ATLANTIC AMPHIBIANS: a data set of amphibian communities from the Atlantic Forests of South America.

Amphibians are among the most threatened vertebrates in the world and this is also true for those inhabiting the Atlantic Forest hotspot, living in ecosystems that are highly degraded and threatened by anthropogenic activities. We present a data set containing information about amphibian communities sampled throughout the Atlantic Forest Biome in South America. The data were extracted from 389 bibliographic references (articles, books, theses, and dissertations) representing inventories of amphibian communities from 1940 to 2017. The data set includes 17,619 records of 528 species with taxonomic certainty, from 1,163 study sites. Of all the records, 14,450 (82%) were classified using the criterion of endemism; of those, 7,787 (44%) were considered endemic and 6,663 (38%) were not. Historically, multiple sampling methods were used to survey amphibians, the most representative methods being active surveys (82.1%), surveys at breeding sites (20%), pitfall traps (15.3%), and occasional encounters (14.5%). Species richness averaged 15.2 ± 11.3 (mean ± SD), ranging from 1 to 80 species per site. We found a low dominance in the communities, with 10 species occurring in about 26% of communities: Physalaemus cuvieri (4.1%), Dendropsophus minutus (3.8%), Boana faber (3.1%), Scinax fuscovarius (2.8%), Leptodactylus latrans (2.7%), Leptodactylus fuscus (2.6%), Boana albopunctata (2.3%), Dendropsophus nanus (1.6%), Rhinella ornata (1.6%), and Leptodactylus mystacinus (1.6%). This data set represents a major effort to compile inventories of amphibian communities for the Neotropical region, filling a large gap in the data on the Atlantic Forest hotspot. We hope this data set can be used as a credible tool in the proposal of new studies on amphibian sampling and even in the development of conservation planning for these taxa. This information also has great relevance for macroecological studies, being foundational for both conservation and restoration strategies in this biodiversity hotspot. No copyright or proprietary restrictions are associated with the use of this data set. Please cite this data paper when the data are used in publications or teaching events.

Can treefrog phylogeographical clades and species' phylogenetic topologies be recovered by bioacoustical analyses?

Phenotypic traits, such as the frog advertisement call, are generally correlated with interspecific genetic variation, and, as a consequence of strong sexual selection, these behaviors may carry a phylogenetic signal. However, variation in acoustic traits is not always correlated with genetic differences between populations (intraspecific variation); phenotypic plasticity and environmental variables may explain part of such variation. For example, local processes can affect acoustic properties in different lineages due to differences in physical structure, climatic conditions, and biotic interactions, particularly when populations are isolated. However, acoustic traits can be used to test phylogenetic hypotheses. We analyzed the advertisement calls of Dendropsophus elegans males from 18 sites and compared them with those of four closely related congeneric species, in order to test for differences between inter and intraspecific variation. We analyzed 451 calls of 45 males of these five species. Because males from distant sites were grouped together without population congruence, differences found in advertisement calls among individuals were not correlated with phylogeographical clades. Phylogenetic and cluster analyses of the D. elegans clades and those of closely related species grouped all five species into the same topology, as reported by previous molecular and morphological phylogenies. However, the topology of the D. elegans phylogeographical clades did not match the topology previously reported. Acoustic communication in D. elegans seems to be conserved among populations, and the phylogeographical history of the species does not explain the variation among lineages in call properties, despite some congruent phylogenetic signals evident at the species level. Based on molecular clocks retrieved from the literature, it seems that more than 6.5 million years of divergence (late Miocene) are necessary to allow significant changes to occur in the acoustic properties of these treefrog calls, making it possible to recover their phylogenetic history only based on acoustic evidence.

Diversity of ants and mites in the diet of the Brazilian frog Chiasmocleis leucosticta (Anura: Microhylidae) / Diversidade de formigas e ácaros na dieta do anuro brasileiro Chiasmocleis leucosticta (Anura: Microhylidae)

Abstract We describe here the diet of the microhylid frog Chiasmocleis leucosticta based on the stomach contents of 72 individuals (47 males and 25 females) collected in pitfall traps at the Reserva Florestal de Morro Grande, state of São Paulo, southeastern Brazil. We identified 1,981 food items distributed in 13 prey categories of arthropods, mainly ants, mites and collembolans. Formicidae was the most abundant and frequent prey category, including 16 genera from seven subfamilies, and data on ant availability in the habitat suggest that C. leucosticta selects ants actively. The second main prey category was Acari, predominantly represented by mites of the suborder Oribatida. This is the first work identifying mites to the family level in the diet of a Microhylidae. There was no statistical difference between males and females regarding diet composition.

