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1.
Washington; Organización Panamericana de la Salud; july 8, 2020. 11 p.
Não convencional em Espanhol | LILACS, Inca | ID: biblio-1102945

RESUMO

Los coronavirus son un grupo de virus ARN altamente diversos de la familia Coronaviridae que se dividen en 4 géneros: alfa, beta, gamma y delta, y que causan enfermedades de leves a graves en humanos y animales (1-3). Existen coronavirus humanos endémicos como los alfacoronavirus 229E y NL63 y los betacoronavirus OC43 y HKU1 que pueden causar enfermedades de tipo influenza o neumonía en humanos (1, 3). Sin embargo, dos coronavirus zoonóticos que causan enfermedades graves en humanos han emergido: el coronavirus del Síndrome respiratorio agudo grave (SARS-CoV) en 2002-2003 y el coronavirus del Síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV) (1-5). En enero de 2020, el agente etiológico responsable de un grupo de casos de neumonía grave en Wuhan, China, fue identificado como un nuevo betacoronavirus, distinto del SARS-CoV y MERS-CoV (6). El 11 de febrero de 2020, el Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) anunció la denominación del virus como coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave 2 (SARS-CoV-2) (7), mientras que, el mismo día, la OMS nombró la enfermedad como enfermedad por coronavirus COVID-19 (8). Para fines de comunicación, haremos referencia a este virus como "el virus responsable de COVID-19" o "el virus COVID-19". La secuencia genómica completa de este nuevo agente está disponible y se han desarrollado diferentes protocolos de detección (9). A la luz de la circulación actual de COVID-19 en la región de las Américas, la Organización Panamericana de la Salud / Organización Mundial de la Salud (OPS / OMS) recomienda a los Estados Miembros garantizar la identificación oportuna de casos sospechosos, la toma y el envío de muestras a los laboratorios de referencia, y la implementación de protocolos de detección molecular, según la capacidad del laboratorio.


Assuntos
Pneumonia Viral/diagnóstico , Manejo de Espécimes/normas , Infecções por Coronavirus/diagnóstico , Técnicas de Laboratório Clínico/normas , Ensaios Enzimáticos Clínicos/normas , RNA/normas , Reação em Cadeia da Polimerase/normas , Equipamento de Proteção Individual/normas , Betacoronavirus
2.
Ciudad de México; CENETEC; 19 jun. 2020.
Não convencional em Espanhol | LILACS, BRISA/RedTESA | ID: biblio-1104192

