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Electron. j. biotechnol ; 43: 23-31, Jan. 2020. ilus, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1087514


Background: Hong Qu glutinous rice wine (HQGRW) is brewed under non-aseptic fermentation conditions, so it usually has a relatively high total acid content. The aim of this study was to investigate the dynamics of the bacterial communities and total acid during the fermentation of HQGRW and elucidate the correlation between total acid and bacterial communities. Results: The results showed that the period of rapid acid increase during fermentation occurred at the early stage of fermentation. There was a negative response between total acid increase and the rate of increase in alcohol during the early fermentation stage. Bacterial community analysis using high-throughput sequencing technology was found that the dominant bacterial communities changed during the traditional fermentation of HQGRW. Both principal component analysis (PCA) and hierarchical clustering analysis revealed that there was a great difference between the bacterial communities of Hong Qu starter and those identified during the fermentation process. Furthermore, the key bacteria likely to be associated with total acid were identified by Spearman's correlation analysis. Lactobacillus, unclassified Lactobacillaceae, and Pediococcus were found, which can make significant contributions to the total acid development (| r| N 0.6 with FDR adjusted P b 0.05), establishing that these bacteria can associate closely with the total acid of rice wine. Conclusions: This was the first study to investigate the correlation between bacterial communities and total acid during the fermentation of HQGRW. These findings may be helpful in the development of a set of fermentation techniques for controlling total acid.

Bactérias/isolamento & purificação , Vinho/microbiologia , Pediococcus/isolamento & purificação , Pediococcus/genética , Pediococcus/metabolismo , Fatores de Tempo , Acetobacter/isolamento & purificação , Acetobacter/genética , Acetobacter/metabolismo , Análise por Conglomerados , Análise de Sequência , Biologia Computacional , Análise de Componente Principal , Fermentação , Microbiota , Concentração de Íons de Hidrogênio , Lactobacillus/isolamento & purificação , Lactobacillus/genética , Lactobacillus/metabolismo
Prensa méd. argent ; 105(9 especial): 621-627, oct 2019. fig
Artigo em Inglês | LILACS, BINACIS | ID: biblio-1046797


Chronic recurrent oral aphthae in residents living in an ecologically unfavourable region are characterized by a permanent course and prolonged recovery processes of regeneration of pathological elements of the oral mucosa. Using the microbiological method and modern test systems, it has been found that on the surface of aphthae an extremely diverse state of the oral microbiota is determined and its types are diverse. Trigger mechanisms have been determined. The role of representatives of various types of microorganisms - enterococci, staphylococci, streptococci, yeast-like fungi of the genus Candida (C. albicans) and obligate-anaerobes in the development of recurrent oral aphthae has been established. The data obtained can serve as an indication for the development of modern treatment and preventive measures regarding this category of patients.

Humanos , Estomatite Aftosa/microbiologia , Estomatite Aftosa/prevenção & controle , Estomatite Aftosa/terapia , Microbiota/imunologia , Estudo de Prova de Conceito , Mucosa Bucal/microbiologia
Pesqui. vet. bras ; 39(7): 454-459, July 2019. tab
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1040710


Periodontitis is an inflammatory response in a susceptible host caused by complex microbiota, predominantly composed of Gram-negative anaerobic bacteria. Aiming to characterize the subgingival bacterial microbiota associated with ovine periodontitis, polymerase chain reaction (PCR) was performed in subgingival periodontal pocket samples of 14 sheep with severe periodontitis and in subgingival sulcus biofilm of 14 periodontally healthy sheep in search mainly of Gram-negative and Gram-positive microorganisms considered important periodontopathogens. The most prevalent bacteria in the sheep with periodontal lesions were Tannerella forsythia (78.6%), Treponema denticola (78.6%), Fusobacterium nucleatum (64.3%), and Porphyromonas gingivalis (50%), whereas in the healthy sheep, F. nucleatum (42.8%) was the most often detected bacterium. Statistically significant differences were observed for Campylobacter rectus, Enterococcus faecium, Prevotella nigrescens, T. forsythia, and T. denticola (p<0.05) in the sheep with periodontitis in the comparison between groups. Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Enterococcus faecalis, and Porphyromonas gulae were not detected in any of the samples analyzed. In conclusion, C. rectus, E. faecium, P. nigrescens, T. forsythia, and T. denticola were associated with severe lesions caused by ovine periodontitis, and F. nucleatum was the most prevalent microorganism in the subgengival sulcus biofilm of healthy sheep.(AU)

Periodontite é a resposta inflamatória de um hospedeiro suscetível causada por complexa microbiota, composta predominantemente por bactérias anaeróbias Gram-negativas. Com o objetivo de caracterizar a microbiota bacteriana subgengival associada à periodontite ovina foi realizada a reação em cadeia da polimerase (PCR) de amostras de biofilme subgengival de 14 ovinos com a enfermidade e 14 ovinos periodontalmente saudáveis, com destaque para micro-organismos Gram-negativos e Gram-positivos considerados importantes periodontopatógenos. As bactérias mais prevalentes em 14 animais com lesões periodontais foram Tannerella forsythia (78,6%), Treponema denticola (78,6%), Fusobacterium nucleatum (64,3%) e Porphyromonas gingivalis (50%). Entretanto, nos 14 ovinos sem lesões periodontais, F. nucleatum (42,8%) foi a bactéria mais detectada. Associação estatisticamente diferente foi observada para Campylobacter rectus, Enterococcus faecium, Prevotella nigrescens, T. forsythia e T. denticola (p<0,05) nos ovinos com periodontite em comparação entre os dois grupos. Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Enterococcus faecalis e Porphyromonas gulae não foram detectados em nenhuma das amostras pesquisadas. Conclui-se que C. rectus, E. faecium, P. nigrescens, T. forsythia e T. denticola estão associados às lesões resultantes da periodontite ovina com manifestação clínica grave e F. nucleatum o micro-organismo mais prevalente no biofilme subgengival de animais periodontalmente sadios.(AU)

