[Mammographic and ultrasonographic BIRADS classification and its correlation with histopathologic findings]. / Clasificación mastográfica y ultrasonográfica del BIRADS y su correlación con los hallazgos histopatológicos.

BACKGROUND: Screening programs for breast cancer include self and clinical examination and Imaging studies to obtain the BIRADS (Breast Imaging Reporting and Data System) grade has been described as an important tool. In México, breast cancer is the leading death cause from malignancy in women and thus an early detection and prompt treatment is an important public health concern OBJECTIVE: To compare the BIRADS classification with histopathological findings and cases of malignancy. METHODS: This is a retrospective, observational and descriptive study about of the correlation between histopathological reports and BIRADS classification. RESULTS: Records of 1551 patients were reviewed, of which only 176 met the inclusion criteria. There was a predominance of fibrocystic condition. 44 patients had cancer, with varying degrees of detection according to each category of the classification where BIRADS 5 corresponded to 100% of the malignant cases. CONCLUSION: Consistent with the results reported by other authors, highlighting some situations like BIRADS 4C (where there was a slight difference compared to literature) and the BIRADS 5 in which a detection of 100% of cases of cancer was achieved.

Elasmobranchs observed in deepwaters (45-330m) at Isla del Coco National Park, Costa Rica (Eastern Tropical Pacific) / Elasmobranquios observados en aguas profundas (45-330m) en el Parque Nacional Isla del Coco, Costa Rica (Pacífico Tropical Oriental)

Isla del Coco is an oceanic island 500km off the Pacific coast of Costa Rica. It is a National Park and its marine fauna has been relatively well protected. The island is famous for its elasmobranch (sharks, rays and skates) sightings in shallow waters. Here we present a catalogue of the deepwater elasmobranchs observed with the DeepSee submersible. Five species of sharks, six species of skates and one ray have been observed between 45 and 330m depth. Triaenodon obesus, the white tip reef shark, was commonly observed between 80 and 301m, but only in the afternoons. Sphyrna lewini, the scalloped hammerhead shark, was observed as deep a 303m, but commonly between 45 and 90m, and close to the island. Odontaspis ferox, the smalltooth sand tiger shark, was observed between 82 and 316m. Echinorhinus cookei, the prickly shark, was observed between 91 and 320m. Rhincodon typus, the whale shark, was observed only close to the island, between 77 and 80m. Taeniura meyeni, the marbled ray, was observed only close to the island, between 45 and 90m. A Dasyatis sp., similar to the the diamond stingray, was observed only once close to the island at 60m; this is the first report of this genus at Isla del Coco National Park. Manta birostris, the giant manta, was only observed close to the island at 90m. Mobula tarapacana, the sicklefin devil ray, was observed between 60 and 326m, extending its maximum depth almost 10 times what has been reported. Aetobatus narinari, the spotted eagle ray, was observed only close to the island between 60 and 82m. Torpedo peruana, the Peruvian torpedo ray, was observed only once at 313m, and is the first record of this species from Isla del Coco National Park.

La Isla del Coco es una isla oceánica a 500km de la costa Pacífica de Costa Rica. Es un Parque Nacional donde la fauna marina ha estado relativamente bien protegida. La isla es famosa por los elasmobranquios (tiburones y rayas) en aguas poco profundas. Aquí presentamos un catálogo de elasmobranquios observados con el sumergible DeepSee. Cinco especies de tiburones y siete especies de rayas han sido observadas entre 45 y 330m de profundidad. Triaenodon obesus, tiburón punta blanca de arrecifes o tiburón cazón coralero, observado comúnmente entre 80 y 301m pero solo en las tardes. Sphyrna lewini, el tiburón martillo o cornuda común, registrado hasta 303m, pero comúnmente entre 45 y 90m, y cerca de la Isla del Coco. Odontaspis ferox, tiburón solrayo, visto entre 82 y 316m. Echinorhinus cookei, tiburón negro espinoso, avistado entre 91 y 320m. Rhincodon typus, tiburón ballena, observado solamente cerca de la isla, entre 77 y 80m. Taeniura meyeni, raya moteada, vista solamente cerca de la isla, entre 45 y 90m. Dasyatis sp., parecida a la raya látigo, registrada solamente una vez, cerca de la isla a 60m; este es el primer informe de esta especie en el Parque Nacional Isla del Coco. Manta birostris, manta gigante, observada únicamente cerca de la isla a 90m. Mobula tarapacana, manta cornuda o manta moruma, vista entre 60 y 326m, extendiendo su profundidad máxima casi 10 veces a lo informado en la literatura. Aetobatus narinari, chucho pintado o raya águila, observada solamente cerca de la isla entre 60 y 82m. Por último, Torpedo peruana, raya torpedo eléctrico o raya peruana, solamente vista una vez a 313m y es el primer informe de esta especie en el Parque Nacional Isla del Coco.