RESUMO

Tipos de Pruebas disponibles Actualmente, las pruebas de laboratorio utilizadas para la enfermedad respiratoria COVID-19 causada por el virus SARS-CoV-2, incluyen métodos basados en la detección de ácidos nucleicos del virus y en la reacción antígeno-anticuerpo (IgM/IgG) producidos en respuesta a la infección. La detección rápida de casos y contactos se hizo crítica para responder eficazmente al brote de COVID-19. A continuación, se describen los 3 tipos principales de pruebas diagnósticas con las que se puede detectar el virus SARS-CoV-2 1 : Moleculares: Detectan ácidos nucleicos de SARS-CoV-2. La prueba de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR), ha sido la prueba de primera línea usada frente al brote de SARS-CoV-2. La PCR es el estándar de referencia para el diagnóstico molecular de agentes infecciosos, ya que es una técnica capaz de proporcionar una sensibilidad y especificidad cercanas al 100% con ensayos diseñados adecuadamente en situaciones controladas2. El tiempo que tarda en obtenerse el resultado es de 4 a 6 horas; Detección de Antígenos: Detectan antígenos de SARS-CoV-2. Están destinadas a la detección cualitativa de la proteína del antígeno viral SARS-COV-2 en muestras de suero y plasma humano o también en muestras nasales o nasofaríngeas; Detección de Anticuerpos: Identifican anticuerpos de SARS-CoV-2. Miden la cantidad de anticuerpos o proteínas presentes en la sangre cuando el organismo responde a una infección específica. Se reconoce que estas son menos complejas que las moleculares y se usan únicamente para identificar anticuerpos, lo que limita su efectividad para el diagnóstico; sin embargo, como se indica en la guía actualizada, la FDA no tiene la intención de objetar la distribución y el uso de pruebas para identificar anticuerpos contra el SARS-CoV-2., cuando las pruebas han sido validadas. RECOMENDACIONES O CRITERIOS PARA LA REALIZACIÓN DE LAS PRUEBAS: Organización Mundial de la Salud (OMS): 1. La decisión de aplicar pruebas de laboratorio para la enfermedad de COVID-19, debe estar basada en factores clínicos y epidemiológicos que estén estrechamente ligados con la probabilidad de estar infectado. Pueden ser considerados pacientes asintomáticos o ligeramente sintomáticos, en caso de que hayan tenido contacto con un caso positivo de COVID-19. Así mismo, los protocolos de detección deben adaptarse a la situación local. 2. Es prioritario recoger muestras y realizar rápidamente pruebas apropiadas de los casos sospechosos 1, que de acuerdo con la OMS y en concordancia con el "Lineamiento Estandarizado para la Vigilancia Epidemiológica y por Laboratorio de COVID-19"4 , elaborada por la Secretaria de Salud, se define como caso sospechoso aquella persona de cualquier edad que presente enfermedad respiratoria aguda leve o grave y que cuente con alguno de los siguientes antecedentes, hasta 14 días previos al inicio de síntomas: 3. Haber estado en contacto con un caso confirmado o bajo investigación a COVID-19. 4. Viaje o estancia en países con transmisión local comunitaria de COVID-19. 5. Los pacientes positivos, deben ser aislados e investigados los contactos cercanos que hayan tenido durante los dos días previos al desarrollo de los síntomas, para realizarles pruebas solamente si presentan síntomas de COVID-19. 6. El algoritmo de laboratorio que debe realizarse, será el de la influenza recomendado por la OPS para la vigilancia rutinaria. Por lo que las pruebas para el COVID-19, deben considerarse sólo para pacientes que cumplan con la definición de caso sosechoso, una vez descartada la influenza y la influenza aviar. PRUEBAS EMERGENTES: Para atender la demanda mundial se han desarrollado recientemente diversas pruebas diagnósticas que prometen ser más rápidas que la PCR utilizada actualmente. La Food and Drug Administration (FDA) ha emitido autorización para alrededor de 30 pruebas diagnósticas, entre las que se destacan por su rapidez en ofrecer resultados las siguientes pruebas moleculares: 1. Xpert Xpress SARS-CoV-2 (Cepheid)9 ; prueba "point of care" molecular automatizada para la detección cualitativa de SARS-CoV-2, que ofrece resultados en 45 minutos. Para su determinación, se necesita del equipo GeneXpert. No se han reportado datos sobre la sensibilidad y especificidad de esta prueba. Actualmente se están corriendo protocolos de validación en Estados Unidos, financiados en parte por el Departamento de Salud y Servicios Sociales de ese país. Esta prueba cuenta con autorización de COFEPRIS. 2. Cobas® (Roche)10; ensayo cualitativo que permite la detección de ácidos nucleicos en muestras de pacientes que cumplen con los criterios clínicos y/o epidemiológicos de COVID-19. Las pruebas son para uso en los sistemas automatizados de alto rendimiento cobas® específicos, los cuales proporcionan hasta 96 resultados en aproximadamente tres horas. No se cuenta con datos de sensibilidad y especificidad específicos de esta prueba para la detección del virus SARS-CoV-2. Esta prueba cuenta con autorización de COFEPRIS. 3. ID NOWTM COVID19 (Abbott)11; prueba molecular rápida in vitro que identifica el ARN del virus SARS-CoV-2 en muestras nasales y nasofaríngeas. Los resultados se obtienen en un lapso de 13 minutos en caso de ser negativos y en 5 en caso de ser positivo. Para su realización se requiere de un pequeño equipo de identificación molecular denominado ID NOW. Aún no se cuenta con información sobre su sensibilidad y especificidad. Esta prueba no está disponible fuera de los Estados Unidos y por ahora la empresa no tiene planes de ofrecerla en otros países, por lo que Abbott no ha iniciado ningún proceso regulatorio en México para esta prueba. El 14 de mayo, la FDA emitió una alerta sobre posibles problemas de precisión de esta prueba, derivado de los resultados falsos negativos que se han presentado. Se investiga si la posible causa podría deberse a los tipos de hisopos utilizados o al tipo de medio de transporte viral. La empresa Abbott se ha comprometido a realizar estudios con diseño adecuado y trabajará en conjunto con la FDA, la cual comunicará públicamente cualquier actualización. Esta prueba no ha sido aprobada por COFEPRIS. Cabe mencionar que ninguna de esas tres pruebas ha sido aprobada por la FDA y han sido autorizadas únicamente bajo la indicación de "Uso de emergencia" para uso en laboratorios certificados para la detección de ácido nucleico del SARS-CoV-2.


Assuntos
Humanos , Pneumonia Viral/diagnóstico , Reação em Cadeia da Polimerase/métodos , Infecções por Coronavirus/diagnóstico , Técnicas e Procedimentos Diagnósticos/instrumentação , Betacoronavirus/isolamento & purificação , Avaliação da Tecnologia Biomédica , Avaliação em Saúde
3.
Neumol. pediátr. (En línea) ; 15(2): 324-329, mayo 2020. tab
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1099531

RESUMO

SARS-CoV-2 virus infection behaves differently in children versus adults, a significant percentage of children are asymptomatic or present mild symptoms. That situation makes diagnostic tests more important in this group. To date, pediatric patients behave less severely compared to adult patients. Among the diagnostic methods, the most important is the detection of RNA through PCR, which is the gold standard. Other tests can be used in a complementary way, especially in cases of uncertain diagnostic or in seriously ill patients.


La infección por virus SARS-CoV-2 se comporta de manera distinta en niños versus adultos, un porcentaje importante de los niños son asintomáticos o presentan síntomas leves, por lo que las pruebas diagnósticas cobran mayor importancia en este grupo. Hasta la fecha los pacientes pediátricos se comportan con menor severidad en comparación con pacientes adultos. Dentro de los métodos diagnósticos el más importante es la detección de RNA a través de PCR que constituye el estándar. Otros exámenes pueden ser utilizados en forma complementaria, especialmente en casos de duda diagnostica o en pacientes graves.