Animais , Doenças Periodontais/veterinária , Periodontite/veterinária , Ovinos , Gengiva/microbiologia , Bactérias Anaeróbias , Reação em Cadeia da Polimerase/veterinária , Microbiota
Rev. chil. nutr ; 46(3): 288-294, jun. 2019. tab, graf
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1003706


RESUMEN El queso artesanal se ha convertido en un vehículo transmisor de microorganismos causantes de infecciones alimentarias. Este estudio busca identificar la carga microbiana presente en este producto y determinar el riesgo potencial para la salud pública con la Norma Técnica Colombiana 750. Se analizaron 31 muestras adquiridas en las tiendas comercializadores de queso artesanal con Registro de Cámara y Comercio de la ciudad de Tunja. Se determinó concentración microbiana de aerobios mesófilos, mohos y levaduras, Staphylococcus aureus, coliformes totales y fecales, Listeria monocytogenes y Salmonella spp., mediante técnicas microbiológicos convencionales. Los valores promedios obtenidos para aerobios mesófilos fue de 6x106 UFC/g; coliformes totales de 6,29x105 UFC/g; coliformes fecales de 3,99x105 UFC/g, Staphylococcus aureus de 1,6x105 UFC/g y para mohos y levaduras de 4.1x105 UFC/g. Se realizó BBL Crystal ® a las colonias de agar nutritivo encontrándose una variedad de microorganismos, principalmente Streptococcus uberis, Enterococcus durans, entre otros. La prevalencia de Listeria monocytogenes fue de 3,6% y en Salmonella sp de 3,1%. Todos los parámetros analizados presentaron recuentos superiores a los establecidos por la norma, indicando que las muestras no contaban con las condiciones higiénicas adecuadas para su consumo, debido principalmente a los procesos de elaboración artesanal del producto.

ABSTRACT Artisanal cheese has become a vehicle that transmits microorganisms that cause food borne infections. This study identified the microbial load present in this product and determined the potential risk to public health using the Colombian Technical Standard 750. Thirty-one samples from artisanal cheese trading stores registered in the Chamber and Commerce of the city of Tunja, Colombia were acquired and analyzed. Microbial concentration of mesophilic aerobes, molds and yeasts, Staphylococcus aureus, total and fecal coliforms, Listeria monocytogenes and Salmonella spp. were determined using conventional microbiological techniques. The average values obtained for aerobic mesophiles were 6x106 CFU/g; total coliforms 6.29x105 CFU/g; fecal coliforms of 3.99x105 CFU/g, Staphylococcus aureus of 1.6x105 CFU/g and for molds and yeasts of 4.1x105 CFU/g. BBL Crystal® was performed on nutritive agar colonies, and a variety of microorganisms were found, mainly Streptococcus uberis, and Enterococcus durans, among others. The prevalence of Listeria monocytogenes was 3.6% and in Salmonella sp 3.1 %. All the analyzed parameters had higher counts than those established by the norm, indicating that the samples did not have the adequate hygienic conditions for their consumption, mainly due to the processes of artisanal elaboration of the product.

Controle de Qualidade , Bactérias Aeróbias , Queijo , Enterobacteriaceae , Inocuidade dos Alimentos , Microbiota , Colômbia
Rev. cient. odontol ; 7(1): 132-139, ene.-jun. 2019.
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1006014


La gingivitis es la enfermedad más prevalente, pues afecta entre un 5% y un 70% de la población mundial, y puede incluso llegar hasta un 90%. En cambio, la enfermedad periodontal (EP) alcanza un promedio del 30% al 80%, y es más frecuente a partir del segundo trimestre de embarazo. En América Latina, afecta entre un 30% y un 40% de la población. Se estima que durante el embarazo hay un mayor riesgo a contraer enfermedad periodontal en una proporción de 1 de cada 5 mujeres. La enfermedad periodontal es una enfermedad inflamatoria que perjudica a los tejidos de soporte del diente (encía, cemento radicular, ligamento periodontal y hueso alveolar).Se ha demostrado que existe una relación directa entre el agravamiento de la EP con el embarazo. Esto se debe a la variación hormonal que ocurre en este periodo, la cual promueve el crecimiento excesivo de microorganismos patógenos responsables de la inflamación gingival. Entre estos microorganismos patógenos encontramos a Prevotella intermedia y Porphyromonas gingivalis. Esta última, junto a Fusobacterium nucleatum, son capaces de atravesar la barrera placen-taria y causar infecciones y resultados adversos en el embarazo, tales como parto prematuro, preeclampsia y muerte fetal. (AU)

Gingivitis is the most prevalent disease worldwide, affecting from 5 to 70% of the population and reaching up to 90%. On the other hand, the mean prevalence of periodontal disease (PD) is 30 to 80%, being more frequent in the second trimester of pregnancy. Periodontal disease is an inflammatory disease of the tissues supporting (gingiva, root cement, periodontal ligament and alveolar bone). In Latin America, PD affects between 30 and 40% of the population, and it is estimated that 1 to 5 women will develop PD during pregnancy. It has been shown that there is a direct relationship between the aggravation of PD and pregnancy. This is due to hormonal changes during gestation, which promote the excessive growth of pathogenic microorganisms responsible for gingival inflammation.These pathogenic microorganisms include Prevotella intermedia and Porphyromonas gingivalis. The latter, together with Fusobacterium nucleatum. are able to cross the placental barrier causing infections and adverse preg-nancy outcomes, such as premature birth, preeclampsia, fetal death and metrial arteritis. (AU)

Humanos , Feminino , Doenças Periodontais , Gravidez , Microbiota , Rotas de Resultados Adversos , Gengivite
Prensa méd. argent ; 105(4): 174-176, jun 2019. tab
Artigo em Inglês | LILACS, BINACIS | ID: biblio-1026796


One of the newest areas of using the potential of a microbial association of kefir grains is obtaining a biodegradable film. The research was aimed at creating a packaging material with new properties of suppressing the development of concomitant microflora in dried berries and fruits.

