Aplicación de PCR a partir de cultivo en la identificación de subespecies del complejo Mycobacterium Tuberculosis / The use of culture-based PCR for the identification of subspecies of the mycobacterium tuberculosis complex

Los métodos diagnósticos clásicos de tuberculosis (TB) se basan en la utilización de baciloscopía y cultivo. La identificación del agente etiológico desde la positivización del cultivo requiere entre 10 y 15 días, mientras que el empleo de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) disminuye el tiempo a 24 h, lo que permite no solo identificar las subespecies del complejo Mycobacterium tuberculosis (CMTB) sino también diferenciarlas de otras especies ambientales clínicamente importantes (MOTT) facilitando el diagnóstico y tratamiento. El objetivo del presente trabajo fue determinar la utilidad de la PCR en la identificación temprana de las micobacterias pertenecientes al CMTB, a partir de cultivos positivos, de pacientes con sospecha de TB, atendidos en un hospital pediátrico de alta complejidad, durante un período de cuatro años. A cada muestra, se le realizó baciloscopía y cultivo en medio líquido. A los cultivos positivos, una inmunocromatografía lateral (TBIDR) y luego PCR. El 4,6% del total de muestras (510/11.162) pertenecientes a 198 pacientes presentó cultivos positivos. Cuatrocientos veintiseis (84%) correspondieron a muestras respiratorias. El rendimiento de la baciloscopía directa fue del 41% (194/470). Cuatrocientos treinta y ocho (86%) resultaron M. tuberculosis, 21 (4%) Mycobacterium bovis, 7 (1%), M. bovis-BCG y 44 (9%) MOTT. La utilización de medios de cultivos líquidos junto con el empleo de PCR favorecen una rápida orientación microbiológica y constituye una estrategia útil para optimizar el manejo clínico de estas infecciones, desde el punto de vista terapéutico y epidemiológico, especialmente en pediatría (AU)

Classical diagnostic methods for tuberculosis (TB) are based on the use of smear microscopy and culture. The identification of the etiological agent from positive culture requires 10 to 15 days, while the use of the polymerase chain reaction (PCR) reduces the time to 24 h, which allows not only to identify the subspecies of the Mycobacterium tuberculosis complex (MTC) but also to differentiate them from clinically important environmental mycobacteria other than tuberculosis (MOTT), facilitating diagnosis and treatment. The aim of this study was to determine the usefulness of PCR in the early identification of mycobacteria belonging to the MTC, from positive cultures of patients with suspected TB seen in a pediatric tertiary hospital over a 4-year period. For each sample, smear microscopy and culture in liquid medium was performed. Positive cultures were subjected to lateral immunochromatography (TBIDR) and then PCR. Of the total number of samples (510/11,162) belonging to 198 patients, 4.6% showed positive cultures; 426 (84%) were respiratory samples. The direct smear microscopy yield was 41% (194/470). Overall, 438 (86%) were found to be M. tuberculosis, 21 (4%) Mycobacterium bovis, 7 (1%), M. bovis-BCG, and 44 (9%) MOTT. The use of liquid culture media together with the use of PCR favors a rapid microbiological orientation and is a useful strategy to optimize the clinical management of these infections, from a therapeutic and epidemiological point of view, especially in children (AU)

Infecciones por Chlamydia trachomatis en una unidad de cuidados intensivos neonatales / Chlamydia trachomatis infections in a neonatal intensive care unit

Las infecciones por Chlamydia trachomatis han aumentado su prevalencia, especialmente en jóvenes embarazadas. Esto adquiere relevancia en pediatría por el elevado riesgo de transmisión vertical al neonato y su potencial gravedad en el lactante. Estas infecciones requieren de un alto índice de sospecha, por cuadro clínico atípico y signos radiológicos inespecíficos. Los métodos diagnósticos convencionales presentan limitaciones para su detección. Las técnicas moleculares son las recomendadas por su elevada sensibilidad, especificidad y rapidez, lo cual permite una terapéutica adecuada y oportuna. En este estudio, desarrollado en una unidad de cuidados intensivos neonatales de un hospital de alta complejidad durante 12 años, se describieron las características de la población, su presentación clínica y evolución. La detección microbiológica se realizó por métodos moleculares. Se incluyeron 29 pacientes (p) con infección por C. trachomatis (3,9% del total de muestras enviadas),13 p con infección respiratoria y 16 p con compromiso ocular. La mediana de edad fue de 19 días al momento del diagnóstico y el 65% de las gestantes tenía <25 años. Veinticuatro p (83%) eran recién nacidos a término y 23 p (79%) previamente sanos. Nueve p (31%) presentaron fiebre al momento del ingreso y 12 (41%) eosinofilia. De los 13 p con enfermedad respiratoria, 9 (69%) consultaron por tos y 11 (85%) con hipoxemia, con requerimientos de oxígeno en 8 (61%), asistencia respiratoria mecánica en 3 (23%) y uno (16%) requirió ECMO. Los hallazgos radiológicos mostraron un patrón intersticial inespecífico. Nueve p (31%) presentaron coinfección y uno falleció asociado a influenza A (AU)

