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1.
PLoS One ; 19(1): e0296305, 2024.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-38165899

ABSTRACT

Peru ranks among the three countries with the highest bird species diversity globally and a majority of those species are found in the Peruvian Amazon. However, birds in this area are currently facing serious anthropogenic threats. Genetic and genomic methods are becoming important tools for avian biodiversity monitoring and conservation planning. Comprehensive molecular libraries that are publicly available are key to the effective deployment of these tools. We analyze the information gaps for four molecular markers in the most important genetic sequence databases, Barcode of Life Data Systems (BOLD) and NCBI GenBank, for bird species of the Peruvian Amazonia. We found that 64% of Peruvian Amazonian bird species have gene sequences for COI, 59.5% have CYTB sequences, 16.4% have 12S sequences, and only 0.6% have 18S sequences. However, these numbers decrease drastically to 4.3% for COI sequences when we only consider specimens sampled in Peru. Our data also showed that 43.8% of Peruvian Amazonian endemic species (n = 32) are missing sequences of any screened marker uploaded to GenBank or BOLD. Our results will encourage and guide efforts of the scientific community to complete reference libraries for Peruvian avian species that will be useful for future DNA-based monitoring projects that include birds.


Subject(s)
Biodiversity , Birds , Animals , Peru , Birds/genetics , Brazil
2.
Sci Rep ; 13(1): 18465, 2023 10 27.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-37891335

ABSTRACT

Small species with high home fidelity, high ecological specialization or low vagility are particularly prone to suffer from habitat modification and fragmentation. The Lima leaf-toed gecko (Phyllodactylus sentosus) is a critically endangered Peruvian species that shelters mostly in pre-Incan archeological areas called huacas, where the original environmental conditions are maintained. We used genotyping by sequencing to understand the population genomic history of P. sentosus. We found low genetic diversity (He 0.0406-0.134 and nucleotide diversity 0.0812-0.145) and deviations of the observed heterozygosity relative to the expected heterozygosity in some populations (Fis - 0.0202 to 0.0187). In all analyses, a clear population structuring was observed that cannot be explained by isolation by distance alone. Also, low levels of historical gene flow were observed between most populations, which decreased as shown in contemporary migration rate analysis. Demographic inference suggests these populations experienced bottleneck events during the last 5 ka. These results indicate that habitat modification since pre-Incan civilizations severely affected these populations, which currently face even more drastic urbanization threats. Finally, our predictions show that this species could become extinct in a decade without further intervention, which calls for urgent conservation actions being undertaken.


Subject(s)
Lizards , Metagenomics , Male , Humans , Animals , Ecosystem , Heterozygote , Lizards/genetics , Peru , Genetic Variation , Endangered Species
3.
Rev. peru. biol. (Impr.) ; 29(3): e22533, July-Set. 2022. tab, graf
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1409970

ABSTRACT

Resumen El ibis de la puna Plegadis ridgwayi, es una especie de Threskiornithidae que habita humedales andinos y realiza migraciones altitudinales hacia la costa. Datos propios, de GBIF, información bibliográfica y del Censo Neotropical de Aves Acuáticas (1992 a 2015) muestran que el ibis de la puna Plegadis ridgwayi se distribuye en Ecuador, Perú, Bolivia, Argentina y Chile, con las mayores densidades poblacionales en Perú y Bolivia en siete y tres localidades respectivamente, que acumulan más del 1% de la población biogeográfica. Se encuentran de 0 a 5000 m de altitud, con las mayores densidades entre 3000 a 4500 m y 0 a 500 m. La mayor incidencia de registros ocurre al sur y centro del Perú, así como costa del centro y norte del Perú. La ampliación de la distribución hacia el norte y costa peruana puede deberse a la disponibilidad ambiental y al deterioro de su hábitat andino. En cuatro humedales costeros del centro del Perú se registraron hasta 818 ibis en 2006, la gran mayoría en Pantanos de Villa y Paraíso. El número de migrantes costeros parece relacionado a la intensidad de sequías en la sierra del Perú central. La abundancia de ibis en el lago altoandino de Junín muestra una disminución histórica, con énfasis después de la sequía de 2004-2005. La expansión distribucional requiere investigar la posible hibridación con las otras especies del género antes alopátridas.