Assuntos
Humanos , Criança , Pneumonia Viral/diagnóstico , Infecções por Coronavirus/diagnóstico , Betacoronavirus/genética , Testes Sorológicos , Reação em Cadeia da Polimerase , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa , Diagnóstico Diferencial , Pandemias
8.
Electron. j. biotechnol ; 44: 6-13, Mar. 2020. tab, graf, ilus
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1087627

RESUMO

BACKGROUND: Hot start can greatly improve specificity, sensitivity and yield of PCR. Non-specific amplification can occur in PCR when reaction mixture is prepared at room temperature, because Taq DNA polymerase is active and the primers can hybridize non-specifically. Hot start Taq DNA polymerases remain inactive at room temperature and are activated after heating at 95°C preventing non-specific amplification. Monoclonal antibodies against Taq DNA polymerase is the first line of reagents used for turn on regular Taq DNA polymerase into Hot start one. The goal of this research was to produce and evaluate Hot Start antibodies derived from chicken eggs. RESULTS: We performed affinity purification of yolk immunoglobulin (IgY) and obtained polyclonal Hot Start antibodies. The yield of specific antibodies was 0.36 mg per egg or 0.2% of total yolk antibodies. The protocol for real time measurement and Hot start IgY activity assessment was developed. We found that Hot start IgY can reversibly block Taq DNA polymerase activity at 50°C and have no negative impact neither on the Taq DNA polymerase activity after denaturation nor on the reverse transcriptase. We estimated that 1.0 µg of Hot start IgY effectively blocks 5 U activity of Taq DNA polymerase. CONCLUSIONS: Egg derived Hot Start polyclonal antibodies are the cheapest source of Hot start antibodies, from one immune egg we can isolate 0.36 mg IgY, this quantity is enough for producing 1800 U activity of Hot start Taq DNA Polymerase.


Assuntos
Gema de Ovo/metabolismo , Anticorpos Monoclonais/biossíntese , Anticorpos Monoclonais/imunologia , Temperatura , Imunoglobulinas/isolamento & purificação , Imunoglobulinas/biossíntese , Imunoglobulinas/imunologia , Ensaio de Imunoadsorção Enzimática , Reação em Cadeia da Polimerase , Taq Polimerase , Gema de Ovo/imunologia , Anticorpos Monoclonais/isolamento & purificação
9.
Electron. j. biotechnol ; 44: 25-32, Mar. 2020. graf, tab, ilus
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1087637

RESUMO

BACKGROUND: Cultivated peanut (Arachis hypogaea. L) represents one of the most important oil crops in the world. Although much effort has been expended to characterize microsatellites or Simple Sequence Repeats (SSRs) in peanut, the quantity and quality of the markers in breeding applications remain limited. Here, genome-wide SSR characterization and marker development were performed using the recently assembled genome of the cultivar Tifrunner. RESULTS: In total, 512,900 microsatellites were identified from 2556.9-Mb genomic sequences. Based on the flanking sequences of the identified microsatellites, 7757 primer pairs (markers) were designed, and further evaluated in the assembled genomic sequences of the tetraploid Arachis cultivars, Tifrunner and Shitouqi, and the diploid ancestral species, A. duranensis and A. ipaensis. In silico PCR analysis showed that the SSR markers had high amplification efficiency and polymorphism in four Arachis genotypes. Notably, nearly 60% of these markers were single-locus SSRs in tetraploid Arachis species, indicating they are more specific in distinguishing the alleles of the A and B sub-genomes of peanut. In addition, two markers closely related with purple testa color and 27 markers near to FAD2 genes were identified, which could be used for breeding varieties with purple testa and high-oleic acid content, respectively. Moreover, the potential application of these SSR markers in tracking introgressions from Arachis wild relatives was discussed. CONCLUSIONS: This study reported the development of genomic SSRs from assembled genomic sequences of the tetraploid Arachis Tifrunner, which will be useful for diversity analysis, genetic mapping and functional genomics studies in peanut


Assuntos
Arachis/genética , Cruzamento/métodos , Repetições de Microssatélites , Polimorfismo Genético , Marcadores Genéticos , Reação em Cadeia da Polimerase , Genoma , Produtos Agrícolas
10.
Washington; Organización Panamericana de la Salud; feb. 1, 2020. 5 p.
Não convencional em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1096511

RESUMO

Los coronavirus son un grupo de virus ARN altamente diversos de la familia Coronaviridae que se dividen en 4 géneros: alfa, beta, gamma y delta, y que causan enfermedades de leves a graves en humanos y animales (1) (2) (3). Existen coronavirus humanos endémicos como los alfacoronavirus 229E y NL63 y los betacoronavirus OC43 y HKU1 que pueden causar enfermedades de tipo influenza o neumonía en humanos (1) (3). Sin embargo, dos coronavirus zoonóticos que causan enfermedades graves en humanos han emergido: el coronavirus del Síndrome respiratorio agudo grave (SARS-CoV) en 2002-2003 y el coronavirus del Síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV) (4) (5). En enero de 2020, el agente etiológico responsable de un grupo de casos de neumonía grave en Wuhan, China, fue identificado como un nuevo betacoronavirus (2019-nCoV), distinto del SARS-CoV y MERS-CoV (6) (7). La secuencia genómica completa de este nuevo agente está disponible y se han desarrollado diferentes protocolos de detección, aunque aún no se han validado por completo. Sin embargo, a la luz de la posible introducción de un caso sospechoso relacionado con el 2019-nCoV en la Región de las Américas, la Organización Panamericana de la Salud / Organización Mundial de la Salud (OPS / OMS) recomienda a los Estados Miembros garantizar su identificación oportuna, el envío de las muestras a laboratorios Nacionales y de referencia y la implementación del protocolo de detección molecular para 2019-nCoV, según la capacidad del laboratorio.