Resumo Descrevemos neste trabalho a dieta do anuro Chiasmocleis leucosticta, pertencente à família Microhylidae, com base no conteúdo estomacal de 72 indivíduos (47 machos e 25 fêmeas) coletados em armadilhas-de-queda na Reserva Florestal de Morro Grande, SP. Foram identificados 1981 itens alimentares, distribuídos em 13 categorias de artrópodes, especialmente formigas, ácaros e colêmbolos. Formicidae foi a categoria de presas mais abundante e frequente, incluindo 16 gêneros pertencentes a sete subfamílias. Os dados de disponibilidade de formigas no ambiente sugerem que C. leucosticta seleciona formigas ativamente. A segunda categoria de presas mais relevante foi Acari, predominantemente representada por ácaros da subordem Oribatida. Este é o primeiro trabalho que identifica os ácaros ao nível de família na dieta de um Microhylidae. Não houve diferença estatística entre machos e fêmeas quanto à composição da dieta.

Anurofauna da floresta de restinga do Parque Estadual da Ilha do Cardoso, Sudeste do Brasil: composição de espécies e uso de sítios reprodutivos / Anuran fauna of the restinga forest of the Parque Estadual da Ilha do Cardoso, Southeastern Brazil: species composition and breeding site utilization

O Parque Estadual da Ilha do Cardoso é uma área de grande importância para a conservação, pois abriga diferentes ecossistemas costeiros, como manguezais, dunas, restingas e mata atlântica de encosta, que, historicamente, estiveram sob forte pressão antrópica. A identificação duvidosa e a descoberta de novas espécies da anurofauna em ambientes costeiros, evidencia a escassez de estudos nessas regiões. Inventariamos a anurofauna da floresta de restinga do Parque Estadual da Ilha do Cardoso entre outubro de 2005 e outubro de 2007, por meio de 25 viagens mensais de dois dias de duração. Foram utilizados dois métodos: procura visual ativa em uma parcela permanente de 10 ha e procura visual e auditiva em nove sítios de reprodução. A anurofauna da área de estudo é composta por 17 espécies pertencentes às famílias Bufonidae (2 espécies), Craugastoridae (1), Hylidae (10), Leiuperidae (1), Leptodactylidae (2) e Microhylidae (1). A riqueza estimada foi de 17,77-17,96, o que mostra que nosso esforço amostral foi suficiente para registrar praticamente toda a anurofauna presente nessa formação de restinga. Essa riqueza pode ser considerada elevada quando comparada à de outras áreas de restinga, principalmente aquelas dotadas de vegetação menos estruturada. O predomínio da família Hylidae é característico de todas as localidades da região neotropical. Nenhuma espécie acha-se incluída nas listas de espécies ameaçadas de extinção do estado de São Paulo e do Brasil, mas Aparasphenodon bokermanni é considerada pouco conhecida ("Data Deficient") pela IUCN, e outras três espécies (Dendrophryniscus leucomystax, Haddadus binotatus e Itapotihyla langsdorffii) apresentam populações em declínio. Essas informações revelam a importância da floresta de restinga da Ilha do Cardoso para a manutenção de populações de anuros. Uma análise de agrupamento de 14 espécies que utilizaram nove sítios reprodutivos evidenciou três grupos, sendo o hidroperíodo o principal fator na determinação das similaridades. Conclui-se que a preservação de corpos d'água com diferentes fisionomias é essencial para a conservação de populações viáveis de anuros.

The Parque Estadual da Ilha do Cardoso is of great concern to conservation because it includes several coastal ecosystems, like mangroves, sand dunes, restingas, and Atlantic Rainforest, all of them under human pressure since Brazil discovery. The anuran fauna of Brazilian restingas remains poorly known; the discovery of new species and the dificulties to determine the anurans reflect the rarity of studies in these areas. We provide here a updated list of amphibians from the restinga Forest of the Parque Estadual da Ilha do Cardoso. Our inventory was conducted from October 2005 and October 2007, totaling 25 two-days trips. Two methods were applied: visual encounter survey in a 10 ha permanent plot and visual and acoustic survey in nine sites used by anurans for reproduction. The anuran fauna of the study site is composed by 17 species belonging to the families Bufonidae (2 species), Craugastoridae (1), Hylidae (10), Leiuperidae (1), Leptodactylidae (2), and Microhylidae (1). Estimated species richness was 17.77-17.96, which suggests our sampling effort was enough to adequately sample the anuran assemblage present in the area. This richness can be considered high when compared to the richness of other restinga areas, especially those with less structured vegetation. The dominance of the family Hylidae is common to all neotropical localities. None species is included in the lists of endangered species from the state of São Paulo and Brazil, but Aparasphenodon bokermanni is considered Data Deficient by IUCN, and other three species (Dendrophryniscus leucomystax, Haddadus binotatus and Itapotihyla langsdorffii) have decreasing populations. This information reveals the importance of the restinga forest of Ilha do Cardoso to the conservation of anuran populations. A cluster analysis of 14 species that used nine breeding sites resulted in three groups, and the hydroperiod can be considered the major factor influencing the similarities among species. We conclude that preserving water bodies with diferent physiognomies is essential for conserving viable anuran populations.

