of 71% were identified in men, 40 (25.6%) of whom had silicosis. Sixty patients (38.5%) met American Thoracic Society microbiological criteria: 62.5% of the silicosis group and 30.2% of the non-silicosis group. The most common species were Mycobacterium avium complex, Mycobacterium genavense and Mycobacterium chelonae. American Thoracic Society criteria for environmental mycobacterial disease were met in 34 (22.7%) patients: 14 in the silicosis group and 20 in the non-silicosis group. Treatment was administered in 24 cases, with better bacteriological eradication levels in the non-silicosis group. Conclusions: In our series, a history of silicosis was related with a higher incidence of environmental mycobacterial disease. The causative species in the majority of cases in our setting wasMycobacterium avium complex, followed by Mycobacterium genavense. Patients with silicosis showed lower cure rates after treatment


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Silicose/complicações , Silicose/diagnóstico , Silicose/prevenção & controle , Micobactérias não Tuberculosas/classificação , Micobactérias não Tuberculosas/patogenicidade , Infecções por Mycobacterium/diagnóstico , Infecções por Mycobacterium/prevenção & controle , Infecções por Mycobacterium/terapia , Silicose/etiologia , Mycobacterium/classificação , Mycobacterium/patogenicidade , Infecções por Mycobacterium não Tuberculosas/diagnóstico , Infecções por Mycobacterium não Tuberculosas/prevenção & controle , Infecções por Mycobacterium não Tuberculosas/transmissão
19.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 34(1): 17-22, ene. 2016. tab, ilus
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-148500

RESUMO

INTRODUCCIÓN: Globalamente la situación epidemiológica de la enfermedad por micobacterias no tuberculosas (MNT) es desconocida debido a que no es una enfermedad de notificación en la mayoría de los países, sin embargo los diversos reportes de infecciones y brotes por MNT publicados sugieren su creciente incremento en los últimos años. Tradicionalmente la identificación se realiza a través de metodologías bioquímicas, las cuales permiten la diferenciación inicial entre M. tuberculosis y MNT, y en algunos casos la identificación de la especie micobacteriana. Sin embargo, esta metodología tiene importantes limitaciones técnicas y la obtención de resultados requiere tiempos prolongados. Por otra parte, la introducción de metodologías basadas en biología molecular ha facilitado significativamente el diagnóstico de las MNT desde el laboratorio. OBJETIVO: Establecer la frecuencia de MNT en los cultivos positivos para bacilos ácido alcohol resistentes remitidos al Laboratorio de Salud pública de Bogotá en un período de 12 meses. MATERIALES Y MÉTODOS: Un total de 100 cultivos provenientes de hospitales públicos y privados de Bogotá fueron identificados a través de pruebas bioquímicas y de las metodologías moleculares; PRA (PCR-análisis de restricción) y PCR múltiplex. Así mismo, la presencia de especies de baja prevalencia, así como el estudio de los casos no concluyentes se realizó través de análisis de secuenciación del blanco molecular 16SrDNA. RESULTADOS: El estudio identificó MNT en el 11% de los cultivos a través de la metodología PRA. Adicionalmente, esta metodología molecular permitió detectar la ocurrencia de más de una especie micobacteriana en el 4% de los cultivos evaluados. Interesantemente un nuevo patrón de restricción-PRA para la especie M. kubicae es reportado en nuestro estudio. CONCLUSIÓN: El uso de un algoritmo de identificación micobacteriana que incluya la metodología molecular PRA incrementa el poder diagnóstico de los métodos convencionales, y contribuye al mejor conocimiento de la epidemiología de las MNT y control de las micobacteriosis


INTRODUCTION: Global epidemiology of non-tuberculous mycobacteria (NTM) is unknown due to the fact that notification is not required in many countries, however the number of infection reports and outbreaks caused by NTM suggest a significant increase in the last years. Traditionally, mycobacteria identification is made through biochemical profiles which allow to differentiate M. tuberculosis from NTM, and in some cases the mycobacteria species. Nevertheless, these methods are technically cumbersome and time consuming. On the other hand, the introduction of methods based on molecular biology has improved the laboratory diagnosis of NTM. OBJECTIVE: To establish the NTM frequency in positive cultures for acid-fast bacilli (AAFB) which were sent to Laboratorio de Salud Pública de Bogotá over a 12 month period. MATERIALS AND METHODS: A total of 100 positive cultures for acid-fast bacilli from public and private hospitals from Bogotá were identified by both biochemical methods and the molecular methods PRA (PCR-restriction enzyme analysis) and multiplex-PCR. Furthermore, low prevalence mycobacteria species and non-interpretable results were confirmed by 16SrDNA sequentiation analysis. RESULTS: Identification using the PRA method showed NMT occurrence in 11% of cultures. In addition, this molecular methodology allowed to detect the occurrence of more than one mycobacteria in 4% of the cultures. Interestingly, a new M. kubicae pattern of PCR-restriction analysis is reported in our study. CONCLUSION: Using a mycobacteria identification algorithm, which includes the molecular method PRA, improves the diagnostic power of conventional methods and could help to advance both NTM epidemiology knowledge and mycobacteriosis control


Assuntos
Humanos , Mycobacterium/isolamento & purificação , Infecções por Mycobacterium não Tuberculosas/microbiologia , Reação em Cadeia da Polimerase Multiplex/métodos , Técnicas de Diagnóstico Molecular/métodos , Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo I
20.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 33(8): e37-e43, oct. 2015. tab
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-143291

RESUMO

Mycobacterium simiae es una micobacteria ambiental de crecimiento lento, fotocromógena, descrita por primera vez en 1965. Se asocia raramente a infecciones humanas, posiblemente por su limitada patogenicidad, principalmente a infección pulmonar en pacientes inmunocompetentes de edad avanzada con enfermedad pulmonar subyacente, e infección diseminada en pacientes jóvenes inmunodeprimidos con sida. El cultivo microbiológico es necesario para confirmar la sospecha clínica, y las técnicas de secuenciación genética son indispensables para identificar la especie. El tratamiento de las infecciones por M. simiae es complicado por su multirresistencia a los fármacos antituberculosos y por la falta de correlación de los datos de sensibilidad in vitro con la respuesta in vivo. El tratamiento adecuado aún está por definir, pero debe incluir claritromicina asociada a otros antimicrobianos, como moxifloxacino y cotrimoxazol. Es posible que las infecciones por M. simiae estén infradiagnosticadas


Mycobacterium simiae is a slow-growing photochromogenic environmental mycobacterium, first described in 1965. Rarely associated with human infections, possibly due to its limited pathogenicity, it mainly produces lung infection in immunocompetent elderly patients with underlying lung disease, and in disseminated infections in immunosuppressed young patients with AIDS. A microbiological culture is needed to confirm the clinical suspicion, and genetic sequencing techniques are essential to correctly identify the species. Treating M. simiae infections is complicated, owing to the multiple resistance to tuberculous drugs and the lack of correlation between in vitro susceptibility data and in vivo response. Proper treatment is yet to be defined, but must include clarithromycin combined with other antimicrobials such as moxifloxacin and cotrimoxazole. It is possible that M. simiae infections are undiagnosed


Assuntos
Humanos , Infecções por Mycobacterium/microbiologia , Infecções por Mycobacterium não Tuberculosas/microbiologia , Mycobacterium/patogenicidade , Tuberculose/microbiologia , Antituberculosos/uso terapêutico , Tuberculose Resistente a Múltiplos Medicamentos/microbiologia , Farmacorresistência Bacteriana Múltipla
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