Assuntos
Humanos , Pneumonia Viral/virologia , Reação em Cadeia da Polimerase/métodos , Infecções por Coronavirus/diagnóstico , Infecções por Coronavirus/epidemiologia , Infecções por Coronavirus/virologia , Contenção de Riscos Biológicos/normas , Pandemias/prevenção & controle , Betacoronavirus/isolamento & purificação , China/epidemiologia
11.
Pesqui. vet. bras ; 40(2): 82-87, Feb. 2020. tab
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1098440

RESUMO

The genus Mycoplasma includes more than 200 bacterial species that cause disease in animals. It is responsible for causing mastitis in bovines and may be related to other manifestations, such as arthritis and pneumonia in calves and heifers. The present study aimed to detect Mycoplasma bovis isolated from milk samples of bovine clinical mastitis, and to compare the isolation rates in two culture media: Hayflick and SP4. An initial screening was performed in order to detect the presence of the class Mollicutes in 1166 milk samples from clinical mastitis by the conventional Polymerase Chain Reaction (PCR) technique. According to the 1166 milk samples evaluated, 8.6% (100/1166) were positive to class Mollicutes. Regarding molecular analyses, 1.1% (13/1166) of conventional PCR for positive M. bovis was obtained and 0.9% (11/1166) in real-time PCR. The results of the microbiological culture of the 100 samples previously screened demonstrated that 6% (6/100) of colony growth have been developed when using the Hayflick medium, and 11% (11/100) when using the SP4 medium (including the positive on Hayflick medium). Concerning the 11 isolates obtained in the microbiological culture, conventional PCR confirmed M. bovis in nine of them, and two cultures were negative. In the phylogenetic analysis of the isolates, all of them were grouped in M. bovis and M. agalactiae clusters. The results confirmed the importance of the presence of M. bovis in the etiology of bovine clinical mastitis and reinforced the need for further studies to elucidate other Mycoplasma species that may be involved in bovine clinical mastitis in Brazil.(AU)


O gênero Mycoplasma inclui mais de 200 espécies que causam doenças nos animais. É responsável por quadros de mastite em bovinos, podendo também estar relacionado à outras manifestações como artrite e pneumonia em bezerros e novilhas. O presente estudo objetivou a detecção de Mycoplasma bovis isolados a partir de amostras de leite de mastite clínica bovina, bem como, a comparação da taxa de isolamento em dois meios de cultura: Hayflick e SP4. Para efeito de triagem amostral, foram avaliadas quanto à presença da classe Mollicutes 1166 amostras de leite de casos de mastite clínica pela técnica de PCR convencional. Das 1166 amostras de leite avaliadas, 8,6% (100/1166) foram positivas à classe. Nas análises moleculares, obteve-se 1,1% (13/1166) de positividade para Mycoplasma bovis na PCR convencional e 0,9% (11/1166) na PCR em tempo real. Os resultados do cultivo microbiológico das 100 amostras triadas previamente demonstraram 6% (6/100) de crescimento de colônias ao se utilizar o meio Hayflick e 11% (11/100) ao se utilizar o meio SP4 (incluindo as positivas ao primeiro). A partir dos 11 isolados obtidos no cultivo microbiológico, a PCR convencional confirmou Mycoplasma bovis em nove deles, e dois foram negativos para o agente. Na análise filogenética dos isolados, todos agruparam no cluster Mycoplasma bovis e Mycoplasma agalactiae. Frente aos resultados, ressalta-se a importância da presença de Mycoplasma bovis na etiologia da mastite clínica bovina e reforça a necessidade de estudos mais aprofundados para a elucidação de outras espécies de micoplasmas que possam estar envolvidas na mastite bovina.(AU)


Assuntos
Animais , Feminino , Bovinos , Mycoplasma bovis/isolamento & purificação , Leite/microbiologia , Mastite Bovina/etiologia , Infecções por Mycoplasma/veterinária , Reação em Cadeia da Polimerase/veterinária , Tenericutes , Mycoplasma agalactiae/isolamento & purificação , Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real/veterinária
12.
Electron. j. biotechnol ; 43: 16-22, Jan. 2020. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1087512

RESUMO

Background: The intestinal bacterial community has an important role in maintaining human health. Dysbiosis is a key inducer of many chronic diseases including obesity and diabetes. Kunming mice are frequently used as a model of human disease and yet little is known about the bacterial microbiome resident to the gastrointestinal tract. Results: We undertook metagenomic sequencing of the luminal contents of the stomach, duodenum, jejunum, ileum, cecum, colon, and rectum of Kunming mice. Firmicutes was the dominant bacterial phylum of each intestinal tract and Lactobacillus the dominant genus. However, the bacterial composition differed among the seven intestinal tracts of Kunming mice. Compared with the small intestine, the large intestine bacterial community of Kunming mice is more stable and diverse. Conclusions: To our knowledge, ours is the first study to systematically describe the gastrointestinal bacterial composition of Kunming mice. Our findings provide a better understanding of the bacterial composition of Kunming mice and serves as a foundation for the study of precision medicine.


