RESUMEN
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RESUMEN
Asthma is a complex disease with striking disparities across racial and ethnic groups. Despite its relatively high burden, representation of individuals of African ancestry in asthma genome-wide association studies (GWAS) has been inadequate, and true associations in these underrepresented minority groups have been inconclusive. We report the results of a genome-wide meta-analysis from the Consortium on Asthma among African Ancestry Populations (CAAPA; 7009 asthma cases, 7645 controls). We find strong evidence for association at four previously reported asthma loci whose discovery was driven largely by non-African populations, including the chromosome 17q12-q21 locus and the chr12q13 region, a novel (and not previously replicated) asthma locus recently identified by the Trans-National Asthma Genetic Consortium (TAGC). An additional seven loci reported by TAGC show marginal evidence for association in CAAPA. We also identify two novel loci (8p23 and 8q24) that may be specific to asthma risk in African ancestry populations.
Asunto(s)
Asma/genética , Negro o Afroamericano/genética , Predisposición Genética a la Enfermedad/genética , Asma/epidemiología , Cromosomas Humanos Par 12/genética , Cromosomas Humanos Par 17/genética , Cromosomas Humanos Par 8/genética , Sitios Genéticos , Estudio de Asociación del Genoma Completo , Hispánicos o Latinos/genética , Humanos , Polimorfismo de Nucleótido Simple/genética , Estados Unidos/epidemiologíaRESUMEN
In the version of this article initially published, the statement "there are no pan-genomes for any other animal or plant species" was incorrect. The statement has been corrected to "there are no reported pan-genomes for any other animal species, to our knowledge." We thank David Edwards for bringing this error to our attention. The error has been corrected in the HTML and PDF versions of the article.
RESUMEN
We used a deeply sequenced dataset of 910 individuals, all of African descent, to construct a set of DNA sequences that is present in these individuals but missing from the reference human genome. We aligned 1.19 trillion reads from the 910 individuals to the reference genome (GRCh38), collected all reads that failed to align, and assembled these reads into contiguous sequences (contigs). We then compared all contigs to one another to identify a set of unique sequences representing regions of the African pan-genome missing from the reference genome. Our analysis revealed 296,485,284 bp in 125,715 distinct contigs present in the populations of African descent, demonstrating that the African pan-genome contains ~10% more DNA than the current human reference genome. Although the functional significance of nearly all of this sequence is unknown, 387 of the novel contigs fall within 315 distinct protein-coding genes, and the rest appear to be intergenic.
Asunto(s)
Población Negra/genética , Genoma Humano/genética , Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos , Humanos , Análisis de Secuencia de ADN/métodosRESUMEN
BACKGROUND: Hereditary angioedema is a disease which manifests itself with episodes of spontaneous edema on skin, mucosal and airway. Treatment includes acute and prophylactic approach to minimize the attacks and severity. In many parts of the world, androgen derivatives, antifibrinolytic and fresh frozen plasma are the therapies available for prophylaxis. CLINICAL REPORT: 16 years old teenager of without history of immune decease, has in the course of 1-year repetitive episodes of painless, non-pruritic angioedema, does not respond to antihistamine therapy, corticosteroids or adrenaline; fresh frozen plasma is applied in 1 occasion exacerbating episode with severity. The diagnosis is delayed because of the unavailability of the study in the country, so it is shipped abroad confirming the deficit of C1 Inhibitor (7.1 µg/mL). Initiating prophylactic therapy with Danazol, with subsequent episodes decreased. CONCLUSION: The delay diagnosis involves considerable risk in these patients; the importance of long-term prophylactic treatment is ratified in the use of androgens, being as an available option in developing countries.
Antecedentes: el angioedema hereditario es una enfermedad que se manifiesta con episodios de edema espontaneo, de piel, mucosas y vía aérea. Su tratamiento se centra en las crisis y en la profilaxis para minimizar el número y severidad de estas. En diversas partes del mundo, los derivados de andrógenos, antifibrinolíticos y plasma fresco congelado son los recursos disponibles para la profilaxis. Caso clínico: adolescente de 16 años sin antecedentes personales ni familiares, quien en el transcurso de 1 año presentó episodios recurrentes de angioedema indoloro, no pruriginoso; no respondió a antihistamínicos, corticosteroides o adrenalina, por lo que se aplicó plasma fresco congelado en una ocasión, que inmediatamente exacerbó la severidad del episodio. Se retrasó el diagnóstico porque no se disponía del estudio en el país; una muestra fue enviada al extranjero donde se confirmó el déficit del inhibidor C1 (7.1 µg/mL). Se inició tratamiento profiláctico con danazol, con respuesta favorable y posterior disminución en el número de episodios. Conclusión: el retraso diagnóstico implica riesgo considerable en estos pacientes; la importancia del tratamiento profiláctico a largo plazo se ratifica en el uso de andrógenos, opción al alcance de los países en desarrollo.
