Compilation of regulations and procedures for monitoring filamentous fungi in hospital environments.

Air and surfaces in the hospital environment are a potential source of exposure to filamentous fungi (FF) that could cause invasive fungal diseases (IFD) in severely immunocompromised patients. The prevalent FF in IFD are species from the genera Aspergillus, Fusarium, Scedosporium, and those within the order Mucorales. We have compiled regulations and described the procedures used in the clinical mycology laboratory to assess the presence of FF in areas at risk for the development of IFD. The infection control committees of each establishment implement hospital policies to regulate and control processes aimed at preventing infections. Fungal load monitoring is an important step in this process to validate air quality in order to ensure a clean and protected environment for severely immunocompromised patients.

Infecciones fúngicas en otorrinolaringología: revisión de la literatura / Fungal infections in otolaryngology: literature review

Ante el aumento a nivel mundial de condiciones inmunosupresoras, la incidencia de enfermedades fúngicas que afectan órganos y sistemas propios del estudio otorrinolaringológico va en alza. Entre estas patologías es posible encontrar la candidiasis orofaríngea, laringitis fúngica, otomicosis, y distintos tipos de rinosinusitis. El estudio de los aspectos clínicos, agentes causantes y mecanismos patogénicos de estas enfermedades será fundamental para la práctica médica de los tiempos por venir.

With the worldwide increase of immunosuppressive conditions, the incidence of fungal diseases affecting organs and systems of otorhinolaryngological study is on the rise. Among these pathologies it is possible to find oropharyngeal candidiasis, fungal laryngitis, otomycosis, and different types of rhinosinusitis. The study of the clinical aspects, causative agents and pathogenic mechanisms of these diseases will be fundamental for the medical practice of the times to come.

Compatibilidad de un bioinsecticida a base de Beauveria bassiana con agroquímicos: efecto en la germinación y la actividad insecticida sobre Diatraea saccharalis

Los barrenadores del tallo del género de Diatraea spp. (Lepidoptera:Crambidae) han sido reconocidos por ser la plaga de mayor impacto en el cultivo de caña de azúcar, en el que causan importantes pérdidas económicas. Para su control, una cepa colombiana de Beauveria bassiana (Bals.) Vuill (aislamiento Bv062) que demostró alta virulencia frente a larvas de D. saccharalis (Fabricius), fue utilizada para el desarrollo de un bioinsecticida formulado como un concentrado emulsionable (CE). Con el fin de integrar este bioinsecticida en un esquema de manejo integrado de plagas, es necesario evaluar su compatibilidad con los agroquímicos utilizados comúnmente en el cultivo de caña de azúcar. Para tal fin se evaluó el efecto in vitro de 11 agroquímicos (fungicidas, insecticidas y herbicidas) sobre la germinación y actividad insecticida de conidios formulados. Inicialmente el CE y los agroquímicos fueron ajustados al doble de la concentración recomendada y mezclados en proporción 1:1, se incubaron durante dos horas, y se determinó el porcentaje de germinación. Los conidios expuestos a los agroquímicos fueron también purificados y utilizados para un bioen-sayo frente a larvas de segundo instar de D. saccharalis. El CE resultó ser compatible con los herbicidas e insecticidas evaluados, manteniendo una germinación y eficacia superior al 80%. Por el contrario, el CE fue incompatible con todos los fungicidas evaua-dos. Estos resultados permiten sugerir recomendaciones de aplicación del bioplaguicida a base de B. bassiana Bv062, junto con insecticidas y herbicidas empleados en el cultivo de caña, pero se recomienda no aplicarlo de manera simultánea con fungicidas como el benomil y del grupo de triazoles. Se recomienda validar estos resultados en condiciones de campo.

Sugarcane stem borers of the genus Diatraea spp. (Lepidoptera:Crambidae) have been recognized as the pest of the greatest impact on sugarcane crops causing significant economic losses. For its control, a colombian strain of Beauveria bassiana (Bals.) Vuill (code Bv062) that showed a high virulence against D. saccharalis (Fabricius) larvae was used for a biopesticide development, formulated as emulsifiable concentrate (EC). In order to include the EC into an integrated pest management (IPM) scheme, it is necessary to evaluate its compatibility with the agrochemicals commonly used in sugarcane crops. For this purpose, the in vitro effect of 11 agrochemicals (fungicides, insecticides and herbicides) on the germination and insecticidal activity of Bv062 formulated conidia was evaluated. Initially, the EC and agrochemicals were adjusted to double the recommended concentration and mixed in a 1:1 ratio. The mixes were incubated for two hours, and the germination percentage was calculated. The conidia exposed to the agrochemicals were also purified and used for a bioassay against second instar larvae of D. saccharalis. The EC was compatible with the herbicides and insecticides, maintaining germination and efficacy higher than 80%. In contrast, EC was incompatible with all the fungicides evaluated. These results allow us to suggest recommendations for the application of the biopesticide based on B. bassiana Bv062 with insecticides and herbicides used in sugarcane crops, but it is not recommended to apply it simultaneously with fungicides such as benomyl and the triazole group. It is recommended to validate these results under field conditions.

