An anti-infodemic virtual center for the Americas.

The Pan American Health Organization/World Health Organization (PAHO/WHO) Anti-Infodemic Virtual Center for the Americas (AIVCA) is a project led by the Department of Evidence and Intelligence for Action in Health, PAHO and the Center for Health Informatics, PAHO/WHO Collaborating Center on Information Systems for Health, at the University of Illinois, with the participation of PAHO staff and consultants across the region. Its goal is to develop a set of tools-pairing AI with human judgment-to help ministries of health and related health institutions respond to infodemics. Public health officials will learn about emerging threats detected by the center and get recommendations on how to respond. The virtual center is structured with three parallel teams: detection, evidence, and response. The detection team will employ a mixture of advanced search queries, machine learning, and other AI techniques to sift through more than 800 million new public social media posts per day to identify emerging infodemic threats in both English and Spanish. The evidence team will use the EasySearch federated search engine backed by AI, PAHO's knowledge management team, and the Librarian Reserve Corps to identify the most relevant authoritative sources. The response team will use a design approach to communicate recommended response strategies based on behavioural science, storytelling, and information design approaches.

El centro virtual contra la infodemia para la Región de las Américas de la Organización Panamericana de la Salud/Organización Mundial de la Salud (OPS/OMS) es un proyecto liderado por el Departamento de Evidencia e Inteligencia para la Acción en la Salud de la OPS y el Center for Health Informatics de la Universidad de Illinois, centro colaborador de la OPS/OMS en sistemas de información para la salud, con la participación de personal y consultores de la OPS en toda la Región. Su objetivo es crear un conjunto de herramientas que combinen inteligencia artificial (IA) y los criterios humanos para apoyar a los ministerios de salud y las instituciones relacionadas con la salud en la respuesta a la infodemia. Los funcionarios de salud pública recibirán formación sobre las amenazas emergentes detectadas por el centro y recomendaciones sobre cómo abordarlas. El centro virtual está estructurado en tres equipos paralelos: detección, evidencia y respuesta. El equipo de detección empleará una combinación de consultas mediante búsqueda avanzada, aprendizaje automático y otras técnicas de IA para evaluar más de 800 millones de publicaciones nuevas en las redes sociales al día con el fin de detectar amenazas emergentes en el ámbito de la infodemia tanto en inglés como en español. El equipo de evidencia hará uso del motor de búsqueda federado EasySearch y, con el apoyo de la IA, el equipo de gestión del conocimiento de la OPS y la red Librarian Reserve Corps, determinará cuáles son las fuentes autorizadas más pertinentes. El equipo de respuesta utilizará un enfoque vinculado al diseño para difundir las estrategias recomendadas sobre la base de las ciencias del comportamiento, la narración de historias y el diseño de la información.

O Centro Virtual Anti-Infodemia para as Américas (AIVCA, na sigla em inglês) da Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde (OPAS/OMS) é um projeto liderado pelo Departamento de Evidência e Inteligência para a Ação em Saúde da OPAS e pelo Centro de Informática em Saúde da Universidade de Illinois, EUA (Centro Colaborador da OPAS/OMS para Sistemas de Informação para a Saúde), com a participação de funcionários e consultores da OPAS de toda a região. Seu objetivo é desenvolver um conjunto de ferramentas ­ combinando a inteligência artificial (IA) com o discernimento humano ­ para ajudar os ministérios e instituições de saúde a responder às infodemias. As autoridades de saúde pública aprenderão sobre as ameaças emergentes detectadas pelo centro e obterão recomendações sobre como responder. O centro virtual está estruturado com três equipes paralelas: detecção, evidência e resposta. A equipe de detecção utilizará consultas de pesquisa avançada, machine learning (aprendizagem de máquina) e outras técnicas de IA para filtrar mais de 800 milhões de novas postagens públicas nas redes sociais por dia, a fim de identificar ameaças infodêmicas emergentes em inglês e espanhol. A equipe de evidência usará o mecanismo de busca federada EasySearch, com apoio de IA, da equipe de gestão de conhecimento da OPAS e do Librarian Reserve Corps (LRC), para identificar as fontes abalizadas mais relevantes. A equipe de resposta usará uma abordagem de design para comunicar estratégias de resposta recomendadas com base em abordagens de ciência comportamental, narração de histórias e design da informação.