Asunto(s)
Angioedemas Hereditarios , Adolescente , Angioedemas Hereditarios/diagnóstico , Angioedemas Hereditarios/tratamiento farmacológico , Danazol/uso terapéutico , Femenino , HumanosRESUMEN
Introducción. Las inmunodeficiencias primarias son un grupo de enfermedades de origen genético que implican altera - ciones asociadas a la respuesta inmunológica. El infra diagnóstico de estas conlleva al retraso de tratamiento, evitables en gran parte; Entre estas existe el síndrome de Wiskott-Aldrich; es un trastorno raro, ligado al cromosoma X, recesivo, que se caracteriza por trom - bocitopenia, eczema e inmunodeficiencia donde su tratamiento curativo es el trasplante de medula ósea. CASO CLÍNICO : Paciente de 10 años, con antecedentes de múltiples hospitalizaciones por procesos infecciosos importantes: neumonías recurrentes, menin - gitis, diarreas, erupción cutánea generalizada y trombocitopenia de hasta 9,000 mm³. Después de múltiples estudios realizados, se confirma el diagnóstico de síndrome de Wiskott -Aldrich por inmunogenetica (mutación del gen WAS) y mediante colaboración médica internacional, se realiza trasplante de médula ósea con posterior resolución de su enfermedad. DISCUSION: Las inmunodeficiencias primarias son patologías más comunes de lo que se creía (prevalencia de hasta 1/1200), la evidencia de aparición y su importancia clínica deben ser tomadas en consideración. En este caso de Síndrome de Wiskot-Aldrich en donde el diagnóstico definitivo es in - munogenetico, (actualmente el país no cuenta), además de tratamiento inmuno-oncológico adecuado, el paciente pudo sobrevivir y mejorar su calidad de vida gracias a soporte investigativo y terapéutico multinacional. Existen colaboraciones multicentricas como el consorcio de tratamiento inmunodeficiencias primarias, que tienen como objetivo colaborar activamente en el diagnóstico y tratamien - to estos casos, salvaguardando la vida de estos pacientes y ayudando a comprender estas enfermedades raras...(AU)
Asunto(s)
Humanos , Enfermedades Autoinmunes , Trasplante de Médula Ósea/métodos , Trombocitopenia/complicaciones , Síndrome de Wiskott-Aldrich/diagnóstico , Cromosoma XRESUMEN
The African Diaspora in the Western Hemisphere represents one of the largest forced migrations in history and had a profound impact on genetic diversity in modern populations. To date, the fine-scale population structure of descendants of the African Diaspora remains largely uncharacterized. Here we present genetic variation from deeply sequenced genomes of 642 individuals from North and South American, Caribbean and West African populations, substantially increasing the lexicon of human genomic variation and suggesting much variation remains to be discovered in African-admixed populations in the Americas. We summarize genetic variation in these populations, quantifying the postcolonial sex-biased European gene flow across multiple regions. Moreover, we refine estimates on the burden of deleterious variants carried across populations and how this varies with African ancestry. Our data are an important resource for empowering disease mapping studies in African-admixed individuals and will facilitate gene discovery for diseases disproportionately affecting individuals of African ancestry.
Asunto(s)
Población Negra/genética , Flujo Génico , Genoma Humano , Migración Humana , Secuencia de Bases , ADN Intergénico/genética , Femenino , Heterogeneidad Genética , Geografía , Humanos , Masculino , Filogenia , Polimorfismo de Nucleótido Simple/genética , SexismoRESUMEN
La Leptospirosis es una zoonosis común de distribución mundial, pero su presentación a nivel de sistema nervioso central es poco frecuente, aunque puede manifestarse como meningitis aséptica. Reportamos el caso de un paciente masculino con cuadro febril, mialgia, cefalea seguida por rigidez de nuca y crisis convulsivas, que una semana previa al inicio de los síntomas había estado en un campamento, en quien prueba de laboratorio reporta leptospira. Se trato con Penicilina cristalina con buena evolución. La epidemiología nos debe de hacer pensar en la posibilidad de esta enfermedad...
Asunto(s)
Humanos , Masculino , Adulto , Brotes de Enfermedades , Leptospira interrogans , Meningitis Aséptica , Sensibilidad y Especificidad , ZoonosisRESUMEN
La Leptospirosis es una zoonosis común de distribución mundial, pero su presentación a nivel de sistema nervioso central es poco frecuente, aunque puede manifestarse como meningitis aséptica. Reportamos el caso de un paciente masculino con cuadro febril, mialgia, cefalea seguida por rigidez de nuca y crisis convulsivas, que una semana previa al inicio de los síntomas había estado en un campamento, en quien prueba de laboratorio reporta leptospira. Se trato con Penicilina cristalina con buena evolución. La epidemiología nos debe de hacer pensar en la posibilidad de esta enfermedad...(AU)