Abstract The Puna ibis Plegadis ridgwayi, is a species of Threskiornithidae that inhabits Andean wetlands and makes altitudinal migrations to the coast. Data from us, GBIF, bibliographic information and the Neotropical Waterbird Census (1992 to 2015) show that this species occurs in Ecuador, Peru, Bolivia, Argentina, and Chile, with a core area in Peru and Bolivia. It is most abundant in the latter two countries, with seven and three localities with more than 1% of the biogeographic population, respectively. They are found from 0 to 5000 m altitude (with peaks at 3000 to 4500 m and 0 to 500 m). The highest incidence of records is in southern and central Peru. There are high values of environmental availability in part of the high Andean zone from Ecuador to northern Chile and northwestern Argentina, as well as the coast of central and northern Peru. The expansion of the distribution towards the Peruvian north and coast may be due to environmental availability and the deterioration of its Andean habitat. In four coastal wetlands in central Peru, up to 818 ibises were recorded in 2006, the vast majority in Pantanos de Villa and Paraíso. The number of coastal migrants seems to be related to the intensity of droughts in the highlands of central Peru. The abundance of ibis in the high Andean Lake of Junín shows a historical decline, with emphasis after the 2004-2005 drought. This distributional expansion requires investigation of possible hybridisation with the other formerly allopatric species of the genus.

4.
Rev. peru. biol. (Impr.) ; 28(spe): e21915, dic. 2021. tab, graf
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1377180

ABSTRACT

Resumen Presentamos una lista actualizada de las especies de aves del departamento de Loreto. La lista está basada en la revisión de ejemplares de colecciones científicas, registros históricos, publicaciones y observaciones de campo. Reportamos 1040 especies de aves para Loreto, 72 de ellas en alguna categoría de amenaza, 72 migratorias y 13 endémicas de Perú. Percnostola arenarum, Pithys castaneus y Polioptila clementsi son endémicas de Loreto. Las familias con mayor número de especies son Tyrannidae, Thamnophilidae y Thraupidae. La lista presentada tiene alta confiabilidad debido al respaldo de cerca del 81% de las especies en especímenes de colecciones científicas y apenas el 1.5% solo por reportes de avistamientos realizados por ornitólogos. Las especies de aves de Loreto representan alrededor del 55% del total reportado para el Perú y en Passeriformes el 52% de los estimado para la Amazonia. La distribución de los registros muestra que es necesario explorar áreas cercanas a las fronteras con Colombia y Brasil, así como las cordilleras que comparten con Amazonas y San Martín. En base a la distribución de la avifauna amenazada y endémica se propone priorizar el estudio y protección de áreas montanas y de bosques de arena blanca en particular.


Abstract We present an updated list of bird species from Department of Loreto. The list is based on the review of specimens from scientific collections, historical records, publications, and field observations. We report 1040 species of birds in Loreto, 72 in some threat category, 72 migratory and 13 endemics to Peru. Percnostola arenarum, Pithys castaneus and Polioptila clementsi are endemics to Loreto. The families with the highest numbers of species are Tyrannidae, Thamnophilidae and Thraupidae. The list presented is highly reliable due to the support of about 81% of the species on specimens from scientific collections and only 1.5% from sighting reports by ornithologists. Bird species from Loreto represent about 55% of the total reported for Peru and in Passeriformes 52% of those estimated for the Amazonia. The distribution of reports shows that it is necessary to explore areas close to the region's borders with Colombia and Brazil, as well as the mountain ranges shared with Amazonas and San Martin. Based on the distribution of threatened and endemic avifauna, we propose to prioritize the study and protection of montane areas and white-sand forests.