Primer registro de Psilocybe cubensis en un ambiente natural de Chile / First record of Psilocybe cubensis from a natural habitat in Chile

Psilocybe cubensiso también llamado hongo San Isidro, es un basidiomicete de distribución amplia que se encuentra por lo general en zonas de clima tropical y subtropical. Aquí se describe el primer registro de esta especie psicotrópica en condiciones naturales para Chile, desde una zona rural de clima de transición entre mediterráneo y templado. Se discuten los posibles causantes de esta extensión geográfica de la especie.(AU)

Psilocybe cubensis, also known as San Isidro, is a widely distributed basidiomycete, generally found in tropical and subtropical climate zones. Here, we describe the first record of this psychotropic speciesin natural conditions for Chile, from a rural environment in the transition zone between mediterranean and temperate climate. Possible causes for thisgeographic expansion of the species arediscussed.(AU)

Primera evidencia de actividad enzimática nitrilasa en Xylaria sp., y su relación con la biosíntesis de ácido indol-3-acético / First evidence of nitrilase enzymatic activity of Xylaria sp. and its relationship with the biosynthesis of indole-3-acetic acid

Resumen Muchos de los hongos degradadores de madera están implicados en la síntesis de metabolitos bioactivos de naturaleza antimicrobiana y terapéutica, así como de compuestos de importancia biotecnológica, incluyendo derivados indólicos, entre otros. Estos hongos brindan ciertos beneficios ecológicos a las plantas, entre los que se destacan la protección contra fitopatógenos y la promoción del crecimiento radicular. Xylaria sp. es un hongo degradador de celulosa (lignocelulolítico) con potencial biotecnológico. El ácido indol-3-acético (AIA) desempeña un papel sumamente importante en las interacciones planta-microorganismo, ya que es esencial para la fisiología y el correcto desarrollo morfológico vegetal. Se sabe que las enzimas nitrilo-hidrolíticas (nitrilasas) están involucradas en la síntesis de compuestos indólicos en las plantas, no obstante, se dispone de poca información acerca de la naturaleza de estas enzimas en el reino de los hongos. A través de una aproximación bioquímica y de genética molecular, se demuestra por primera vez que Xylaria sp. posee actividad enzimática nitrilasa utilizando compuestos ricos en nitrógeno y carbono como sustrato. La cepa estudiada aumentó sus niveles de expresión génica relativa y mostró crecimiento micelial, ambos en presencia de compuestos químicos como cianobenceno y KCN. Los resultados de este trabajo sugieren que el microorganismo es capaz de degradar moléculas nitrogenadas complejas. Por otra parte, mediante biofertilización con extractos fúngicos, se observó que Xylaria sp. promueve el desarrollo del sistema radicular de plántulas de Arabidopsis thaliana, además de sintetizar AIA.

Abstract Endophytic fungi inhabit plant tissues internally and asymptomatically, and many of them are involved in the synthesis of bioactive metabolites of antifungal and therapeutic nature, as well as other compounds of biotechnological importance including indole derivatives, among many others. Ecologically, they provide some benefits to plants including protection against phy-topathogens and promotion of root growth. In this sense, Xylaria sp. is a cellulose-decomposing fungus with biotechnological potential. It is worth mentioning that indole-3-acetic acid (IAA) also plays an extremely important role in plant-micro-organism interactions, as it is essential for physiology and proper plant morphological development. It is known that nitrile-hydrolytic enzymes (nitrilases) are involved in the synthesis of plant indole compounds; however, relatively little information is available concerning the nature of these enzymes in the fungal kingdom. In view of the above, through a biochemical and molecular-genetic approach, it has been demon-strated for the first time that Xylaria sp. carries out nitrile-hydrolytic enzyme activity using nitrogen and carbonrich compounds as substrate. The studied strain increased its relative gene expression levels and showed mycelial growth, both in the presence of chemical compounds such as cyanobenzene and KCN. Thus, the results of this work suggest that the micro-organism is capable of degrading complex nitrogenous molecules. On the other hand, through fungal biofertilization, it was observed that Xylaria sp. promotes the development of the root system of Arabidopsis thaliana seedlings, in addition to synthesizing IAA.

Nuevos nombres para antiguas especies fúngicas de importancia médica / New names for ancient fungal species of medical importance

En las últimas décadas ha existido un reordenamiento de los géneros y especies fúngicas de importancia médica debido a los constantes avances en la biología molecular. Desde la declaración de Amsterdam en el año 2011, se han ido abandonando la taxonomía de dos nombres (sexual y asexual) por cada especie, además se ha priorizado al primer nombre descrito. Dado que se recomienda comenzar a utilizar los nombres actualizados de los géneros y especies de levaduras y hongos filamentosos, se propone una transición utilizando el nombre actual, y el antiguo entre paréntesis escrito con minúscula, con el fin de evitar confusiones en los médicos clínicos ya acostumbrados a la nomenclatura previa.

In recent decades there has been a rearrangement of fungal genera and species of medical importance due to constant advances in molecular biology. Since the Amsterdam declaration in 2011, the taxonomy of two names (sexual and asexual) for each species has been abandoned, and the first name described has also been prioritized. Since it is recommended to start using the updated names of the genera and species of yeasts and filamentous fungi, a transition is proposed using the current name, and the old one in parentheses written with lower case, in order to avoid confusion in clinician physicians already accustomed to the previous nomenclature.

Alternatives for mushroom poisoning timely care in Mexico and Central America.