Assuntos
Animais , Camundongos , Bactérias/isolamento & purificação , Trato Gastrointestinal/microbiologia , Bactérias/genética , RNA Ribossômico 16S , Reação em Cadeia da Polimerase , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Firmicutes/isolamento & purificação , Microbioma Gastrointestinal , Lactobacillus/isolamento & purificação
13.
Int. j. odontostomatol. (Print) ; 14(3): 448-456, 2020. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1114920

RESUMO

Enterococci are important nosocomial pathogens due to their intrinsic multiresistance and the acquisition of new antibiotic resistance genes (ARG). Enterococcus faecalis has been shown to be one of the main pathogens in persistent endodontic infections, therefore, the main objective of this study was to evaluate the phenotype and resistance genotype of strains of E. faecalis isolated from teeth with persistent endodontic lesions, to the most commonly prescribed antibiotics in dentistry. Thirteen strains of E. faecalis of different pulsotype were analyzed to evaluate the susceptibility to antibiotics, amoxicillin, amoxicillin/clavulanic acid, tetracycline, erythromycin and metronidazole, using the Epsilometer test (E- test) and the presence of beta-lactamases with nitrocefin test. Finally, the detection of ARG was performed with a molecular polymerase chain reaction (PCR) technique and confirmed by the sequencing of the amplification products. Fisher's exact test was used, using 95 % confidence. Regarding the phenotype of resistance, the evaluated strains, independent of the pulsotype, were totally resistant to the action of metronidazole. Antibiotics with higher minimum inhibitory concentration (MIC) after metronidazole include tetracycline and erythromycin. In contrast, lower MIC are applied to the combination of amoxicillin with clavulanic acid. The nitrocefin test was positive only in one strain. Genotypically, two genetically distant strains isolated from a single patient, presented a genotype of resistance to erythromycin, determined by the presence of the ermB gene. No statistically significant relationship was found between phenotypic resistance and the presence of ARG in relation to erythromycin (p> 0.05). It was concluded that isolates of E. faecalis from persistent endodontic infections showed phenotypes of resistance to several antimicrobial agents, all of which were susceptible to amoxicillin/clavulanic acid. Periodic evaluation of susceptibility to antibiotics is suggested as an important practice for the surveillance of antibiotic resistance in oral strains.


Los enterococos son importantes patógenos nosocomiales debido a su multi resistencia intrínseca y la adquisición de nuevos genes de resistencia a los antibióticos (ARG). Enterococcus faecalis es uno de los principales patógenos en infecciones endodónticas persistentes, por lo tanto, el objetivo principal de este estudio fue evaluar el fenotipo y el genotipo de resistencia de cepas de E. faecalis aisladas de dientes con lesiones endodóncicas persistentes, a los antibióticos comúnmente recetados en odontología. Se analizaron 13 cepas de E. faecalis de diferentes pulsotipos para evaluar la susceptibilidad a los antibióticos, amoxicilina, amoxicilina / ácido clavulánico, tetraciclina, eritromicina y metronidazol, utilizando la prueba de Epsilometría (E-test) y la presencia de beta-lactamasas con prueba de nitrocefina. Finalmente, la detección de ARG se realizó con una técnica molecular de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y se confirmó mediante la secuenciación de los productos de amplificación. Se utilizó la prueba exacta de Fisher, con un 95 % de confianza. En cuanto al fenotipo de resistencia, las cepas evaluadas, independientes del pulsotipo, fueron totalmente resistentes a la acción del metronidazol. Los antibióticos con los valores más altos de concentración mínima inibitoria (CMI) después del metronidazol incluyen tetraciclina y eritromicina. En contraste, las CMI mas bajas se aplican a la combinación de amoxicilina con ácido clavulánico. La prueba de nitrocefina fue positiva solo en una cepa. Genotípicamente, dos cepas distantes genéticamente, aisladas de un mismo paciente fueron positivas para el gen ermB. No se encontró una relación estadísticamente significativa entre la resistencia fenotípica y la presencia de ARG en relación con la eritromicina (p> 0,05). Se concluyó que los aislamientos de E. faecalis de infecciones endodónticas persistentes mostraron fenotipos de resistencia a varios agentes antimicrobianos, todos los cuales fueron susceptibles a amoxicilina / ácido clavulánico. Se sugiere una evaluación periódica de la susceptibilidad a los antibióticos como una práctica importante para la vigilancia de la resistencia a los antibióticos en las cepas orales.