5.
Rev. peru. biol. (Impr.) ; 28(spe): e21916, dic. 2021. graf
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1377181

ABSTRACT

Resumen En 1542 Orellana llega al Amazonas e inicia una historia de exploración continua de Loreto. Sin embargo, los estudios de las aves de este departamento recién empiezan en el siglo XIX con las exploraciones de Johann Baptist von Spix, Johann Jakob Von Tschudi, Francis-Louis de Castelnau, Emile Deville, Edward Bartlett, John Hauxwell y Henry Walter Bates quienes colectan para museos europeos y estadounidenses. En 1850 llega Antonio Raimondi al Perú incorporándose a la Universidad Nacional Mayor de San Marcos e iniciando los estudios nacionales de aves loretanas en 1859 y 1869. Raimondi colaboró activamente con Władysław Taczanowski, asistidos por Konstanty Jelski y Jan Stolzmann, cuyas colectas en Loreto fueran usadas en Ornithologie du Pérou, primer tratado de la avifauna peruana, conservándose algunos especímenes en el Museo de Historia Natural de la UNMSM (MHN). A inicios del siglo XX, Malcolm Anderson y Wilfred Osgood y posteriormente los hermanos Olalla colectaron para museos estadounidenses, marcando el inicio del predominio norteamericano en la ornitología en Perú. El investigador peruano Javier Ortiz de la Puente, primer jefe de la Sección Aves del MHN, realizó colectas en Loreto en 1948 y 1952, antes de su prematura muerte. María Koepcke, siguiente responsable de la Sección Aves del MHN, colecta en Pacaya-Samiria en 1967. John Patton O'Neill visita Loreto en 1963, iniciándose un interés que lo llevaría a impulsar la ornitología en Perú por varias décadas. La investigación continua de la avifauna loretana convirtió a esta región en un punto clave para entender los patrones de diversificación de las aves amazónicas.


Abstract In 1542 Orellana arrived in the Amazon and began a history of continuous exploration of Loreto. However, the birds' study of Loreto began in the 19th century with the explorations of Johann Baptist von Spix, Johann Jakob von Tschudi, Francis-Louis de Castelnau, Emile Deville, Edward Bartlett, John Hauxwell and Henry Walter Bates, who collected for European and American museums. In 1850 Antonio Raimondi arrived in Peru, joining the Universidad Nacional Mayor de San Marcos, and starting national studies of birds of Loreto in 1859 and 1869. Raimondi actively collaborated with Władysław Taczanowski, assisted by Konstanty Jelski and Jan Stolzmann, whose collections in Loreto were used in Ornithologie du Pérou, the first treatise on Peruvian avifauna. Some of these specimens are preserved in the Museo de Historia Natural of the UNMSM (MHN). At the beginning of the 20th century, Malcolm Anderson and Wilfred Osgood and later the Olalla brothers collected for American museums, marking the beginning of American predominance in ornithology in Peru. The Peruvian researcher Javier Ortiz de la Puente, the first head of the Bird Section of the MHN, collected in Loreto in 1948 and 1952, before his unfortunate death. María Koepcke, next head of the MHN Bird Section, collected in Pacaya-Samiria in 1967. John Patton O'Neill visited Loreto in 1963, initiating an interest that would lead him to promote ornithology in Peru for several decades. The continuous research of Loreto's avifauna turned this region into a key point to understand the diversification patterns of Amazonian birds.