BACKGROUND: In countries where the consumption of mushrooms is common, hundreds of mushroom poisonings occur every year, which represents a public health problem. In Mexico, mushroom poisoning is classified as a non-bacterial gastrointestinal poisoning, which prevents timely care. OBJECTIVE: To create a free-access platform that synthesizes and standardizes the information on mycetism cases and offers tools for diagnosis and timely treatment. MATERIAL AND METHODS: In locations where cases of mycetism have occurred, information was obtained on the fungi involved, the poisonings that occurred, care protocols, and sample processing. RESULTS: Records were generated that synthesize and describe the types of mycetism with the highest probability of occurrence in Mexico. Therein, the biological characteristics of fungi, the symptoms they cause and their treatment are described. A protocol proposal for patient care and for the processing of biological samples is presented. Finally, a form is included to collect information on cases of poisoning. CONCLUSIONS: Systematized and analyzed information on mycetism allows to simplify its diagnosis, attention and treatment. The protocols for clinical care and sample processing are the basis for generating strategies that prevent deaths due to mycetism.

ANTECEDENTES: En países donde el consumo de hongos es frecuente ocurren cientos de casos de micetismos al año, por lo que representan un problema de salud pública. En México, los micetismos son clasificados como una intoxicación gastrointestinal de tipo no bacteriano, lo que impide su atención oportuna. OBJETIVO: Crear una plataforma de libre acceso que sintetice y estandarice la información de los casos de micetismos y ofrezca herramientas para su diagnóstico y tratamiento oportuno. MATERIAL Y MÉTODOS: En localidades donde han ocurrido casos de micetismos se obtuvo información sobre los hongos involucrados, las intoxicaciones ocurridas, protocolos de atención y procesamiento de muestras. RESULTADOS: Se generaron cédulas que sintetizan y describen las intoxicaciones por hongos con mayor probabilidad de ocurrencia en México. En ellas se describen las características biológicas de los hongos, síntomas que provocan y su tratamiento. Se presenta una propuesta de protocolo para la atención del paciente y para el procesamiento de muestras biológicas. Por último, se incluye un formulario para recopilar información sobre los casos de intoxicaciones. CONCLUSIONES: La información sistematizada y analizada sobre los micetismos permite simplificar su diagnóstico, atención y tratamiento. Los protocolos para la atención clínica y el procesamiento de muestras son la base para generar estrategias que eviten decesos por micetismo.

Alternativas para la atención oportuna de las intoxicaciones por consumo de hongos en México y Centroamérica / Alternatives for mushroom poisoning timely care in Mexico and Central America

Resumen Antecedentes: En países donde el consumo de hongos es frecuente ocurren cientos de casos de micetismos al año, por lo que representan un problema de salud pública. En México, los micetismos son clasificados como una intoxicación gastrointestinal de tipo no bacteriano, lo que impide su atención oportuna. Objetivo: Crear una plataforma de libre acceso que sintetice y estandarice la información de los casos de micetismos y ofrezca herramientas para su diagnóstico y tratamiento oportuno. Material y métodos: En localidades donde han ocurrido casos de micetismos se obtuvo información sobre los hongos involucrados, las intoxicaciones ocurridas, protocolos de atención y procesamiento de muestras. Resultados: Se generaron cédulas que sintetizan y describen las intoxicaciones por hongos con mayor probabilidad de ocurrencia en México. En ellas se describen las características biológicas de los hongos, síntomas que provocan y su tratamiento. Se presenta una propuesta de protocolo para la atención del paciente y para el procesamiento de muestras biológicas. Por último, se incluye un formulario para recopilar información sobre los casos de intoxicaciones. Conclusiones: La información sistematizada y analizada sobre los micetismos permite simplificar su diagnóstico, atención y tratamiento. Los protocolos para la atención clínica y el procesamiento de muestras son la base para generar estrategias que eviten decesos por micetismo.

Abstract Background: In countries where the consumption of mushrooms is common, hundreds of mushroom poisonings occur every year, which represents a public health problem. In Mexico, mushroom poisoning is classified as a non-bacterial gastrointestinal poisoning, which prevents timely care. Objective: To create a free-access platform that synthesizes and standardizes the information on mycetism cases and offers tools for diagnosis and timely treatment. Material and methods: In locations where cases of mycetism have occurred, information was obtained on the fungi involved, the poisonings that occurred, care protocols, and sample processing. Results: Infographics were generated that synthesize and describe the types of mycetism with the highest probability of occurrence in Mexico. Therein, the biological characteristics of fungi, the symptoms they cause and their treatment are described. A protocol proposal for patient care and for the processing of biological samples is presented. Finally, a form is included to collect information on cases of poisoning. Conclusions: Systematized and analyzed information on mycetism allows to simplify its diagnosis, attention and treatment. The protocols for clinical care and sample processing are the basis for generating strategies that prevent deaths due to mycetism.

Mycosynthesis of silver nanoparticles using psychrotrophic strains of Tulasnella albida Bourdot & Galzin from the South Orkney Islands (Antarctica).