Amoebicidal and giardicidal compounds from the leaves of Zanthoxylum liebmannianun.

The crude ethanol extract from the leaves of Zanthoxylum liebmannianum exhibited inhibitory effect on the reproduction of trophozoites of Entamoeba histolytica (IC(50)=3.48 microg/ml) and Giardia lamblia (IC(50)=58.00 microg/ml). From this extract, asarinin, hyperin, beta-sitosterol, and beta-sitosterol glucoside were isolated. Among them, asarinin was the most active with IC(50) values of 19.86 microg/ml for E. histolytica and 35.45 microg/ml for G. lamblia. The remaining compounds showed moderate activity against both parasites.

Fructo-oligosaccharides production by the Gluconacetobacter diazotrophicus levansucrase expressed in the methylotrophic yeast Pichia pastoris.

Levansucrase (LsdA) (EC 2.4.1.10) from Gluconacetobacter diazotrophicus (formerly Acetobacter diazotrophicus) yields high levels of fructo-oligosaccharides (FOS) from sucrose. A DNA fragment encoding the precursor LsdA lacking the first 57 amino acids was fused to the pho1 signal sequence under the control of the Pichia pastoris-alcohol oxidase 1 (AOX1) promoter. Methanol induction of a P. pastoris strain harboring a single copy of the lsdA expression cassette integrated in the genome resulted in the production of active levansucrase. After fermentation of the recombinant yeast, LsdA activity was detected in the periplasmic fraction (81%) and in the culture supernatant (18%) with an overall yield of 1% of total protein. The recombinant LsdA was glycosylated and displayed optimal pH and temperature for enzyme activity similar to those of the native enzyme, but thermal stability was increased. Neither fructosylpolymerase activity nor FOS production was affected. Incubation of recombinant LsdA in sucrose (500 g l(-1)) yielded 43% (w/w) of total sugar as 1-kestose, with a conversion efficiency about 70%. Intact recombinant yeast cells also converted sucrose to FOS although for a 30% efficiency.

Structural levansucrase gene (lsdA) constitutes a functional locus conserved in the species Gluconacetobacter diazotrophicus.

Levansucrase (EC 2.4.1.10) was identified as a constitutive exoenzyme in 14 Gluconacetobacter diazotrophicus strains recovered from different host plants in diverse geographical regions. The enzyme, consisting of a single 60-kDa polypeptide, hydrolysed sucrose to synthesise oligofructans and levan. Sugar-cane-associated strains of the most abundant genotype (electrophoretic type 1) showed maximal values of levansucrase production. These values were three-fold higher than those of the isolates recovered from coffee plants. Restriction fragment length polymorphism analysis revealed a high degree of conservation of the levansucrase locus (IsdA) among the 14 strains under study, which represented 11 different G. diazotrophicus genotypes. Targeted disruption of the lsdA gene in four representative strains abolished their ability to grow on sucrose, indicating that the endophytic species G. diazotrophicus utilises plant sucrose via levansucrase.

Levansucrase from Acetobacter diazotrophicus SRT4 is secreted via periplasm by a signal-peptide-dependent pathway.

