Material genético do SARS-CoV-2 em superfícies de equipamentos utilizados na prática de atividades físicas / Genetic material of SARS-CoV-2 on the surface of equipment used in the practice of physical activities

A humanidade foi impactada por uma Pandemia que expôs a população ao contato com um vírus de elevado contágio e com o índice de letalidade alarmante. Este estudo objetivou avaliar a possibilidade da persistência de material genético do SARS-CoV-2 na superfície dos equipamentos de estabelecimentos de prática de atividades físicas indoor e outdoor. Foram coleta das amostras de equipamentos utilizados para a prática de exercícios físicos em cinco academias, cinco praças e entre os frequentadores desses ambientes. Aplicou-se a técnica RT-PCR para a detecção doRNA do SARS-CoV-2 e posterior análise dos resultadose foi detectada a existência de partículas de RNA viral do SARS-CoV-2 em 48,57% das amostras coletadas dos equipamentos das academias e 12,85% das amostras coletadas nas praças, evidenciando uma incidência menor em equipamentos utilizados em locais abertos em todas as áreas comparadas.Além disso, constatou-se que 35,7% dos participantes do estudo testaram positivo para COVID-19.Os casos positivos para COVID-19 detectados apresentaram sintomas classificados como levesa moderados e uma recuperação rápida.A presença de material genético nos equipamentos,por sua vez, leva-nos a perceber a importância da higienização adequada das superfícies, como forma de prevenção.

Humanity was impacted by a Pandemic that exposed the population to contact with a highly contagious virus with an alarming lethality rate. The present study aimed to evaluate the possibility of the persistence of genetic material from SARS-CoV-2 on the surface of equipment used to practice indoor and outdoor physical activities. A sample of equipment used for the practice of physical activity was collected in five gyms and five squares and among the regulars of these environments. The RT-PCR technique was applied to detect the RNA of SARS-CoV-2 and subsequent analysis of the results. The existence of SARS-CoV-2 viral RNA particles was detected in 48.57% of the samples collected from gym equipment and 12.85% of the samples collected in squares, evidencing a lower incidence in equipment used in open spaces in all areas compared and it was found that 35.7% of the study participants tested positive for COVID-19. The positive cases for COVID-19 detected, had symptoms classified as mild to moderate and a quick recovery. The presence of genetic material in the equipment, in turn, leads us to realize the importance of proper cleaning of surfaces, as a form of prevention.

Uma análise dos principais diagnósticos de Sars-cov-2 disponíveis no Brasil: uma revisão de literatura / Diagnosis and main types of coronavirus in humans: a narrative review / Diagnóstico y principales tipos de coronavirus en humanos: una revisión narrativa

Introdução: Com a emergência do SARS-CoV-2 foi disponibilizado uma grande quantidade de ferramentas de diagnóstico. Neste contexto, a falta de vacina, de tratamento e o grande número de casos graves e morte, possibilitou a aprovação emergencial de diversos testes, que ainda necessitam de estudos populacionais para seu registro definitivo. Objetivo: Realizar uma revisão de literatura para avaliar as metodologias de diagnóstico disponíveis no Brasil, de acordo com a realidade local de saúde, explorando o momento epidemiológico a complexidade do teste e a finalidade da sua aplicação. Metodologia: Trata-se de um estudo bibliográfico, descritivo do tipo revisão de literatura. Foram utilizadas as seguintes bases de dados científicos para buscas: PUBMED, MEDLINE, LILACS E COCHRANE LIBRARY, através de descritores selecionados na plataforma DECS. Resultados: O cenário de diversos ensaios, baseados em diferentes metodologias, como os testes baseados em RNA viral, em detecção de antígenos virais ou de anticorpos, associados ao conhecimento da história natural do vírus, possibilita uma análise crítica do melhor diagnóstico de acordo com a clínica do paciente, os epidemiológicos, o objetivo do diagnóstico e a acurácia do ensaio. Atualmente, há mudança no padrão imunológico da população e a descrição de tipos e subtipos de SARS-CoV-2 com mudanças gênicas, que podem levar a mudanças na acurácia diagnóstica ou a re-emergência em surtos de doença grave. Conclusão: Ainda é incerto o caminho evolutivo da história natural da Covid-19 e os ensaios diagnósticos estão em diferentes estágios de desenvolvimento, validação e produção e cada tipo de teste tem suas próprias vantagens e desvantagens distintas inerentes a plataforma tecnológica de origem e uma combinação de tipos de testes usados em momentos diferentes pode ser útil para a condução clínica dos pacientes e no controle da pandemia por SARS-CoV-2.