This study is the first report on mycosynthesis of silver nanoparticles (NPs) using psychrotrophic Antarctic filamentous fungi, and the first report regarding Tulasnella (Basidiomycota). In this work, the ability to synthesize silver NPs from cell free filtrates of strains of Tulasnella albida isolated from Antarctica was assessed. All fungal filtrates were capable of synthesizing silver NPs with the addition of AgNO3. UV-vis spectroscopy, TEM and SEM microscopy analyses were performed to characterize the synthesized NPs. ATR-FTIR and Micro Raman spectroscopy analyses were conducted to find functional groups responsible for the reduction of AgNO3 and to detect the presence of silver oxide on the AgNPs. Theoretical calculations of optical absorption based on core-shell Ag-Ag2O were used to characterize the experimental absorption spectra of silver NPs colloids. Spherically shaped silver NPs, typically 2-3nm in diameter, were obtained. The largest ones showed a capping shell around them, which could be associated with the formation of small silver NPs. Functional groups corresponding to amides and alcohols were detected, confirming the presence of proteins as possible intermediates in the synthesis of AgNPs. On the other hand, the Micro Raman analysis confirms the presence of silver oxide on the surface of the AgNPs. This work presents a simple procedure for the synthesis of silver NPs using a psychrotrophic organism that could be interesting for the industry.

[First evidence of nitrilase enzymatic activity of Xylaria sp. and its relationship with the biosynthesis of indole-3-acetic acid]. / Primera evidencia de actividad enzimática nitrilasa en Xylaria sp., y su relación con la biosíntesis de ácido indol-3-acético.

Endophytic fungi inhabit plant tissues internally and asymptomatically, and many of them are involved in the synthesis of bioactive metabolites of antifungal and therapeutic nature, as well as other compounds of biotechnological importance including indole derivatives, among many others. Ecologically, they provide some benefits to plants including protection against phytopathogens and promotion of root growth. In this sense, Xylaria sp. is a cellulose-decomposing fungus with biotechnological potential. It is worth mentioning that indole-3-acetic acid (IAA) also plays an extremely important role in plant-micro-organism interactions, as it is essential for physiology and proper plant morphological development. It is known that nitrile-hydrolytic enzymes (nitrilases) are involved in the synthesis of plant indole compounds; however, relatively little information is available concerning the nature of these enzymes in the fungal kingdom. In view of the above, through a biochemical and molecular-genetic approach, it has been demonstrated for the first time that Xylaria sp. carries out nitrile-hydrolytic enzyme activity using nitrogen and carbon-rich compounds as substrate. The studied strain increased its relative gene expression levels and showed mycelial growth, both in the presence of chemical compounds such as cyanobenzene and KCN. Thus, the results of this work suggest that the micro-organism is capable of degrading complex nitrogenous molecules. On the other hand, through fungal biofertilization, it was observed that Xylaria sp. promotes the development of the root system of Arabidopsis thaliana seedlings, in addition to synthesizing IAA.

El papel del laboratorio de microbiología en la práctica clínica / The role of the microbiology laboratory in clinical practice

Los seres humanos albergamos en el cuerpo a cientos de miles de microbios (bacterias, virus, hongos, archaea). Con la mayoría convivimos armónicamente, y obtenemos beneficios mutuos. Ellos participan activamente en nuestros procesos metabólicos e inmunológicos, y nosotros les damos vivienda y nutrientes [1]. Si el equilibrio se altera, como ocurre cuando el sistema inmune se suprime, algunos de estos microorganismos aprovechan la oportunidad y desencadenan infección [2], siendo este el origen de la mayoría de las infecciones, pero no el único, pues los ambientes externos al cuerpo humano también están poblados de microbios, y si bien pocos se consideran patógenos, al entrar en contacto con ellos adquirimos infecciones que llamamos exógenas. De acuerdo con la Organización Mundial de la Salud (OMS), las enfermedades transmisibles están entre las 10 principales causas de muerte en el mundo, y excluyendo la infección por SARS-CoV-2 (COVID-19) en 2021, las infecciones respiratorias agudas fueron la cuarta causa más frecuente de defunción a nivel mundial [3]. El laboratorio de microbiología clínica tiene un papel crucial en el proceso diagnóstico, terapéutico y preventivo de las enfermedades infecciosas causadas por bacterias, hongos, virus y parásitos, pues determinar el agente causal de manera eficaz permite tomar acciones oportunas para definir el manejo individual de las personas infectadas y cortar la cadena de transmisión cuando se requiera [2]

Disaster mycology / Micología de desastres

Natural and human-made disasters have long played a role in shaping the environment and microbial communities, also affecting non-microbial life on Earth. Disaster microbiology is a new concept based on the notion that a disaster changes the environment causing adaptation or alteration of microbial populations-growth, death, transportation to a new area, development traits, or resistance-that can have downstream effects on the affected ecosystem. Such downstream effects include blooms of microbial populations and the ability to colonize a new niche or host, cause disease, or survive in former extreme conditions. Throughout history, fungal populations have been affected by disasters. There are prehistoric archeological records of fungal blooms after asteroid impacts and fungi implicated in the fall of the dinosaurs. In recent times, drought and dust storms have caused disturbance of soil fungi, and hurricanes have induced the growth of molds on wet surfaces, resulting in an increased incidence of fungal disease. Probably, the anticipated increase in extreme heat would force fungi adaptation to survive at high temperatures, like those in the human body, and thus be able to infect mammals. This may lead to a drastic rise of new fungal diseases in humans.

