Hepatitis B in the Northwestern region of Sao Paulo State: genotypes and resistance mutations.

In Brazil, few studies on the molecular aspects of hepatitis B virus (HBV) infection have been conducted in the interior regions of Sao Paulo State. This study aimed to identify HBV genotypes and evaluate strains with resistance mutations for nucleoside analogues in the Administrative Region (AR) of the municipality of Sao Jose do Rio Preto. We performed nested PCRs of 127 samples from the Health Care Services of the AR to amplify, sequence and analyze fragments of the HBV DNA, in order to identify genotypes and resistance mutations. The HBV S/Pol regions of 126 samples were successfully amplified and sequenced. Five different genotypes were found, and the main ones were A, D and F; a greater number of samples contained the subgenotypes A1 (n = 51; 40.5%), D3 (n = 36; 28.6%), A2 (n = 14; 11.1%) and F2a (n = 9; 7.1%). Resistance mutations (rtM204V/I/S) associated or not with compensatory mutations (rtL180M, rtV173L) were identified in 13.9% (5/36) of patients undergoing viral treatment and 1.1% (1/90) of naïve patients. The diversity of genotypes/subgenotypes found is probably due to the intense migration occurring in the region. These data can complement epidemiological and clinical surveillance, and can be used for a more effective management of chronic HBV patients.

Breve histórico da sífilis e evolução do diagnóstico laboratorial no período de 2005 a 2016 / Brief history of syphilis and evolutive diagnosis laboratory in the period 2005-2016

Essa revisão explorou dois aspectos: a evolução do diagnóstico laboratorial, quantitativamente, com análise de 12.328 dados da produção laboratorial (de 2005 a 2016) e o histórico epidemiológico, com abordagem qualitativa (descritiva). Com o objetivo de traçar um panorama e apresentar as ações laboratoriais, avaliou-se o impacto no diagnóstico com a implantação do teste treponêmico TPHA (2007) e atendimento aos fluxogramas I-A (2011) e I-B (2014), da Portaria nº 3.242/GM/MS/2011(revogada em 2016). Para traçar a trajetória epidêmica do sífilismo no contexto social, do Brasil colonial à atualidade, buscou-se a literatura científica nas bases de dados PubMed, Scielo, Lilacs, PAHO, BVS, Google Acadêmico, elegendo os descritores isolados/agrupados: sífilis/congênita, sorodiagnóstico da sífilis, saúde pública. Das 200 publicações avaliadas por leitura exploratória, seletiva, analítica e interpretativa, 63 foram selecionadas para descrever a sífilis nos aspectos já mencionados. A ausência de dados laboratoriais e epidemiológicos dificulta o conhecimento das transformações do processo de manifestação da sífilis e adoção de medidas corretivas/preventivas para seu combate. Esse estudo detectou, com originalidade, pontos vulneráveis na execução do ensaio; necessidade de estratégias para melhoria da qualidade do diagnóstico laboratorial e, do ponto de vista epidemiológico, a inserção de políticas públicas específicas para atenção ao grupo de pessoas em idade fértil.

This review explored two aspects: quantitative evolution of the laboratory diagnosis with analysis of 12,328 laboratory data (2005/2016) and, epidemiological history with a qualitative (descriptive) approach. With aim of to draw a panorama and to present the laboratory actions was evaluated the impact from treponemic test (TPHA, 2007) in the diagnosis and attendance to flowcharts IA (2011)/IB (2014), of Ordinance Nº 3,242 /GM/MS/ 2011 (repealed in 2016). For drawing the syphilis epidemic trajectory in the social context, since Brazil colony to the currently scientific literature was searched in the databases PubMed, Scielo, Lilacs, PAHO, BVS, Google Scholar, choosing the isolated / grouped descriptors: syphilis / congenital, serodiagnosis, public health. From 200 publications selected 63 evaluated by exploratory, selective, analytical, interpretive reading, to describe syphilis in all aspects mentioned above. The lack of epidemiological and laboratorial data makes it difficult to know the changes in the syphilis manifestation process, and to adopt corrective/preventive measures to combat it. This original study detected vulnerability in the assay execution, need for strategies formulation to improve the laboratory diagnosis quality and, from an epidemiological point of view insertion of specific public policies for attention to childbearing age people group.