Anurofauna da Floresta Estacional Semidecidual da Estação Ecológica dos Caetetus, Sudeste do Brasil / Anuran fauna of the Semi-deciduous Forest of the Estação Ecológica dos Caetetus, Southeastern Brazil

A Floresta Estacional Semidecidual é considerada uma das formações florestais mais ameaçadas e suprimidas pela expansão agrícola do início do século passado, com sua cobertura vegetal reduzida a menos de 8 por cento da original. Estudos sobre taxocenoses de anfíbios anuros nessa formação florestal ainda são escassos, mesmo quando consideramos as poucas áreas de floresta primária que restaram. Apresentamos neste estudo os resultados de um levantamento de espécies de anfíbios anuros da Estação Ecológica dos Caetetus, uma unidade de conservação que abriga importante remanescente de Floresta Estacional Semidecidual na região Centro-oeste do estado de São Paulo, região considerada prioritária para conservação no estado. Foram registradas 34 espécies distribuídas em nove famílias, dentre as quais Hylidae e Leptodactylidae foram as que apresentaram as maiores riquezas, com 14 e oito espécies, respectivamente. A elevada riqueza de espécies da área, principalmente da família Hylidae, provavelmente está associada tanto à grande heterogeneidade ambiental dessa formação florestal como à sua localização em área de transição entre áreas de Cerrado e de Floresta Ombrófila. A alta riqueza de espécies, quando comparada à de outras áreas de mesma formação florestal, bem como a presença de representantes das famílias Centrolenidae, Craugastoridae e Hylodidae, que são dependentes de habitats florestais, atestam o bom estado de conservação e a importância regional desse remanescente florestal.

Semi-deciduous Forest is one of the most threatened and deforested vegetation types of Brazil due to its land conversion to agriculture in the beginning of the 20th Century; its distribution is now reduced to less than 8 percent of its original extent. Studies about anuran taxocenosis associated to these forests are scarce, even when we consider the remaining areas of pristine forest. We present herein results from an amphibian survey at the Estação Ecológica dos Caetetus, a conservation unit with a singular preserved Semi-deciduous Forest from the Middle-West region of the State of São Paulo, located inside the priority areas for conservation on São Paulo State. We provided here data on species richness, composition, geographical distribution, and natural history notes for each taxa found in the area. We recorded 34 anuran species belonging to nine families, of which Hylidae and Leptodactylidae are the two most speciose families, with 14 and eight species respectively. The high species richness in the area, mainly in the family Hylidae, can be explained by both the high environmental heterogeneity of this remnant and its geographic location between Cerrado savannas and Atlantic rain forest areas. Its high species richness when compared with other localities of the same vegetation type, as well as the presence of forest dependent species in the families Centrolenidae, Hylodidae and Craugastoridae, indicate both the good conservation status and the regional importance of this forest remnant.

Composição, uso de hábitat e estações reprodutivas das espécies de anuros da floresta de restinga da Estação Ecológica Juréia-Itatins, sudeste do Brasil / Species composition, habitat use and breeding seasons of anurans of the restinga forest of the Estação Ecológica Juréia-Itatins, Southeastern Brazil

Apresentamos aqui dados sobre a composição de espécies, o uso de hábitat e as estações reprodutivas dos anuros da floresta de restinga da Estação Ecológica Juréia-Itatins, sudeste do Brasil. Entre fevereiro e dezembro de 1993, foram realizadas visitas mensais à área de estudo, com permanência de três ou quatro dias, totalizando 28 dias de trabalhos de campo. Três poças pré-selecionadas foram investigadas diariamente entre 18:00 e 22:30 horas, quando foi estimado o número de machos vocalmente ativos nas agregações observadas, tentando-se localizá-los visualmente em seus substratos característicos de vocalização. A fauna é composta por 20 espécies, a maior riqueza já registrada em um ambiente de restinga do Brasil. De acordo com os critérios da IUCN, oito dessas espécies possuem populações em declínio, devido principalmente à perda de hábitat. Onze espécies apresentaram machos em atividade de vocalização e reprodução nas poças monitoradas mensalmente durante todo o período de estudo; a maioria dos hilídeos apresentou segregação vertical em seus sítios de vocalização sobre a vegetação marginal. Scinax hayii e S. littoralis foram consideradas de reprodução contínua, mas o período reprodutivo da maior parte das espécies mostrou-se associado à estação chuvosa. A alta riqueza de espécies observada na área e a indicação de declínios populacionais de algumas espécies em outras regiões sugerem que a região da Juréia apresenta uma grande relevância como área de preservação de anuros.