Los desastres naturales o los causados por el hombre impactan la formación de ecosistemas y comunidades microbianas, y también afectan las formas de vida no microbianas. Este concepto es conocido como "microbiología de desastres", una subespecialización de la microbiología, basada en los cambios ambientales generados por un desastre y las posibles adaptaciones o alteraciones de las poblaciones microbianas -crecimiento, muerte, trasporte a una nueva región, o adquisición de resistencia o de nuevas características- que influirán en el moldeamiento del ecosistema transformado. Algunos de los efectos de estas adaptaciones pueden ser: el surgimiento de poblaciones microbianas, la habilidad de colonizar nuevos nichos u huéspedes, la generación de nuevas enfermedades, o el crecimiento de microorganismos en condiciones que antes eran "extremas" para ellos. A lo largo de la historia, varias poblaciones de hongos han sido afectadas por desastres. Existen registros arqueológicos prehistóricos que evidencian la presencia y el crecimiento de hongos luego del impacto de asteroides, y otros de hongos relacionados con la extinción de los dinosaurios. Actualmente, las sequías y las tormentas de polvo causan perturbaciones en las comunidades de hongos del suelo, y los huracanes inducen el crecimiento de hongos filamentosos en superficies húmedas, lo que aumenta la cantidad de enfermedades por hongos. Además, con el aumento de las temperaturas extremas es posible que los hongos puedan adaptarse para sobrevivir a temperaturas más altas, equivalentes a las temperaturas corporales, y nuevas especies puedan infectar mamíferos. Esto puede llevar a un aumento drástico de las infecciones fúngicas en humanos.

Candida auris: a global pathogen that has taken root in Colombia / Candida auris: un agente patógeno global que se ha arraigado en Colombia

Candida auris has been recognized as an emerging multidrug-resistant pathogen with a significant public health burden, causing cases of invasive infection and colonization due to its persistence on inanimate surfaces, ability to colonize skin of some patients, and high transmissibility in healthcare settings. The first sporadic report of the isolation of this species from the ear canal of a patient in Asia was in 2009 and reports from other regions of the world soon followed. However, it was not until 2015 that global epidemiological alerts were communicated as a result of an increasing number of reports of invasive infections caused by C. auris in several countries. Colombia was soon added to this list in 2016 after an unusual increase in the number of C. haemulonii isolates was reported, later confirmed as C. auris. Since the issuing of a national alert by the Colombian National Institute of Health together with the Ministry of Health in 2016, the number of cases reported reached over 2,000 by 2022. Colombian isolates have not shown pan resistance to available antifungals, unlike C. auris strains reported in other regions of the world, which leaves patients in Colombia with therapeutic options for these infections. However, increasing fluconazole resistance is being observed. Whole-genome sequencing of Colombian C. auris isolates has enhanced molecular epidemiological data, grouping Colombian isolates in clade IV together with other South American isolates. Data from Colombia showed that public health authorities, scientific community, and the general public need to be aware of fungal diseases as they present an often-deadly threat to patients.

Candida auris ha sido reconocido como un agente patógeno multirresistente emergente con una carga significativa en la salud pública. Genera casos de infección invasiva y colonización debido a su persistencia en superficies inanimadas, su capacidad para colonizar fácilmente la piel de algunos pacientes y su alta transmisibilidad en el ambiente hospitalario. El primer reporte esporádico de esta especie fue en Asia en el 2009 cuando se realizó su aislamiento a partir del conducto auditivo de un paciente, y pronto le siguieron reportes en otras regiones del mundo. Sin embargo, no fue hasta 2015 que se conocieron las alertas epidemiológicas a nivel mundial debido a un aumento en el número de casos de infecciones causadas por C. auris en varios países. Colombia se sumó a la lista en 2016 luego de un aumento inusual en el número de aislamientos de C. haemulonii informados, que luego se confirmaron como C. auris. Desde que el Instituto Nacional de Salud junto con el Ministerio de Salud emitieron la Alerta Nacional en el 2016, el número de casos reportados superó los 2.000 en el 2022. Los aislamientos colombianos no han mostrado resistencia generalizada a los antifúngicos disponibles, contrario a lo reportado para cepas de C. auris en algunas regiones del mundo, por lo que los pacientes en Colombia aún cuentan con opciones terapéuticas para estas infecciones. No obstante, se ha observado un aumento en la resistencia al fluconazol. La secuenciación del genoma completo agrupó los aislamientos colombianos en el Ciado IV, junto con otros sudamericanos de C. auris, y aportó al conocimiento de los datos epidemiológicos moleculares de esta especie. Los datos de Colombia evidencian que las autoridades de salud pública, la comunidad científica y el público en general deben ser conscientes de las enfermedades fúngicas, ya que a menudo representan una amenaza mortal para los pacientes.

Taxonomía de los hongos: un rompecabezas al que le faltan muchas piezas / Fungal taxonomy: A puzzle with many missing pieces

Los hongos son organismos polifacéticos presentes en casi todos los ecosistemas de la tierra, donde establecen diversos tipos de simbiosis con otros seres vivos. A pesar de ser reconocidos por los humanos desde la antigüedad -y de la cantidad de trabajos que han profundizado sobre su biología y ecología-, aún falta mucho por conocer sobre estos organismos. Algunos de los criterios que clásicamente se han utilizado para su estudio, hoy resultan limitados y hasta cierto punto permiten un agrupamiento de los aislamientos según algunas características, pero generan confusión en su clasificación y, más aún, cuando se pretende comprender sus relaciones genealógicas. Los caracteres fenotípicos no son suficientes para identificar una especie de hongos y, menos aún, para construir una filogenia amplia o de un grupo particular. Hay grandes vacíos que hacen que los árboles generados sean inestables y fácilmente debatidos. Para los profesionales de la salud, parece que la identificación de los hongos hasta niveles inferiores como género y especie es suficiente para elegir el tratamiento más adecuado para su control, comprender la epidemiología de los cuadros clínicos asociados y reconocer los brotes y los factores determinantes de la resistencia a los antimicrobianos. No obstante, la ubicación taxonómica dentro del reino permitiría establecer relaciones filogenéticas entre los taxones fúngicos, facilitando la comprensión de su biología, su distribución en la naturaleza y la evolución de su potencial patogénico. Los avances de las técnicas de biología molecular y las ciencias de la computación en los últimos 30 años han permitido cambios importantes dirigidos a establecer los criterios para definir una especie fúngica y alcanzar una construcción filogenética más o menos estable. Sin embargo, el camino por recorrer aún es largo, y supone un trabajo mancomunado de la comunidad científica a nivel global y el apoyo a la investigación básica.