An anti-infodemic virtual center for the Americas

[ABSTRACT]. The Pan American Health Organization/ World Health Organization (PAHO/WHO) Anti-Infodemic Virtual Center for the Americas (AIVCA) is a project led by the Department of Evidence and Intelligence for Action in Health, PAHO and the Center for Health Informatics, PAHO/WHO Collaborating Center on Information Systems for Health, at the University of Illinois, with the participation of PAHO staff and consultants across the region. Its goal is to develop a set of tools—pairing AI with human judgment—to help ministries of health and related health institutions respond to infodemics. Public health officials will learn about emerging threats detected by the center and get recommendations on how to respond. The virtual center is structured with three parallel teams: detection, evidence, and response. The detection team will employ a mixture of advanced search que- ries, machine learning, and other AI techniques to sift through more than 800 million new public social media posts per day to identify emerging infodemic threats in both English and Spanish. The evidence team will use the EasySearch federated search engine backed by AI, PAHO’s knowledge management team, and the Librar- ian Reserve Corps to identify the most relevant authoritative sources. The response team will use a design approach to communicate recommended response strategies based on behavioural science, storytelling, and information design approaches.

[RESUMEN]. El centro virtual contra la infodemia para la Región de las Américas de la Organización Panamericana de la Salud/Organización Mundial de la Salud (OPS/OMS) es un proyecto liderado por el Departamento de Eviden- cia e Inteligencia para la Acción en la Salud de la OPS y el Center for Health Informatics de la Universidad de Illinois, centro colaborador de la OPS/OMS en sistemas de información para la salud, con la participación de personal y consultores de la OPS en toda la Región. Su objetivo es crear un conjunto de herramientas que combinen inteligencia artificial (IA) y los criterios humanos para apoyar a los ministerios de salud y las instituciones relacionadas con la salud en la respuesta a la infodemia. Los funcionarios de salud pública reci- birán formación sobre las amenazas emergentes detectadas por el centro y recomendaciones sobre cómo abordarlas. El centro virtual está estructurado en tres equipos paralelos: detección, evidencia y respuesta. El equipo de detección empleará una combinación de consultas mediante búsqueda avanzada, aprendizaje automático y otras técnicas de IA para evaluar más de 800 millones de publicaciones nuevas en las redes sociales al día con el fin de detectar amenazas emergentes en el ámbito de la infodemia tanto en inglés como en español. El equipo de evidencia hará uso del motor de búsqueda federado EasySearch y, con el apoyo de la IA, el equipo de gestión del conocimiento de la OPS y la red Librarian Reserve Corps, determinará cuáles son las fuentes autorizadas más pertinentes. El equipo de respuesta utilizará un enfoque vinculado al diseño para difundir las estrategias recomendadas sobre la base de las ciencias del comportamiento, la narración de historias y el diseño de la información.

[RESUMO]. O Centro Virtual Anti-Infodemia para as Américas (AIVCA, na sigla em inglês) da Organização Pan-Ameri- cana da Saúde/Organização Mundial da Saúde (OPAS/OMS) é um projeto liderado pelo Departamento de Evidência e Inteligência para a Ação em Saúde da OPAS e pelo Centro de Informática em Saúde da Uni- versidade de Illinois, EUA (Centro Colaborador da OPAS/OMS para Sistemas de Informação para a Saúde), com a participação de funcionários e consultores da OPAS de toda a região. Seu objetivo é desenvolver um conjunto de ferramentas — combinando a inteligência artificial (IA) com o discernimento humano — para ajudar os ministérios e instituições de saúde a responder às infodemias. As autoridades de saúde pública aprenderão sobre as ameaças emergentes detectadas pelo centro e obterão recomendações sobre como responder. O centro virtual está estruturado com três equipes paralelas: detecção, evidência e resposta. A equipe de detecção utilizará consultas de pesquisa avançada, machine learning (aprendizagem de máquina) e outras técnicas de IA para filtrar mais de 800 milhões de novas postagens públicas nas redes sociais por dia, a fim de identificar ameaças infodêmicas emergentes em inglês e espanhol. A equipe de evidência usará o mecanismo de busca federada EasySearch, com apoio de IA, da equipe de gestão de conhecimento da OPAS e do Librarian Reserve Corps (LRC), para identificar as fontes abalizadas mais relevantes. A equipe de resposta usará uma abordagem de design para comunicar estratégias de resposta recomendadas com base em abordagens de ciência comportamental, narração de histórias e design da informação.