Assuntos
Humanos , Enterococcus faecalis/efeitos dos fármacos , Enterococcus faecalis/genética , Cavidade Pulpar/microbiologia , Antibacterianos/farmacologia , Tetraciclina , Testes de Sensibilidade Microbiana , Eritromicina , Reação em Cadeia da Polimerase , Ácido Clavulânico/farmacologia , Farmacorresistência Bacteriana/genética , Amoxicilina/farmacologia , Metronidazol
15.
Int. j. odontostomatol. (Print) ; 14(3): 342-347, 2020. tab, graf
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1114904

RESUMO

La Leishmaniasis es un grupo de enfermedades transmitidas por vectores y causada por la Leishmania, un parásito intracelular, que se presenta de preferencia en regiones tropicales y subtropicales. Se manifiesta mediante un amplio rango de formas clínicas como la cutánea, mucocutánea, y visceral, dependiendo de la especie y respuesta inmunológica del paciente. Se presenta el caso de un hombre de 35 años que acudió derivado a Unidad de Estomatología del Hospital Señor del Milagro, Salta, Argentina, presentando en la cavidad oral lesión, granulomatosa, ulcerada, dolorosa a la palpación, única, en paladar blando, de tres meses de evolución. Se realizaron estudios serológicos, parasitológicos y PCR. Los ELISAs lisados, PCRs y cultivos de materiales de lesiones fueron positivos, confirmando diagnóstico de leishmaniasis mucocutánea. El paciente fue derivado al Servicio de Dermatología donde recibió tratamiento con Antimoniato de Meglumina, con repuesta clínica favorable. El conocimiento de las manifestaciones orales puede llevar al diagnóstico clínico de leishmaniasis mucocutánea por parte del odontólogo, pudiendo entregar un tratamiento oportuno y a la vez ayudar al paciente, evitando complicaciones de esta enfermedad.


Leishmaniasis is a group of vector-borne diseases caused by Leishmania, an intracellular parasite, which occurs preferentially in tropical and subtropical regions. It manifests itself through a wide range of clinical forms such as cutaneous, mucocutaneous, and visceral, depending on the species and the patient's immune response. We present a case of a 35-year-old man who was referred to the Stomatology Unit of the Señor del Milagro Hospital, Salta, Argentina, presenting in the oral cavity lesion, granulomatous, ulcerated, painful on palpation, unique, soft palate with three months of evolution. Serological, parasitological and PCR studies were performed. Lysed ELISAs, PCRs and cultures of lesion materials were positive, confirming diagnosis of mucocutaneous leishmaniasis. The patient was referred to the Dermatology Service where he received treatment with Meglumine Antimony, with favorable clinical response. The knowledge of the oral manifestations can lead to the clinical diagnosis of mucocutaneous leishmaniasis by the dentist, being able to provide timely treatment and at the same time help the patient, avoiding complications of this disease.


Assuntos
Humanos , Masculino , Adulto , Leishmaniose Mucocutânea/diagnóstico , Leishmaniose Mucocutânea/parasitologia , Doenças da Boca/diagnóstico , Doenças da Boca/parasitologia , Paracoccidioidomicose/diagnóstico , Ensaio de Imunoadsorção Enzimática , Reação em Cadeia da Polimerase , Diagnóstico Diferencial , Histoplasmose/diagnóstico , Leishmania/isolamento & purificação , Mucosa Bucal/parasitologia
17.
Rev. bras. parasitol. vet ; 29(1): e016319, 2020. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1058011

RESUMO

Abstract Leishmania infantum is a trypanosomatid that causes parasitic dermatopathy in dogs. Trypanosoma caninum is another trypanosomatid, which infects the skin of dogs, although cutaneous abnormalities are absent. This study aimed to investigate the occurrence of T. caninum infection and its associated cutaneous and histological changes and compare it with the occurrence of L. infantum infection in dogs. The study included 150 dogs, of which T. caninum infection was identified in 3 (2%) and L. infantum infection in 15 (10%) of them, with no association (p>0.05) of these infections with the breed, gender, age, or cutaneous abnormalities. The cutaneous abnormalities were based on 1 (4.8%) and 12 (57.1%) dogs infected by T. caninum and L. infantum, respectively. The dermatohistopathological abnormalities in the dogs infected with T. caninum included mild perivascular lymphohistioplasmacytic infiltrates in the clinically asymptomatic ones, while in those with dermatological abnormalities, acanthosis, epidermal orthokeratotic hyperkeratosis, melanomacrophages, and co-infection with Microsporum sp. and Trichophyton sp. were observed. InL. infantum infected, the histopathological findings included chronic granulomatous inflammatory infiltrates and structures compatible with amastigotes. Despite the low frequency of T. caninum infection, our findings suggest that this trypanosomatid, unlike L. infantum, does not cause any macroscopic skin abnormalities.


Resumo Leishmania infantum é um tripanosomatídeo que causa dermatopatia parasitária em cães. Trypanosoma caninum é outro tripanosomatídeo, que infecta a pele de cães, embora anormalidades cutâneas sejam ausentes. Este estudo teve como objetivo investigar a ocorrência da infecção por T. caninum e suas alterações cutâneas e histológicas associadas e compará-las com a ocorrência da infecção por L. infantum em cães. O estudo incluiu 150 cães, dos quais a infecção por T. caninum foi identificada em 3 (2%) e a infecção por L. infantum em 15 (10%) deles, sem associação (p>0,05) dessas infecções com a raça, sexo, idade ou anormalidades cutâneas. As alterações cutâneas foram observadas em 1 (4,8%) e 12 (57,1%) cães infectados por T. caninum e L. infantum, respectivamente. As anormalidades dermato-histopatológicas nos cães infectados por T. caninum incluíram infiltrados linfo-histioplasmocitários perivasculares leves nos clinicamente assintomáticos, enquanto naqueles com anormalidades dermatológicas, foram observados acantose, hiperqueratose ortoqueratótica epidermal e melanomacrófagos e co-infecção por Microsporum sp. e Trichophyton sp. Nos cães infectados por L. infantum, os achados histopatológicos incluíram infiltrados inflamatórios granulomatosos crônicos e estruturas compatíveis com amastigotas. A despeito da baixa frequência da infecção por T. caninum, nossos achados sugerem que esse tripanosomatídeo, diferentemente de L. infantum, não causa anormalidades macroscópicas na pele.