Fungi are multifaceted organisms found in almost all ecosystems on Earth, where they establish various types of symbiosis with other living beings. Despite being recognized by humans since ancient times, and the high number of works delving into their biology and ecology, much is still unknown about these organisms. Some criteria classically used for their study are nowadays limited, generating confusion in categorizing them, and even more, when trying to understand their genealogical relationships. To identify species within Fungi, phenotypic characters to date are not sufficient, and to construct a broad phylogeny or a phylogeny of a particular group, there are still gaps affecting the generated trees, making them unstable and easily debated. For health professionals, fungal identification at lower levels such as genus and species, is enough to select the most appropriate therapy for their control, understand the epidemiology of clinical pictures associated, and recognize outbreaks and antimicrobial resistance. However, the taxonomic location within the kingdom, information with apparently little relevance, can allow phylogenetic relationships to be established between fungal taxa, facilitating the understanding of their biology, distribution in nature, and pathogenic potential evolution. Advances in molecular biology and computer science techniques from the last 30 years have led to crucial changes aiming to establish the criteria to define a fungal species, allowing us to reach a kind of stable phylogenetic construction. However, there is still a long way to go, and it requires the joint work of the scientific community at a global level and support for basic research.

El distrés oxidativo y sus implicaciones moleculares en algunas enfermedades infecciosas: una revisión / Oxidative distress and its molecular implication for some infectious diseases: A review

Introducción: Las especies reactivas de oxígeno, nitrógeno y azufre (ERONS) se generan continuamente en la fisiología de los organismos. Como parte de la respuesta de las células inmunitarias frente a los patógenos podrían aumentar y producir distrés oxidativo, citotoxicidad y daño de los órganos. El reconocimiento de las implicaciones moleculares de las ERONS todavía es un campo de investigación en desarrollo. Objetivo: Describir los aspectos moleculares relacionados con el metabolismo oxidativo y algunos patógenos (virus, parásitos, bacterias y hongos) en relación con las infecciones. Métodos: Se identificaron 520 documentos relacionados con los criterios de búsqueda en las bases de datos LILACS, Science Direct, SciELO, EMBASE, PubMed e Infomed, con los buscadores Google y Google académico. De estos, fueron analizados 78 documentos publicados a partir de 1980 al 2021 en español o inglés y organizados en 7 subtemas. Información, análisis y síntesis: Los agentes infecciosos y el hospedero interactúan produciendo ERONS que pueden superar los sistemas de defensa antioxidantes e influyen en el distrés oxidativo. Los procesos biológicos asociados al estado redox se relacionan con los factores de transcripción Nrf2 y NF-κB. Ambos permiten una respuesta celular entre la susceptibilidad y la resistencia a los agentes infecciosos, por lo que pueden iniciar o acelerar procesos fisiopatológicos en el organismo. En general la respuesta redox en la fisiopatología infecciosa está interconectada con la reprogramación metabólica, las respuestas antimicrobianas e inflamatorias y la disfunción celular o de tejido. Conclusiones: Los eventos moleculares redox pueden participar en diversas enfermedades infecciosas, mediando diferentes respuestas o trastornos asociados.

Introduction: Reactive oxygen/nitrogen/sulfur species (RONSS) are continuously generated in the physiology of organisms. As part of the immune cell response to pathogens, they may increase and lead to oxidative stress, cytotoxicity and organ damage. Recognizing the molecular implications of RONSS is still a developing field of research. Objective: To describe the molecular aspects related to oxidative metabolism and some pathogens (viruses, parasites, bacteria and fungi) in relation to infections. Methods: Based on the search criteria, 520 documents were identified in LILACS, Science Direct, SciELO, EMBASE, PubMed and Infomed databases, using the search engines Google and Google Scholar. Of these, 78 documents published from 1980 to 2021 in Spanish or English and organized into seven subtopics were analyzed. Information, analysis and synthesis: Infectious agents and the host interact to produce RONSS that can overcome antioxidant defense systems influencing on oxidative stress. Biological processes associated with the redox state are related to the transcription factors Nrf2 and NF-κB. Both generate a cellular response between susceptibility and resistance to infectious agents, thus they can initiate or accelerate pathophysiological processes in the organism. In general, the redox response in infectious pathophysiology is interconnected with metabolic reprogramming, antimicrobial and inflammatory responses, and cellular or tissue dysfunction. Conclusions: Molecular redox events may be involved in various infectious diseases, where different associated responses or disorders mediate.