The prevalence of Chlamydia trachomatis infections has increased, especially among young pregnant women. This is of particular relevance in pediatrics due to the high risk of motherto-child transmission and the potential severity of the infection in infants. A high index of suspicion is required for these infections due to the atypical clinical features and non-specific radiological signs. The usefulness of conventional diagnostic methods is limited. Molecular techniques are recommended because of their high sensitivity, specificity, and speed, allowing for adequate and timely treatment. In this 12-year study conducted in a neonatal intensive care unit of a tertiary-care hospital, patient characteristics, clinical presentation, and outcome are described. Microbiological detection was performed using molecular methods. Twenty-nine patients with C. trachomatis infection (3.9% of the total samples submitted), of whom 13 had respiratory tract infection and 16 ocular involvement, were included. The median age at diagnosis was 19 days and 65% of the mothers were <25 years old. Twenty-four p (83%) were term newborns and 23 patients (79%) were previously healthy. On admission, 9 patients (31%) had fever and 12 (41%) had eosinophilia. Of the 13 patients with respiratory tract involvement, 9 (69%) consulted for cough and 11 (85%) had hypoxemia, requiring oxygen in 8 (61%), mechanical ventilation in 3 (23%), and ECMO in 1 (16%). Radiological findings showed a nonspecific interstitial pattern. Nine patients (31%) presented with coinfection, one of whom died due to an associated influenza A infection (AU)

Características clínicas y epidemiológicas asociadas con internación en niños con COVID-19 en un hospital pediátrico de alta complejidad: Estudio de cohorte enero-marzo 2022 / Clinical and epidemiologic characteristics associated with hospital admission in children with COVID19 in a tertiary-care pediatric hospital: A January-March 2022 cohort study

Introducción: La proporción de casos reportados de niños y adolescentes con COVID-19 aumenta progresivamente. La hospitalización relacionada con COVID-19 en niños es infrecuente, pero causa morbilidad y sobrecarga al sistema de salud. Objetivos: Describir las características clínicas y evolutivas de los niños con diagnóstico de COVID-19 en un hospital pediátrico de alta complejidad. Comparar los pacientes que requirieron internación y los que no. Material y métodos: Cohorte prospectiva. Se incluyeron todos los pacientes con diagnóstico virológico de COVID-19 desde 1.1.2022 a 1.3.22 en un hospital pediátrico de alta complejidad. Se compararon los antecedentes, características clínicas y evolutivas de los pacientes según requirieran o no internación. Se utilizó STATA 16. Resultados: n: 1764 pacientes, de ellos 958 eran varones (54%). La mediana de edad fue 56 meses (RIC 17-116). Tenían enfermedad de base 789 pacientes (46%). Las más frecuentes fueron: enfermedad oncohematológica 215 (12%), neurológica 103 pacientes (6%) , enfermedad pulmonar crónica 68 (4%), cardiopatías congénitas 65 (4%) y síndrome genético 57 pacientes (3%). Eran inmunosuprimidos: 292 (17%). Presentaron síntomas relacionados con COVID-19 1319 pacientes (79%). Requirieron internación 591 (34%). Tuvieron coinfección con otros virus respiratorios 33 pacientes (2%). Ingresaron a Cuidados intensivos en relación a la COVID-19 22 pacientes (1.3%) y fallecieron en relación con la infección 8 (0.5%). En el análisis univariado, la presencia de comorbilidades, la coinfección viral y la inmunosupresión se asociaron estadísticamente con el requerimiento de internación. El antecedente de 2 o más dosis de vacuna para SARS-CoV-2 fue un factor protector para la internación en los mayores de 3 años. En el modelo multivariado, los pacientes menores de 3 años (OR 6.5, IC95% 1.2-36.8, p 0.03), con comorbilidades (OR 2.04, IC 95% 1.7- 3.3, p 0.00) y los huéspedes inmunocomprometidos (OR 2.89, IC95% 2.1-4.1, p 0.00) tuvieron más riesgo de internación. Ajustado por el resto de las variables, haber recibido dos o más dosis de vacuna fue un factor protector para la internación (OR 0.65, IC 95% 0.49-0.87, p<0.01). Conclusiones: En este estudio de cohorte prospectivo de niños con diagnóstico confirmado de COVID-19 predominó la enfermedad sintomática. Fueron admitidos en relación con el COVID-19, 34% de los pacientes. La vacunación con dos o más dosis fue un factor protector para la internación en el modelo multivariado. Además, se asociaron estadísticamente con la hospitalización, la edad menor de 3 años, las comorbilidades previas y la inmunosupresión (AU)