Biodegradação Ambiental , Taxa de Sobrevida , Embalagem de Alimentos/métodos , Microbiota , Kefir/microbiologia , Imobilização
Rev. Investig. Salud. Univ. Boyacá ; 6(2): 17-37, 2019. graf
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1100518


Introducción. Las bacterias son organismos que se encuentran en diferentes tipos de ambientes que actúan como reservorios, entre estos, los productos de consumo derivados de los animales. Algunas de estas bacterias son capaces de causar enfermedad a los humanos y, a su vez, han evolucionado generando resistencia a antibióticos, lo cual se ha convertido en un problema de salud pública a nivel mundial. Objetivo. Describir los perfiles de susceptibilidad de grupos bacterianos provenientes de productos cárnicos y derivados, de dos lugares de abasto de Tunja. Materiales y Métodos. Estudio descriptivo de corte transversal. Se realizó muestreo de productos cárnicos en los expendios de carne y derivados, en un periodo de tres meses, en dos lugares de abasto de la ciudad de Tunja, de los cuales se tomaron diferentes cortes de productos cárnicos para su posterior análisis. Resultados. A partir de 160 muestras cárnicas recolectadas de 32 puntos de venta, se aislaron 333 cepas bacterianas, encontrando presencia de bacterias Gram negativas y Gram positivas en un 83.2% y 16.8% respectivamente. Por otra parte, los perfiles de susceptibilidad antimicrobiano para estas bacterias mostraron sensibilidad del 19,2% y 0,9%, respectivamente, a los seis antibióticos utilizados para cada grupo en el estudio. Conclusiones. Se encontró una alta presencia de bacterias procedentes de los aislados de productos cárnicos, que obliga a la mejora de las condiciones de manipulación y expendio de estos productos, dado que, entre los principales riesgos se encuentra la adquisición de cepas resistentes mediante el consumo de alimentos contaminados.

Introduction. Bacteria are found in different types of environments that act as reservoirs, among these consumer products derived from animals. Some of these bacteria are able to cause disease to humans and, it in turn, they have devolved generating antibiotics resistance, for that reason has become a public health problem worldwide. Objective. To describe susceptibility profiles of groups bacterium from meat products and derivatives, in two Tunja´s market. Materials and Methods. Descriptive cross-sectional study, they realized sampling meat´s products in meat sale zone and by-products in a three-month period in two Tunja´s market, which different cuts of meat products were taken, for further analysis. Results. From 160 meat samples collected from 32 outlets were isolated 333 bacterial strains, it found presence of Gram-negative and Gram-positive bacteria in 83.2% and 16.8% respectively. Furthermore, the profiles of antimicrobial susceptibility for these bacteria, it showed sensibility of 19,2% and 0,9% respectively to the six antibiotics used for each group in the study. Conclusions. It found a high presence of isolated bacterium from meat products, what oblige to improve od manipulation conditions and sale of these products, since, among the principal risks are the acquisition of strains resistant by means consume of these food contaminate.

Introdução. As bactérias são microorganismos que se encontram em diferentes ambientes os quais atuam como reservatórios, entre estes, os produtos de consumo derivados de animais. Algumas das bactérias têm a capacidade de causar doenças em humanos, além disso, têm evoluído gerando resistência aos antibióticos, o qual tornou-se um problema de Saúde Pública a nível mundial. Objetivo. Descrever os perfis de susceptibilidade de grupos bacterianos isolados de produtos à base de carne e derivados, de dois locais de suprimento de Tunja. Materiais e métodos. Estudo descritivo e transversal. Realizou-se uma amostragem de produtos à base de carne e derivados por um período de três meses, em locais de suprimento da cidade de Tunja, foram coletadas diferentes secções dos produtos para uma análise posterior. Resultados. De 160 amostras de produtos à base de carne e derivados coletados em 32 pontos de venda, foram isoladas 333 estirpes bacterianas, com a presença de bactérias Gram negativas y Gram positivas em 83.2 % e 16.8 % respetivamente. Por outro lado, os perfis de susceptibilidade aos antimicrobianos mostraram sensibilidade de 19,2 % e 0,9 % respetivamente, aos seis antibióticos usados para cada grupo no estudo. Conclusões. Encontrou-se uma elevada presença de bactérias isoladas de produtos à base de carne e derivados, que obriga a melhorar as condições do manuseio e da despesa dos mesmos, dado que, entre os principais riscos encontra-se a aquisição de estirpes resistentes pelo consumo dos alimentos contaminados.

Resistência a Medicamentos , Bactérias , Inocuidade dos Alimentos , Microbiota , Doenças Transmitidas por Alimentos
Gastroenterol. latinoam ; 30(supl.1): S9-S12, 2019. tab
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1116065


An adequate functioning of the digestive tract, liver and pancreas is fundamental to providing the organism with the necessary conditions for its development and maintaining its digestive and systemic homeostasis. Life expectancy has increased, it is estimated that adults over 65 years old by 2050, will represent 25% of the local population. The morphological and functional changes associated with aging in the digestive system, liver and pancreas are modest except for those that occur in the microbiota. Recently it has been possible to establish the contribution of the microbiota to life expectancy and establish a link between gastrointestinal microbiota, inflammation associated with aging (inflammaging) and survival. This represents a shift in the paradigm of our understanding physiology, chronic diseases, neoplasms and for the development of new therapies.

