RESUMEN
A key challenge in the analysis of cancer genomes is the identification of driver genes from the vast number of mutations present in a cohort of patients. DOTS-Finder is a new tool that allows the detection of driver genes through the sequential application of functional and frequentist approaches, and is specifically tailored to the analysis of few tumor samples. We have identified driver genes in the genomic data of 34 tumor types derived from existing exploratory projects such as The Cancer Genome Atlas and from studies investigating the usefulness of genomic information in the clinical settings. DOTS-Finder is available at https://cgsb.genomics.iit.it/wiki/projects/DOTS-Finder/.
RESUMEN
Introducción. Los programas de visualización permiten profundizar el conocimiento teórico sobre la estructura proteica. Este trabajo tiene por finalidad familiarizar alalumno con el manejo del programa de visualización molecular RasMol v. 2.7.2 para el análisis de proteínas, ya que integra conocimientos previos y persigue otros objetivos generales de la formación universitaria. Materiales y métodos.El trabajo se contextualizó considerando el eje integrador de las materias. Además, se articuló con los contenidos conceptuales y procedimentales de la temática Niveles estructurales de las proteínas. En primer lugar, se seleccionaron actividades que permitieran evaluar aspectos vinculados con la formación general pretendida para este nivel de la enseñanza formal, como expresión escrita y oral, interpretación de textos científicos en idioma inglés y manejo de base de datos bibliográficos. Resultados y conclusiones. El 70% de los alumnos pudo realizar las actividad desde manera satisfactoria. La mayoría de los grupos enfatizó tanto las cuestiones teóricas como las netamente inherentes al manejo del programa. El 30% tuvo problemas de expresión oral y escrita. Se notaron algunas dificultades en la interpretación de los modelos teóricos planteados y en la interpretación del idioma inglés, pero también hubo desconocimiento previo de la temática y falta de iniciativa para la búsqueda de material complementario. Se propone la inclusión de algunas revisiones en idioma nativo, sin perjuicio de los textos en inglés, y ejemplos más sencillos de manera introductoria para los programas de visualización,con una paulatina incorporación de ejemplos más complejos que requieran lectura complementaria (AU)
Introduction. Visualizations programs allow to analyzed eeply theoretical knowledge of protein structure. The aim of this work was to familiarize the students with the molecular visualization program RasMol v. 2.7.2 for protein analysis,integrating previous concepts and pursuing other general objectives of university formation. Materials and methods. The work was contextualized considering the integrative axis of the subjects, articulating it with conceptual and procedural contents of the topic Protein Structure Levels. Activities were selected in order to evaluate different aspects of the general formation pretended at this level of teaching, like oral and written expression, interpretation of scientific papers in English,and bibliographic database search. Results and conclusions. 80% of the students were able to do the proposed activities with acceptable quality. Most of the students equally emphasized both the theoretical and practical procedures.30% of the students have shown problems with oral or written expression. We noticed some difficulties in the interpretation of the proposed theoretical models and interpretation of the scientific papers in English. Additionally students did not show previous knowledge of the topics and did not look upfor complementary bibliography. We propose to include somereviews in native language and simpler examples to serve as an introduction to the visualization program, with gradualin corporation of more complex models that require complementary bibliography reading (AU)
