An Immunoinformatics Approach for SARS-CoV-2 in Latam Populations and Multi-Epitope Vaccine Candidate Directed towards the World's Population.

The coronavirus pandemic is a major public health crisis affecting global health systems with dire socioeconomic consequences, especially in vulnerable regions such as Latin America (LATAM). There is an urgent need for a vaccine to help control contagion, reduce mortality and alleviate social costs. In this study, we propose a rational multi-epitope candidate vaccine against SARS-CoV-2. Using bioinformatics, we constructed a library of potential vaccine peptides, based on the affinity of the most common major human histocompatibility complex (HLA) I and II molecules in the LATAM population to predict immunological complexes among antigenic, non-toxic and non-allergenic peptides extracted from the conserved regions of 92 proteomes. Although HLA-C, had the greatest antigenic peptide capacity from SARS-CoV-2, HLA-B and HLA-A, could be more relevant based on COVID-19 risk of infection in LATAM countries. We also used three-dimensional structures of SARS-CoV-2 proteins to identify potential regions for antibody production. The best HLA-I and II predictions (with increased coverage in common alleles and regions evoking B lymphocyte responses) were grouped into an optimized final multi-epitope construct containing the adjuvants Beta defensin-3, TpD, and PADRE, which are recognized for invoking a safe and specific immune response. Finally, we used Molecular Dynamics to identify the multi-epitope construct which may be a stable target for TLR-4/MD-2. This would prove to be safe and provide the physicochemical requirements for conducting experimental tests around the world.

A conceptual model to understand the drivers of change in tropical wetlands: a comparative assessment in India and Brazil / Un modelo conceptual para comprender los impulsores del cambio en los humedales tropicales: una evaluación comparativa en India y Brasil

Tropical wetlands are amongst the most biodiverse ecosystems on Earth and have immense socio-ecological value. However, tropical wetlands are considered exploitable resources and continue to be drained and converted to other "productive" uses. It is therefore urgent to identify and understand the interactions between various drivers of change triggering degradation of such wetlands. In the present study, we systematically reviewed and analyzed the existing literature on wetlands in two tropical countries namely India and Brazil with special reference to inland wetlands, and proposed a conceptual model illustrating the intricate linkages of such wetlands with different drivers of change. We also developed the Nature Futures' Framework to depict the diverse values of inland wetlands contributing to human wellbeing in the two tropical countries. Findings revealed similar drivers of change triggering the degradation of Indian and Brazilian wetlands. These include changes in climate & land use, population growth, poor land governance due to weak policies, besides other anthropogenic activities such as deforestation, and overexploitation of wetland resources. Among these, land-use change such as agriculture intensification and infrastructure development were the major direct drivers; whereas, institutional and governance factors such as the absence of concrete policy measures were the major indirect drivers threatening the inland wetlands in India and Brazil. Results also revealed some contrasting drivers of change such as illegal human settlements, and land grabbing by the brick industry for Indian wetlands; while, gold mining and intensification of bovine systems for Brazilian wetlands. Our paper also provides an insight into the status of wetland conservation in India and Brazil. We recommend the promotion of community-based conservation practices while adopting sustainable livelihood strategies by the local people for the conservation and wise use of inland wetlands in India and Brazil. The arguments raised in the paper have the potential to assist the stakeholders and/or decision-makers towards implementing sustainable management strategies for inland wetlands in the two countries, and tropical wetlands in general.