Assuntos
Animais , Cães , Trypanosoma/genética , Tripanossomíase/veterinária , Leishmania infantum/genética , Doenças do Cão/patologia , Leishmaniose Visceral/veterinária , Tripanossomíase/patologia , Tripanossomíase/epidemiologia , Brasil/epidemiologia , Reação em Cadeia da Polimerase , Prevalência , DNA de Protozoário/genética , Doenças do Cão/epidemiologia , Coinfecção , Leishmaniose Visceral/patologia , Leishmaniose Visceral/epidemiologia
18.
Arq. Inst. Biol ; 87: e0682019, 2020. ilus
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1118081

RESUMO

CABMV is a limiting virus for passion fruit crop in Brazil, its main producing country. This virus has been reported in all producing states of the country, with the state of Santa Catarina (SC) in 2017 standing as the third largest passion fruit producer. In 2017, it reached 8.4% of the national production. The southern coast is the main responsible for the increase in production, which has been supplying the domestic market. However, in that same year, this region recorded the first symptom expressions in plants and fruits. The evaluation of the samples collected in the municipalities of Sombrio, Praia Grande and São João do Sul, southern coast of SC, was performed by using a mechanical transmission to indicator plants, PTA-ELISA and RT-PCR, and by sequencing. The evaluation results were positive for CABMV and negative for CMV in PTA-ELISA. In RT-PCR, there was the formation of a 700bp ca band, expected size for Potyvirus, whose sequence comparison with those deposited in GenBank reveled 98% identity with the isolates from São Paulo State. The occurrence of the virus in the southern coast of SC did not reach a serious decrease in passion fruit production due to the union of producers, who adopted preventive management measures to control the virus, whose effect led to a consolidation of the passion fruit production chain in the region.(AU)


O CABMV é um vírus limitante para a cultura do maracujá no Brasil, principal país produtor mundial, cuja ocorrência já foi relatada em todos os estados produtores. Em 2017, o estado de Santa Catarina (SC) foi o terceiro maior produtor de maracujá no Brasil, responsável por 8,4% da produção nacional, sendo o litoral sul o principal responsável pelo aumento da produção, garantindo o abastecimento do mercado interno. Entretanto, nesse mesmo ano, essa região registrou as primeiras expressões de sintomas em plantas e frutos. Uma avaliação das amostras coletadas nos municípios de Sombrio, Praia Grande e São João do Sul, litoral sul de Santa Catarina, foi realizada por transmissão mecânica para plantas indicadoras, PTA-ELISA, RT-PCR e sequenciamento. Os resultados foram positivos para o CABMV e negativos para o CMV, tanto em PTA-ELISA quanto RT-PCR. Na RT-PCR, houve a amplificação de bandas com ca de 700pb, tamanho esperado para o Potyvirus cuja comparação de sequências com as depositadas no GenBank revelaram 98% de similaridade com os isolados do estado de São Paulo. A ocorrência do vírus na região do litoral sul de Santa Catarina não causou quebra na produção de maracujá devido à adoção conjunta de medidas preventivas de manejo pelos produtores, fato que consolidou a cadeia produtiva do maracujá na região.(AU)


Assuntos
Comovirus/patogenicidade , Passiflora , Ensaio de Imunoadsorção Enzimática , Reação em Cadeia da Polimerase
19.
Rev. bras. parasitol. vet ; 29(1): e017119, 2020. tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1101625

RESUMO

Abstract The present study aimed to characterize the importance of the Anaplasma marginale, Babesia bovis and Babesia bigemina in the genesis of cattle tick fever (CTF) among dairy calves in the northwest of Minas Gerais, Brazil. Blood samples from 300 calves were collected, followed by DNA extraction and nested PCR using oligonucleotide primers to amplify fragments of the semi-nested for the msp5 gene (A. marginale), sbp-4 (B. bovis) and rap-1a (B. bigemina) Among the examined calves, the prevalence of A. marginale was 55.6% (n=167/300), B. bovis was 4.0% (n=12/300) and B. bigemina was 15.3% (n=46/300), by PCR techniques. Parasitic forms of A. marginale and B. bigemina were found in 36,3% and 2,6% of the blood smears while B. bovis was not detected. There was a statistical difference between the positivity of infected animals in the age groups 1 (10-70 days) and (>70-300 days) for A. marginale and B. bigemina. A total of 15 calves with the classic symptoms of disease were examined, and the samples obtained were confirmed as a simple infection by A. marginale through semi-nested PCR. These results confirm bovine anaplasmosis as the primary cause of CTF among the calves of dairy cattle within the studied area.


