Using comparative extinction risk analysis to prioritize the IUCN Red List reassessments of amphibians.

Assessing the extinction risk of species based on the International Union for Conservation of Nature (IUCN) Red List (RL) is key to guiding conservation policies and reducing biodiversity loss. This process is resource demanding, however, and requires continuous updating, which becomes increasingly difficult as new species are added to the RL. Automatic methods, such as comparative analyses used to predict species RL category, can be an efficient alternative to keep assessments up to date. Using amphibians as a study group, we predicted which species are more likely to change their RL category and thus should be prioritized for reassessment. We used species biological traits, environmental variables, and proxies of climate and land-use change as predictors of RL category. We produced an ensemble prediction of IUCN RL category for each species by combining 4 different model algorithms: cumulative link models, phylogenetic generalized least squares, random forests, and neural networks. By comparing RL categories with the ensemble prediction and accounting for uncertainty among model algorithms, we identified species that should be prioritized for future reassessment based on the mismatch between predicted and observed values. The most important predicting variables across models were species' range size and spatial configuration of the range, biological traits, climate change, and land-use change. We compared our proposed prioritization index and the predicted RL changes with independent IUCN RL reassessments and found high performance of both the prioritization and the predicted directionality of changes in RL categories. Ensemble modeling of RL category is a promising tool for prioritizing species for reassessment while accounting for models' uncertainty. This approach is broadly applicable to all taxa on the IUCN RL and to regional and national assessments and may improve allocation of the limited human and economic resources available to maintain an up-to-date IUCN RL.

Uso del análisis comparativo del riesgo de extinción para priorizar la reevaluación de los anfibios en la Lista Roja de la UICN Resumen El análisis del riesgo de extinción de una especie con base en la Lista Roja (LR) de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN) es clave para guiar las políticas de conservación y reducir la pérdida de la biodiversidad. Sin embargo, este proceso demanda recursos y requiere de actualizaciones continuas, lo que se complica conforme se añaden especies nuevas a la LR. Los métodos automáticos, como los análisis comparativos usados para predecir la categoría de la especie en la LR, pueden ser una alternativa eficiente para mantener actualizados los análisis. Usamos a los anfibios como grupo de estudio para predecir cuáles especies tienen mayor probabilidad de cambiar de categoría en la LR y que, por lo tanto, se debería priorizar su reevaluación. Usamos las características biológicas de la especie, las variables ambientales e indicadores climáticos y del cambio de uso de suelo como predictores de la categoría en la LR. Elaboramos una predicción de ensamble de la categoría en la LR de la UICN para cada especie mediante la combinación de cuatro algoritmos diferentes: modelos de vínculo acumulativo, menor número de cuadros filogenéticos generalizados, bosques aleatorios y redes neurales. Con la comparación entre las categorías de la LR y la predicción de ensamble y con considerar la incertidumbre entre los algoritmos identificamos especies que deberían ser prioridad para futuras reevaluaciones con base en el desfase entre los valores predichos y los observados. Las variables de predicción más importantes entre los modelos fueron el tamaño de la distribución de la especie y su configuración espacial, las características biológicas, el cambio climático y el cambio de uso de suelo. Comparamos nuestra propuesta de índice de priorización y los cambios predichos en la LR con las reevaluaciones independientes de la LR de la UICN y descubrimos un buen desempeño tanto para la priorización como para la direccionalidad predicha de los cambios en las categorías de la LR. El modelo de ensamble de la categoría de la LR esa una herramienta prometedora para priorizar la reevaluación de las especies a la vez que considera la incertidumbre del modelo. Esta estrategia puede generalizarse para aplicarse a todos los taxones de la LR de la UICN y a los análisis regionales y nacionales. También podría mejorar la asignación de los recursos humanos y económicos limitados disponibles para mantener actualizada la LR de la UICN.

Effects of protected area coverage and research on conservation status of primates globally.

Conducting conservation research and establishing protected areas (PAs) based on research results are critical to biodiversity conservation. However, the effect of research and PAs on conservation of threatened species has rarely been evaluated simultaneously. We collected data on PAs from 2000 for 2021 and determined the number of publications on global primates (published from 1950 to 2021) to assess the effect of PAs, research, and biological and socioeconomic factors on the current International Union for Conservation of Nature endangered status and change in status. We used the MCMCglmm package to conduct a phylogenetic comparative analysis to control the phylogenetic relationship of primate species. The status of 24.6% (82 of 333) of species assessed at least twice declined. Only the black lion tamarin (Leontopithecus chrysopygus) had an improved status. Species with status declines mostly occurred on the south coast of West Africa and in Madagascar. PAs covered 22.1% of each species' range. Forest loss in PAs (5.5%) was significantly lower than forest loss within 5 km outside PAs (13.8%), suggesting PAs effectively mitigated forest loss. Both the median number of total publications and conservation publications on critically endangered species were higher than those of other categories. Models showed that PA coverage and number of publications or conservation-focused publications were not related to current status or change in status over time. A decline in status was not related to creation of PAs or increase of research since the last assessment. Our results suggest that current PAs and research are not reversing the extinction crisis of global primates. Doing more conservation-oriented research, strengthening management of current PAs, and expanding PAs will be needed to protect primates globally.