Acetobacter diazotrophicus SRT4 secretes a constitutive levansucrase (LsdA) (EC 2.4.1.10) that is responsible for sucrose utilization. Immunogold electron microscopical studies revealed that LsdA accumulates in the periplasm before secretion. The periplasmic and extracellular forms of the enzyme were purified to homogeneity. Both proteins exhibited similar physical and biochemical characteristics indicating that LsdA adopts its final conformation in the periplasm. The N-terminal sequence of mature LsdA was pGlu-Gly-Asn-Phe-Ser-Arg as determined by PSD-MALDI-TOFMS (post-source decay-matrix-assisted laser desorption/ionization-time-of-flight mass spectrometry). Comparison of this sequence with the predicted precursor protein revealed the cleavage of a 30-residue typical signal peptide followed by the formation of the pyroglutamic acid (pGlu) residue. Thus, in contrast with other Gram-negative bacteria, A. diazotrophicus secretes levansucrase by a signal-peptide-dependent mechanism.

Substitution of Asp-309 by Asn in the Arg-Asp-Pro (RDP) motif of Acetobacter diazotrophicus levansucrase affects sucrose hydrolysis, but not enzyme specificity.

beta-Fructofuranosidases share a conserved aspartic acid-containing motif (Arg-Asp-Pro; RDP) which is absent from alpha-glucopyranosidases. The role of Asp-309 located in the RDP motif of levansucrase (EC 2.4.1.10) from Acetobacter diazotrophicus SRT4 was studied by site-directed mutagenesis. Substitution of Asp-309 by Asn did not affect enzyme secretion. The kcat of the mutant levansucrase was reduced 75-fold, but its Km was similar to that of the wild-type enzyme, indicating that Asp-309 plays a major role in catalysis. The two levansucrases showed optimal activity at pH 5.0 and yielded similar product profiles. Thus the mutation D309N affected the efficiency of sucrose hydrolysis, but not the enzyme specificity. Since the RDP motif is present in a conserved position in fructosyltransferases, invertases, levanases, inulinases and sucrose-6-phosphate hydrolases, it is likely to have a common functional role in beta-fructofuranosidases.

Functional Bradyrhizobium japonicum NifA expression under a hybrid nptII-nifH promoter in E. coli and Acetobacter diazotrophicus SRT4.

A hybrid promoter consisting of the in tandem fusion of the Tn5 nptII and the Klebsiella pneumoniae nifH promoters was constructed to study the functionality of the nif genes transcriptional activator NifA from Bradyrhizobium japonicum in two different host bacteria. beta-galactosidase experiments in E. coli revealed that the hybrid nptII-nifH promoter can behave as a constitutive or a NifA-inducible promoter depending on the aeration conditions. Expression of the B. japonicum NifA from the hybrid nptII-nifH promoter (plasmid pBPF204) induced "in trans" lacZ transcription from the Azotobacter chroococcum nifH promoter in E. coli and A. diazotrophicus cells grown at low pO2. Similarly, the plasmid pBPF204 increased nitrogenase activity in A. diazotrophicus cells grown under microaerobic conditions. Based on these results, we suggest that the B. japonicum NifA could function as an efficient O2-sensitive transcriptional activator of nif genes in genetically distant diazotrophic bacteria.

Desarrollo de un modelo matemático predictivo de mortalidad para pacientes en UTI / Development of a predictive mathematic model of the mortality for Intensive Care patients

Tipo de estudio: Estudio de casos, prospectivo, multicéntrico. Objetivo: Desarrollar un modelo predictivo de mortalidad, aplicable a los pacientes en Terapia Intensiva, encaminado a una propuesta de criterios de admisión y ayuda en la toma de decisiones. Material y métodos: Se analizaron los datos de 561 pacientes internados en las UTI de Comodoro Rivadavia-Chubut; entre septiembre de 1995 y agosto de 1996. La muestra se sometió a análisis multivariados cuya variable dependiente fue la evolución de los pacientes. Se calculó, previamente, el peso de cada falla orgánica y de cada punto del score APACHE en la base global. Se estudió el desarrollo de un modelo predictivo que englobara al puntaje APACHE II, diagnósticos de ingreso, pertenencia al grupo clínico o quirúrgico y desarrollo de fallas orgánicas, mediante regresión logística. Se calibró el modelo según Goodness of Fit de Hosmer Lemeshow y se discriminó por metodología ROC. El modelo predictivo se armó, separando los pacientes en dos grupos (Set de desarrollo= 286) (Set de validación= 275) que se sometieron al mismo análisis estadístico. La correlación entre ambos grupos fue buena. Resultados: El análisis de la pertenencia al grupo de patología clínica o quirúrgica, y de los grupos de diagnóstico al ingreso; no arrojaron diferencias estadísticas con respecto al egreso. Los resultados del modelo que consideró a la sumatoria total de: APACHE II, requerimiento de ARM y sumatoria de pesos de FMO, mostraron tanto en el set de desarrollo como en el validación, un nivel de clasificación correcto para sobrevivientes (SV) de 96,4 por ciento y NO sobrevivientes (NS) de 60,7 por ciento. La clasificación correcta global fue del 89,42 por ciento. El área cubierta bajo la curva ROC es de 0,91. El punto de corte de probabilidad utilizado fue de 0,5. Dada la buena calibración y discriminación en la muestra de estudio, se analizó un modelo alternativo que estuviera conformado por la sumatoria de pesos relativos de APACHE II (0,19/punto), ARM (4,69) y FMO (1 a 3), el que también presentó una buena calibración y discriminación. La discriminación de este modelo arrojó una sensibilidad del 59,8 por ciento y una especificidad del 96,5 por ciento. Total de correctos verdaderos 89,4 por ciento. El área bajo la curva ROC es de 0,91...