Introduction: The rate of reported cases of children and adolescents with COVID-19 is progressively increasing. COVID-19-related hospital admission in children is uncommon, but leads to morbidity and places a burden on the healthcare system. Objectives: To describe the clinical characteristics and outcome of children diagnosed with COVID-19 in a pediatric tertiary-care hospital and to compare patients who required hospital admission with those who did not. Material and methods: A prospective cohort study. All patients with a virological diagnosis of COVID-19 seen between 1.1.2022 and 1.3.22 in a tertiary-care pediatric hospital were included. We compared patient history, clinical characteristics, and outcome according to whether or not they required hospital admission. STATA 16 was used. Results: n: 1764 patients, 958 of whom were male (54%). The median age was 56 months (IQR, 17- 116). Overall, 789 patients had an underlying disease (46%), the most frequent of which were hematology-oncology disease in 215 patients (12%), neurological disease in 103 (6%), chronic lung disease in 68 (4%), congenital heart disease in 65 (4%), and a genetic syndrome in 57 (3%); 292 were immunosuppressed (17%). Overall, 1319 patients (79%) had COVID-19-related symptoms and 591 (34%) required hospital admission. A coinfection with other respiratory viruses was observed in 33 patients (2%). Intensive care admission due to COVID-19 was required in 22 patients (1.3%) and 8 (0.5%) died with COVID-19. In univariate analysis, the presence of comorbidities, viral coinfecton, and immunosuppression were statistically significantly associated with the need for hospitalization. A history of two or more doses of the SARSCoV2 vaccine was a protective factor against hospital admission in children older than 3 years. In the multivariate model, patients younger than 3 years (OR 6.5, 95% CI 1.2-36.8, p 0.03), with comorbidities (OR 2.04, 95%CI 1.7-3.3, p 0.00) and immunocompromised hosts (OR 2.89, 95% CI 2.1-4.1, p 0.00) had a higher risk of hospital admission. When adjusting for the remaining variables, having received two or more doses of the vaccine was found to be a protective factor against hospital admission (OR 0.65, 95% CI 0.49-0.87, p<0.01). Conclusions: In this prospective cohort study of children with a confirmed diagnosis of COVID-19, symptomatic disease predominated. Thirty-four percent of the patients were admitted for COVID-19. Vaccination with two or more doses was a protective factor against hospitalization in the multivariate model. In addition, age younger than 3 years, previous comorbidities, and immunosuppression were statistically associated with hospital admission (AU)

Características clínicas y evolutivas de niños con infección por SARS-CoV-2 en un hospital de alta complejidad: estudio de cohorte / Clinical and outcome characteristics of children with SARS CoV-2 infection in a tertiary-care hospital: a cohort study