Can dark septate endophytic fungi (DSE) mobilize selectively inorganic soil phosphorus thereby promoting sorghum growth? A preliminary study / ¿Los hongos endófitos septados oscuros (DSE) pueden movilizar selectivamente el fósforo inorgánico y promover así el crecimiento del sorgo? Un estudio preliminar

Abstract Phosphate fertilizers tend to precipitate with soil components, affecting fertilization efficiency and causing negative environmental effects. Soil microorganisms have been used to solve this problem. However, the ability of dark septate endophytic fungi (DSE) to dissolve phosphates and increase crop yield are not well known. The activity of DSE fungi capable of solubilizing reagent grade phosphates was studied in a Typic Hapludoll (Hapludol típico). The effect of the fungi on the inorganic phosphorus fractions was evaluated and an experiment was conducted in pots with sorghum as a crop. No fungal structures were found in the roots. Curvularia sp. aerial biomass and root length increased; however, P concentration was not affected. Although the results are not conclusive, they represent an advance in the potential use of DSE fungi as P solubilizers to treat crop nutrition.

Resumen Los fertilizantes fosfatados tienden a precipitar con componentes del suelo, lo que afecta la eficiencia de la fertilización y causa efectos negativos. Para resolver este problema se han utilizado microorganismos del suelo. Sin embargo, no se conoce bien la capacidad de los hongos endófitos septados oscuros (ESO) para disolver fosfatos y aumentar el rendimiento de los cultivos. Se estudió en un hapludol típico (typic hapludoll) la actividad de hongos ESO capaces de solubilizar fosfatos de grado reactivo. Se evaluó el efecto de los hongos sobre las fracciones de fósforo inorgánico y se realizó un experimento en macetas con sorgo como cultivo. No se encontraron estructuras fúngicas en las raíces. Curvularia sp. aumentó la biomasa aérea y la longitud radical, pero la concentración de fósforo no se vio afectada. Aunque los resultados no son concluyentes, representan un avance en el uso potencial de hongos ESO como solubilizadores de fósforo para tratar la nutrición de cultivos.

Infección fúngica invasiva por Saprochaete capitata en un niño con aplasia medular / Invasive fungal infection by Saprochaete capitata in a child with bone marrow aplasia

RESUMEN Saprochaete capitata es una causa rara de infección fúngica invasiva en pacientes inmunocomprometidos con alta mortalidad y resistencia antifúngica. Presentamos el caso de un niño de cinco años con diagnóstico de aplasia medular, sometido a trasplante de progenitores hematopoyéticos (TPH), que cursó con neutropenia febril persistente, dolor abdominal intenso, aparición de lesiones maculopapulares en piel y deterioro de la función renal. Se identificó la presencia de S. capitata, en hemocultivos transcatéter venoso central. Esta infección fúngica invasiva resulta ser rara, pero emergente y potencialmente mortal, en pacientes con neutropenia febril persistente y uso prolongado de dispositivos invasivos intravasculares como catéter venoso central.

ABSTRACT Saprochaete capitata is a rare cause of invasive fungal infection in immunocompromised patients with high mortality and antifungal resistance. We present the case of a 5-year-old boy with bone marrow aplasia, who underwent hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) and presented persistent febrile neutropenia, abdominal pain, appearance of maculopapular lesions on the skin, and impaired renal function. The presence of S. capitata was identified by blood culture from a central venous catheter. This invasive fungal infection is rare but emergent and life-threatening, especially in immunocompromised patients with persistent febrile neutropenia and prolonged use of invasive devices such as central venous catheters.

Possible Trichosporon asahii urinary tract infection in a critically ill COVID-19 patient.

BACKGROUND: Trichosporon asahii, an emerging fungal pathogen, has been frequently associated with invasive infections in critically ill patients. CASE REPORT: A 74-year-old male patient diagnosed with COVID-19 was admitted to an Intensive Care Unit (ICU). During hospitalization, the patient displayed episodes of bacteremia by Staphylococcus haemolyticus and a possible urinary tract infection by T. asahii. While the bacterial infection was successfully treated using broad-spectrum antibiotics, the fungal infection in the urinary tract was unsuccessfully treated with anidulafungin and persisted until the patient died. CONCLUSIONS: With the evolving COVID-19 pandemic, invasive fungal infections have been increasingly reported, mainly after taking immunosuppressant drugs associated with long-term broad-spectrum antibiotic therapy. Although Candida and Aspergillus are still the most prevalent invasive fungi, T. asahii and other agents have emerged in critically ill patients. Therefore, a proper surveillance and diagnosing any fungal infection are paramount, particularly in COVID-19 immunocompromised populations.

Can dark septate endophytic fungi (DSE) mobilize selectively inorganic soil phosphorus thereby promoting sorghum growth? A preliminary study.

Phosphate fertilizers tend to precipitate with soil components, affecting fertilization efficiency and causing negative environmental effects. Soil microorganisms have been used to solve this problem. However, the ability of dark septate endophytic fungi (DSE) to dissolve phosphates and increase crop yield are not well known. The activity of DSE fungi capable of solubilizing reagent grade phosphates was studied in a Typic Hapludoll (Hapludol típico). The effect of the fungi on the inorganic phosphorus fractions was evaluated and an experiment was conducted in pots with sorghum as a crop. No fungal structures were found in the roots. Curvularia sp. aerial biomass and root length increased; however, P concentration was not affected. Although the results are not conclusive, they represent an advance in the potential use of DSE fungi as P solubilizers to treat crop nutrition.