Los humedales tropicales se encuentran entre los ecosistemas con mayor biodiversidad en la Tierra y tienen un inmenso valor socioecológico. Sin embargo, los humedales tropicales se consideran recursos exploTables y continúan siendo drenados y convertidos a otros usos "productivos". Por lo tanto, es urgente identificar y comprender las interacciones entre varios impulsores del cambio que desencadenan la degradación de dichos humedales. En el presente estudio, revisamos y analizamos sistemáticamente la literatura existente sobre humedales en dos países tropicales, a saber, India y Brasil, con especial referencia a los humedales continentales, y propusimos un modelo conceptual que ilustra el intrincado vínculo de dichos humedales con diferentes impulsores del cambio. También desarrollamos el Marco de Nature Futures para resaltar los diversos valores de los humedales continentales de India y Brasil que contribuyen al bienestar humano en los dos países tropicales. Los resultados revelaron impulsores similares de los cambios que desencadenan la degradación de los humedales de la India y Brasil, incluidos los cambios en el clima y el uso de la tierra, el crecimiento de la población, las políticas débiles y la mala gobernanza de la tierra, además de otras actividades antropogénicas como la deforestación y la sobreexplotación de recursos. Entre estos, el cambio en el uso de la tierra, como la intensificación de la agricultura y el desarrollo de infraestructura, fueron los principales impulsores directos, mientras que los factores institucionales y de gobernanza, como la ausencia de medidas políticas concretas, fueron el principal impulsor indirecto que amenazó los humedales continentales de India y Brasil. Los resultados también revelaron algunos factores de cambio contrastantes, como los asentamientos humanos ilegales y el acaparamiento de tierras por parte de la industria del ladrillo para los humedales indios; mientras que la extracción de oro y la intensificación de los sistemas bovinos para los humedales brasileños. Nuestro documento también proporciona una visión sobre el estado de la conservación de humedales en India y Brasil. Recomendamos la promoción de prácticas de conservación basadas en la comunidad al adoptar estrategias de medios de vida sostenibles por parte de la población local para la conservación y el uso racional de los humedales continentales en India y Brasil. Los argumentos planteados en el artículo tienen el potencial de ayudar a las partes interesadas y / o los tomadores de decisiones para implementar estrategias de gestión sostenible para los humedales continentales en los dos países, y para los humedales tropicales en general.

A conceptual model to understand the drivers of change in tropical wetlands: a comparative assessment in India and Brazil / Un modelo conceptual para comprender los impulsores del cambio en los humedales tropicales: una evaluación comparativa en India y Brasil

Abstract: Tropical wetlands are amongst the most biodiverse ecosystems on Earth and have immense socio-ecological value. However, tropical wetlands are considered exploitable resources and continue to be drained and converted to other "productive" uses. It is therefore urgent to identify and understand the interactions between various drivers of change triggering degradation of such wetlands. In the present study, we systematically reviewed and analyzed the existing literature on wetlands in two tropical countries namely India and Brazil with special reference to inland wetlands, and proposed a conceptual model illustrating the intricate linkages of such wetlands with different drivers of change. We also developed the Nature Futures' Framework to depict the diverse values of inland wetlands contributing to human wellbeing in the two tropical countries. Findings revealed similar drivers of change triggering the degradation of Indian and Brazilian wetlands. These include changes in climate & land use, population growth, poor land governance due to weak policies, besides other anthropogenic activities such as deforestation, and overexploitation of wetland resources. Among these, land-use change such as agriculture intensification and infrastructure development were the major direct drivers; whereas, institutional and governance factors such as the absence of concrete policy measures were the major indirect drivers threatening the inland wetlands in India and Brazil. Results also revealed some contrasting drivers of change such as illegal human settlements, and land grabbing by the brick industry for Indian wetlands; while, gold mining and intensification of bovine systems for Brazilian wetlands. Our paper also provides an insight into the status of wetland conservation in India and Brazil. We recommend the promotion of community-based conservation practices while adopting sustainable livelihood strategies by the local people for the conservation and wise use of inland wetlands in India and Brazil. The arguments raised in the paper have the potential to assist the stakeholders and/or decision-makers towards implementing sustainable management strategies for inland wetlands in the two countries, and tropical wetlands in general.