6.
Enferm. intensiva (Ed. impr.) ; 27(3): 129-131, jul.-sept. 2016.
Article in Spanish | IBECS | ID: ibc-155141

ABSTRACT

Antecedentes: Es importante describir los factores estresantes percibidos por los pacientes ingresados en las unidades de cuidados intensivos (UCI), para poder garantizar un cuidado holístico y poder eliminarlos. También es fundamental un feedback a los proveedores de cuidados de salud para que puedan garantizar el bienestar de los pacientes en las unidades de críticos. Objetivo: Los objetivos del estudio son, en primer lugar, investigar la percepción que tienen los pacientes de los factores estresantes en las UCI; en segundo lugar, estudiar la percepción que tienen los proveedores de cuidados de salud sobre lo que puede estresar a los pacientes en las UCI; y en tercer lugar describir cómo los proveedores de cuidados de salud manejan los factores de estrés de sus pacientes. Diseño: Estudio mixto de investigación. La parte cuantitativa replica el estudio de Cornock's del año 1998, pero no solo incluye enfermeras en su muestra, sino que amplía al resto de proveedores de cuidados de salud de las UCI. La parte cualitativa consta de un estudio fenomenológico y describe cómo los proveedores de cuidados de salud manejan los factores de estrés de los pacientes en las UCI. La teoría de Lazarus y Folkman constituyen la base para integrar todas las variables recogidas en el estudio. Tamaño de la muestra: La muestra estuvo constituida por 70 pacientes y 70 proveedores de cuidados de salud. Una vez que consintieron aceptar en el estudio se les pasó una batería de preguntas sobre datos demográficos y el cuestionario en papel Enviromental Stressors graphic data form questionnaire (ESQ). Los datos se recogieron de manera anónima mientras duraba el ingreso. Resultados: El presente artículo solo muestra la parte cuantitativa del estudio. El análisis descriptivo de los datos se realizó utilizando el paquete estadístico SPSS(R). Los 3 ítems del cuestionario más puntuados por los pacientes fueron: sentir dolor, incapacidad para dormir y las preocupaciones económicas. Según los proveedores de cuidados de salud los ítems más puntuados fueron: sentir dolor, incapacidad para comunicarse y falta de control sobre uno mismo. La puntuación en la escala para conocer la percepción del estrés fue más elevada en los profesionales que en los pacientes. Implicaciones para la práctica: La información que aporta el estudio puede ayudar al equipo de las unidades de intensivos a cambiar y rediseñar el ambiente en las UCI para crear un ambiente menos estresante


No disponible


Subject(s)
Humans , Male , Female , Critical Care , Critical Care/organization & administration , Critical Care/standards , Intensive Care Units , Intensive Care Units/organization & administration , Burnout, Professional/complications , Burnout, Professional/nursing , Burnout, Professional/psychology , Stress, Psychological/complications , Stress, Psychological/nursing , Stress, Psychological/psychology
7.
Rev. chil. cir ; 68(2): 176-179, abr. 2016. ilus
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-784850

ABSTRACT

Aim: To present a patient with an uncommon primary extramedullary plasmocytoma in the colon. Case report: We report a case of a 64 year old female with wasting syndrome and low-gastrointestinal bleeding. Histology described colon and rectum with plasma cell infiltration in the muscle layer. The immunohistochemistry showed CD45 (+) and lambda (+). Infiltration of bone marrow and other places with a thoraco-abdominal-pelvic scan, blood tests, bone survey and bone marrow biopsy was discarded. Surgical management was performed by laparoscopic low anterior resection with end colostomy. Conclusion: Primary plasmacytoma of colon is a rare clinical entity that is a challenge for the pathologist and surgeon, but early diagnosis contributes to early handling.


Objetivo: Presentar un caso de esta poco frecuente patología en el colon. Caso clínico: Se reporta el caso de una paciente mujer de 64 años con síndrome consuntivo y sangrado digestivo bajo. La anatomía patológica describe colon y recto con infiltración de células plasmáticas en la capa muscular. La inmunohistoquímica demostró CD45 (+) y lambda (+). Se descartó la infiltración de médula ósea y otros lugares con una tomografía abdomino-pélvica, análisis de sangre, radiografía de cráneo y biopsia de médula ósea. El manejo quirúrgico se realizó mediante resección anterior baja laparoscópica con colostomía terminal. Conclusión: El plasmocitoma primario de colon es una entidad clínica rara que constituye un reto para el patólogo y cirujano, pero su diagnóstico oportuno contribuye a un manejo temprano.


Subject(s)
Humans , Female , Middle Aged , Plasmacytoma/surgery , Colorectal Neoplasms/surgery , Plasmacytoma/diagnosis , Colorectal Neoplasms/diagnosis
8.
Aten Primaria ; 40(6): 291-5, 2008 Jun.
Article in Spanish | MEDLINE | ID: mdl-18588800