Efectos de la cobertura e investigación de áreas protegidas sobre el estado de conservación de los primates a nivel mundial Resumen La investigación para la conservación y la creación de áreas protegidas (AP) con base en sus resultados son de suma importancia para conservar la biodiversidad. Sin embargo, pocas veces se ha analizado de forma simultánea el efecto de la investigación y las AP sobre la conservación de especies amenazadas. Recolectamos datos sobre las AP entre el 2000 y el 2021 y determinamos el número de artículos sobre primates publicados entre 1950 y 2021 para evaluar el efecto de las AP, la investigación y los factores biológicos y socioeconómicos sobre el estado actual de en peligro y de cambio de estatus de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza. Usamos el paquete MCMCglmm para realizar un estudio filogenético comparativo para analizar la relación filogenética del estado de las especies y del cambio de estatus de primates. El estatus del 24.6% (82 de 333) de las especies analizadas declinó al menos dos veces. Solamente el tití leoncito (Leontopithecus chrysopygus) tuvo una mejoraría en su estado. Las especies con declinación en su estado se ubicaron principalmente en la costa sur del Oeste de África y en Madagascar. Las AP cubrieron el 22.1% de la distribución de cada especie. La pérdida de bosques en las AP (5.5%) fue mucho menor que la pérdida dentro de los primeros 5 km fuera de las AP (13.8%), lo que sugiere que las AP mitigan eficientemente la pérdida de bosque. Tanto el número medio de publicaciones totales como el de publicaciones sobre la conservación de especies en peligro crítico fue mayor que aquellos de cualquier otra categoría. Los modelos mostraron que la cobertura de AP y el número de publicaciones o de publicaciones enfocadas en la conservación no estaban relacionados con el estado actual o el cambio de estado. La declinación del estado no estuvo relacionada con la creación de AP o el incremento en la investigación desde nuestro último análisis. Nuestros resultados sugieren que la investigación y las AP actuales no están revirtiendo la crisis mundial de extinción de primates. Para proteger a los primates se necesitará realizar más investigación orientada a la conservación, fortalecer el manejo actual de las AP, así como expandirlas.

A standard approach for including climate change responses in IUCN Red List assessments.

The International Union for Conservation of Nature (IUCN) Red List is a central tool for extinction risk monitoring and influences global biodiversity policy and action. But, to be effective, it is crucial that it consistently accounts for each driver of extinction. Climate change is rapidly becoming a key extinction driver, but consideration of climate change information remains challenging for the IUCN. Several methods can be used to predict species' future decline, but they often fail to provide estimates of the symptoms of endangerment used by IUCN. We devised a standardized method to measure climate change impact in terms of change in habitat quality to inform criterion A3 on future population reduction. Using terrestrial nonvolant tetrapods as a case study, we measured this impact as the difference between the current and the future species climatic niche, defined based on current and future bioclimatic variables under alternative model algorithms, dispersal scenarios, emission scenarios, and climate models. Our models identified 171 species (13% out of those analyzed) for which their current red-list category could worsen under criterion A3 if they cannot disperse beyond their current range in the future. Categories for 14 species (1.5%) could worsen if maximum dispersal is possible. Although ours is a simulation exercise and not a formal red-list assessment, our results suggest that considering climate change impacts may reduce misclassification and strengthen consistency and comprehensiveness of IUCN Red List assessments.