Un adecuado funcionamiento del tubo digestivo, hígado y páncreas es fundamental para poder brindar al organismo las condiciones necesarias para su desarrollo y mantener su homeostasis digestiva y sistémica. La expectativa de vida se ha incrementado, estimándose a nivel nacional que para el año 2050 los adultos mayores de 65 años representarán el 25% de la población. Los cambios morfológicos y funcionales asociados al envejecimiento en el aparato digestivo, hígado y páncreas son modestos a excepción, de los que se producen en la microbiota. Recientemente se ha podido establecer la contribución de la microbiota a la esperanza de vida y establecer un nexo entre microbiota gastrointestinal, inflamación asociada al envejecimiento y sobrevida. Esto representa un cambio en el paradigma sobre cómo comprendemos la fisiología, las patologías crónicas, neoplásicas y en el desarrollo de nuevas terapias.

Humanos , Pâncreas/crescimento & desenvolvimento , Envelhecimento/fisiologia , Trato Gastrointestinal/crescimento & desenvolvimento , Fígado/crescimento & desenvolvimento , Pâncreas/fisiologia , Pâncreas/patologia , Sobrevida , Trato Gastrointestinal/fisiologia , Trato Gastrointestinal/patologia , Microbiota/fisiologia , Fígado/fisiologia , Fígado/patologia
São Paulo; s.n; s.n; 2019. 87 p. graf, tab.
Tese em Português | LILACS | ID: biblio-1008501


A simbiose desenvolvida entre seres vivos e microrganismos desempenha um importante papel na relação saúde-doença do hospedeiro. Neste sentido, o corpo humano abriga uma grande e diversa comunidade de microrganismos, sendo as mucosas vaginal, intestinal e oral as principais superfícies mucosas do corpo feminino que abrigam as comunidades bacterianas de fundamental importância para a mulher. Estes microrganismos atuam no desenvolvimento e modulação do sistema imune, na manutenção e otimização de vias metabólicas e competem por sítios de colonização, prevenindo que microrganismos patogênicos estabeleçam colonização. A composição da microbiota feminina varia com a idade, pH, secreção hormonal, ciclo menstrual, uso de anticoncepcional e atividade sexual. O presente estudo buscou caracterizar a composição da microbiota do corpo feminino durante o período gestacional, comparando os achados entre gestantes e não gestantes saudáveis, através de técnicas de biologia molecular. Foram selecionadas 60 mulheres saudáveis para o estudo e coletadas amostras de secreção vaginal, fezes e swab oral de cada participante. O DNA das amostras foi extraído e submetido à sequenciamento do gene 16S rRNA e quantificado através da técnica de PCR em tempo real. Das participantes selecionadas, 42 eram gestantes e 18 eram mulheres não gestantes em idade reprodutiva. Observamos que a quantificação total de bactérias na vagina não apresentou diferenças entre gestantes e não gestantes. Houve aumento na abundância de Lactobacillus no sítio vaginal, bactérias produtoras de butirato na microbiota intestinal e Streptococcus na microbiota oral de mulheres grávidas quando comparadas com mulheres não gestantes. Além disso, observamos que a composição e a disposição dos gêneros encontrados sofrem uma modificação, tal como aumento de gêneros relacionados com a manutenção da homeostase no grupo de mulheres gestantes. O período gestacional influencia positivamente na composição da microbiota, garantindo assim a prevalência de gêneros bacterianos responsáveis pela manutenção das condições ideais para o desenvolvimento da gestação saudável

The symbiosis developed between living organisms and microorganisms plays an important role in the health-disease relationship of the host. In this sense, the human body harbor a large and diverse community of microorganisms, the vaginal, intestinal and oral mucosa are the main mucosal surfaces of the female body that harbor bacterial communities of fundamental importance for women. These microorganisms act in the development and modulation of the immune system, in the maintenance and optimization of metabolic pathways and compete for colonization sites, preventing pathogenic microorganisms from establishing colonization. The composition of the female microbiota varies with age, pH, hormonal secretion, menstrual cycle, contraceptive use and sexual activity. The present study aimed to characterize the microbiota composition of the female body during the gestational period, comparing the findings between healthy and non - pregnant women through molecular biology techniques. Sixty healthy women were selected for the study and samples of vaginal secretion, stool and oral swab from each participant were collected. The DNA of the samples was extracted and submitted to the 16S rRNA gene sequencing and quantified by the real-time PCR technique. Were select, 42 were pregnant and 18 were non-pregnant women of reproductive age. We observed that the total quantification of bacteria in the vaginal samples did not present differences between pregnant and non-pregnant women. There was an increase in the abundance of Lactobacillus in the vaginal site, butyrate producing bacteria in the intestinal microbiota and Streptococcus in the oral microbiota of pregnant women when compared to nonpregnant women. In addition, we observed that the composition and arrangement of the genera found undergo a modification, such as an increase in genera related to the maintenance of homeostasis in the group of pregnant women. The pregnancy influences the composition of the microbiota, thus ensuring the prevalence of bacterial genera responsible for the maintenance of the ideal conditions for the development of healthy pregnancy

Humanos , Feminino , Gravidez , Adolescente , Adulto , Pessoa de Meia-Idade , Mulheres , Gravidez , Microbiota/imunologia , Streptococcus agalactiae/imunologia , Microbioma Gastrointestinal , Lactobacillus/classificação
São Paulo; s.n; s.n; 2019. 132 p. graf, tab, ilus.
Tese em Português | LILACS | ID: biblio-995087


