ABSTRACT
Danos no DNA podem ser induzidos por um grande número de agentes físicos e químicos presentes no ambiente, como também por compostos produzidos pelo próprio metabolismo celular. Estes danos podem interferir com processos celulares como replicaçäo e transcriçäo, levando a morte celular e/ou mutações. Os baixos níveis de mutaçäo nas células säo devidos à presença de vias enzimáticas, que reparam os danos no DNA. Diversos genes de reparo de DNA têm sido clonados e seus produtos caracterizados, principalmente em bactérias, leveduras e mamíferos. O interesse no estudo de mecanismos de reparo de DNA advém de seu envolvimento com a proteçäo da integridade da informaçäo genética. A alta conservaçäo observada para a maioria dos genes relacionados ao reparo de DNA, especialmente em eucariotos, aponta para sua importância para a manutençäo da vida na terra. Em plantas, o conhecimento sobre os mecanismos de reparo de DNA é ainda reduzido. Os primeiros genes de reparo foram recentemente clonados e o mecanismo de açäo de seus produtos está por ser caracterizado. Nosso objetivo neste trabalho de data mining foi identificar, no banco de dados gerados pelo projeto Genoma da Cana de Açúcar (Sugarcane Expressed Tag Project-SUCEST), genes relacionados ao reparo por excisäo de bases (BER). Esta busca foi feita através do programa tblastn. Em cana de açúcar, foram identificados clusters homólogos para a maioria das proteínas BER analisadas e um alto grau de conservaçäo foi observado. Os melhores resultados foram obtidos com proteínas BER de Arabidopsis thaliana. Para alguns homólogos BER de cana de açúcar, a presença de mais de uma forma de mRNA é possível, como definido pela ocorrência de mais de um cluster homólogo.