Resumen: Los humedales tropicales se encuentran entre los ecosistemas con mayor biodiversidad en la Tierra y tienen un inmenso valor socioecológico. Sin embargo, los humedales tropicales se consideran recursos exploTables y continúan siendo drenados y convertidos a otros usos "productivos". Por lo tanto, es urgente identificar y comprender las interacciones entre varios impulsores del cambio que desencadenan la degradación de dichos humedales. En el presente estudio, revisamos y analizamos sistemáticamente la literatura existente sobre humedales en dos países tropicales, a saber, India y Brasil, con especial referencia a los humedales continentales, y propusimos un modelo conceptual que ilustra el intrincado vínculo de dichos humedales con diferentes impulsores del cambio. También desarrollamos el Marco de Nature Futures para resaltar los diversos valores de los humedales continentales de India y Brasil que contribuyen al bienestar humano en los dos países tropicales. Los resultados revelaron impulsores similares de los cambios que desencadenan la degradación de los humedales de la India y Brasil, incluidos los cambios en el clima y el uso de la tierra, el crecimiento de la población, las políticas débiles y la mala gobernanza de la tierra, además de otras actividades antropogénicas como la deforestación y la sobreexplotación de recursos. Entre estos, el cambio en el uso de la tierra, como la intensificación de la agricultura y el desarrollo de infraestructura, fueron los principales impulsores directos, mientras que los factores institucionales y de gobernanza, como la ausencia de medidas políticas concretas, fueron el principal impulsor indirecto que amenazó los humedales continentales de India y Brasil. Los resultados también revelaron algunos factores de cambio contrastantes, como los asentamientos humanos ilegales y el acaparamiento de tierras por parte de la industria del ladrillo para los humedales indios; mientras que la extracción de oro y la intensificación de los sistemas bovinos para los humedales brasileños. Nuestro documento también proporciona una visión sobre el estado de la conservación de humedales en India y Brasil. Recomendamos la promoción de prácticas de conservación basadas en la comunidad al adoptar estrategias de medios de vida sostenibles por parte de la población local para la conservación y el uso racional de los humedales continentales en India y Brasil. Los argumentos planteados en el artículo tienen el potencial de ayudar a las partes interesadas y / o los tomadores de decisiones para implementar estrategias de gestión sostenible para los humedales continentales en los dos países, y para los humedales tropicales en general.

Probabilistic meta-analysis of risk from the exposure to Hg in artisanal gold mining communities in Colombia.

Colombia is one of the largest per capita mercury polluters in the world as a consequence of its artisanal gold mining activities. The severity of this problem in terms of potential health effects was evaluated by means of a probabilistic risk assessment carried out in the twelve departments (or provinces) in Colombia with the largest gold production. The two exposure pathways included in the risk assessment were inhalation of elemental Hg vapors and ingestion of fish contaminated with methyl mercury. Exposure parameters for the adult population (especially rates of fish consumption) were obtained from nation-wide surveys and concentrations of Hg in air and of methyl-mercury in fish were gathered from previous scientific studies. Fish consumption varied between departments and ranged from 0 to 0.3 kg d(-1). Average concentrations of total mercury in fish (70 data) ranged from 0.026 to 3.3 µg g(-1). A total of 550 individual measurements of Hg in workshop air (ranging from

Detección de Toxina Termolábil y Termoestable de Escherichia coli en 100 niños con Enfermedad Diarréica Aguda

Las toxinas producidas por Escherichia coli enterotoxigénica están involucradas en la etiología de la enfermedad diarreica aguda, la cual representa un importante problema de salud pública en países en vía de desarrollo. Con el propósito de detectar la presencia de estas toxinas y determinar la sensibilidad antimicrobiana de las cepas productora de ellas, entre enero y marzo de 1997 se estudiaron 100 muestras de materia fecal de niños entre 0 y 7 años de edad con diagnóstico de enfermedad diarreica aguda. Los pacientes asistieron a consulta de urgencias en el Hospital de Meissen en Santafé de Bogotá, y tenían algunos criterios clínicos y microbiológicos específicos que orientaban a la presencia de una infección por bacteria toxigénica no invasiva y ausencia de enfermedad diarreica aguda de origen viral. De las muestras obtenidas, se aislaron 60 cepas de E. coli de las cuales se escogieron aleatoriamente 30 cepas para la detección de toxinas. Para la toxina termolábil se utilizó la prueba VET-RPLA (Oxoid Basingstoke, Reino Unido) y para la toxina termoestable un ELISA competitivo (Oxoid Basingstoke, Reino Unido). También se realizó antibiograma a todas las cepas productoras de toxina. La toxina termolábil fue la única enterotoxina detectada en diez muestras (33.3 por ciento), en niños entre seis meses y dos años de edad, y no se encontró ninguna cepa productora de toxina termoestable o de ambas toxinas. Se obtuvo un porcentaje de sensibilidad del 100 por ciento para la ciprofloxacina, gentamicina, ácido nalidíxico y cefotaxime mientras que en un porcentaje de las cepas fue resistente a la ampicilina y al trimetropim-sulfametaxazol. Los resultados obtenidos sugieren que E. coli productora de toxina termolábil está asociada con la producción de enfermedad diarreica aguda en niños menores de dos años