O controle microbiológico durante a produção de preparações farmacêuticas é de grande importância para garantir a qualidade do produto final, quanto às propriedades terapêuticas e de segurança ao paciente. O monitoramento ambiental é uma valiosa ferramenta como forma de mensurar a efetividade das medidas que integram a estratégia de controle de contaminação microbiana. Neste contexto, pouco destaque tem sido dado à manufatura de produtos farmacêuticos não-estéreis, por representarem as classes cujos riscos de contaminação microbiana são menores, quando comparados aos produtos parenterais. Dessa maneira, este estudo teve como objetivo caracterizar os isolados microbianos de amostras de ar ativo e passivo e de superfícies de áreas produtivas não-estéreis. Ainda, visou-se avaliar estatisticamente os dados de monitoramento ambiental, como base para o desenvolvimento de uma abordagem para determinação de limites de alerta e ação. Os resultados obtidos revelaram que a maioria dos microrganismos encontrados são de origem humana, seguidos por bactérias e fungos provenientes do solo. As diferenças sazonais foram observadas, principalmente, para a ocorrência de fungos, mais prevalentes no período seco. Foi desenvolvida uma abordagem estatística baseada em (1) determinação de subgrupos racionais, (2) avaliação da distribuição estatística e (3) determinação de limites, utilizando, como critério, o índice de capacidade do processo (Cpk). Um melhor entendimento do perfil microbiano das áreas produtivas e a determinação de limites de acordo com a distribuição real dos dados levará à destinação dos recursos necessários a ações que visem a qualidade do produto e a segurança do paciente

The microbiological control during the production of pharmaceutical preparations is of great importance for quality assurance of the final product regarding to therapeutic properties and patient safety. Environmental monitoring is a valuable tool to measure the effectiveness of the actions that integrate the microbial contamination control strategy. In this context, little attention has been given to the manufacture of non-sterile pharmaceutical products, because they represent classes whose microbial contamination risks are lower when compared to parenteral products. Considering this scenario, this study aimed to characterize microbial isolates from surfaces, active and passive air sampling of non-sterile manufacturing areas. Furthermore, it was expected to statistically evaluate the environmental monitoring data, as a basis for the development of an approach for determining alert and action limits. The results showed that most of the microorganisms found are from human source, followed by bacteria and fungi typically found in the soil. The seasonal differences were mainly observed for fungi recovery, which were more prevalent in the dry period. A statistical approach was developed based on (1) the determination of rational subgroups, (2) evaluation of the statistical distribution and (3) limit determination, using the process capacity index (Cpk) as criteria. A better understanding of the typical manufacturing areas microbial profile and the determination of limits according to the actual data distribution will lead to the allocation of the necessary resources to actions focusing on product quality and patient safety

Preparações Farmacêuticas/classificação , Técnicas Microbiológicas , Monitoramento Ambiental/estatística & dados numéricos , Preparações Farmacêuticas/análise , Estatísticas Ambientais , Microbiota/fisiologia
São José dos Campos; s.n; 2019. 201 p. il., tab., graf..
Tese em Português | LILACS, BBO - Odontologia | ID: biblio-1021069


A Fibrose Cística (FC) é uma doença genética de elevada prevalência global e que causa função anormal das glândulas exócrinas. As alterações nas funções das glândulas salivares podem impactar a saúde bucal que por sua vez podem influenciar a saúde geral. A boca pode representar um reservatório microbiano de potenciais patógenos e colonizadores das vias aéreas, causando infecções crônicas pulmonares. O objetivo deste estudo foi avaliar os impactos da FC na cavidade bucal, saliva e microbioma bucal. Foram incluídos no estudo 50 pacientes com diagnóstico de FC com idades de 3 a 20 anos, divididos em 2 grupos de acordo com o grau de severidade da doença determinado pelo escore de Shwachman-Kulczycki: G1 (baixa severidade) e G2 (alta severidade). Foi também incluído grupo controle pareado ao grupo de estudo quanto ao gênero e idade (G3, n=50). A presença de lesões de cárie foi avaliada. O impacto da FC sobre a saúde bucal foi avaliado por questionário preenchido pelos pais ou responsáveis. Amostra de saliva estimulada foi coletada de todos os pacientes. O microbioma bucal foi avaliado por Human Oral Microbe Identification using Next Generation Sequencing (HOMINGS) e metodologias de cultivo, para análise da microbiota potencialmente oportunista e cariogênica. Realizouse ainda a análise proteômica da saliva e quantificação de imunoglobulinas salivares. Os resultados foram analisados e, de acordo com a distribuição dos dados e avaliação desejada, foram aplicados os testes estatísticos apropriados, sendo adotado o nível de significância de 5%. O questionário aplicado apontou que os pais consideraram que a saúde bucal não impacta negativamente a saúde geral dos seus filhos em todos os grupos estudados Os grupos de pacientes com FC apresentaram menores índices de Ceo-d, CPO-D, taxa de fluxo salivar e pH inicial em relação ao grupo controle. As contagens de estafilococos e leveduras foram significativamente mais elevadas nos grupos FC. Todos os isolados fúngicos foram suscetíveis aos antifúngicos testados. Alta incidência de resistência foi observada dentre as cepas bacterianas. Os níveis de IgA foram mais altos nos grupos com FC em relação ao controle. Pseudomonas aeruginosa foi detectada apenas nos grupos com FC. A análise proteômica identificou 7 potenciais biomarcadores para a fibrose cística. Conclui-se que o monitoramento do microbioma oral de pacientes com fibrose cística pode ser uma ferramenta importante na prevenção da colonização pulmonar por potenciais patógenos. O estudo de biomarcadores salivares pode contribuir para o desenvolvimento de novos métodos de diagnóstico alternativos ao teste do suor para a fibrose cística(AU)