Validación del APACHE II en la Patagonia Central: APACHE II, un índice pronóstico / Validation of APACHE II system in the Central Patagonia: APACHE II, a prognostic indicator

Tipo de estudio: Prospectivo, multicéntrico. Objetivo: Validación regional del sistema APACHE II, de los fallos multiorgánicos (FMO) y de la utilización de prácticas terapeúticas complejas como indicadores pronósticos en pacientes gravemente injuriados ingresados a terapia intensiva, encaminado a una propuesta de criterios de admisión y niveles de intensidad en el tratamiento. Material y métodos: Se estudiaron 561 pacientes internados en las Unidades de Terapia Intensiva de Comodoro Rivadavia durante un año. A su ingreso se los evaluó según el sistema APACHE II, y durante su internación se registraron los FMO desarrollados por cada paciente, y si fueron sometidos a cirugía, hemodiálisis y/o asistencia respiratoria mecánica. La variable dependiente fue la evolución final de cada paciente y su estdía en UTI. Se utilizó el análisis con Chi-cuadrado para variables ctegóricas; el Anova (Análisis de Varianza) para variables numéricas; los análisis multivariados de regresión logística para calcular los pesos de cada falla orgánica y de cada punto de apache en la población total y el de regresión de riesgos proporcionales de Cox para el estudio de factores pronósticos y su participación en la evolución de cada paciente. A aquellos factores que demostraron tener significación estdística se los sometió a análisis de Kaplan-Meier para establecer la media de sobrevida de los pacientes con esos factores. Resultados: El score fisiológico agudo (APS), APACHE II y los pesos de fallas orgánicas, demostraron valores de p<0,001, muy significativos. Si bien, la mayor parte de las variables demostraron una distribución disgnificativa con respecto al egreso, las únicas que evidenciaron ser factores de riesgo para NO Sobrevivientes (NS) fueron el desarrollo de falla del sistema nervioso central (SNC), respiratoria y el requerimiento de asistencia respiratoria mecánica (ARM). Los pesos de cada falla orgánica calculados fueron: HEMATOLOGICO, CARDIOLOGICO y RENAL 1; DIGESTIVO 2; SNC 2,5; y RESPIRATORIO 3. Conclusión: Se validó el sistema APACHE II en nuestra región como un indicador pronóstico de gran utilidad. Las fallas del sistema hematohemostático, cardiovascular y renal presentan pesos bajos que no influyen netamente en la mortalidad, el sistema digestivo es intermedio y el SNC y respiratorio poseen los más altos pesos

Desarrollo de un modelo matemático predictivo de mortalidad para pacientes en UTI / Development of a predictive mathematic model of the mortality for Intensive Care patients