Introduction: With the emergence of SARS-CoV-2, a large number of diagnostic tools were made available. In this context, the lack of vaccine, treatment and the large number of severe cases and death, allowed the emergency approval of several tests, which still require population studies for their definitive registration. Objective: To carry out a literature review to evaluate the diagnostic methodologies available in Brazil, according to the local health reality, exploring the epidemiological moment, the complexity of the test and the purpose of its application. Methodology: This is a bibliographic, descriptive study of the literature review type. The following scientific databases were used for searches: PUBMED, MEDLINE, LILACS AND COCHRANE LIBRARY, through selected descriptors on the DECS platform. Results: The scenario of several tests, based on different methodologies, such as tests based on viral RNA, on detection of viral antigens or antibodies, associated with knowledge of the natural history of the virus, allows a critical analysis of the best diagnosis according to the patient's clinical, epidemiological, diagnostic objective and assay accuracy. Currently, there is a change in the immune pattern of the population and the description of types and subtypes of SARS-CoV-2 with genetic changes, which can lead to changes in diagnostic accuracy or the re-emergence in outbreaks of severe disease. Conclusion: The evolutionary path of the natural history of Covid-19 is still uncertain and diagnostic assays are at different stages of development, validation and production and each type of test has its own distinct advantages and disadvantages inherent in the technology platform of origin and a combination of types of tests used at different times can be useful for the clinical management of patients and in the control of the SARS-CoV-2 pandemic.

Introducción: Con la aparición del SARS-CoV-2, se dispuso de un gran número de herramientas diagnósticas. En este contexto, la falta de vacuna, tratamiento y el gran número de casos graves y muerte, permitieron la aprobación de urgencia de varias pruebas, que aún requieren estudios poblacionales para su registro definitivo. Objetivo: Realizar una revisión bibliográfica para evaluar las metodologías diagnósticas disponibles en Brasil, de acuerdo con la realidad sanitaria local, explorando el momento epidemiológico, la complejidad de la prueba y la finalidad de su aplicación. Metodología: Se trata de un estudio bibliográfico, descriptivo, del tipo revisión de literatura. Para las búsquedas se utilizaron las siguientes bases de datos científicas PUBMED, MEDLINE, LILACS Y COCHRANE LIBRARY, a través de descriptores seleccionados en la plataforma DECS. Resultados: El escenario de varias pruebas, basadas en diferentes metodologías, como pruebas basadas en el ARN viral, en la detección de antígenos virales o anticuerpos, asociado al conocimiento de la historia natural del virus, permite un análisis crítico del mejor diagnóstico de acuerdo con la clínica del paciente, epidemiológica, objetivo diagnóstico y precisión de la prueba. Actualmente, hay un cambio en el patrón inmunológico de la población y la descripción de tipos y subtipos de SARS-CoV-2 con cambios genéticos, que pueden conducir a cambios en la precisión diagnóstica o la reaparición en brotes de enfermedad grave. Conclusiones: El camino evolutivo de la historia natural del Covid-19 es aún incierto y los ensayos de diagnóstico se encuentran en diferentes etapas de desarrollo, validación y producción y cada tipo de prueba tiene sus propias ventajas y desventajas distintas inherentes a la plataforma tecnológica de origen y una combinación de tipos de pruebas utilizadas en diferentes momentos puede ser útil para el manejo clínico de los pacientes y en el control de la pandemia de SARS- CoV-2.