Cystic Fibrosis (CF) is a genetic disease with high global prevalence that causes abnormal function of the exocrine glands. The functional alterations of salivary glands and saliva can impact the oral health and influence general health. Oral cavity may represent a microbial reservoir of potential pathogens that can colonize the airways and cause chronic pulmonary infections. The aim of this study is to evaluate the impact of cystic fibrosis on the oral cavity, saliva and oral microbiome. Fifty CF patients aged from 3 to 20 years were divided into two groups according to the disease severity determined by the Shwachman-Kulczycki score: G1 (low severity) and G2 (high severity). Also, age and gender paired control group was included in the study (G3, n = 50). The occurrence of caries was evaluated. The impact of CF on oral health was evaluated by a questionnaire filled by parents or responsible person. Stimulated whole saliva (WS) samples were collected from all patients. The oral microbiome was analyzed by Human Oral Microbe Identification using Next Generation Sequencing (HOMINGS) and by microbiological culture methodologies to evaluate the potential opportunistic and cariogenic microbiota. The proteomic analysis of saliva and quantification of salivary immunoglobulins were carried out. Statistical analysis was performed according to the normality of the data at a significance level of 5%. The applied questionnaire pointed out that oral health did not impact systemic health negatively, according to the parents in all groups. The groups of patients with CF had lower rates of dmft, DMFT, salivary flow rate and initial pH in comparison to the control group. The counts of staphylococcal and yeast from CF groups were significant higher than the controls. All fungal isolates were susceptible to the antifungal agents. Higher incidence of bacterial resistance was observed. The IgA levels were higher in both CF groups than in the control group. Pseudomonas aeruginosa were detected only in the CF groups. The proteomic analysis identified 7 potential biomarkers for cystic fibrosis. The effects of CF in saliva and oral microbiome must be considered to establishment of therapeutic and preventives multidisciplinary protocols aiming overall health and quality of life of these patients. In conclusion, monitoring the oral microbiome of CF patients may be an important tool in the prevention of pulmonary colonization by potential pathogens. The study of salivary biomarkers may contribute to the development of new diagnostics methods alternative to sweat test for CF(AU)

Humanos , Saliva , Proteínas e Peptídeos Salivares/efeitos adversos , Fibrose Cística/classificação , Cárie Dentária/complicações , Microbiota/imunologia
Braz. J. Pharm. Sci. (Online) ; 55: e17507, 2019. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1039077


Lactobacilli prevent overproduction of pathogenic microorganisms and contribute protecting vaginal microbiota. Many probiotic microorganisms are categorized as Lactic Acid Bacteria. In this study, it was aimed identifying probiotic characteristics of Lactobacillus crispatus isolated from the vagina of a healthy woman. For this purpose, lactic acid, hydrogen peroxide and proteolytic activity quantities and auto-aggregation, co-aggregation and hydrophobicity abilities of Lactobacillus crispatus, which has been isolated and identified by 16s rRNA sequence analysis, were determined. Additionally, bile salt and acid resistance, along with antibiotic susceptibility of Lactobacillus crispatus were analyzed by the end of 3 hours. Lactic acid, hydrogen peroxide and proteolytic activity quantities of Lactobacillus crispatus were measured 2.275%, 0.334±0.075 µg/mL and 2.131±0,000 mg/mL respectively. The findings include existence of co-aggregation and auto-aggregation ability, but not hydrophobicity. By the end of 3 hours, the viability was preserved in 0.1% and 0.3% bile salt medium and, at pH 3. L. crispatus exhibited resistance to methicillin, metronidazole, oxacillin, and sulfamethoxazole + trimethoprim, but the bacteria exhibited susceptibility to tested the other antibiotics. This study will make an important contribution to the literature about probiotic characteristics of L. crispatus and our strain isolated from the vagina might be considered as a candidate probiotic.

Vagina/lesões , Probióticos/análise , Lactobacillus crispatus/metabolismo , Ácido Láctico/farmacologia , Microbiota
Braz. j. microbiol ; 49(4): 742-748, Oct.-Dec. 2018. graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-974296


ABSTRACT We examined microbial communities from enriched fine and retorted shale particles using sequencing of V4 variable region of 16S rRNA. High number of microbial genera was found in both enriched shale by-products that were dominate by Actinobacteria, Firmicutes and Proteobacteria, showing differences due to microbial colonization after the pyrolysis process.

Bactérias/isolamento & purificação , Resíduos/análise , Sedimentos Geológicos/microbiologia , Microbiota , Filogenia , Bactérias/classificação , Bactérias/genética , Brasil , DNA Bacteriano/genética , RNA Ribossômico 16S/genética , Sedimentos Geológicos/química , Biodiversidade
Braz. j. microbiol ; 49(4): 823-831, Oct.-Dec. 2018. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-974299


ABSTRACT Sour cassava starch (Polvilho azedo) is obtained from a spontaneous fermentation conducted by microorganisms from raw materials and fermentation tanks. This product is traditionally used in the baking industry for the manufacture of biscuits and Brazilian cheese breads. However, the end of fermentation is evaluated empirically, and the process occurs without standardization, which results in products of inconsistent quality. Predominant microbiota from a cassava flour manufacturer was isolated in order to select starter cultures for the production of sour cassava starch in a pilot-scale fermentation process. Lactic acid bacteria and yeasts were isolated, enumerated and grouped by Restriction Fragment Length Polymorphism, and PCR fingerprinting, respectively. One isolate of each molecular profile was identified by sequencing of the rRNA gene. LAB were prevalent throughout the entire process. Lactobacillus brevis (21.5%), which produced the highest values of acidity, and Lactobacillus plantarum (13.9%) were among the most frequent species. Pichia scutulata (52.2%) was the prevalent yeast and showed amylolytic activity. The aforementioned species were tested as single and mixed starter cultures in a pilot-scale fermentation process for 28 days. L. plantarum exhibited better performance as a starter culture, which suggests its potential for the production of sour cassava starch.

