ABSTRACT
In this study, we associated the restriction modification (RM) tests to the polymerase chain reaction (PCR) detection of molecular markers (SCCmec III, seh, agr II-SCCmec IV, and lukSF) for revealing the main methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) clones circulating in Brazil. This simple and rapid approach allowed a precise classification of the MRSA analyzed when compared with pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) data.
Subject(s)
DNA Restriction-Modification Enzymes , Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus/classification , Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus/isolation & purification , Molecular Typing/methods , Polymerase Chain Reaction/methods , Staphylococcal Infections/microbiology , Brazil , Cluster Analysis , Electrophoresis, Gel, Pulsed-Field , Humans , Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus/geneticsABSTRACT
The bacteriophages Cb1/204 and Cb1/342 were obtained by induction from the commercial strain Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis Cb1, and propagated on Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis 204 (Lb.l 204) and Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus 342 (Lb.b 342), respectively. By cross sensitivity, it was possible to detect a delay in the lysis of Lb.l 204 with Cb1/342 phage, while the adsorption rate was high (99.5%). Modified and unmodified phages were isolated using phage Cb1/342 and strain Lb.l 204. The EOP (Efficiency of Plaquing) values for the four phages (Cb1/204, Cb1/342, Cb1/342modified and Cb1/342unmodified) suggested that an R/M system modified the original temperate phage, and the BglII-DNA restriction patterns of these phages might point out the presence of a Type II R/M system. Also, the existence of a Type I R/M system was demonstrated by PCR and nucleotide sequence, being the percentages of alignment homology with Type I R/M systems reported previously higher than 95%. In this study it was possible to demonstrate that the native phage resistant mechanisms and the occurrence of prophages in commercial host strains, contribute strongly to diversify the phage population in a factory environment.
Subject(s)
Bacteriophages/physiology , DNA Restriction-Modification Enzymes/metabolism , DNA, Bacterial/genetics , Lactobacillus delbrueckii/virology , Base Sequence , DNA Restriction-Modification Enzymes/genetics , Gene Expression Regulation, Bacterial/physiology , Molecular Sequence DataABSTRACT
Las especies del género Malassezia han adquirido importancia por su asociación a diversos procesos patológicos. Desde 1996 fueron clasificadas en M. pachydermatis, M. furfur, M. sympodialis, M. slooffae, M. obtusa, M. globosa y restricta. El esquema de identificación basado en las características morfológicas, fisiológicas y bioquímicas no siempre permite distinguir entre algunas de ellas. El objetivo de este trabajo fue poner a punto una metodología rapida, específica y eficaz para la identificación de las especies de este género. Con este fin, basados en la técnica de PCR-REA de Guillot y col., se introdujeron modificaciones en la metodología de extracción y purificación del ADN y en la electroforesis. Las variaciones propuestas en este trabajo confieren mayor practicidad a la técnica y disminuyen los costos. La obtención de resultados definidos permitiría a través de investigaciones taxonómicas y epidemiológicas avanzar en el estudio de la ecología, definir el rol patogénico y aumentar la información epidemiológica del género Malassezia
Subject(s)
Bacterial Typing Techniques , Malassezia , DNA Restriction Enzymes , DNA Restriction-Modification Enzymes , Malassezia , Mycology , Opportunistic Infections , Polymerase Chain ReactionABSTRACT
Las especies del género Malassezia han adquirido importancia por su asociación a diversos procesos patológicos. Desde 1996 fueron clasificadas en M. pachydermatis, M. furfur, M. sympodialis, M. slooffae, M. obtusa, M. globosa y restricta. El esquema de identificación basado en las características morfológicas, fisiológicas y bioquímicas no siempre permite distinguir entre algunas de ellas. El objetivo de este trabajo fue poner a punto una metodología rapida, específica y eficaz para la identificación de las especies de este género. Con este fin, basados en la técnica de PCR-REA de Guillot y col., se introdujeron modificaciones en la metodología de extracción y purificación del ADN y en la electroforesis. Las variaciones propuestas en este trabajo confieren mayor practicidad a la técnica y disminuyen los costos. La obtención de resultados definidos permitiría a través de investigaciones taxonómicas y epidemiológicas avanzar en el estudio de la ecología, definir el rol patogénico y aumentar la información epidemiológica del género Malassezia (AU)