Una estrategia estándar para incluir las respuestas al cambio climático en las evaluaciones de la Lista Roja de la UICN Resumen La Lista Roja de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN) es una herramienta central para el monitoreo del riesgo de extinción e influye sobre las acciones y políticas para la biodiversidad. Para que esta herramienta sea efectiva, es crucial que tenga en cuenta de manera regular cada factor de extinción. El cambio climático se está convirtiendo rápidamente en un factor de extinción importante, pero considerar información sobre este factor todavía es un reto para la UICN. Se pueden usar varios métodos para predecir la declinación de una especie en el futuro, pero generalmente fallan en proporcionar estimaciones de los síntomas del peligro usados por la UICN. Diseñamos un método estandarizado para medir el impacto del cambio climático en términos del cambio en la calidad del hábitat para informar el criterio A3 sobre la reducción futura de las poblaciones. Usamos a los tetrápodos terrestres no voladores como estudio de caso para medir este impacto como la diferencia entre el nicho climático actual y futuro de las especies, definido con base en las variables bioclimáticas actuales y futuras con algoritmos de modelos alternativos, escenarios de dispersión y emisión y modelos climáticos. Nuestros modelos identificaron 171 especies (13% de las especies analizadas) para las que su categoría actual en la lista roja podría empeorar bajo el criterio A3 si no logran dispersarse más allá de su distribución actual en el futuro. Las categorías para 14 especies (1.5%) podrían empeorar si es posible la dispersión máxima. Aunque realizamos una simulación y no una evaluación formal para listas rojas, nuestros resultados sugieren que considerar los impactos del cambio climático podría reducir la clasificación incorrecta y fortalecer la coherencia y exhaustividad de las evaluaciones de la Lista Roja de la UICN.

Vulnerabilidad de las especies de Dytiscidae (Coleoptera) en Cuba / Vulnerability of Dytiscidae species (Coleoptera) in Cuba

Resumen La diversidad de coleópteros acuáticos de Cuba se encuentra entre las más elevadas en el Caribe insular. Sin embargo, existe escasa información sobre los ditíscidos cubanos para identificar las especies y hábitats que requieren urgentes acciones de conservación. El objetivo de este estudio fue identificar los taxa amenazados de la familia Dytiscidae en Cuba según su grado de vulnerabilidad. Para ello se recopiló información sobre la distribución de todos los ditíscidos cubanos, incluyendo datos de la literatura, de colecciones y de muestreos realizados en el período comprendido entre los años 2000 y 2014. Además, fue evaluada la vulnerabilidad de las especies a partir de una metodología que combina seis criterios referentes a las características de las especies y los hábitats que ocupan. El análisis de vulnerabilidad fue posible realizarlo a 50 de las 53 especies de ditíscidos (94 %) presentes en Cuba. Un total de cinco especies (9 %) presentan vulnerabilidad alta, 20 (38 %) media y 25 (48 %) baja. Las cinco especies más amenazadas son Laccodytes cobrinae, Laccophilus alariei, Copelatus barbouri, C. darlingtoni, and Desmopachria glabella. Estas son endémicas de Cuba y se caracterizan por presentar poblaciones muy localizadas, poco abundantes, así como por una alta especificidad de hábitat. Por ello, se propone su inclusión en lista roja de la fauna de Cuba, así como en la Lista Roja de la UICN bajo la categoría de "Vulnerable". Además, no todas las áreas donde se encuentran estas especies pertenecen al Sistema Nacional de Áreas Protegidas de Cuba, por lo que recomendamos la inclusión de la Laguna Base Julio A. Mella y el Norte de Imías en este sistema. Así mismo, sugerimos la implementación de medidas de gestión efectivas que eviten o mitiguen la alteración de los ecosistemas acuáticos en los que aparecen las especies vulnerables.

Abstract Cuba has one of the richest diving beetles species diversity in the Caribbean islands. However, Cuban Dytiscidae remain scarcely studied, and there is need to identify those species and habitats that urgently require effective conservation actions. Here we aim to identify the threatened taxa of the family Dytiscidae in Cuba according to their degree of vulnerability. For that, we compiled distributional data on the Cuban fauna, including data from literature, collections and own samplings carried out between the period 2000 and 2014. In addition, the vulnerability of the species was evaluated using a methodology that combines six criteria regarding both species and habitat attributes. This analysis of vulnerability was completed to 50 (94 %) out of 53 Cuban species. Five species (9 %) were identified as highly vulnerable, 20 (38 %) moderately and 25 (48 %) as having low conservation status. The five most threatened species were Laccodytes cobrinae, Laccophilus alariei, Copelatus barbouri, C. darlingtoni, and Desmopachria glabella. These species are endemic to Cuba and characterized by highly localized populations and low abundance as well as high habitat specificity. Thus, we propose the inclusion of these five species in both the red list of Cuban fauna and the IUCN Red List (under the category of "Vulnerable"). In addition, not all areas where these species were found belong to the National System of Protected Areas of Cuba. Thus, we suggest the inclusion of the Laguna Base Julio A. Mella and the North of Imías, and to develop effective management measures to prevent the alteration of these aquatic ecosystems. Rev. Biol. Trop. 66(2): 709-721. Epub 2018 June 01.