Introducción: Las infecciones por SARS-CoV-2 representan un problema de salud pública a nivel mundial. En los niños se reporta menor incidencia y cuadros clínicos más leves. Se realizó el presente estudio con el objetivo de describir las características clínicas y evolutivas de los niños con diagnóstico de infección por SARS CoV-2 en el Hospital Juan P. Garrahan. Material y métodos: estudio de cohorte prospectivo. Se incluyeron todos los pacientes con diagnóstico confirmado por PCR de COVID-19 desde 20.4.20 hasta el 3.07.21 y con seguimiento en el hospital de Pediatría Juan P. Garrahan. Resultados: n: 1644. Eran varones 836 (51%). La mediana de edad fue 75 meses (RIC 22- 143). Tenían alguna enfermedad de base previa al diagnóstico de COVID-19: 884 pacientes (53,7%), la más frecuente fue la enfermedad oncohematológica. Estaban asintomáticos 423 pacientes (25,7%). De los pacientes sintomáticos, 1071 (65,1%) presentaron cuadro leve, 5 (0,3%) moderado, 69 (4,2%) grave y 76 (4,6%) crítico. La fiebre fue el hallazgo más frecuente n: 782; (47,5%). Se internaron 900 pacientes (54,7%), 33 en UCI (2%). Fallecieron 7 pacientes (0,4%), todos ellos con comorbilidades graves. Conclusiones: En este estudio de cohorte de niños con infección por SARS-CoV-2 confirmada, predominaron los pacientes con enfermedad de base y las formas leves de COVID-19. El ingreso a UCI fue menor al 2%. Fallecieron 7 pacientes (0.4%) todos ellos con comorbilidades y coinfecciones (AU)

Introduction: SARS-CoV-2 infections represent a worldwide public health problem. A lower incidence and milder clinical pictures are reported in children. The aim of this study was to describe clinical and outcome characteristics of children diagnosed with SARS-CoV-2 infection at Hospital de Pediatría Juan P. Garrahan. Methods: A prospective cohort study was conducted. All patients with a PCR-confirmed diagnosis of COVID-19 seen between 20.4.20 and 3.07.21 and followed-up at Hospital de Pediatría Juan P. Garrahan were included. Results: n: 1644; 836 males (51%) were male. Median age was 75 months (IQR, 22-143). Overall, 884 patients (53.7%) had an underlying disease prior to COVID-19 diagnosis, most frequently hematologic/ oncologic disease. 423 patients (25.7%) were asymptomatic. Of the symptomatic patients, 1071 (65.1%) had mild, 5 (0.3%) moderate, 69 (4.2%) severe, and 76 (4.6%) critical disease. Fever was the most frequent finding (n: 782; 47.5%). A total of 900 patients (54.7%) were admitted, 33 of whom to the ICU (2%). Seven patients (0.4%) died, all with severe comorbidities. Conclusions: In this cohort study of children with confirmed SARSCoV-2 infection, patients with underlying disease and mild forms of COVID-19 predominated. ICU admission occurred in less than 2%. Seven patients (0.4%) died, all of them with comorbidities and coinfections. (AU)

Citomegalovirus congénito: ¿El diagnóstico y el tratamiento precoz pueden revertir una discapacidad permanente? / Congenital cytomegalovirus: Can early diagnosis and treatment revert permanent disability?

Introducción: La infección congénita por citomegalovirus (CMV) es la causa más frecuente de hipoacusia neurosensorial (HNS) no genética en países desarrollados. La incidencia de HNS en los lactantes sintomáticos oscila entre el 30 y el 65%. Objetivos: Describir las formas de presentación clínica de la infección por CMV congénita en pacientes sintomáticos y la evolución auditiva en los pacientes tratados con antivirales y aquellos sin tratamiento. Diseño: Estudio retrospectivo, descriptivo, observacional y longitudinal. Población: Se incluyeron niños, menores de 2 meses, con CMV congénito (confirmado por viruria positiva con método de PCR), sintomáticos, internados en la Unidad de Neonatología, desde el año 2005 al 2013. Método: Diagnóstico y seguimiento auditivo utilizando otoemisiones acústicas (OEA), potenciales evocados auditivos de tronco cerebral (PEAT) y audiometría (AT) según edad e indicación en cada caso en particular. El tratamiento antiviral se realizó con ganciclovir (GCV) y/o valganciclovir (VGCV). Resultados: Clínicamente se estudiaron 16 pacientes con diagnóstico de CMV congénito sintomáticos. Se excluyeron tres. Se describen los motivos de internación más frecuentes. Para el estudio y seguimiento audiológico los pacientes se dividieron en dos grupos de acuerdo a que recibieran o no tratamiento: A: no recibieron tratamiento antiviral (n: 5) y B: recibieron tratamiento antiviral (n: 8). En los pacientes que recibieron tratamiento, las secuelas auditivas fueron menores y en dos de los casos se produjo una mejoría importante en la audición. Conclusiones: El tratamiento de neonatos con infección congénita por CMV con GCV y/o VGCV ofrece resultados alentadores en la prevención de la hipoacusia (AU)