An anti-infodemic virtual center for the Americas / Un centro virtual contra la infodemia para la Región de las Américas / Um centro virtual anti-infodemia para as Américas

ABSTRACT The Pan American Health Organization/World Health Organization (PAHO/WHO) Anti-Infodemic Virtual Center for the Americas (AIVCA) is a project led by the Department of Evidence and Intelligence for Action in Health, PAHO and the Center for Health Informatics, PAHO/WHO Collaborating Center on Information Systems for Health, at the University of Illinois, with the participation of PAHO staff and consultants across the region. Its goal is to develop a set of tools—pairing AI with human judgment—to help ministries of health and related health institutions respond to infodemics. Public health officials will learn about emerging threats detected by the center and get recommendations on how to respond. The virtual center is structured with three parallel teams: detection, evidence, and response. The detection team will employ a mixture of advanced search queries, machine learning, and other AI techniques to sift through more than 800 million new public social media posts per day to identify emerging infodemic threats in both English and Spanish. The evidence team will use the EasySearch federated search engine backed by AI, PAHO's knowledge management team, and the Librarian Reserve Corps to identify the most relevant authoritative sources. The response team will use a design approach to communicate recommended response strategies based on behavioural science, storytelling, and information design approaches.

RESUMEN El centro virtual contra la infodemia para la Región de las Américas de la Organización Panamericana de la Salud/Organización Mundial de la Salud (OPS/OMS) es un proyecto liderado por el Departamento de Evidencia e Inteligencia para la Acción en la Salud de la OPS y el Center for Health Informatics de la Universidad de Illinois, centro colaborador de la OPS/OMS en sistemas de información para la salud, con la participación de personal y consultores de la OPS en toda la Región. Su objetivo es crear un conjunto de herramientas que combinen inteligencia artificial (IA) y los criterios humanos para apoyar a los ministerios de salud y las instituciones relacionadas con la salud en la respuesta a la infodemia. Los funcionarios de salud pública recibirán formación sobre las amenazas emergentes detectadas por el centro y recomendaciones sobre cómo abordarlas. El centro virtual está estructurado en tres equipos paralelos: detección, evidencia y respuesta. El equipo de detección empleará una combinación de consultas mediante búsqueda avanzada, aprendizaje automático y otras técnicas de IA para evaluar más de 800 millones de publicaciones nuevas en las redes sociales al día con el fin de detectar amenazas emergentes en el ámbito de la infodemia tanto en inglés como en español. El equipo de evidencia hará uso del motor de búsqueda federado EasySearch y, con el apoyo de la IA, el equipo de gestión del conocimiento de la OPS y la red Librarian Reserve Corps, determinará cuáles son las fuentes autorizadas más pertinentes. El equipo de respuesta utilizará un enfoque vinculado al diseño para difundir las estrategias recomendadas sobre la base de las ciencias del comportamiento, la narración de historias y el diseño de la información.