Amido/metabolismo , Leveduras/metabolismo , Manihot/química , Lactobacillus/metabolismo , Amido/química , Leveduras/genética , Brasil , Manihot/metabolismo , Fermentação , Microbiota , Microbiologia de Alimentos , Lactobacillus/isolamento & purificação , Lactobacillus/genética
Braz. j. microbiol ; 49(4): 770-776, Oct.-Dec. 2018. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-974307


ABSTRACT Anaerobic digestion is important for the management of livestock manure with high ammonia level. Although ammonia effects on anaerobic digestion have been comprehensively studied, the molecular mechanism underlying ammonia inhibition still remains elusive. In this study, based on metatranscriptomic analysis, the transcriptional profile of microbial community in anaerobic digestion under low (1500 mg L-1) and high NH4 + (5000 mg L-1) concentrations, respectively, were revealed. The results showed that high NH4 + concentrations significantly inhibited methane production but facilitated the accumulations of volatile fatty acids. The expression of methanogenic pathway was significantly inhibited by high NH4 + concentration but most of the other pathways were not significantly affected. Furthermore, the expressions of methanogenic genes which encode acetyl-CoA decarbonylase and methyl-coenzyme M reductase were significantly inhibited by high NH4 + concentration. The inhibition of the co-expressions of the genes which encode acetyl-CoA decarbonylase was observed. Some genes involved in the pathways of aminoacyl-tRNA biosynthesis and ribosome were highly expressed under high NH4 + concentration. Consequently, the ammonia inhibition on anaerobic digestion mainly focused on methanogenic process by suppressing the expressions of genes which encode acetyl-CoA decarbonylase and methyl-coenzyme M reductase. This study improved the accuracy and depth of understanding ammonia inhibition on anaerobic digestion.

Bactérias/genética , Bactérias/metabolismo , Amônia/metabolismo , Bactérias/isolamento & purificação , Bactérias/classificação , Transcrição Genética , Reatores Biológicos/microbiologia , Ácidos Graxos Voláteis/metabolismo , Microbiota , Anaerobiose , Metano/metabolismo
J. bras. pneumol ; 44(5): 424-432, Sept.-Oct. 2018. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-975938


ABSTRACT The study of the human microbiome-and, more recently, that of the respiratory system-by means of sophisticated molecular biology techniques, has revealed the immense diversity of microbial colonization in humans, in human health, and in various diseases. Apparently, contrary to what has been believed, there can be nonpathogenic colonization of the lungs by microorganisms such as bacteria, fungi, and viruses. Although this physiological lung microbiome presents low colony density, it presents high diversity. However, some pathological conditions lead to a loss of that diversity, with increasing concentrations of some bacterial genera, to the detriment of others. Although we possess qualitative knowledge of the bacteria present in the lungs in different states of health or disease, that knowledge has advanced to an understanding of the interaction of this microbiota with the local and systemic immune systems, through which it modulates the immune response. Given this intrinsic relationship between the microbiota and the lungs, studies have put forth new concepts about the pathophysiological mechanisms of homeostasis in the respiratory system and the potential dysbiosis in some diseases, such as cystic fibrosis, COPD, asthma, and interstitial lung disease. This departure from the paradigm regarding knowledge of the lung microbiota has made it imperative to improve understanding of the role of the microbiome, in order to identify possible therapeutic targets and to develop innovative clinical approaches. Through this new leap of knowledge, the results of preliminary studies could translate to benefits for our patients.

RESUMO O estudo do microbioma humano - e, mais recentemente, o do sistema respiratório - através de sofisticadas técnicas de biologia molecular, desvendou a imensa diversidade de colonização microbiana nos seres humanos, sejam saudáveis, sejam portadores de diferentes doenças. Aparentemente, ao contrário do que se acreditava, existe uma colonização não patogênica dos pulmões por microrganismos, como bactérias, fungos e vírus. Esse microbioma pulmonar fisiológico apresenta uma densidade baixa de colônias, porém uma elevada diversidade; por outro lado, alguns estados patológicos levam a uma perda dessa diversidade, com aumento da concentração de alguns gêneros bacterianos em detrimento de outros. Ainda, além do conhecimento qualitativo das bactérias presentes no pulmão em diversos estados de saúde ou de doença, o conhecimento avança para o entendimento da interação que essa microbiota tem com o sistema imune local e sistêmico, modulando a resposta imunológica. Compreendendo essa intrínseca relação entre a microbiota e os pulmões, estudos apresentam novos conceitos sobre os mecanismos fisiopatogênicos da homeostase do sistema respiratório e a possível disbiose em estado de algumas doenças, como fibrose cística, DPOC, asma e doenças intersticiais. Essa quebra de paradigma do conhecimento da microbiota presente nos pulmões fez com que se torne premente entender melhor o papel do microbioma para identificar possíveis alvos terapêuticos e abordagens clínicas inovadoras. Através desse novo salto de conhecimento é que os resultados dos estudos preliminares poderão ser traduzidos em benefícios aos nossos pacientes.

Humanos , Disbiose/imunologia , Microbiota/fisiologia , Sistema Imunitário/microbiologia , Pulmão/microbiologia , Pneumopatias/microbiologia
Odontología (Ecuad.) ; 20(1): 75-87, 20180608.
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-988130


El curso de enfermedades periodontales en el Síndrome de Down (SD) es más temprano y agresivo y está mediado por numerosos factores, como los hábitos de higiene bucal, el perfil inflamatorio y las alteraciones salivales. Objetivo: Evaluar cómo la hiposalivación y otros parámetros salivales pueden influir en las enferme-dades periodontales en los pacientes con síndrome de Down en diferentes edades. Materiales y métodos: Una muestra compuesta por 124 pacientes (Grupo A - 62 síndrome de Down; Grupo B - 62 pacientes no sindrómi-cos) de 6 a 52 años fue excedida para evaluar los parámetros salivales (flujo salival, pH y capacidad tampón) y enfermedades periodontales (índice de placa, sonda de sangrado, profundidad de sondeo y otros). Además, se recopiló información sobre salud general y hábitos de higiene oral. Resultados: El grupo A presentó un alto índice de placa, baja capacidad tampon y bajo flujo salival. Se encontró una alta prevalencia de enfermedades periodontales en pacientes con SD y una correlación entre el flujo salival bajo y la gravedad de la enferme-dad periodontal (correlación = -0,27, p = 0,002). Estos datos revelan el impacto sobre el indicador salival y la enfermedad periodontal. Conclusión: Los pacientes con SD e hiposalivación presentan un mayor riesgo de desarrollar enfermedad periodontal.