ABSTRACT

OBJECTIVES: To evaluate the efficacy of nursing care and monitoring of patients over 65 in primary care, to reduce the rate of readmission and to extend time till readmission. DESIGN: Non-randomised clinical trial with control. SETTING: Base Area 8, Madrid, Spain. Primary and specialist care. PARTICIPANTS: Patients over 65 admitted from home with the pathologies under study. There were 97 patients in the study, 49 in the intervention group and 48 in the control group. INTERVENTIONS: In the intervention group, link nursing conducted visits every 48 hours and provided health education to carer and patient. Patients in the control group received conventional care. Patients in both groups were contacted by phone by primary care nurses 2, 6, 12, and 24 weeks after their hospital discharge. MEASUREMENTS: Readmission for the same reason was recorded. As a secondary variable, time till readmission was recorded. RESULTS: Patients in the control group were admitted more often than those in the experimental group (OR, 3.3; 95% CI, 1.13-9.52; adjusted for the admission diagnosis). The result was consistent, on conducting an analysis of the time elapsed before readmission (HR, 2.29; 95% CI, 1.03-5.10; adjusted in the same way). CONCLUSIONS: A planned intervention into discharges with full, individual evaluation reduces readmissions and increases the time till readmission in patients over 65.


Subject(s)
Patient Care Planning , Patient Readmission/statistics & numerical data , Aged , Female , Humans , Male
9.
Aten. prim. (Barc., Ed. impr.) ; 40(6): 291-295, jun. 2008. ilus, tab
Article in Es | IBECS | ID: ibc-66017

ABSTRACT

Objetivos. Evaluar la eficacia de la planificación del alta y seguimiento en atención primaria de pacientes mayores de 65 años, para disminuir la tasa de reingresos y la reducción del tiempo hasta el reingreso. Diseño. Ensayo clínico controlado, no aleatorizado. Emplazamiento. Área Sanitaria 8 de Madrid. Participantes. Mayores de 65 años que ingresaran procedentes de sus domicilios con las patologías de estudio. Participaron en el estudio 97 pacientes, 49 en el grupo intervención y 48 en el grupo control. Intervenciones. El personal de enfermería de enlace realizaba visitas cada 48 horas y proporcionaba educación sanitaria al cuidador y al paciente. Los pacientes en el grupo control recibieron la atención convencional. El personal de enfermería de atención primaria contactó telefónicamente con los pacientes de ambos grupos a las 2, 6, 12 y 24 semanas después de su alta hospitalaria. Mediciones. Se registró el reingreso por la misma causa y el tiempo hasta el reingreso. Resultados. Los pacientes del grupo control ingresaron con más frecuencia que los del grupo experimental (OR = 3,3; IC del 95%, 1,13-9,52; ajustado por el diagnóstico al ingreso). El resultado concordaba al realizar un análisis considerando el tiempo hasta el reingreso (HR = 2, 29; IC del 95%, 1,03-5,10; ajustando de la misma manera). Conclusiones. Una intervención planificada del alta con una valoración integral individualizada disminuye los reingresos y el tiempo hasta el reingreso en mayores de 65 años


Objectives. To evaluate the efficacy of nursing care and monitoring of patients over 65 in primary care, to reduce the rate of readmission and to extend time till readmission. Design. Non-randomised clinical trial with control. Setting. Base Area 8, Madrid, Spain. Primary and specialist care. Participants. Patients over 65 admitted from home with the pathologies under study. There were 97 patients in the study, 49 in the intervention group and 48 in the control group. Interventions. In the intervention group, link nursing conducted visits every 48 hours and provided health education to carer and patient. Patients in the control group received conventional care. Patients in both groups were contacted by phone by primary care nurses 2, 6, 12, and 24 weeks after their hospital discharge. Measurements. Readmission for the same reason was recorded. As a secondary variable, time till readmission was recorded. Results. Patients in the control group were admitted more often than those in the experimental group (OR, 3.3; 95% CI, 1.13-9.52; adjusted for the admission diagnosis). The result was consistent, on conducting an analysis of the time elapsed before readmission (HR, 2.29; 95% CI, 1.03-5.10; adjusted in the same way). Conclusions. A planned intervention into discharges with full, individual evaluation reduces readmissions and increases the time till readmission in patients over 65


Subject(s)
Humans , Male , Female , Middle Aged , Efficacy/methods , Patient Discharge/statistics & numerical data , Patient Discharge/trends , Health Planning/methods , Health Planning/statistics & numerical data , Nursing Staff/organization & administration , Nursing Staff , Primary Health Care/methods , Primary Health Care/trends , Patient Selection , Patient Discharge/economics , Efficacy/organization & administration , Patient Care Planning/economics , Patient Care Planning/organization & administration , Nursing Staff/education , Nursing Staff/statistics & numerical data
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