RESUMEN
Introduction: New massive sequencing techniques make it possible to determine the composition of airway microbiota in patients with cystic fibrosis (CF). However, the relationship between the composition of lung microbiome and the clinical status of paediatric patients is still not fully understood. Material and methods: A cross-sectional observational study was conducted on induced sputum samples from children with CF and known mutation in the CFTR gene. The bacterial sequences of the 16SrRNA gene were analyzed and their association with various clinical variables studied. Results: Analysis of the 13 samples obtained showed a core microbiome made up of Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Rothia spp., Gemella spp. and Granulicatella spp., with a small number of Pseudomonas spp. The cluster of patients with less biodiversity were found to exhibit a greater number of sequences of Staphylococcus spp., mainly Staphylococcus aureus (p 0.009) and a greater degree of lung damage. Conclusion: An airway microbiome with greater biodiversity may be an indicator of less pronounced disease progression, in which case new therapeutic interventions that prevent reduction in non-pathogenic species of the airway microbiota should be studied
Introducción: Las nuevas técnicas de secuenciación masiva permiten determinar la composición de la microbiota de las vías respiratorias en pacientes con fibrosis quística (FQ). Sin embargo, la relación entre la composición de la microbiota pulmonar y el estado clínico de los pacientes pediátricos todavía no se ha establecido bien. Material y métodos: Se realizó un estudio transversal observacional en muestras de esputo inducido de niños con FQ y mutación conocida en el gen CFTR. Se analizaron las secuencias bacterianas del gen 16SrRNA y se estudió su asociación con diversas variables clínicas. Resultados: El análisis de las 13 muestras obtenidas mostró un microbioma central compuesto por Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Rothia spp., Gemella spp. y Granulicatella spp., con un pequeño número de Pseudomonas spp. Se descubrió que el grupo de pacientes con menos biodiversidad mostraba un mayor número de secuencias de Staphylococcus spp., principalmente Staphylococcus aureus (p 0,009) y un mayor daño de la función pulmonar. Conclusión: La mayor biodiversidad del microbioma de vía respiratoria puede ser un indicador de menor progresión de la enfermedad, en cuyo caso deben estudiarse nuevas intervenciones terapéuticas que prevengan la disminución de especies no patógenas
Asunto(s)
Humanos , Masculino , Femenino , Niño , Adolescente , Fibrosis Quística/diagnóstico , Fibrosis Quística/microbiología , Microbiota/efectos de los fármacos , Sistema Respiratorio/microbiología , Esputo/microbiología , Micobioma , Estudios Transversales , Pulmón/microbiologíaRESUMEN
Background: The most common cystic fibrosis (CF)-causing mutation is deltaF508 (F508del), which is present in 28% of CF Spanish patients. While the literature based on real-life studies on CF patients homozygous F508del treated with lumacaftor/ivacaftor is limited, it demonstrates the need for better strategies to prevent related adverse events (AEs) as well as the development of newer drugs. Methods: We conducted a multicenter, retrospective, observational study to describe the effects of lumacaftor/ivacaftor treatment in real-life in Spain. 20 CF patients were included, all aged 6 and upwards and presented with ppFEV1 < 40%, chosen from CF units country-wide. For the purposes of the study, they were treated with lumacaftor/ivacaftor 200/125 mg two tablets twice a day on a compassionate use programme throughout 2016. The primary endpoint was measured in all of the sample patients. Data were analysed from ppFEV1 at baseline and was measured every 6 months. Results: The mean age was 26.65 (range of 10-45), while the mean ppFEV1 before the treatment was 32.4% and mean BMI was 19.9 kg/m2. We analysed the changes in ppFEV1 and BMI from baseline during the treatment with lumacaftor/ivacaftor, but no differences were found. However, a moderate association between days of intravenous antibiotic needed and the use of lumacaftor/ivacaftor (p = 0.001) was established. Indeed, under the lumacaftor/ivacaftor, patients required 5.8 days of intravenous antibiotic treatment compared to 14.9 days prior to study. Also, severe pulmonary exacerbations requiring hospitalisation were statistically fewer under lumacaftor/ivacaftor treatment (p = 0.003). Finally, 75% of the sample presented with AEs, which led 35% of the subjects to discontinue the treatment. Conclusions: While treatment with lumacaftor/ivacaftor resulted in an improvement in the number of pulmonary severe exacerbations, no improvement in ppFEV1 or BMI was found
Introducción: La mutación causante de fibrosis quística (FQ) más frecuente es la deltaF508 (F508del), presente en el 28% de los pacientes españoles con FQ. Aunque la literatura sobre estudios en vida real en pacientes de FQ homocigotos para F508del tratados con lumacaftor/ivacaftor es escasa, pone de manifiesto la necesidad de contar con mejores estrategias para prevenir los efectos adversos (EA) relacionados con el tratamiento, así como del desarrollo de nuevos fármacos. Métodos: Se realizó un estudio observacional, retrospectivo multicéntrico para describir los efectos del tratamiento con lumacaftor/ivacaftor en vida real en España. Se incluyeron 20 pacientes con FQ, edad superior a los 6 años y ppFEV1 < 40%, procedentes de unidades de FQ de todo el país. Para los fines del estudio, fueron tratados con 2 comprimidos de lumacaftor/ivacaftor 200/125 mg/2 veces al día como parte de un programa de uso compasivo a lo largo de 2016. El criterio de valoración primario se midió en las muestras de todos los pacientes. Los datos de ppFEV1 se analizaron al inicio y cada 6 meses. Resultados: La mediana de edad fue de 26,65 (rango: 10-45), mientras que la mediana de ppFEV1 antes del tratamiento fue del 32,4% y la mediana del IMC 19,9 kg/m2. No se encontraron diferencias al analizar los cambios de ppVEF1 e IMC desde el inicio y durante el tratamiento con lumacaftor/ivacaftor. Sin embargo, se estableció una asociación moderada entre los días requeridos de antibiótico intravenoso y el uso de lumacaftor/ivacaftor (p = 0,001). De hecho, con lumacaftor/ivacaftor, los pacientes requirieron 5,8 días de tratamiento intravenoso con antibiótico, comparado con los 14,9 días previos al estudio. Además, el número de exacerbaciones pulmonares graves que requirieron hospitalización fue estadísticamente menor con lumacaftor/ivacaftor (p = 0,003). Por último, el 75% de la muestra presentó EA, lo cual supuso la discontinuación del tratamiento en un 35% de los casos. Conclusión: El tratamiento con lumacaftor/ivacaftor mejoró el número de exacerbaciones pulmonares severas, pero no supuso mejora ni en el ppFEV1 ni el IMC