Fisheries, life-history and conservation status of the catfish pirá Conorhynchos conirostris (Ostariophysi: Siluriformes) in Brazil

Pirá, Conorhynchos conirostris (Valenciennes, 1840), a large migratory catfish endemic to the São Francisco River (SFR), is listed as threatened in the red lists of both Brazil and the state of Minas Gerais. Although fishing for pirá has been prohibited, it is still an important fishery resource, particularly in the middle SFR. We used historical and current occurrence and abundance data regarding pirá to determine if it meets the IUCN criteria of a threatened species. Pirá occurs in the main course of the SFR as well as in its major tributaries. Unlike the most well-known migratory fishes of the SFR, pirá does not use floodplain lakes as nurseries. In the first half of the 20th century, pirá occurred from the upper to the lower SFR. Currently, it is most abundant in the middle SFR, and is rare in the upper SFR and even rarer in the sub-middle SFR. Pirá has not been captured in the lower SFR since around the mid-1980's. Despite the reduction in its geographic distribution, we did not find evidence to justify considering pirá as threatened. Thus, we recommend that it be removed from the red lists of Brazil and the state of Minas Gerais.(AU)

Pirá, Conorhynchos conirostris (Valenciennes, 1840), um grande siluriforme migrador endêmico do rio São Francisco (RSF), está incluído como ameaçado nas listas vermelhas do Brasil e do estado de Minas Gerais. Embora sua pesca esteja proibida, ele ainda é recurso pesqueiro importante, particularmente no médio RSF. Utilizamos dados históricos e atuais de ocorrência e abundância do pirá para determinar se ele atende aos critérios da UICN para ser classificado como ameaçado. Pirá ocorre na calha do RSF, bem como em seus principais afluentes. Ao contrário dos peixes migradores mais conhecidos do RSF, ele não usa lagoas das várzeas como berçários. Na primeira metade do século 20, pirá costumava ocorrer do alto ao baixo RSF. Atualmente, ele é mais abundante no médio RSF. A espécie é rara no alto RSF e parece ainda mais rara no sub-médio RSF. O pirá não é capturado no baixo RSF desde cerca da metade da década de 1980. Apesar da redução na distribuição geográfica, não encontramos evidências para classificar o pirá como espécie ameaçada e, portanto, recomendamos que ele seja removido das listas vermelhas do Brasil e do estado de Minas Gerais.(AU)

Spondias tuberosa Arruda (Anacardiaceae), a threatened tree of the Brazilian Caatinga? / Spondias tuberosa Arruda (Anacardiaceae), uma árvore ameaçada de extinção da Caatinga?

Abstract Spondias tuberosa Arr., a fructiferous tree endemic to the northeast Brazilian tropical dry forest called Caatinga, accounts for numerous benefits for its ecosystem as well as for the dwellers of the Caatinga. The tree serves as feed for pollinators and dispersers as well as fodder for domestic ruminants, and is a source of additional income for local smallholders and their families. Despite its vantages, it is facing several man-made and natural threats, and it is suspected that S. tuberosa could become extinct. Literature review suggests that S. tuberosa suffers a reduced regeneration leading to population decrease. At this juncture S. tuberosa cannot be considered threatened according to the International Union for Conservation of Nature Red List Categories and Criteria, as it has not yet been assessed and hampered generative regeneration is not considered in the IUCN assessment. The combination of threats, however, may have already caused an extinction debt for S. tuberosa. Due to the observed decline in tree density, a thorough assessment of the S. tuberosa population is recommended, as well as a threat assessment throughout the entire Caatinga.

Resumo Spondias tuberosa Arr., é uma árvore frutífera endêmica da Caatinga, floresta seca tropical localizada no Nordeste do Brasil. A árvore traz diversos benefícios para o ecossistema e para a população local. Ela serve de alimento tanto para polinizadores e dispersores quanto para ruminantes domésticos e é fonte de renda extra para os agricultores familiares da região. Apesar de seus benefícios, esta árvore enfrenta várias ameaças naturais e antrópicas que podem levar a sua extinção. A revisão da literatura científica sugere que S. tuberosa sofre de reduzida capacidade de regeneração, o que leva à diminuição da população. Todavia, S. tuberosa não é considerada uma espécie ameaçada de extinção de acordo com as categorias e critérios da Lista Vermelha da União Internacional para a Conservação da Natureza, já que a espécie ainda não foi avaliada e capacidade regenerativa reduzida não é considerado critério pelo UICN. A combinação de ameaças, entretanto, pode já ter levado ao débito de extinção da S. tuberosa. Devido ao declínio observado da densidade das árvores, recomenda-se uma avaliação completa da população de S. tuberosa e uma avaliação de todas as ameaças sofridas pela árvore na Caatinga.