Introduction: Congenital cytomegalovirus (CMV) infection is the most common cause of non-genetic sensorineural hearing loss (SNH) in developed countries. The incidence of SNH in symptomatic infants ranges between 30% and 65%. Objectives: To describe different forms of clinical presentation of congenital CMV infection in symptomatic patients as well as outcome in patients treated with antiviral drugs and those in whom treatment was withheld. Study design: A retrospective, longitudinal, observational, descriptive study. Population: Symptomatic infants younger than 2 months of life with congenital CMV infection (confirmed by positive viruria using PCR), admitted to the Neonatology Unit between 2005 and 2013. Method: Diagnosis and audiological follow-up with otoacoustic emissions (OAE), brainstem auditory evoked potentials (BAEP) and audiometry (AT) according to age and indication for the individual patient. Antiviral treatment consisted of ganciclovir (GCV) and/or valganciclovir (VGCV). Results: Sixteen patients with symptomatic congenital CMV infection were clinically studied. Three were excluded. Main reasons for admission are described. For evaluation and audiological follow-up the patients were divided into two groups according to whether or not they received treatment. Group A: did not receive antiviral treatment (n: 5) and B: received antiviral treatment (n: 8). In patients that received treatment hearing sequelae were less severe and in two patients significant hearing improvement was observed. Conclusions: Treatment with GCV and/or VGCV of neonates with congenital CMV was found to have promising results for the prevention of hearing loss (AU)

Infecciones por acinetobacter multirresistente en la unidad de quemados / Multiresistant acinetobacter infections in the burn unit

Acinetobacter spp ha emergido como un importante germen en unidades de cuidados intensivos y en pacientes críticos como los quemados. Objetivos: Evaluar las características epidemiológicas, clínicas y de evolución en pacientes admitidos en la unidad de quemados con infecciones por Acinetobacter spp multiresistente. Población y Métodos: Se realizó un estudio de todos los pacientes que entre enero de 2005 y diciembre de 2006 tuvieron aislamiento de Acinetobacter spp multitresistente en la unidad de quemados del Hospital J P Garrahan. Resultados: Se incluyeron 26 pacientes. La edad media fue de 66.5 meses (rango: 2 a 168 m), 17 pacientes (65%) fueron del sexo masculino. La superficie quemada fue entre 10% y 87% (mediana 42.5%). Diez pacientes (39%) tenían quemadura profunda o "full thickness". El foco más frecuente fue sepsis asociada a la quemadura en 10 pacientes (39%). En 8 pacientes (30%), la infección de la quemadura no se asoció con sepsis. Fue diagnosticada Bacteriemia asociada a catéter en 3 pacientes (11%), y bacteriemia no asociada en 1 paciente (4%). Dos pacientes tuvieron neumonía asociada a respirador (8%), y 2 (8%) infección urinaria asociada a sonda. Todos los pacientes recibieron colistín de acuerdo a test de susceptibilidad. El tiempo de tratamiento con colistín fue entre 10 y 71 días (mediana 21días). Ninguno de los pacientes presentó alteraciones renales o neurológicas relacionadas con el colistín. La evolución fue favorable en todos los pacientes (AU)

Acinetobacter spp has emerged as an important germ in intensive care units and in critical patients, such as those with burn wounds. Objectives: To assess epidemiological and clinical features and evolution of patients admitted to the burn unit with multiresistent Acinetobacter spp infections. Patients and Methods: All patients admitted to the burn unit of the J P Garrahan Hospital between January 2005 and December 2006 in whom multiresistent Acinetobacter spp was isolated were studied. Results: 26 patients were included in the study. Mean age was 66.5 months (range: 2 to 168 m), 17 patients (65%) were male. The burn surface was between 10% and 87% (median 42.5%). Ten patients (39%) had a deep or "full thickness" burn. The most frequent focus was burn-wound-associated sepsis in 10 patients (39%). In 8 patients (30%), infection of the burn wound was not associated with sepsis. Catheter-related bacteriemia was diagnosed in three patients (11%) and non-catheter-related bacteriemia in one patient (4%). Two patients developed respirator-associated pneumonia (8%) and two (8%) catheterassociated urinary infection. After susceptibility testing, all patients received colistin. Duration of colistin treatment was between 10 and 71 days (median: 21days). None of the patients developed colestin-related renal or neurological impairment. Evolution was favorable in all patients (AU)