Herein we present data on species composition, habitat use, and calling seasons of anurans from the Restinga forest of the Estação Ecológica Juréia-Itatins, Southeastern Brazil. The study site was visited monthly (3 to 4 days) between February and December 1993, a total of 28 days of field work. Three previously selected puddles were searched for anurans between 6:00 and 10:30 PM, when the number of calling males of each species was estimated and the positions of their calling sites were recorded. Anuran fauna is composed by 20 species, the highest richness ever recorded in a Brazilian restinga habitat. According to IUCN criteria, eight of these species have populations declining mainly due to habitat loss. Eleven species showed calling males in the three pools monitored during the study period; most hylids showed some vertical segregation on the marginal vegetation used as calling sites. Scinax hayii and S. littoralis were considered continuous breeders, but the calling and breeding period of most species was associated to the rainy season. The high species richness recorded and the indication of declining populations for some species outside the area suggest the E.E. Juréia-Itatins has a high potential to preserve anuran fauna.

Herpetofauna da Estação Ambiental de Peti, um fragmento de Mata Atlântica do estado de Minas Gerais, sudeste do Brasil / Herpetofauna of Estação Ambiental de Peti, an Atlantic Rainforest fragment of Minas Gerais State, southeastern Brazil

Here we provide a list of amphibians and reptiles of Estação de Pesquisa e Desenvolvimento Ambiental de Peti, an Atlantic rainforest reserve located in the mountains of the Espinhaço Range, State of Minas Gerais, southeastern Brazil. This list originated from a 78-days inventory conducted in the area 13 years after a first inventory. We actively searched for amphibians and reptiles in forest trails and anuran breeding sites. Between April 2002 and October 2004 we recorded 48 species belonging to Anura (29 species), Gymnophiona (1), Chelonia (1), Crocodylia (1), and Squamata (16 species: one amphisbaenian, five lizards and 10 snakes). Thirteen species were not recorded in the first inventory, and 14 species previously recorded were not found in the present work. Possible explanations for these differences are discussed. Although none of the recorded species is included in the available lists of threatened species for the State of Minas Gerais and Brazil, the reserve must be considered an important source of natural habitats to the local herpetofauna.

Fornecemos aqui uma lista de espécies de anfíbios e répteis da Estação de Pesquisa e Desenvolvimento Ambiental de Peti, uma reserva de Mata Atlântica localizada nas montanhas da Cadeia do Espinhaço, estado de Minas Gerais, sudeste do Brasil. Essa lista originou-se de um inventário conduzido durante 78 dias de trabalhos de campo, 13 anos após a realização de um primeiro levantamento. Entre abril de 2002 e outubro de 2004, aplicamos o método de procura visual durante caminhadas nas trilhas da floresta, em diversos corpos d'água e nos sítios reprodutivos dos anuros. Foram registradas 48 espécies, incluídas nas ordens Anura (29), Gymnophiona (1), Chelonia (1), Crocodylia (1) e Squamata (16 espécies: uma anfisbena, cinco lagartos e 11 serpentes). Treze espécies não haviam sido registradas no inventário anterior, e 14 espécies registradas anteriormente não foram detectadas em nosso inventário. São discutidas possíveis explicações para as diferenças observadas. Embora nenhuma espécie esteja incluída nas listas de espécies ameaçadas do Estado de Minas Gerais e do Brasil, a reserva deve ser considerada importante para a manutenção das populações da herpetofauna local.