Evaluación in vivo de la pirogenicidad de bioproductos fúngicos con potencial prebiótico / In vivo pyrogenicity evaluation of fungal bioproducts with prebiotic potential / Avaliação in vivo da pirogenicidade de bioprodutos fúngicos com potencial prebiótico

RESUMEN Introducción: Los productos naturales con actividad farmacológica requieren de evaluaciones preclínicas que justifiquen su empleo sobre una base científica. El ensayo de pirógenos es una prueba dentro de la Farmacología de Seguridad que se realiza para determinar la presencia de endotoxinas y constituye un método valioso, para demostrar la seguridad de bioderivados con potencial prebiótico en el campo de la inmunonutrición. Objetivo: Evaluar la pirogenicidad de bioproductos fúngicos de Pleurotus ostreatus (extractos acuosos del micelio y cuerpos fructíferos) y un biopreparado de levadura Kluyveromyces marxianus, empleando el ensayo de pirógenos en conejos Nueva Zelanda. Método: Se ensayaron concentraciones de 1,0 y 10,0 mg/mL de cada muestra por vía endovenosa en dosis de 0,5 y 5,0 mg/kg de peso. El diseño experimental cumplió las buenas prácticas de laboratorio según lo establecido por el International Council for Laboratory Animals Science y se realizó de acuerdo a los procedimientos normalizados de trabajo del Centro de Toxicología y Biomedicina, Santiago de Cuba. Resultados: Los extractos de Pleurotus ostreatus y el biopreparado de levadura (0,5 mg/kg) no mostraron signos de pirogenicidad. En los resultados del biopreparado (5,0 mg/kg), los valores de temperatura caen en un rango de incertidumbre, según la Farmacopea de Estados Unidos (USP) y se sugirió repetir el estudio. Conclusiones: Los extractos de Pleurotus ostreatus y el biopreparado de Kluyveromyces marxianus (0,5 mg/kg) no indujeron un aumento de temperatura significativo en los animales, lo cual sugiere que en estos bioproductos no existen niveles de endotoxinas que puedan provocar pirogenicidad.

ABSTRACT Introduction: Natural products with pharmacological activity require preclinical evaluations to justify their uses scientifically. The pyrogen assay is a safety pharmacology test performed to determine the presence of endotoxins and it is a valuable method to demonstrate the bio-derivative products safety and their prebiotic potential in the field of immunonutrition. Objective: To evaluate the pyrogenicity of fungal bioproducts from Pleurotus ostreatus (aqueous extracts from mycelium and fruiting bodies) and a biopreparation from Kluyveromyces marxianus yeast, using a pyrogen assay in New Zealand rabbits. Method: Concentrations of 1.0 and 10.0 mg/mL of each sample were tested intravenously at doses of 0.5 and 5.0 mg/kg body weight. The experimental design complied with good laboratory practices as established by the International Council for Laboratory Animal Science and was carried out according to the standard work procedures of the Centro de Toxicología y Biomedicina, Santiago de Cuba. Results: Pleurotus ostreatus extracts and the yeast biopreparation (0.5 mg/kg) showed no signs of pyrogenicity. In the biopreparation results (5.0 mg/kg), temperature values fall in the uncertainty range according to the United States Pharmacopoeia (USP), and therefore it was suggested to repeat the study. Conclusions: Pleurotus ostreatus extracts and Kluyveromyces marxianus biopreparation (0.5 mg/kg) did not induce a significant temperature increase in the animals, thereby suggesting that there are no endotoxin levels in such bioproducts that could cause pyrogenicity.

RESUMO Introdução: Produtos naturais com atividade farmacológica requerem avaliações pré-clínicas que justifiquem seu uso em bases científicas. O ensaio de pirogênio é um teste dentro da Farmacologia de Segurança que é realizado para determinar a presença de endotoxinas e é um método valioso para demonstrar a segurança de bioderivados com potencial prebiótico no campo da imunonutrição. Objetivo: Avaliar a pirogenicidade de bioprodutos fúngicos de Pleurotus ostreatus (extratos aquosos do micélio e corpos de frutificação) e de uma biopreparação da levedura Kluyveromyces marxianus, utilizando o ensaio pirogênico de coelho da Nova Zelândia. Método: Concentrações de 1,0 e 10,0 mg/mL de cada amostra foram testadas por via intravenosa nas doses de 0,5 e 5,0 mg/kg de peso. O desenho experimental obedeceu às boas práticas laboratoriais estabelecidas pelo Conselho Internacional para a Ciência dos Animais de Laboratório e foi realizado de acordo com os procedimentos de trabalho padrão do Centro de Toxicologia e Biomedicina, Santiago de Cuba. Resultados: Os extratos de Pleurotus ostreatus e a biopreparação de leveduras (0,5 mg/kg) não apresentaram sinais de pirogenicidade. Nos resultados da biopreparação (5,0 mg/kg), os valores de temperatura estão dentro de uma faixa de incerteza, segundo a Farmacopeia dos Estados Unidos (USP) e foi sugerido repetir o estudo. Conclusões: Os extratos de Pleurotus ostreatus e a biopreparação de Kluyveromyces marxianus (0,5 mg/kg) não induziram um aumento significativo da temperatura nos animais, o que sugere que não há níveis de endotoxinas nesses bioprodutos que possam causar pirogenicidade.