A Pandemia de COVID-19 e Iniquidades em Saúde no Estado de Sergipe / The COVID-19 Pandemic and Health Inequities in the State of Sergipe

O estudo analisa a associação das taxas de incidência e mortalidade por COVID-19 nos municípios do estado de Sergipe ­ Brasil com indicadores de vulnerabilidade social e desenvolvimento humano utilizados no país; e com a taxa de realização de exames RT PCR para diagnóstico da doença realizados por município. Trata-se de estudo ecológico dos casos e óbitos por COVID-19 acumulados de março de 2020 a março de 2021, ocorridos no Estado de Sergipe por município; e sua correlação com o Índice de Vulnerabilidade Social (IVS), Índice de Desenvolvimento Humano Municipal (IDHM) e quantidade de testes RT PCR realizados para diagnóstico da doença, utilizando a correlação de Spearman (ρ). Contrariando nossas hipóteses e a literatura científica, os municípios com maiores índices de vulnerabilidade social e menor desenvolvimento humano tiveram menos casos da doença e óbitos por habitante, ao mesmo tempo que testaram menos para o diagnóstico da COVID-19. O estudo aponta a iniquidade como fator a ser superado no enfrentamento da pandemia, por prejudicar um diagnóstico de cenário mais próximo da realidade, comprometendo o planejamento e implementação de medidas de saúde coletiva.

This study analyzes the association of incidence and mortality rates by COVID-19 in the municipalities of the state of Sergipe, Brazil with indicators of social vulnerability and human development used in the country, as well as with the rate of RT-PCR exams for the diagnosis of the disease performed by each municipality. This is an ecological study of COVID-19 cases and deaths accumulated from March 2020 to March 2021, which occurred in the State of Sergipe by municipality; and its correlation with the Social Vulnerability Index (SVI), Municipal Human Development Index (MHDI), and number of RT-PCR tests performed to diagnose the disease, using Spearman's correlation (ρ). Contrary to our hypotheses and the scientific literature, municipalities with higher rates of social vulnerability and lower human development had fewer cases of the disease and deaths per inhabitant, while testing less for the diagnosis of COVID-19. The study points to inequity as a factor to be overcome in the face of the pandemic, as it impairs a proper diagnosis of the scenario closer to reality, compromising the planning and implementation of collective health measures.

Tool for Estimating the Probability of Having COVID-19 With 1 or More Negative RT-PCR Results.

Early case detection and isolation of infected individuals are critical to controlling coronavirus disease 2019 (COVID-19). Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) is considered the gold standard for the diagnosis of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 infection, but false negatives do occur. We built a user-friendly online tool to estimate the probability of having COVID-19 with negative RT-PCR results and thus avoid preventable transmission.

Seroprevalence of SARS-CoV-2 Infection and Adherence to Preventive Measures in Cuenca, Ecuador, October 2020, a Cross-Sectional Study.

A door-to-door survey was organised in Cuenca, Ecuador, to determine the prevalence of COVID-19 infection and adherence of the population to COVID-19 preventive measures. A total of 2457 persons participated in the study; 584 (23.7%) reported having experienced at least one flu-like symptom since the onset of the pandemic. The maximum SARS-CoV-2 seroprevalence in Cuenca was 13.2% (CI: 12-14.6%) (IgM or IgG positive). Considering PCR confirmed infections, the prevalence was 11% (CI: 10-12.4%). There was no significant difference in seroprevalence between rural and urban areas. Participants aged 35-49 years old, living with a COVID-19 positive person, at least six people in a household, physical contact with someone outside the household, a contact with a person outside the home with flu-like symptoms, using public transport, and not having enough resources for living, significantly increased the odds for SARS-CoV-2 seropositivity. Overall, there was good adherence to COVID-19 preventive measures. Having known someone who tested positive for COVID-19, having a primary or secondary level of education, and having enough resources for living, significantly increased the odds for higher adherence. In conclusion, despite good overall adherence of the population of Cuenca with COVID-19 preventive measures, our study suggests high ongoing COVID-19 transmission in Cuenca, particularly in certain parishes. Prevention should not only focus on behavioural change, but on intensified testing strategies in demographical risk groups.

On the effectiveness of the search and find method to suppress spread of SARS-CoV-2.

Search and find methods*) such as cluster tracing1)-6) or large-scale PCR testing**) of those who exhibit no symptoms or only mild symptoms of COVID-19 is shown by data analysis to be a powerful means to suppress the spread of COVID-19 instead of, or in addition to, lockdown of the entire population. Here we investigate this issue by analyzing the data from some cities and countries and we establish that search and find method is as powerful as lockdown of a city or a country. Moreover, in contrast to lockdown, it neither causes inconvenience to citizens nor does it disrupt the economy. Generally speaking, it is advisable that both social distancing and increased test numbers be employed to suppress spread of the virus. The product of the total test number with the rate of positive cases is the crucial index.