Anuros do cerrado da Estação Ecológica e da Floresta Estadual de Assis, sudeste do Brasil / Anurans of the cerrado of the Estação Ecológica and the Floresta Estadual de Assis, southeastern Brazil

O cerrado brasileiro é um dos 25 "hotspots" da Terra, áreas caracterizadas pela concentração de espécies endêmicas e por experimentar excepcional perda de hábitat. São conhecidas cerca de 150 espécies de anfíbios no Cerrado brasileiro, e aproximadamente 28% dessas espécies são endêmicas. Trabalhos com comunidades de anuros do cerrado ainda são escassos, e a forte pressão antrópica, o alto grau de endemismo e o declínio de populações de anuros registrados nesse bioma reforçam a importância de estudos relacionados à anurofauna. O presente trabalho apresenta um inventário de espécies de anuros em duas unidades de conservação no cerrado da cidade de Assis, sudoeste do Estado de São Paulo: Estação Ecológica de Assis e Floresta Estadual de Assis. Durante o estudo, foram registradas 23 espécies distribuídas em 13 gêneros e seis famílias. A fauna de anuros do cerrado de Assis é fortemente dominada pelas famílias Hylidae (oito espécies) e Leptodactylidae (seis espécies), um padrão comumente encontrado em localidades da região Neotropical. A riqueza de espécies e a representatividade das famílias foram similares às encontradas em outras áreas de cerrado do Brasil e de formações vegetais antropizadas com perda de área florestal e aumento de áreas abertas. A taxocenose de anuros da localidade de estudo é composta por espécies amplamente distribuídas em ambientes abertos do complexo Cerrado-Caatinga-Chaco.

The Brazilian cerrado is a hotspot of biodiversity, areas with many endemic species subjected to severe habitat loss. About 150 amphibian species are known to the Brazilian cerrado, and 28% of them are endemic. Studies focusing cerrado anuran communities are rare. Here we provide a commented list of anurans of two conservation unities of the municipality of Assis, southeastern Brazil: the Estação Ecológica de Assis and the Floresta Estadual de Assis. Twenty three anuran species were recorded, and these belong to 13 genera and six families. The anuran fauna of the cerrado of Assis is dominated by the families Hylidae (eight species) and Leptodactylidae (six species), a pattern commonly found in neotropical sites. Species richness and taxonomic composition at the family level were similar to those of other Brazilian cerrados and perturbed areas characterized by deforestation and increase of open areas. The taxocenosis contains species widespread in open formations of the Cerrado-Caatinga-Chaco complex.

Food habits of snakes from the RPPN Feliciano Miguel Abdala, an Atlantic Forest fragment of southeastern Brazil / Hábito alimentar de serpentes da RPPN Feliciano Miguel Abdala, um fragmento de Mata Atlântica do sudeste do Brasil

We present data on the diet of 15 species of snakes belonging to a community from Reserva Particular do Patrimônio Natural Feliciano Miguel Abdala, an Atlantic Forest fragment of Southeastern Brazil, based on their stomach contents. For 12 items we were able to determine the direction of the ingestion. Most snakes ingested the prey head-first. A cluster analysis was conducted with items grouped as chilopods, mollusks, adult anurans, anuran tadpoles, lizards, amphisbaenians, snakes, and rodents. The phylogenetic influence on diet preferences is discussed.

Apresentamos aqui a dieta de 15 espécies de serpentes de uma comunidade da Reserva Particular do Patrimônio Natural Feliciano Miguel Abdala, um fragmento de Mata Atlântica do sudeste do Brasil, com base na análise de conteúdos estomacais. Para 12 itens, pudemos determinar o sentido de ingestão da presa. A maioria das serpentes ingeriu a presa no sentido cranial-caudal. Realizamos uma análise de agrupamento reunindo os itens nas categorias quilópodes, moluscos, anuros adultos, girinos, lagartos, anfisbenas, serpentes e roedores. A influência da filogenia sobre a dieta das espécies é discutida.

Primeiro registro de larvas de Chironomus inquinatus Correia, Trivinho-Strixino & Michailova (Diptera, Chironomidae) vivendo no casco do cágado Phrynops geoffroanus Schweigger (Testudines, Chelidae) na região Neotropical / First record of Chironomus inquinatus larvae Correia, Trivinho-Strixino & Michailova (Diptera, Chironomidae) living on the shell of the side-necked turtle Phrynops geoffroanus Schweigger (Testudines, Chelidae)

Neste estudo reportamos pela primeira vez a ocorrência de larvas de Chironomus inquinatus Correia, Trivinho-Strixino & Michailova vivendo no casco do cágado Phrynops geoffroanus Schweigger, possivelmente em função da intensa acumulação de sedimento, em um rio poluído da região Neotropical.

In this study we report for the first time the occurrence of Chironomus inquinatus larvae Correia, Trivinho-Strixino & Michailova living on the shell of the side-necked turtle, Phrynops geoffroanus Schweigger, possibly by the intense accumulation of sediment, in a polluted river of the Neotropics.