Tipo de estudio: Estudio de casos, prospectivo, multicéntrico. Objetivo: Desarrollar un modelo predictivo de mortalidad, aplicable a los pacientes en Terapia Intensiva, encaminado a una propuesta de criterios de admisión y ayuda en la toma de decisiones. Material y métodos: Se analizaron los datos de 561 pacientes internados en las UTI de Comodoro Rivadavia-Chubut; entre septiembre de 1995 y agosto de 1996. La muestra se sometió a análisis multivariados cuya variable dependiente fue la evolución de los pacientes. Se calculó, previamente, el peso de cada falla orgánica y de cada punto del score APACHE en la base global. Se estudió el desarrollo de un modelo predictivo que englobara al puntaje APACHE II, diagnósticos de ingreso, pertenencia al grupo clínico o quirúrgico y desarrollo de fallas orgánicas, mediante regresión logística. Se calibró el modelo según Goodness of Fit de Hosmer Lemeshow y se discriminó por metodología ROC. El modelo predictivo se armó, separando los pacientes en dos grupos (Set de desarrollo= 286) (Set de validación= 275) que se sometieron al mismo análisis estadístico. La correlación entre ambos grupos fue buena. Resultados: El análisis de la pertenencia al grupo de patología clínica o quirúrgica, y de los grupos de diagnóstico al ingreso; no arrojaron diferencias estadísticas con respecto al egreso. Los resultados del modelo que consideró a la sumatoria total de: APACHE II, requerimiento de ARM y sumatoria de pesos de FMO, mostraron tanto en el set de desarrollo como en el validación, un nivel de clasificación correcto para sobrevivientes (SV) de 96,4 por ciento y NO sobrevivientes (NS) de 60,7 por ciento. La clasificación correcta global fue del 89,42 por ciento. El área cubierta bajo la curva ROC es de 0,91. El punto de corte de probabilidad utilizado fue de 0,5. Dada la buena calibración y discriminación en la muestra de estudio, se analizó un modelo alternativo que estuviera conformado por la sumatoria de pesos relativos de APACHE II (0,19/punto), ARM (4,69) y FMO (1 a 3), el que también presentó una buena calibración y discriminación. La discriminación de este modelo arrojó una sensibilidad del 59,8 por ciento y una especificidad del 96,5 por ciento. Total de correctos verdaderos 89,4 por ciento. El área bajo la curva ROC es de 0,91...(AU)

Validación del APACHE II en la Patagonia Central: APACHE II, un índice pronóstico / Validation of APACHE II system in the Central Patagonia: APACHE II, a prognostic indicator

Tipo de estudio: Prospectivo, multicéntrico. Objetivo: Validación regional del sistema APACHE II, de los fallos multiorgánicos (FMO) y de la utilización de prácticas terapeúticas complejas como indicadores pronósticos en pacientes gravemente injuriados ingresados a terapia intensiva, encaminado a una propuesta de criterios de admisión y niveles de intensidad en el tratamiento. Material y métodos: Se estudiaron 561 pacientes internados en las Unidades de Terapia Intensiva de Comodoro Rivadavia durante un año. A su ingreso se los evaluó según el sistema APACHE II, y durante su internación se registraron los FMO desarrollados por cada paciente, y si fueron sometidos a cirugía, hemodiálisis y/o asistencia respiratoria mecánica. La variable dependiente fue la evolución final de cada paciente y su estdía en UTI. Se utilizó el análisis con Chi-cuadrado para variables ctegóricas; el Anova (Análisis de Varianza) para variables numéricas; los análisis multivariados de regresión logística para calcular los pesos de cada falla orgánica y de cada punto de apache en la población total y el de regresión de riesgos proporcionales de Cox para el estudio de factores pronósticos y su participación en la evolución de cada paciente. A aquellos factores que demostraron tener significación estdística se los sometió a análisis de Kaplan-Meier para establecer la media de sobrevida de los pacientes con esos factores. Resultados: El score fisiológico agudo (APS), APACHE II y los pesos de fallas orgánicas, demostraron valores de p<0,001, muy significativos. Si bien, la mayor parte de las variables demostraron una distribución disgnificativa con respecto al egreso, las únicas que evidenciaron ser factores de riesgo para NO Sobrevivientes (NS) fueron el desarrollo de falla del sistema nervioso central (SNC), respiratoria y el requerimiento de asistencia respiratoria mecánica (ARM). Los pesos de cada falla orgánica calculados fueron: HEMATOLOGICO, CARDIOLOGICO y RENAL 1; DIGESTIVO 2; SNC 2,5; y RESPIRATORIO 3. Conclusión: Se validó el sistema APACHE II en nuestra región como un indicador pronóstico de gran utilidad. Las fallas del sistema hematohemostático, cardiovascular y renal presentan pesos bajos que no influyen netamente en la mortalidad, el sistema digestivo es intermedio y el SNC y respiratorio poseen los más altos pesos (AU)

Ambulatory vs. in-patient stapedectomy: a randomized twenty-patient pilot study.