Breve histórico da sífilis e evolução do diagnóstico laboratorial no período de 2005 a 2016 / Brief history of syphilis and evolutive diagnosis laboratory in the period 2005-2016

Essa revisão explorou dois aspectos: a evolução do diagnóstico laboratorial, quantitativamente, com análise de 12.328 dados da produção laboratorial (de 2005 a 2016) e o histórico epidemiológico, com abordagem qualitativa (descritiva). Com o objetivo de traçar um panorama e apresentar as ações laboratoriais, avaliou-se o impacto no diagnóstico com a implantação do test treponêmico TPHA (2007) e atendimento aos fluxogramas I-A (2011) e I-B (2014), da Portaria nº 3.242/GM/MS/2011(revogada em 2016). Para traçar a trajetória epidêmica do sífilismo no contexto social, do Brasil colonial à atualidade, buscou-se a literatura científica nas bases de dados PubMed, Scielo, Lilacs, PAHO, BVS, Google Acadêmico, elegendo os descritores isolados/agrupados: sífilis/congênita, sorodiagnóstico da sífilis, saúde pública. Das 200 publicações avaliadas por leitura exploratória, seletiva, analítica e interpretativa, 63 foram selecionadas para descrever a sífilis nos aspectos já mencionados. A ausência de dados laboratoriais e epidemiológicos dificulta o conhecimento das transformações do processo de manifestação da sífilis e adoção de medidas corretivas/preventivas para seu combate. Esse estudo detectou, com originalidade, pontos vulneráveis na execução do ensaio; necessidade de estratégias para melhoria da qualidade do diagnóstico laboratorial e, do ponto de vista epidemiológico, a inserção de políticas públicas específicas para atenção ao grupo de pessoas em idade fértil. (AU)

This review explored two aspects: quantitative evolution of the laboratory diagnosis with analysis of 12,328 laboratory data (2005/2016) and, epidemiological history with a qualitative (descriptive) approach. With aim of to draw a panorama and to present the laboratory actions was evaluated the impact from treponemic test (TPHA, 2007) in the diagnosis and attendance to flowcharts IA (2011)/IB (2014), of Ordinance Nº 3,242 /GM/MS/ 2011 (repealed in 2016). For drawing the syphilis epidemic trajectory in the social context, since Brazil colony to the currently scientific literature was searched in the databases PubMed, Scielo, Lilacs, PAHO, BVS, Google Scholar, choosing the isolated / grouped descriptors: syphilis / congenital, serodiagnosis, public health. From 200 publications selected 63 evaluated by exploratory, selective, analytical, interpretive reading, to describe syphilis in all aspects mentioned above. The lack of epidemiological and laboratorial data makes it difficult to know the changes in the syphilis manifestation process, and to adopt corrective/preventive measures to combat it. This original study detected vulnerability in the assay execution, need for strategies formulation to improve the laboratory diagnosis quality and, from an epidemiological point of view insertion of specific public policies for attention to childbearing age people group. (AU)

Resultado da atuação do Centro de Laboratório Regional do Instituto Adolfo Lutz - São José do Rio Preto - X, na implantação do teste rápido e Elisa para dengue NS1 / Results of the actions performed by the Regional Laboratory Center of the Institute Adolfo Lutz - São José do Rio Preto - X, in the implementation of rapid and Elisa tests for NS1 dengue

O Centro de Laboratório Regional do Instituto Adolfo Lutz – São José do Rio Preto – X participou da implantação do teste rápido e Elisa para detecção do antígeno NS1 na região do Departamento Regional de Saúde XV. Na execução técnica, utilizou kits BIO-RAD Dengue-NS1 Ag STRIP (teste rápido) e panbio early para enzimelinked immuno sorbent assay (Elisa-NS1), com informação imediatado resultado, por e-mail. As amostras reagentes para NS1 foram enviadas ao IAL Central-SP para isolamento de vírus. Entre março de 2009 e março de 2010, foram processadas 788 amostras pelo teste rápido e 9.270 por Elisa, com 166 (21,1%) e 4.439 (47,9%)amostras positivas, respectivamente. Foram identificados os sorotipos circulantes em 26 municípios, com 93,7% depositividade para o sorotipo 1. O número de amostras analisadas e a rapidez na informação dos resultados positivos contribuíram para agilização e ampliação das ações de controle da dengue