Comparación entre cinco técnicas de PCR para el diagnóstico del SARS-CoV-2 / Comparison between five PCR techniques for the diagnosis of SARS-CoV-2

Introducción. Desde que aparecieron los primeros casosde SARS-CoV-2 son numerosas las técnicas que se han desarrollado para el diagnóstico o seguimiento de la infección,tanto técnicas directas como serológicas. La elección de unabuena herramienta diagnóstica es fundamental para el controlepidemiológico. El objetivo ha sido comparar cinco técnicascomercializadas de RT-PCR a tiempo real, en sensibilidad, especificidad y concordancia para la detección del SARS-CoV-2.Material y métodos. Se compararon cinco kits comerciales de RT-PCR para la detección del SARS-CoV-2. Se tomaronocho muestras positivas conocidas que se sometieron a sietediluciones o concentraciones diferentes y otras 135 muestrasnegativas para determinar valores de sensibilidad, especificidad y concordancia.Resultados. La sensibilidad, especificidad, valor predictivopositivo (VPP) y valor predictivo negativo (VPN) para las técnicas de Palex, Roche y GeneXpert respecto a Seegene fueronidénticas, correspondientes a 98,21%, 100%, 100% y 99,26%respectivamente. Para Becton Dickinson la sensibilidad fue del89,28%, la especificidad del 100%, el VPP del 100% y el VPNdel 95,74%. La concordancia mediante el índice Kappa paraPalex, Roche y GeneXpert fue del 0,9892, mientras que la concordancia para Becton Dickinson fue con un índice Kappa de0,9215.Conclusión. Todos los kits de RT-PCR comerciales presentaron elevadas sensibilidades y especificidades, así como VPP,VPN y concordancia. (AU)

Introduction. Since the first cases of SARS-CoV-2appeared, there have been numerous techniques that havebeen developed for the diagnosis or monitoring of infection, both direct and serological techniques. Choosing agood diagnostic tool is essential for epidemiological control. The objective was to compare five commercializedRT-PCR techniques in real time, in sensitivity, specificityand agreement for the detection of SARS-CoV-2.Material and methods. Five commercial RT-PCR kitsfor the detection of SARS-CoV-2 were compared. Eightknown positive samples were taken and subjected to seven different dilutions or concentrations, and another 135negative samples were used to determine sensitivity, specificity, and agreement values.Results. The sensitivity, specificity, positive predictivevalue (PPV) and negative predictive value (NPV) for thePalex, Roche and GeneXpert techniques with respect toSeegene were identical, corresponding to 98.21%, 100%,100% and 99.26% respectively. For Becton Dickinson thesensitivity was 89.28%, the specificity of 100%, the PPVof 100% and the NPV of 95.74%. The agreement using theKappa index for Palex, Roche and GeneXpert was 0.9892,while the agreement for Becton Dickinson was with aKappa index of 0.9215.Conclusion. All commercial RT-PCR kits had highsensitivities and specificities, as well as PPV, NPV, andconcordance. (AU)

Utilización de la Historia Digital de Salud y la aplicación "WebMovil" corporativa en la gestión de la comunicación de resultados críticos de Microbiología, en el ámbito de Atención Primaria de un Área Sanitaria / Use of Digital Health Records and "WebMovil" corporate service in the communication management of critical results of Microbiology, in the context of a primary health care area

Introducción. El objetivo ha sido describir y evaluar un nuevo protocolo de comunicación de resultados críticos aplicado a Microbiología en un Área Sanitaria de Andalucía. Material y métodos. Se analiza el tamaño y tipo de los valores críticos de Microbiología para pacientes de Atención Primaria. Se evaluó un nuevo sistema de notificación informatizado, a tiempo real, a través de la Historia Digital de Salud Diraya, que integra el módulo de pruebas analíticas (MPA). Dicho protocolo se complementa, en colaboración con la tecnología de la información (TI), con el servicio de mensajes cortos (SMS) "WebMovil" de la Junta de Andalucía. Resultados. El número total de avisos de resultados críticos por el nuevo protocolo en el año 2012 fue de 817. El número de valores críticos para Atención Primaria fue de 570, de los cuales 90 fueron de Microbiología. El aviso más frecuente fue por aislamiento en el coprocultivo (n=51; 56,67 %). La prevalencia de los valores críticos de Microbiología en Atención Primaria fue de 0,45/100. El tiempo promedio de notificaciones fue de 13 minutos. La tasa de éxito de las notificaciones ha sido del 97,7 % y se obtuvo un 0% de abandonos. En el 99,93% de los casos se constató el contacto con el enfermo, y en el 98,55% la actuación médica. Conclusiones. La comunicación por un sistema informatizado unida a la tecnología SMS demostró una reducción en el tiempo de notificación y produjo beneficios adicionales, como eliminar el riesgo de errores cuando por parte del receptor no hay una repetición de la información recibida por el laboratorio. Además, el uso de mensajes SMS asegura que a los médicos de guardia siempre les llegue la información de una forma inmediata (AU)

Introduction. The objective was to describe and evaluate a new communication protocol of reporting critical results applied to Microbiology in a health area of Andalusia. Material and methods. The size and type of the critical values of Microbiology are analyzed for primary care patients. A new computerized reporting system was analyzed, in real time, through Diraya Digital Health Records, which integrates the analytical test module (MPA). The protocol is complemented, in collaboration with the Information Technology (IT), with the Junta de Andalucía short message service (SMS) "WebMovil". Results. The total number of notices of critical results by the new protocol in 2012 was 817. The number of critical values for primary care was 570, of which 90 were for Microbiology. The most frequent notice was by isolation in the stool culture (n = 51; 56.67%). The prevalence of the critical values of Microbiology in primary care was 0.45/100. The average time of notifications was 13 minutes. The success rate of notifications was 97.7% and 0% obtained in the number of withdrawals. In 99.93% of cases the contact with the patient was stated and in 98.55% the medical intervention was also confirmed. Conclusions. Communication by a computerized system linked to the SMS technology showed a reduction in the time of notification, and produced additional benefits, such as eliminating the risk of error when there is no repetition of information from the recipient received by the laboratory. Furthermore, the use of SMS messages ensures that doctors on duty always receive information immediately (AU)