A prospective study was undertaken to determine whether stapedectomy can safely be performed in an outpatient setting. Twenty patients with otosclerosis amenable to surgical treatment were divided into two groups; those in the hospitalized group were admitted the day before surgery and discharged 24 hours after the procedure. The patients in the ambulatory group were admitted on the day surgery was scheduled and released 1 or 2 hours after the procedure. We analyzed the intensity and duration of postoperative vertigo, and the hearing gain obtained, studying the speech frequencies(500 to 2000 Hz) separately from the high frequencies (4000 to 8000 Hz). No significant difference was found at 1, 3, and 6 months of follow-up in any of the parameters studied, concluding that small-fenestra stapedectomy can safely be performed as an outpatient procedure.

Isolation and enzymic properties of levansucrase secreted by Acetobacter diazotrophicus SRT4, a bacterium associated with sugar cane.

Acetobacter diazotrophicus, a nitrogen-fixing bacterium associated with sugar cane, secretes a levansucrase (sucrose-2,6-beta-D-fructan 6-beta-D-fructosyltransferase; EC 2.4.1.10). This enzyme is constitutively expressed and represents more than 70% of the total proteins secreted by strain SRT4. The purified protein consists of a single 58 kDa polypeptide with an isoelectric point of 5.5. Its activity is optimal at pH 5.0. It catalyses transfructosylation from sucrose to a variety of acceptors including water (sucrose hydrolysis), glucose (exchange reaction), fructan (polymerase reaction) and sucrose (oligofructoside synthesis). In vivo the polymerase activity leads to synthesis of a high-molecular-mass fructan of the levan type. A. diazotrophicus levansucrase catalyses transfructosylation via a Ping Pong mechanism involving the formation of a transient fructosyl-enzyme intermediate. The catalytic mechanism is very similar to that of Bacillus subtilis levansucrase. The kinetic parameters of the two enzymes are of the same order of magnitude. The main difference between the two enzyme specificities is the high yield of oligofructoside, particularly 1-kestotriose and kestotetraose, accumulated by A. diazotrophicus levansucrase during sucrose transformation. We discuss the hypothesis that these catalytic features may serve the different biological functions of each enzyme.

[Role of environmental factors in the development of insulin-dependent diabetes mellitus (IDDM) in Venezuelan children]. / Papel de los factores ambientales en el desarrollo de la Diabetes Mellitus Insulino Dependiente (DMID) en niños venezolanos.

In view of the controversy surrounding the role of environmental factors, such as the presence of bovine albumin in milk, or viral infections, in the etiology of IDDM, a study was undertaken to determine the relationship between these events and the subsequent risk of developing IDDM. On 40 venezuelan diabetic children (< 18 y) and forty, age, sex and race-matched controls were studied at the same time. Parents of children completed a questionnaire on the infant's feeding habits, its environment and family history. The X2 method and the Fischer's exact test were used to analyze the results. We found that 20% of the controls, and 10% of IDDM (NS), were never breast-fed. In 95% of controls vs 65% of IDDM (p < 0.001), cow's milk was given exclusively from birth, or combined with breast-feeding, 65% of IDDM and 60% of controls (NS) were breast-fed (alone or combined with milk substitutes) for more than three months. These results do not support the hypothesis that early exposure to breast milk substitutes increases the risk of IDDM in venezuelan children. The study revealed, however, that a family history of diabetes mellitus was present in 55% of IDDM vs 30% of controls (p < 0.05) and mumps infection before the onset of diabetes was recorded in 42.5% of IDDM in comparison with 12.5% of controls (p = 0.005). Other viral infections (rubella, chicken pox) had no statistical significance. The latter results suggest an association between a family history of diabetes mellitus and viral infections with the development of IDDM among this group of children.