The periodontal diseases course in Down syndrome (DS) are earlier and aggressive and are mediated by nume-rous factors, such as oral hygiene habits, inflammatory profile and salivary alterations. Objective: To evaluate how the hyposalivation and other salivary parameters can influence a periodontal disease on patients with Down syndrome in different ages. Material and methods: A sample composed by 124 patients (Group A ­ 62 Down syndromes; Group B ­ 62 Non-syndromic patient) from 6 to 52 years old was excessed to evaluate the salivary parameters (salivary flow, pH and buffer capability) and periodontal diseases (plaque index, bleeding probing, probing depth and others). Also, was collected information about general health and oral hygiene habits. Re-sults: The Group A exhibited high rate of plaque, low buffer capacity and low salivary flow. It was found a high prevalence of periodontal diseases in DS patients and a correlation among the low salivary flow and the seve-rity of the periodontal disease (correlation = -0,27, p = 0,002). These data reveal the impact upon the salivary indicator and the periodontal disease. Conclusion: Patients with DS and hyposalivation present a greater risk to developing periodontal disease.

O curso de doenças periodontais na Síndrome de Down (SD) é precoce e agressivo e mediado por inúmeros fatores, como hábitos de higiene bucal, perfil inflamatório e alterações salivares. Objetivo: Avaliar como a hipossalivação e outros parâmetros salivares podem influenciar as doenças periodontais em pacientes com síndrome de Down em diferentes idades. Métodos: Amostra composta por 124 pacientes (Grupo A - 62 com Síndrome de Down; Grupo B - 62 não sindrômicos) com 6 a 52 anos de idade foi excedida para avaliar os parâ-metros salivares (fluxo salivar, pH e capacidade tampão) e doenças periodontais (índice de placa, sangramento sondagem, profundidade de sondagem e outros). Além disso, foram coletadas informações sobre saúde geral e hábitos de higiene bucal. Resultados: O grupo A apresentou alto índice de placa, baixa capacidade tampão e baixo fluxo salivar. Foi encontrada uma alta prevalência de doenças periodontais em pacientes com SD e uma correlação entre o baixo fluxo salivar e a gravidade da doença periodontal (correlação = -0,27, p = 0,002). Esses dados revelam o impacto sobre o indicador salivar e a doença periodontal. Conclusão: Pacientes com SD e hipossalivação apresentam maior risco de desenvolver doença periodontal.

Humanos , Criança , Adolescente , Adulto , Pessoa de Meia-Idade , Higiene Bucal , Doenças Periodontais , Periodontia , Xerostomia , Síndrome de Down , Placa Dentária , Análise Estatística , Técnicas de Pesquisa , Microbiota , Inflamação , Anamnese
Rev. habanera cienc. méd ; 17(3): 376-385, mayo.-jun. 2018.
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-978537


Introducción: El viroma humano se refiere al conjunto de todos los virus encontrados en el organismo humano. La diversidad viral del organismo humano bajo condiciones no patológicas ha sido subestimada. Se estima que hay 100 veces más virus en el cuerpo humano que células eucariotas. Objetivo: Realizar una revisión sistemática sobre las implicaciones del viroma humano para la salud y la enfermedad. Material y Métodos: Se realizó una revisión de artículos científicos publicados entre 2012 y 2017 en diversas bases de datos en línea. Se utilizaron en total 26 fuentes bibliográficas, incluidos artículos originales y revisiones. Desarrollo: Se presenta el conocimiento existente hasta el momento sobre las comunidades virales encontradas en diferentes sitios anatómicos como el sistema digestivo, respiratorio, genitourinario y sangre, los bacteriófagos y los Anellovirus son los virus más frecuentemente detectados. Si bien se hace evidente que el viroma tiene un papel tanto en el mantenimiento de la salud como en la enfermedad, estos mecanismos aún no se han esclarecido. Conclusiones: El organismo humano tiene una alta diversidad viral incluso bajo condiciones no patológicas. Aunque mucho se desconoce aún sobre las implicaciones del viroma, los avances en este campo abren nuevas perspectivas en la biomedicina(AU)

Introduction: The human virome refers to the collection of all viruses found in the human body. The viral diversity of the human body under non-pathological conditions has been underestimated. It is estimated that there are 100 times more viruses in the human body than eukaryotic cells. Objective: To carry out a systematic review of the human virome and its implications in health and disease. Materials and Methods: A review of scientific papers published between 2012 and 2017 in different online databases was made. A total of 26 bibliographic sources were used, including both original articles and reviews. Development: We present the existing knowledge to date about the viral communities found in different anatomical sites such as the digestive, respiratory, and genitourinary systems and the bloodstream; being the bacteriophages and Anellovirus the most frequently detected viruses. Although it is clear that the human virome plays a role both in maintaining health and in disease, these mechanisms have not yet been clarified. Conclusions: The human body has a high viral diversity even under non-pathological conditions. Although much is still unknown about the implications of these viruses on health and disease, advances in this field open new perspectives in the world of biomedicine(AU)

Humanos , Vírus , Microbiota , Genética Humana/métodos