Resumo O presente estudo teve como objetivo caracterizar a importância de Anaplasma marginale, Babesia bigemina e Babesia bovis na gênese da tristeza parasitária bovina em bezerros leiteiros do noroeste de Minas Gerais. Foram coletadas 300 amostras sanguíneas de bezerros, seguidas por extração de DNA e Nested- PCR utilizando oligonucleotídeos iniciadores que amplificam fragmentos dos genes sbp-4 (B. bovis) e rap-1a (B. bigemina) e a Semi-Nested para o gene msp5 (A. marginale). A prevalência de A. marginale foi 55,66% (167/300), B. bigemina, 15,33% (46/300) e B. bovis 4,0% (12/300) dos bezerros examinados. Formas parasitárias de A. marginale and B. bigemina foram encontradas em 36,33% e 2,66% dos esfregaços sanguíneos, enquanto B. bovis não foi detectado. Houve diferença estatística entre as prevalências de animais infectados nas faixas etárias 1 (10-70 dias) e 2 (>70-300 dias). Um total de 15 animais com sintomas clássicos da doença foram examinados, e as amostras foram confirmadas como uma infecção simples por A. marginale através da Nested-PCR. Esses resultados confirmam a anaplasmose bovina como a principal agente da tristeza parasitária bovina nos bezerros do rebanho estudado.


Assuntos
Animais , Masculino , Feminino , Bovinos , Babesia/genética , Babesiose/parasitologia , Carrapatos/parasitologia , Doenças dos Bovinos/parasitologia , Anaplasma marginale/genética , Anaplasmose/parasitologia , Filogenia , Babesiose/diagnóstico , Babesiose/epidemiologia , Brasil , Doenças dos Bovinos/diagnóstico , Doenças dos Bovinos/epidemiologia , Reação em Cadeia da Polimerase/veterinária , Anaplasmose/diagnóstico , Anaplasmose/epidemiologia
20.
Rev. bras. parasitol. vet ; 29(1): e020219, 2020. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1092693

RESUMO

Abstract Rickettsia rickettsii is the causative agent of Brazilian spotted fever (BSF), for which humans and dogs are both susceptible. Dogs are sentinels in serological surveys, however, canine disease is rarely reported. Therefore, we aimed to evaluate natural infection by spotted fever group (SFG) Rickettsia spp. in dogs and ticks collected from domiciles close to forest fragments, featuring domestic-wildlife interface areas. Samples from 115 dogs and 135 ixodids were assessed by polymerase chain reactions (PCR) targeting the gltA gene for Rickettsia spp. and the ompA gene for the SFG rickettsial species. One dog (0.87%; 1/115) was positive for R. rickettsii. This dog presented nonspecific laboratory and clinical abnormalities (thrombocytopenia, hyperproteinemia, lymph node enlargement, emaciation, anorexia, and lethargy). Rickettsia parkeri was identified in 2.96% (4/135) of the ticks (Amblyomma sculptum, A. aureolatum, and Rhipicephalus sanguineus). This study confirmed the presence of SFG bacteria in non-endemic and preserved locations, where domestic and wild populations interact. We reinforce the fact that the dog is susceptible to natural R. rickettsii infection. Although this is a rare finding, preventive measures should be taken against BSF in the studied areas. Finally, R. parkeri infection is possibly being demonstrated in A. sculptum for the first time.


Resumo Rickettsia rickettsii é o agente causador da Febre Maculosa Brasileira (FMB), doença na qual humanos e cães são susceptíveis. Os cães são sentinelas nos inquéritos sorológicos, contudo, a doença canina é raramente descrita. Assim sendo, objetivou-se avaliar a infecção natural por Rickettsia spp. do Grupo da Febre Maculosa (GFM) em cães e carrapatos obtidos de domicílios próximos a fragmentos de mata, caracterizando áreas de interface doméstico-silvestre. Amostras de 115 cães e 135 ixodídeos foram avaliadas pela reação em cadeia da polimerase (PCR) tendo como alvo o gene gltA de Rickettsia spp. e o gene ompA das espécies do GFM. Um cão (0,87%; 1/115) foi positivo para R. rickettsii. Este animal apresentou alterações clínicas e laboratoriais inespecíficas (trombocitopenia, hiperproteinemia, linfonodos edemaciados, emagrecimento, anorexia e letargia). Rickettsia parkeri foi identificada em 2,96% (4/135) dos carrapatos (Amblyomma sculptum, A. aureolatum e Rhipicephalus sanguineus). Este estudo confirmou a presença de bactérias do GFM em locais preservados e não endêmicos, onde populações domésticas e silvestres interagem. Reforçamos o fato do cão ser susceptível à infecção natural por R. rickettsii. Embora este seja um achado raro, medidas preventivas devem ser tomadas contra a FMB nas áreas estudadas. Em última análise, a infecção por R. parkeri possivelmente está sendo demonstrada pela primeira vez em A. sculptum.


Assuntos
Animais , Masculino , Cães , Rickettsia/genética , Carrapatos/microbiologia , Doenças do Cão/diagnóstico , Rickettsiose do Grupo da Febre Maculosa/veterinária , Rickettsia/isolamento & purificação , Rickettsia/classificação , Brasil , Reação em Cadeia da Polimerase , Doenças do Cão/microbiologia , Rickettsiose do Grupo da Febre Maculosa/diagnóstico , Rickettsiose do Grupo da Febre Maculosa/microbiologia , Anticorpos Antibacterianos/sangue
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