RESUMO O Centro Virtual Anti-Infodemia para as Américas (AIVCA, na sigla em inglês) da Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde (OPAS/OMS) é um projeto liderado pelo Departamento de Evidência e Inteligência para a Ação em Saúde da OPAS e pelo Centro de Informática em Saúde da Universidade de Illinois, EUA (Centro Colaborador da OPAS/OMS para Sistemas de Informação para a Saúde), com a participação de funcionários e consultores da OPAS de toda a região. Seu objetivo é desenvolver um conjunto de ferramentas — combinando a inteligência artificial (IA) com o discernimento humano — para ajudar os ministérios e instituições de saúde a responder às infodemias. As autoridades de saúde pública aprenderão sobre as ameaças emergentes detectadas pelo centro e obterão recomendações sobre como responder. O centro virtual está estruturado com três equipes paralelas: detecção, evidência e resposta. A equipe de detecção utilizará consultas de pesquisa avançada, machine learning (aprendizagem de máquina) e outras técnicas de IA para filtrar mais de 800 milhões de novas postagens públicas nas redes sociais por dia, a fim de identificar ameaças infodêmicas emergentes em inglês e espanhol. A equipe de evidência usará o mecanismo de busca federada EasySearch, com apoio de IA, da equipe de gestão de conhecimento da OPAS e do Librarian Reserve Corps (LRC), para identificar as fontes abalizadas mais relevantes. A equipe de resposta usará uma abordagem de design para comunicar estratégias de resposta recomendadas com base em abordagens de ciência comportamental, narração de histórias e design da informação.

Lung epithelial and endothelial damage, loss of tissue repair, inhibition of fibrinolysis, and cellular senescence in fatal COVID-19.

Coronavirus disease 2019 (COVID-19), caused by the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), is characterized by respiratory distress, multiorgan dysfunction, and, in some cases, death. The pathological mechanisms underlying COVID-19 respiratory distress and the interplay with aggravating risk factors have not been fully defined. Lung autopsy samples from 18 patients with fatal COVID-19, with symptom onset-to-death times ranging from 3 to 47 days, and antemortem plasma samples from 6 of these cases were evaluated using deep sequencing of SARS-CoV-2 RNA, multiplex plasma protein measurements, and pulmonary gene expression and imaging analyses. Prominent histopathological features in this case series included progressive diffuse alveolar damage with excessive thrombosis and late-onset pulmonary tissue and vascular remodeling. Acute damage at the alveolar-capillary barrier was characterized by the loss of surfactant protein expression with injury to alveolar epithelial cells, endothelial cells, respiratory epithelial basal cells, and defective tissue repair processes. Other key findings included impaired clot fibrinolysis with increased concentrations of plasma and lung plasminogen activator inhibitor-1 and modulation of cellular senescence markers, including p21 and sirtuin-1, in both lung epithelial and endothelial cells. Together, these findings further define the molecular pathological features underlying the pulmonary response to SARS-CoV-2 infection and provide important insights into signaling pathways that may be amenable to therapeutic intervention.

Knowledge-guided analysis of "omics" data using the KnowEnG cloud platform.

We present Knowledge Engine for Genomics (KnowEnG), a free-to-use computational system for analysis of genomics data sets, designed to accelerate biomedical discovery. It includes tools for popular bioinformatics tasks such as gene prioritization, sample clustering, gene set analysis, and expression signature analysis. The system specializes in "knowledge-guided" data mining and machine learning algorithms, in which user-provided data are analyzed in light of prior information about genes, aggregated from numerous knowledge bases and encoded in a massive "Knowledge Network." KnowEnG adheres to "FAIR" principles (findable, accessible, interoperable, and reuseable): its tools are easily portable to diverse computing environments, run on the cloud for scalable and cost-effective execution, and are interoperable with other computing platforms. The analysis tools are made available through multiple access modes, including a web portal with specialized visualization modules. We demonstrate the KnowEnG system's potential value in democratization of advanced tools for the modern genomics era through several case studies that use its tools to recreate and expand upon the published analysis of cancer data sets.

Dynamics of mammalian chromosome evolution inferred from multispecies comparative maps.

The genome organizations of eight phylogenetically distinct species from five mammalian orders were compared in order to address fundamental questions relating to mammalian chromosomal evolution. Rates of chromosome evolution within mammalian orders were found to increase since the Cretaceous-Tertiary boundary. Nearly 20% of chromosome breakpoint regions were reused during mammalian evolution; these reuse sites are also enriched for centromeres. Analysis of gene content in and around evolutionary breakpoint regions revealed increased gene density relative to the genome-wide average. We found that segmental duplications populate the majority of primate-specific breakpoints and often flank inverted chromosome segments, implicating their role in chromosomal rearrangement.