Complicaciones infecciosas en pacientes quemados pediátricos / Infectious complications in pediatric burn patients

Las infecciones juegan un importante rol en la morbilidad y mortalidad asociada a quemaduras. La experiencia en pacientes pediátricos es escasa. Objetivos: Evaluar las características epidemiológicas, clínicas, microbiológicas y de evolución de pacientes pediátricos quemados. Material y métodos: Se realizó un estudio prospectivo, descriptivo de 51 pacientes quemados admitidos entre junio 2007 a junio 2008 en la unidad de quemados del Hospital Juan P. Garrahan. Resultados: la edad media de los pacientes fue de 48 meses (r: 3-241m), 36 p (70%) eran de sexo masculino. La superficie quemada fue entre 1% y 80% (mediana 25%). En 41p (80%) se diagnosticó quemadura de tipo B. Presentaron síndrome inhalatorio 27 p (53%). En 51 pacientes se diagnosticaron 115 infecciones. La sepsis relacionada con la quemadura fue el foco más frecuente: 53 casos (46%). En 19 casos la infección de la quemadura sin sepsis (16%). Bactieremia asociada a catéter en 15 casos (13%) y sólo bacteriemia en 2 p (2%), neumonía en 7 casos, (6%) osteomielitis en 3p (2%), infección urinaria en 8 casos (7%) y en 9 casos (8%) otras infecciones. Cuarenta y dos infecciones (36%) fueron causadas por P aeruginosa spp y 11 (10%) por Acinetobacter spp sólo sensibles a colistin. Infecciones fúngicas fueron detectadas en 22 casos (19%) El tiempo medio de hospitalización fue de 42 días (r: 8-139 d). Diez pacientes (20%) murieron con causas relacionadas con la infección. Conclusiones: Las infecciones juegan un papel importante en los niños quemados. Las infecciones relacionadas con la quemadura (con o sin sepsis) fueron las más frecuentes. Los bacilos Gram negativos multiresistentes fueron los más frecuentes lo que obligó al uso de colistín como única alternativa de tratamiento. La mortalidad de los pacientes estuvo relacionada con la infección (AU)

Infections play an important role in burn-associated morbidity and mortality. However, experience in pediatric patients is scarce. Objectives: To evaluate the epidemiological, clinical, and microbiological features and evolution in pediatric burn patients. Material and methods: We conducted a prospective, descriptive study in 51 burn patients admitted to the burn unit of the Juan P. Garrahan Hospital between June 2007 and June 2008. Results: Mean age of the patients was 48 months (r: 3-241m), 36 patients (70%) were male. The burn surface was between 1% and 80% (median 25%). In 41 patients (80%) a type B burn was diagnosed. Twenty-seven patients had respiratory distress syndrome (53%). In 51 patients 115 infections were diagnosed. Burn-related sepsis was the most frequent focus of infection: 53 cases (46%). Infection without sepsis occurred in 19 cases (16%). Catheter-associated bacteremia was seen in 15 cases (13%) and bacteremia alone in 2 (2%). Pneumonia was found in 7 cases (6%), osteomyelitis in 3 (2%), urinary infection in 8 (7%), and other infections in 9 cases (8%). Forty-two infections (36%) were caused by P aeruginosa spp and 11 (10%) by Acinetobacter spp sensitive only to colistin. Fungal infections were found in 22 cases (19%). Mean time of hospital stay was 42 days (r: 8-139 d). Ten patients (20%) died due to infection-related causes. Conclusions: Infections play an important role in pediatric burn patients. Burn-related infections (with or without sepsis) were the most frequently found. Multiresistant Gram-negative bacilli were the most common causative agents leaving colistin as the only treatment option. Mortality was infection related (AU)